このプロトコルでは、組換えタンパク質精製とユビキチン鎖切断アッセイを組み合わせることにより、神経発達障害に関連する遺伝的変異が脱ユビキチン化酵素活性に及ぼす影響を測定する方法を説明しています。
| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| Amersham Protran 0.45 NC 200 mm × 200 mm 25/PK | Cytiva | 10600041 | |
| Ammonium sulfate | Fisher Scientific | AC205872500 | |
| Ampicillin | Fisher Scientific | BP1760 25 | |
| Anti- Ubiquitin (Mouse monoclonal) | Biolegend | Cat# 646302, RRID:AB_1659269 | (WB: 1:1000 |
| )Anti-GST (Sheep polyclonal) | MRC-PPU 試薬およびサービス | Cat# S902A サードブリード | (WB: 1:1000) |
| https://mrcppureagents.dundee.ac.uk/ バッフル培養フラスコ 2 L | フィッシャーサイエンティフィック | 10-042-5N | |
| ブラッドフォード試薬 | ミリポアシグマ | B6916-500ML | |
| クロラムフェニコール | ゴールドバイオテクノロジー | C-105-25 | |
| コンプリート、プロテアーゼ阻害剤錠剤 | ミリポアシグマ | ||
| エコノコラム 1.5 × 5 cm | Bio-Rad | 7371507 | |
| Eppendorf ThermoMixer F1.5 | エッペンドルフ | 5384000020 | |
| Excel | マイクロソフト | ||
| https://www.microsoft.com/en-us/microsoft-365/excel グリセロール | ジェネシー サイエンティフィック | 18-205 | |
| イラストレーター | Adobe | https://www.adobe.com/products/illustrator.html | |
| Image Studio | LI-COR バイオサイエンス | https://www.licor.com/bio/image-studio/ | |
| Inkscape | Inkscape | ||
| https://inkscape.org/ Invitrogen 4-12% NuPAGE 1mm 12 well gel | Thermo Fisher Scientific | NP0322BOX | |
| IPTG (Isopropyl-b-D-Thiogalactopyranoside) | Genesee Scientific | 20-109 | |
| IRDye 800CW Donkey anti-Goat IgG Secondary Antibody | LI-COR Biosciences | Cat# 926-32214 | (WB: 1:10000) |
| IRDye 800CW ロバ抗マウス IgG 二次抗体 | LI-COR Biosciences | Cat# 926-32212 | (WB: 1:10000) |
| Isotemp デジタル ドライバス | フィッシャー サイエンティフィック | サイエンティフィック サイエンティフィック カ88860022 | |
| K63 ジユビキチン | サウス ベイ バイオ LLC | SBB-UP0072 | |
| LB 寒天 | ジェネシー サイエンティフィック | 11-119 | |
| LB ブロス | ジェネシー サイエンティフィック | 11-118 | |
| リゾチーム | 金バイオテクノロジー | L-040-100 | |
| MaxQ 4000 卓上軌道シェーカー | サーモフィッシャーサイエンティフィック | SHKE4000-7 | |
| MES-SDS ランニングバッファー | ボストンバイオプロダクツインク | BP-177 | |
| ミニチューブローテーター | フィッシャーサイエンティフィック | 88-861-051 | |
| NuPage LDS サンプルバッファー 4x | サーモフィッシャーサイエンティフィック | NP0007 | |
| オデッセイ FC Imager | LI-COR Biosciences | 43214 | |
| PageRuler Plus Ladder | Thermo Fisher Scientific | 26620 | |
| pGEX6P1 ヒト USP27X | MRC-PPU 試薬およびサービス | DU21193 | https://mrcppureagents.dundee.ac.uk/ |
| pGEX6P1 ヒト USP27X F313V | Addgene | 225715 | Koch et at 2024 (PMID: 38182161) |
| pGEX6P1 ヒト USP27X S404N | Addgene | 225717 | Koch et at 2024 (PMID: 38182161) |
| pGEX6P1 human USP27X Y381H | Addgene | 225716 | Koch et at 2024 (PMID: 38182161) |
| Pierce Glutathione Agarose | Thermo Fisher Scientific | 16100 | |
| PMSF (Phenylmethylsulfonyl fluoride) | Gold Biotechnology | P-470-10 | |
| Polysorbate 20 (Tween 20) | Fisher Scientific | AC233360010 | |
| Rosetta 2 コンピテントセル | ミリポア Sigma | 71402-M | |
| SimplyBlue SafeStain | サーモフィッシャーサイエンティフィック | LC6060 | |
| SmartSpec 3000 | バイオ・ラッド | 170-2501 | |
| SOC メディウム | サーモフィッシャーサイエンティフィック | 15544034 | |
| 塩化ナトリウム | ネシーサイエンティフィック | 18-216 | |
| ソニファイア 250 | ブランソン | 100-132-135 | |
| ソルバル RC 6 プラス 遠心分離機 | サーモフィッシャーサイエンティフィック | 46910 | |
| TCEP (トリス - (カルボキシエチル) ホスフィン塩酸塩) | ゴールド バイオテクノロジー | TCEP10 | |
| テリフィック ブロス パウダー | ジェネシー サイエンティフィック | 18-225 | |
| トリス ベース | ジェネシー サイエンティフィック | 18-146 | |
| XCell SureLock ミニセルおよびXCell II ブロットモジュール | サーモフィッシャーサイエンティフィック | EI0002 |
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