我々は、誘導型FRETバイオセンサーのFRET値を測定する方法を説明し、in vitro でER(CFPタグ付き)またはミトコンドリア(YFPタグ付き)を標的とし、Aβ生成に影響を与えるミトコンドリア関連ER膜(MAMs)のタイトネスを評価する方法を記述し、この方法は合成または天然のMAM調節剤の初期スクリーニングに用いられます。
方法論記事
我々は、誘導型FRETバイオセンサーのFRET値を測定する方法を説明し、in vitro でER(CFPタグ付き)またはミトコンドリア(YFPタグ付き)を標的とし、Aβ生成に影響を与えるミトコンドリア関連ER膜(MAMs)のタイトネスを評価する方法を記述し、この方法は合成または天然のMAM調節剤の初期スクリーニングに用いられます。
複数の研究により、ERミトコンドリア接触部、すなわちミトコンドリア関連膜(MAMs)の数、長さ、隙間幅(厚さ)が生物学的役割に影響を与えることが示されています。私たちの以前の研究では、約7nmのギャップ幅を特徴とするタイトなMAMの安定化はアミロイドβ(Aβ)レベルの増加をもたらす一方、約40nmのギャップ幅の緩いMAMの存在はアルツハイマー病(AD)の三次元(3D)神経モデルにおいてAβ産生を減少させることを示しました。ギャップ幅の異なるMAMsの効果を調べるために、ERおよびミトコンドリア標的FRET(Förster共鳴エネルギー伝達)バイオセンサーであるER-CFP(シアン蛍光タンパク質)とMito-YFP(黄色蛍光タンパク質)が開発され、緩やかまたは非MAMとは対照的にタイトなMAM(<10nm幅)を定量化しました。FRETは、ドナー蛍光団(CFP)と受容蛍光団(YFP)が10nm以内に位置している場合に発生し、このシステムはMAMの近接度を評価するのに適しています。このプロトコルは、スペクトル比率FRETを用いて密なMAM形成の範囲を測定する方法を概説しています。
ミトコンドリア関連小胞体接触(MERC)は、生化学的にミトコンドリア関連ER膜(MAMs)として単離されており、アルツハイマー病(AD)を含む複数の神経変性疾患に関与しています。最近提唱された「MAM仮説」は、MAMがアミロイドβ(Aβ)の生成に中心的な役割を果たし、ADの病原性カスケードを開始すると示唆しています。この連鎖には神経線維絡まり(NFT)、カルシウムの食虫異常、神経炎症の形成が含まれます。MAMは、小胞体および外ミトコンドリア膜(OMM)に存在するコレステロール豊富な脂質ラフト状のマイクロドメインからなり、構造的および機能的多様性に寄与する特定の結合タンパク質によって結ばれています3。ERミトコンドリア接触の安定化は、ERカルシウムシグナル伝達やアポトーシスを含むさまざまな細胞過程に影響を与えます。推定では、ミトコンドリアの5%〜20%が小胞体と物理的接触を形成し、MAMs6を形成しています。複数の研究で、MAM部位におけるERとミトコンドリア間の数、長さ、隙間幅(厚さ)が機能的役割を決定する重要な要因であることが示されています。低温電子顕微鏡およびマウス肝臓のin vivo解析により、肝細胞の代謝状態がMAMs7の厚さ(14nmから20nmの範囲)および長さ(145nmから270nmの範囲)の両方を調節することが示されています。
MAMsはがんや代謝障害を含むさまざまな疾患の潜在的な治療標的としても注目されています。MAMの厚さまたは隙間幅は細胞の生存を調節します。構成的なMAM安定化剤であるMAM 1XおよびMAM 9Xは、それぞれタイト(6 nm ± 1 nm ギャップ幅)と緩いMAM(24 nm ± 3 nm ギャップ幅)を安定化するために設計されており、タイトなMAMの安定化が新しい3D神経培養モデルにおいてAβ生成を劇的に増加させることを示しました。対照的に、緩いMAMの安定化は効果なし8。したがって、タイトなMAMの安定化を緩いMAMに変換することは、アミロイド病理の低下に有益かもしれません。構造的・機能的な複雑さと、MAMの安定化度に関する正確な定量的分析の欠如により、MAMを薬物発見のために標的とするのは困難です。ER結合ミトコンドリアの軸索速度に関する新規のライブ細胞イメージングおよびキモグラフィーに基づく解析により、ミトコンドリアの軸索速度はMAM安定化を定量的に測定する指標として用いられることが示されました。なぜなら、ERとの接触が密接にミトコンドリア軸索速度を自由ミトコンドリア8,9に比べて有意に低下させるからです。hAPP発現のニューロ2A(N2A APP細胞)におけるMAMの誘導安定剤を用い8、MAMギャップ幅を狭めることでAβ生成が線量依存的に増加することを発見しました8。誘導性MAM安定化剤は、CFP(シアン蛍光タンパク質)エピトープ標的ER標的およびYFP(黄色蛍光タンパク質)エピトープ標的ミトコンドリア標的バイオセンサーをコードし、ラパマイシン誘導性FK506ラパマイシン結合(FRB)または12-kDa FK506結合タンパク質(FKBP)ドメインに融合した発現プラスミドです。これらのバイオセンサーはそれぞれER-CFPとMito-YFPと呼ばれました。CFPは、受容蛍光体YFPが>10 nm離れたときにエネルギーを伝達するドナー蛍光色素です。誘導性バイオセンサーを発現する細胞(N2AAPP)はラパマイシン処理8時にAβ生成を増加させ、MAMのタイト化がAβ生成を増加させることを示唆しています。これらの手法は、MAMの小分子モジュレーターのスクリーニングや、最適なタイトなMAMの安定化を達成するために必要な有効濃度のスクリーニングに有益であり、これにより病原性(「Aβ増加」)MAMを治療的(「Aβ低下」)MAMに変換しつつ、ERやミトコンドリアの接触を完全に不安定化させることなく、細胞生存に重要です。
実験モデル
本研究では、APP751(N2AAPP)を一貫的に発現するNeuro2A(N2A)細胞を用いています。これらの細胞は、素朴なN2A細胞と比べて、条件付け培地(CM)に検出可能なAβを放出します。N2A APP細胞は、前述の通り10% FBS、100 U/mLペニシリン、100 μg/mLのストレプトマイシン、および200 μg/mL G418を補足した2 mM L-グルタミン酸を補足したDMEMで維持されました。
発現プラスミド
発現プラスミドリア標的配列は、哺乳類 のA-キナーゼアンカータンパク質1 のYFP(黄蛍光タンパク質)標的ミトコンドリア標的配列[AKAP1(34-63])および ホスファチルノシトール-3-ホスファターゼ Sac1ホスファターゼ[Sac1(521-587])の自己切断型Tav2A配列(pYFP-AKAP1-Tav2A-Sac1-CFP8)を融合させることで生成されました.Tav2A融合した発現プラスミドは、FK506ラパマイシン結合(FRB)ドメイン[EMWHEGLEEASRLYFGERNVKGMFEVLEPL HAMMERGPQTLKETSFNQAYGRDLMEAQEWCRKYMKSGNV (K 2095P)DLTQAWDLYYHVFRRISKQ]または12-kDa FK506結合タンパク質(FKBP)ドメイン(MGVEKQVIRPGNGPPPGQTVTVHCTGFGKD GDLSQFQFQIGKGAVIKGWDEGVIGMQ IGEVARLRCSSDYAYGAGGFPAWGIQPNSVLDFEIEVLSVQ)ドメイン(MGVEKQVIRPGNGPKPPGPGQDGQ)をコードしています。FRB-YFP-AKAP1(34-63)-Tav2A-Sac1(521-587)-CFP-FKBP(ここではMAM-Tav2Aと表記)は、FRB-YFP-AKAP1(34-63)およびSac1(521-587)-CFP-FKBPの等モル発現レベルを得るために生成され、比率的FRET解析を行いました。Sac1(521-587)-CFP-FKBP(ER-CFPと表記)はドナーの蛍光色素であり、一方でMito-YFP-FRBはMito-YFPと表記され、約10 nm8分離するとFRETを生成する受容体蛍光色素です。したがって、FRTベースのバイオセンサーは狭いMAM(6〜10nm、ギャップ幅)を検出します。FRBおよびFKBPは、ラパマイシン添加時にMAMギャップ幅が線量依存的に狭まることを誘導するために導入され、FRETsignal8の増加を測定することで定量化可能でした。
本研究で使用される試薬および機器は 材料表に記載されています。
1. トランスフェクション
2. 薬物治療
3. 蛍光共鳴エネルギー伝達(FRET)のための共焦点顕微鏡
4. 比率法FRT解析(6 - 12時間)
注:ドナーER-CFP(468-503 nm)および受容体Mito-YFP(525-565 nm)からの蛍光放出は、共焦点顕微鏡を用いて検出されました。ImageJソフトウェアは背景減算後の平均ピクセル蛍光強度を定量化するために使用されました。YFPとCFPの放射強度の比率を計算し、スペクトルFRET解析の読み取りとして使用しました。
FACS富集N2AAPP 細胞でMAM-Tav2Aを発現した比率計測FRET解析では、ラパマイシン治療後にAβ40レベルが用量依存的に増加することが示されました。ラパマイシンは哺乳類の標的であるラパマイシン(mTOR)シグナル伝達経路を阻害することで作用し、これによりミクログリア内のTREM2(骨髄細胞に発現するトリガー受容体2)の発現をダウンレギュレートし、5XFADのアルツハイマー病マウスモデルにおけるAβプラーククリアランスが低下します。ラパマイシン類似体AP21967、一般にラパログ(Log)と呼ばれるものは、mTORへの親和性が低いため、細胞に対して比較的無毒です。しかし、FRBドメイン12に代償的空洞形成変異(K2095P)が導入されたため、ラパマイシンと同じ親和性でFRBドメインに結合する能力は保持しています。
ラパおよびログ処理によりFRT比率が増加しました(図1)。この治療は、IP3R3やVDAC1など他のMAMタンパク質のレベルにほとんど、あるいは全く効果を示しませんでした。したがって、タイト(<10 nm)のMAMを増やすことで、 in vitro8でAβ生成が増加しました。特に、ナイーブN2A細胞で行われたFRETアッセイでも同様の結果が得られました。

図1:MAMギャップ幅の狭さにより、in vitroで Aβ生成が増加しました。(A) 誘導性MAM安定化剤CFP-FRB-ER-Tav2A-ミト-FKBP-YFP(MAM-Tav2A)の回路図。これは自己切断を行い、ドナー(CFP-FRB-ERまたはER-CFP)と受容体(ミト-FKBP-YFPまたはミト-YFP)の等モルレベルを生成し、内因性タイトMAMに結合した場合や、ラパマイシン(Rapa)またはそのアナログラパログ(Log)とのFRBおよびFKBP相互作用を誘導することでタイトMAM形成を強化することでFRET/FLIMを促進します。(B) TAV2Aの自己切断後にCFP-ER(青いボックス)およびミトYFP(黄色いボックス)が等モル発現を示すMAM-Tav2A(Tav2A)細胞のIB。(C) DMSO(Veh)またはRapa(250 nM)で過剰発現したMAM-Tav2A細胞の共焦点画像。(D,E)。Vehを除いた細胞、または100 nMラパマイシン(Rapa)(D)またはラパログ(Log)(E)で処理された細胞の比率計量FRET解析。FRET値はチャネル2(465-500 nm)とチャネル1(525-555 nm)間の強度の比率として示されます。FRET解析ごとに、40〜50個の細胞が無作為に選ばれ、細胞ごとにROIを生成しました。一方通行ANOVA。p < 0.0001。(F) リバスチグミン(Riv: 0または50 μM)による24時間処理後のMAM-Tav2A発現N2AAPP細胞の代表的なウェスタンブロット画像。MAM-Tav2Aはドナー(CFP-ER)と受容体(ミト-YFP)の等モルレベルを生成しました。(G) ドナーと受容体間のFRET比の定量化(車両処理0 μM)またはリブ処理済み(50 μM)。(H)Aβ ELISA (Wako)は、車両処理(0 μM)またはRiv処理(50 μM)細胞の調和培地(CM)において、50 μM Riv処理後にAβ40(pM)レベルの有意な低下を示しました。n = 6、p < 0.001。(I) FRET(比率)およびAβ(pM)値を表にまとめます。図はZellmerら8から修正されています。この図の拡大版はこちらをクリックしてご覧ください。
補足ファイル1:MAM-Tav2Aプラスミド配列ファイル。ER標的配列であるSac1配列(521FLALPIIMVVAFSMCIICLLMA GDTWTETLAYVLFWGVASIGTFILYNGKDFVDAPRLVQ KEKID587)をコードする発現プラスミドのDNA配列はFKBPおよびCFP配列に結びつき、ミトコンドリア標的配列であるAKAP1配列(34SSHDEQQVEAGAVQLRADPAIKEPLPVEDV63)はFRBおよび自己切断性Tav2A配列(EGRGSLLTCGD VEENPGP)と結合したYFP配列に連結しています。このファイルをダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
MAMsの調節は、がん、代謝障害、神経変性疾患など様々な疾患に対する潜在的な示唆を持つ新興の研究分野です。ダイニン受容薬LDC-3/ダイナレスチン、抗糖尿病薬メトホルミン、抗がん剤スルフォラファンなど多くの薬理学的薬剤はMAMを破壊し、現在がんおよび代謝障害の前臨床および臨床試験が進行中です。これらの薬理学的薬剤は、PTPIP51、VAPB、VDAC1、PACS2、MFN2、VDAC1、IP3R3 14,15,16,17,18,19,20などのMAMテザーリングタンパク質間の相互作用を調節することで、ERミトコンドリア接触またはMAM接触幅を調節します。シグマ1受容体(S1R)アンタゴニスト(NE-100)は、AD21の3次元ニューロンモデルにおいてMAMをダウンレギュレーションし、軸索Aβレベルを劇的に低下させました。最近の報告では、S1Rの喪失が緩いMAMを増加させ、MAMのタイトなMAMを減少させることが示されており、S1RがMAMのタイトネスを調節する治療的標的であることが示唆されました。
アルツハイマー病(AD)由来のトランスジェニックラットの生FRET(蛍光共鳴エネルギー転送)画像では、タイトMAM(<10 nm)に有意な乱乱が見られ、野生型対照群と比較して緩いMAM(~20 nm)には観察可能な変化が見られませんでした1。N2AAPP細胞で発現するラパマイシン(Rapa)/ラパログ(Log)誘導型FRBおよびFKBP二量体化ドメインを含む誘導型FRET/FLIMベースのMAM安定剤は、Rapa/Log処理がMAMの引き締まりを強化し、線量依存的にAβ40産生を増加させることを示しました8,9。これにより、MAMギャップ幅の狭窄がアミロイドゲン処理を促進することが初めて実証されました。FDA承認の抗記憶薬リバスチグミンは、現在軽度から中等度のAD22,23で前臨床試験が行われており、VDAC1やBACE1の発現を変化させず、CFP-ERとミトYFPの共局在頻度に影響を与えることなく、Aβ40レベル(p < 0.001)を有意に低下させました。リバスチグミンは、MAMアンカータンパク質であるミトフシン-2(MFN2)24のレベルを調節することで、MAMの安定化に影響を与えると考えられています。この発見は、リバスチグミンが培養ニューロンおよびADマウスモデルにおけるAβレベルを低下させることを報告する他の研究と一致しています(3xTg)25,26。MAMギャップ幅は細胞生存に不可欠なさまざまな細胞プロセスを調節するため、MAMの安定性を標的的に調節することは、MAMの完全な不安定化よりもAβ蓄積に対するより効果的な治療戦略を提供する可能性があります。完全な不安定化は意図しない副作用を引き起こす可能性があります。
この手法の大きな制約は、比率法FRET技術がドナーとアクセプターの等モル発現に依存していることです。ドナーや受容体をコードする発現プラスミドの共発現は、結果に不一致をもたらします。ドナーと受容体バイオセンサーを接続する自己切断型Tav2Aを使用することで、バイオセンサーの等分子発現が保証されます。しかし、バイオセンサーの発現レベルはFRET解析前にウェスタンブロット解析で確認されました。
ラパマイシン(Rapa)は、MAMの締め付けがAβ産生に与える影響を評価するには理想的でない場合があります。なぜなら、これは哺乳類のラパマイシン(mTOR)シグナル伝達経路を阻害し、ミクログリア中のTREM2(発現する発現受容体2)のダウンレギュレーションを引き起こし、結果としてアルツハイマー病(AD)マウスモデルにおけるAβプラーククリアランスを低下させるからです(5XFAD)11.代替として、ラパマイシン類似体AP21967、一般にラパログ(Log)と呼ばれるものが使用されることがあります。ログはmTORに対する結合親和性が低いため、細胞に対して比較的無毒です。しかし、FRBドメイン12に補償的な空洞形成変異(K2095P)が導入されたため、ラパマイシンと同様の親和性でFRBドメインに結合する能力は保持しています。
この方法は非常に重要です。合成または天然の小分子MAMモジュレーターががんや代謝障害において有望な治療効果を示すいくつかの前臨床研究の証拠があるにもかかわらず、まだ臨床試験は実施されていません。その主な理由の一つは、効果的な治療法開発の前提条件であるMAMの安定性を定量的に測定できる信頼できる方法が不足していることです。MAMの構造と機能の関係を定量化するには細胞全体を完全な観察が必要であり、成熟したニューロンでは従来のTEMや他の高解像度顕微鏡では達成できませんが、低倍率で取得可能です。したがって、TEM、クライオTEM、走査型電子顕微鏡(SEM)などの従来の手法はナノスケールで細胞構造を検出できますが、ミトコンドリア29とER30,31の非常に動的な性質によりMAM構造は一時的であるため、MAMの安定化度を測定する際には制限があります 32,33,34.MAMの構造機能関係を調べるために、生細胞イメージングとキモグラフィー解析を用いて、狭いまたは緩いMAMを介して小胞体に接続されたミトコンドリアの軸索速度を測定することが提案されています。これは、ADの脳35および分化したADサイブリッジ細胞からの皮質ニューロンにおけるミトコンドリアの軸索輸送の減少という報告と一致しています。高い定量的精度を持つにもかかわらず、ライブセルイメージング技術は高スループット薬物スクリーニングには適さない可能性があります。これに対し、FRET/FLIM分析は将来的に既存の生細胞顕微鏡や高分解能顕微鏡よりも高速な定量的手法として応用され、ADの小分子治療薬の特定に活用される可能性があります。
ここで述べるFRETプロトコルは、ERとミトコンドリア間の人工的な連鎖の文脈で特に適用可能であることが示されています。その簡潔さにより、ERミトコンドリア接触安定性の効率的な評価と、アミロイド病理への影響の調査が可能であり、これがこのアプローチの主な目的となっています。我々は、この手法をさらに活用して、最近開発された3次元(3D)AD薬物スクリーニングプラットフォーム37内で、MAM調節可能な小分子ライブラリをスクリーニングすることを目指しています。この結果は、将来的にin vivoや臨床試験に拡張可能な潜在的な抗Aβ小分子MAMモジュレーター13in vitroの選定に非常に役立つでしょう。
マサチューセッツ総合病院(MGH)のルドルフ・E・タンジ教授に、原稿に関する洞察に満ちたコメントを心より感謝いたします。MIHの助教授である前坂正人博士に、FLIMアッセイの専門知識を共有していただき、感謝いたします。フィラデルフィアのトーマス・ジェファーソン大学教授、ジョルギー・ハイノツキー博士にER-CFPまたはミトYFPをコードする発現プラスミドを寛大に提供していただき、感謝申し上げます。この研究は、キュア・アルツハイマー基金の支援を受けてRBに提供されました。
| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| BSA | フィッシャーサイエンティフィック | 501781532 | |
| 共焦点顕微鏡 | オリンパス FV3000RS (東京、日本) | N/A | |
| GlutaMAX補充剤付きDMEM | ジブコ/Thermo Fisher Scientific | 10564011 | |
| EDTA | ライフテクノロジーズ | 41116134 | |
| ファルコン6ウェルプレート | VWRインターナショナル | 41122107 | |
| GAPDHポリクローナル抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA1-988 | |
| ゼラチン | VWRインターナショナル | 9000-70-8 | |
| ジェネティック(G418硫酸塩) | ジブコ/Thermo Fisher Scientific | 10131035 | |
| GFPモノクローナル抗体 | Invitrogen | MA5-15256 | |
| Graphpad Prism N/A | Prism 9、バージョン9.5.0 | N/A | |
| ヘパリン | Sigma-Aldrich | H0200000 | |
| ImageJソフトウェア | ImageJ 1.53a | N/A | |
| 倒立型共焦点顕微鏡 | 日立(C2 Eclipse Ti2) | N/A | |
| Lipofectamine2000 | Invitrogen | 11668027 | |
| MS Excel | Microsoft Excel、バージョン2302 | N/A | |
| NaCl | フィッシャーサイエンティフィック | 7647145 | |
| NuPAGE 4–12% Bis-Trisゲル | Invitrogen | NP0321BOX | |
| ペニシリン/ストレプトマイシン/アンホテリシンB | ロザ | 17-745E | |
| フォトショップ | Adobe Photoshop CC 20.0.10 | N/A | |
| Tris-HCL、pH 7.6 | ボストンバイオプロダクツ | 42000000 | |
| トリトンX-100 | Sigma-Aldrich | T8787 | |
| トリプシン-EDTA | ジブコ/Thermo Fisher Scientific | 25200056 | |
| Tween 20 | フィッシャーサイエンティフィック | 501657287 |
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