このプロトコルは、カテーテル挿入された尿路の in vitro モデルの詳細を述べており、これは、シミュレートされたカテーテル関連尿路感染症におけるプランクトンおよびバイオフィルム関連細菌細胞集団の両方を研究するために使用できます。このモデルは、尿路感染症の制御を目的とした抗菌製品の有効性を研究するためにさらに活用できます。
方法論記事
このプロトコルは、カテーテル挿入された尿路の in vitro モデルの詳細を述べており、これは、シミュレートされたカテーテル関連尿路感染症におけるプランクトンおよびバイオフィルム関連細菌細胞集団の両方を研究するために使用できます。このモデルは、尿路感染症の制御を目的とした抗菌製品の有効性を研究するためにさらに活用できます。
カテーテル関連尿路感染症(CAUTI)は、最も一般的な医療関連感染症の1つです。尿道カテーテルでのバイオフィルム形成は、これらの感染症の病因における重要な側面であり、カテーテルの閉塞や腎盂腎炎や敗血症などの重篤な合併症につながることがよくあります。このような状況でのバイオフィルム形成をモデル化および研究するアプローチは、CAUTIの病因を支えるメカニズムの基本的な理解と、CAUTIとカテーテル閉塞を制御するための効果的な治療戦略の開発と堅牢な前臨床評価の両方に不可欠です。このプロトコルは、カテーテル挿入された尿路の in vitro モデルを記述し、臨床診療で使用されるカテーテル閉鎖ドレナージシステムを複製し、代表的な条件下でのCAUTIおよびカテーテルバイオフィルム形成の研究を促進します。さらに、このプロトコルでは、現在NHSサプライチェーンで利用可能な製品を含む、抗菌カテーテルメンテナンス製品の有効性を評価するための in vitro 膀胱モデルの適用について詳しく説明しています。
尿道カテーテルは、最も一般的に展開されている医療機器の 1 つであり、急性期医療施設での有病率は 19% と推定されています 1,2,3。カテーテルは、主に膀胱機能障害の場合の尿量管理を支援するために展開され、膀胱に直接挿入され、尿が中央の内腔2,3を介して膀胱から排尿することを可能にする。尿道カテーテルは、定期的に膀胱に挿入して尿を排出する間欠的に使用することも、カテーテルを膀胱内にその場に残して尿を連続的に排出する留置カテーテルを利用することもできます3,4。尿道カテーテルは広く使用されているにもかかわらず、尿路感染症 (UTI) の発症の最大の危険因子であり、尿路感染症は医療関連感染症の推定 5,6 を占めています。実際、カテーテル自体は、しばしば微生物のコロニー形成の初期部位として機能し、尿路病原体が尿路に付着し、さらにコロニーを形成するための表面を提供する1,6,7,8。長期の持続的カテーテル法 (カテーテルを ≥28 日間留置する) を受けているほぼすべての患者は、細菌尿を経験し、カテーテルがその場にある日ごとにリスクが ~5% 増加します 2,9,10,11。それに比例して、尿路感染症の約80%は尿道カテーテルの使用に関連しています6。
カテーテル関連尿路感染症(CAUTIs)は、医療サービスにとって大きな負担であり、合併症のない尿路感染症よりも重篤な上部尿路感染症の症状(尿管炎や腎盂腎炎など)と関連していることが多く、二次血流感染のリスクも高い1,7,12,13,14 .CAUTIの標準治療には抗生物質療法が含まれるが、これらの感染症は、カテーテル表面上の複雑なバイオフィルムコミュニティの発生の結果として、抗菌治療に対してしばしば抵抗性である15,16,17,18,19,20。実際、CAUTIの~80%はバイオフィルム形成尿路病原体に由来すると推定されています19。バイオフィルム形成は、細菌細胞のカテーテル表面への付着と、細胞外高分子物質(EPS)の広範なマトリックスに埋め込まれたコミュニティの発達によって特徴付けられます21,22,23,24。EPSの産生は、バイオフィルムコミュニティの決定的な特徴であり、抗菌剤に対する耐性の上昇や免疫クリアランス21,22,24など、バイオフィルム関連細胞が示す多くの創発特性に関与しています。EPSは、細胞を物理的に遮蔽し、抗菌剤または免疫エフェクターから保護することにより、これらの表現型において直接的な役割を果たすことができるだけでなく、バイオフィルムの物理化学的微小環境や持続性細胞の形成など、バイオフィルムコミュニティのより広範な側面の開発を促進することによって間接的に役割を果たすことができる23,24,25,26。さらに、CAUTIsの~11%を占めるProteus spp.を含む一部の尿路病原体は、強力なウレアーゼ酵素を保有しており、尿中に存在する尿素を加水分解し、尿中pH2,27,28,29,30の全体的な上昇をもたらします。このpH上昇は、カルシウムとリン酸マグネシウムの結晶の沈殿を伴い、成長するバイオフィルムに組み込むことができ、バイオミネラリゼーションとカテーテルをブロックできる高密度の結晶性バイオフィルム構造の形成をもたらします。これらの結晶性バイオフィルムは、治療を問題にするだけでなく、腎盂腎炎や敗血症などの深刻な合併症を引き起こす可能性があります2,28,31,32,33,34。
カテーテル挿入された尿路の複雑な環境ニッチ、およびこれらの感染症におけるバイオフィルム形成の重要な役割は、CAUTIの病因の研究において特定の課題を提起します。96ウェルプレートベースのアッセイなど、バイオフィルム形成を研究および定量するために広く使用されているシンプルで広く使用されているラボモデルは、CATUIでのバイオフィルム形成、特に結晶性バイオフィルムの研究には不十分です。例えば、そのようなモデルは、尿によって提供される複雑な栄養環境、カテーテル表面が接着およびその後のバイオフィルム産生にどのように影響するか、および尿媒体の継続的な流れなど、CAUTIニッチの主要な側面を考慮していない35,36,37,38,39,40.さらに、尿路病原体の抗菌薬感受性を決定するために使用される標準的なアッセイは、多くの場合、実際の臨床感受性を反映していません。最小阻害濃度アッセイおよび微生物懸濁試験は、CAUTI病原体の抗菌剤感受性を推測するために頻繁に使用されるが、典型的には、尿道カテーテルの存在およびその後のバイオフィルム形成が抗菌剤感受性に及ぼす可能性のある影響のようなCAUTI環境の重要な変数をシミュレートしない41,42,43。
この研究では、カテーテル挿入された尿路の環境をシミュレートし、1999 年に Stickler et al.44 によって最初に記述された、臨床診療で使用される標準的なカテーテル閉鎖ドレナージ システムを再現する in vitro 膀胱モデルのセットアップと実行について詳しく説明します (図 1)。このモデルは、標準サイズのフォーリーカテーテル(現在NHSサプライチェーンで利用可能)と、Nzakizwanayoら45によって以前に説明された人工尿培地(AUM)を使用して、CAUTIとバイオフィルム形成をシミュレートします。in vitro膀胱モデルは、「膀胱」として機能する二重壁のガラスチャンバーで構成され、フォーリーカテーテルを中央のガラスチャンバーに挿入できる出口があります。中央のガラスチャンバーの上部には、蠕動ポンプを使用して生物学的に適切な流量でAUMを「膀胱」に供給できる入口があり、蠕動ポンプはドレナージアイホールを介してカテーテルを通って廃棄物バッグに流れ込みます。さらに、外側のチャンバーはウォーターバス回路に接続されているため、モデルを一定の温度に保つことができます。in vitro膀胱モデルは、中央チャンバーを介して接種できるため、生物学的に代表的なニッチでのCAUTI病原体の研究が可能になります。さらに、モデルにカテーテルを挿入し、常に新鮮なAUMを供給することで、プランクトン細胞とバイオフィルム関連細胞の両方の成長と集団動態を研究することができます。
過去の研究では、Proteus mirabilisや大腸菌 43,45,46,47,48,49などの著名なCAUTI病原体におけるバイオフィルム形成の基礎研究を含む、いくつかの用途でin vitro膀胱モデルが利用されています。さらに、インビトロモデルは、CAUTIを制御するか、または閉塞を予防することを目的とした製品の有効性を評価するために利用されてきた50,51,52。最近では、AMRに関連する適応と突然変異がP. mirabilisのバイオフィルム形成とCAUTIの病因に影響を与えるかどうかを判断するためにモデルが使用されています43,46。in vitro膀胱モデルは、新たに処方されたセラノスティックカテーテルコーティングやファージ療法治療など、CAUTIの治療を目的とした新しい抗菌治療の研究にも使用されています47,48。このプロトコルには、in vitro膀胱モデルのセットアップと実行、モデルと尿道カテーテル表面からの生存可能なプランクトン細胞とバイオフィルム関連細胞の列挙、および尿路産生を監視するための尿中pHの測定が含まれます。また、現在NHSのサプライチェーンで利用可能な膀胱洗浄液や抗菌潤滑ジェルなど、CAUTIの治療または予防を目的とした抗菌製品の評価に関するプロトコルも詳細に説明されています。
in vitro膀胱モデルのセットアップの概略図を図1に示します。In vitro 膀胱モデルは、標準的な Foley カテーテルと互換性があるように設計されています (図 1 に示す寸法は、標準サイズ 14 のフランス製カテーテルと互換性があります)。すべてのin vitro膀胱モデル機器を滅菌し、使用するシリコンチューブをメディア回路にクランプしてから使用してください。in vitroモデルのセットアップ全体を通じて無菌技術を厳守する必要があり、モデルを無菌条件(つまり、カテゴリーII微生物安全キャビネットまたは層流フード)で組み立てることをお勧めします。in vitro膀胱モデル実験の統計的有意性を決定するために、最小n = 5回の反復が推奨されます。試薬や使用機器の詳細については、資料表に記載されています。
1. 人工尿培地の調製
注:人工尿培地(AUM)は、実験に必要な培地の量が多く、ヒト尿サンプルに関連する変動性があるため、 in vitro 膀胱モデルでの使用が推奨されます。このプロトコルは、前述のようにAUMの調製を詳しく説明し、Nzakizwanayoらによる in vitro 膀胱モデルでの使用に最適化されています。 (5L最終容量)43、45、46、48、53、54。
2. 体外 膀胱モデルのセットアップ
3. in vitro 膀胱モデルの接種

4. in vitro 膀胱モデル流量の計算

5. in vitro 膀胱モデルからの浮遊性細胞のサンプリング
注: in vitro 膀胱モデルは、集団動態を監視するために、実験全体を通じて定期的にサンプリングする必要があります。すべてのモデルは、接種直後、AUMフロー活性化の時点、接種後4時間(流量が計算されるとき)、およびモデルが終了する時点(閉塞または所定のエンドポイント)でサンプリングする必要があります。>24時間モデルを実行する場合は、CFU/mLを監視するために24時間ごとにサンプルを採取することをお勧めします。また、ユーザーの必要に応じて追加のサンプルを採取することもできます。
6. in vitro 膀胱モデルからのバイオフィルム関連細胞のサンプリング
7. in vitro 膀胱モデルによる抗菌薬感受性試験
注:カテーテル関連尿路感染症の制御を目的としたほとんどの治療法は、標準的なフォーリーカテーテルと互換性があり、 in vitro 膀胱モデル実験を開始する前に互換性を確認してください。
8. in vitro 膀胱モデル実験の終了
注: P. mirabilis などのウレアーゼ陽性生物は、結晶性バイオフィルム形成 を介して 尿道カテーテルの閉塞を引き起こす可能性があります。したがって、閉塞は in vitro 膀胱モデルの生物学的に関連するエンドポイントとして使用でき、結晶性バイオフィルムによるカテーテルアイホールの完全な閉塞と、ガラス「膀胱」の中央チャンバー内のAUMの体積の増加によって視覚的に識別されます(図3)。
in vitro膀胱モデルの運用が成功するかどうかは、優れた無菌技術を実践し、実験全体を通じて培地の濁度を注意深く観察することにかかっています(図3)。接種前、滅菌AUMは淡黄色で、in vitro膀胱モデルの中央チャンバー内では透明でした(図3A)。培地リザーバー内のAUMは、濁度の変化が発生すると、溶液からの塩の沈殿や培地の汚染を示している可能性があるため、実験中は常に透明に保つ必要があります。メディアリザーバーまたはメディア回路チューブのAUMが曇ったり、色が急激に変化したりした場合は、レプリケートを破棄して繰り返す必要があります。接種後、in vitro膀胱モデル中央チャンバー内のAUMの濁度の増加がはっきりと見えます(図3B)。濁度の変化は、P. mirabilisなどのウレアーゼ陽性生物でより顕著であることがよくありますが、ウレアーゼ陰性生物では接種後も目に見えるはずです。.AUMフローが開始された後、プランクトン細胞が洗い流されるときにAUMの濁度の減少が観察されることが多く、モデルに生存細胞が不足していることを示すものではありません。中央チャンバー内の培地レベルを観察することは、ウレアーゼ陽性生物を利用する場合の閉塞時間を決定するためにも使用できます(図3C)。モデルが稼働しているときは、カテーテルのアイホールと先端が完全に見えるようにして、廃棄物バッグに適切に排出されていることを示す必要があります。閉塞すると、中央チャンバー内のAUMのレベルがカテーテルのアイホールと先端より上に上昇し、実験がエンドポイントの読み取りと終了の準備ができていることを示します。実験中、in vitro膀胱モデル培地回路の圧力効果により、モデルが詰まって見えることがあります。閉塞が疑われる場合は、チューブ内の気泡やねじれが「エアロック」を引き起こし、カテーテルの排出を妨げる可能性があるため、アッセイを終了する前にAUM回路、カテーテル、および廃液バッグチューブがぴんと張っていることを確認してください。
in vitro膀胱モデル実験では、プランクトンサンプリングにより、モデル内の成長ダイナミクスとCAUTIの進行に関する貴重な洞察を得ることができます。細胞増殖、pH、バイオフィルム形成はすべて、モデルを終了させることなく、実験全体を通じて監視できます(図4)。ウレアーゼ陽性生物を使用する場合、閉塞時間の計算をバイオフィルム形成速度の尺度として利用し、異なる細菌株の特性を比較するために使用できます(図4)。P. mirabilisの野生型株とLPS変異体(mini-tn5 waaCへの挿入)の比較では、ブロックまでの時間が延長され、変異体でのバイオフィルム形成が減少したことが示されました(図4)。ウレアーゼ陰性生物は通常、in vitro膀胱モデルをブロックしないため、実験前に設定されたエンドポイントを決定することをお勧めします。場合によっては、ウレアーゼ陰性菌がカテーテル閉塞を引き起こす可能性があります。例えば、肺炎桿菌のウレアーゼ陰性株は、広範囲のムコイドバイオフィルムを生成することができますが、これらは通常、ウレアーゼ陽性バイオフィルムよりもはるかに長い時間をかけて排液をブロックするため、エンドポイントを設定することが推奨されます。
膀胱モデルの実験全体でpHを測定することで、ひずみ間の違いやCAUTIの進行状況についての洞察も得られます。ウレアーゼ陰性菌を利用する場合、 in vitro 膀胱モデルの中央チャンバー内のpHは実験全体を通じてほぼ安定しているはずですが、実験の過程で集団動態が変化するため、pHのわずかな変動が予想されます。 in vitro モデルにウレアーゼ陽性生物を接種すると、時間の経過とともにpHが大幅に上昇し、通常、閉塞時に最も高いpHが観察され、~8-9という高いpH測定値が観察されます(図4B)。
浮遊性CFU/mLの計数化は、in vitro膀胱モデリングの重要な要素であり、オペレーターは接種が成功したかどうかを評価し、実験の進行状況を監視することができます。実験の最後にCFU/mLを測定することで、異なる細菌株間の膀胱コロニー形成の違いを明らかにすることができます。P. mirabilisのmini-Tn5変異株を野生型と比較したところ、閉塞時のCFU/mLの有意な減少が観察されました(図4C)。さらに、カテーテル表面のバイオフィルムからCFUを列挙し、バイオフィルムバイオマスを定量化することで、カテーテルを装着した尿路にコロニーを形成するさまざまな病原体の能力についての洞察を得ることができます。クリスタルバイオレット染色を使用して、野生型P.ミラビリスHI4320株とクロルヘキシジンで継代した分離株との間のバイオフィルム形成の違いを決定しました(図5)。595 nmでの光学密度測定により、クロルヘキシジンで継代した分離株は、クロルヘキシジンの非存在下で可決された野生型および対照群と比較してバイオフィルム形成の減少を示したことが示されました。
in vitro膀胱モデルの目的はCAUTIニッチを正確に再現することであるため、モデルは、臨床的に関連性のある環境でCAUTIを治療することを目的とした抗菌治療薬の効果を研究するためにも利用できます。ウレアーゼ陽性生物の場合、処理済みモデルと未処理モデルの閉塞時間を比較することで、治療の有効性に関する有用な洞察を得ることができます。P. mirabilisを0.02%クロルヘキシジン膀胱洗浄液で接種したin vitro膀胱モデルの処理は、未処理または0.9%生理食塩水で処理したモデルと比較して、閉塞までの時間を有意に延長しました(図6A)。さらに、in vitro膀胱モデルは、抗菌治療薬の殺菌活性を研究するために利用することができます。抗菌治療後のプランクトン性およびバイオフィルム関連細胞のCFU/mLの変化をモニタリングすることで、治療が有効かどうかを示すことができます。P. mirabilisを接種したin vitro膀胱モデルの処理では、メーカーの指示に従って適用した場合、未処理の0.9%生理食塩水灌漑モデルと比較して、治療直後のプランクトンCFU / mLが>7 log減少したことが示されました(図6B)。

図1: in vitro 膀胱モデルの主要コンポーネントの概略図。 (A)膀胱モデル(クローズドドレナージシステム):(1)膀胱をシミュレートする二重壁ガラスチャンバー (2)メディアインレット、AUは蠕動ポンプ を介して 膀胱モデル内部チャンバーに供給されます (3)循環水浴 を介して 外部チャンバーに供給される水入口 (4)水出口 (5)フォーリーカテーテル、内部チャンバーに挿入されます (6)ドレナージルーメン接続ポイント;ゴミ袋/灌漑ポーチの接続ポイント (7) 尿の流出を収集する排水バッグ。(B) in vitro 膀胱モデルのセットアップと、モデルを通る媒体と水の流れの方向を示す概略図。人工尿は、室温で培地リザーバー(1)に保存され、実験期間中、蠕動ポンプ(2) を介して ~0.75 mL min-1 の一定流量でモデルに供給されます。培地は、膀胱(3)を表す二重壁のガラス容器の中央チャンバーに流れ込み、フォーリーカテーテル(4)のアイホール を通って ドレナージバッグ(5)に排出され、滅菌クローズドドレナージシステムが完成します。 in vitro 膀胱モデルは、二重壁ガラス容器の外側のチャンバーを流れる循環水浴(6) を介して 37°Cの一定温度に保たれます。破線はシリコンチューブを表し、矢印は流れの方向を表します。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図2:バイオフィルム関連細胞を処理するための尿道カテーテルの切片化。 下流のバイオフィルム定量のための解剖用の尿道カテーテル上のサンプルポイント。(A)カテーテルは、最初に先端/アイホールに近位の8cm領域(ほとんどのバイオフィルム形成が観察される場所)で横方向に切片化されます。1cmの切片をメスで除去しますが、一般的には、処理の再現性が難しいため、収縮したカテーテルバルーンを含む領域を避けます(1-3)。(B)カテーテルが最初に1cmの断片に切片化されたら、中央の内腔に別の縦方向の切断が行われ、さらなるバイオフィルム定量、すなわち結晶紫色染色のCFU/mL列挙のために存在するバイオフィルムが露出します。破線は解剖点を表します。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図3:in vitro膀胱モデル実験の段階。 実験のさまざまな段階にわたるin vitro膀胱モデルの中央チャンバーの画像。(A)接種前のin vitro膀胱モデル中央チャンバー内のAUM。中央チャンバー内の培地は完全に透明で、滅菌が成功したことを示しており、カテーテルの先端とアイホールは培地の線の上に見え、カテーテルが正常に排出されていることを示しています。(B)P.ミラビリスの接種後(接種後4時間)後のin vitro膀胱モデル中央チャンバー内の培地。接種の成功は、培地の濁度の増加によって示されます。カテーテルの先端とアイホールの視認性は、AUMがカテーテルを介して正常に排出されており、閉塞が発生していないことを示しています。(C)閉塞したin vitro膀胱モデルの一例。P. mirabilis の接種とそれに続くバイオフィルムの形成と石灰化により、カテーテルのアイホールが閉塞し、ドレナージが妨げられ、中央チャンバー内の媒体のレベルがカテーテル先端より上に上昇しました。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図4:in vitro膀胱モデルのエンドポイント測定は、閉塞するまで実行しました。 P. mirabilisの臨床株RS47(WT)と、バイオフィルム形成が弱毒化された変異株RS47-2(変異体)を接種したin vitro膀胱モデルからの閉塞時のエンドポイント測定の例。(A)WTおよびP.mirabilisの変異株の閉塞時間(h)。(B)閉塞時のin vitro膀胱モデルのpH。(C)閉塞時のin vitro膀胱モデルチャンバー内のプランクトン細胞のCFU/mL。すべてのデータは、5回の生物学的複製の平均を表しています。エラーバーは、平均の標準誤差(SEM)を示します。*p ≤ 0.05;**p ≤ 0.01.この図は、Clarke et al.46から修正されています。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図5:in vitro膀胱モデルからのバイオフィルム関連細胞測定。 P. mirabilisのバイオフィルム形成の定量化、野生型HI4320株とクロルヘキシジン(CHD)の有無にかかわらず、結晶紫色染色および595nmでの光学密度(OD)の測定による適応集団の比較。WT:P.ミラビリスHI4320;1、3、5:CHD曝露のない通路制御。2、4、6:HI4320を4μg/ mL CHDで継代。すべてのデータは、5回の生物学的複製の平均を表しています。エラーバーはSEMを示しています。 *p ≤ 0.05;** p ≤ 0.01.この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図6:抗菌治療後のin vitro膀胱モデルからの測定値。プランクトンサンプルは、0.02% クロルヘキシジン抗菌溶液 (100 mL) または 0.9% 生理食塩水コントロールによる灌漑後に、P. mirabilis を接種した in vitro 膀胱モデルから採取しました。(A)灌漑後のin vitro膀胱モデルの閉塞時間。(B)灌漑処理直後のプランクトン性CFU / mL。すべてのデータは、5回の生物学的複製の平均を表しています。エラーバーはSEMを示します。 *p ≤ 0.05;**p ≤ 0.01;*p ≤ 0.0001 です。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
カテーテル挿入された尿路は、実験室環境で再現するのが難しい複雑な生物学的ニッチを表しています。in vitro膀胱モデルは、CAUTIをシミュレートする目的で設計されており、標準的な尿道カテーテルを使用して、臨床診療で使用される無菌の閉鎖型ドレナージシステムを再現しています。カテーテル挿入された尿路は、尿道カテーテルが CAUTI 6,55 の発症の最大の危険因子であることからも明らかなように、感染に非常に敏感です。それに見合った、慎重な無菌技術は、in vitro膀胱モデルの実行を成功させるために重要です。AUMの濁度は、汚染された培地や期限切れの培地が時間の経過とともに濁り、すべての複製物を廃棄する必要があるため、無菌性の明確な指標です。準備された接種物を追加するために中央のチャンバーを開くと、無菌の閉じた排水システムが壊れ、in vitro膀胱モデルが汚染されやすくなるため、in vitro膀胱モデルを接種およびサンプリングする際には、慎重な無菌技術も利用する必要があります。中央チャンバーの汚染を避けるために、トリプルルーメンカテーテルを使用してプランクトン細胞集団をサンプリングすることができます(廃液ルーメンをクランプオフし、追加のルーメンを介して排出することにより)。4時間の時点ではある程度のウォッシュアウトが予想されますが、この時点で生存可能なプランクトン細胞が列挙されていない場合は、トラブルシューティングが必要になることがあります。4時間後に生存細胞が列挙されない場合は、細菌のコロニー形成をより適切にサポートするために、使用する接種密度またはAUM製剤を最適化する必要があるかもしれません。さらに、接種物のウォッシュアウトは、メディア回路に問題があることを示している可能性があります。チューブ内のねじれは、適切な排水を妨げ、細菌の増殖を妨げる可能性のある有毒な代謝物の蓄積をもたらす可能性がありますが、メディアチューブを洗い流すために使用される残留消毒剤は殺菌効果を持つ可能性があります。
このプロトコルは、以前にNzakizwanayoらによって記述されたAUMの調製を詳述しており、Proteus mirabilisおよびEscherichia coli 43,45,46,48などの著名なCAUTI病原体を用いたin vitro膀胱モデルでの使用が以前に検証されています.ただし、プロトコルで使用されるAUM製剤を変更して、他の病原体の増殖を選択する余地があります。多数の多様なAUM定式化が発表されており、代わりにメディア回路28、56、57、58、59、60で使用することができる。さらに、培地リザーバー内のAUMには、特定の病原体の増殖のために選択するための栄養素や抗生物質を補給することができます。歴史的に、in vitro膀胱モデルにはプールされたヒト尿も供給されてきたが、in vitro膀胱モデルの複製を実行するために必要な大量の培地は、ヒトサンプルの収集を非現実的にする可能性がある53,54。さらに、ヒトの尿の組成は患者サンプル間で大きく異なる可能性があり、ホルモン、塩、タンパク質の濃度、ならびに水分補給状態の違いが細菌の増殖およびバイオフィルム形成に影響を与えることが示されているため、実験の再現性に影響を与える可能性がある38,39,61,62。
上記のプロトコルは、in vitro 膀胱モデルに ~1010 CFU/mL を複製する後期 CAUTI の接種について詳述しています。しかし、in vitro膀胱モデルの接種部位は、CAUTIの初期段階、すなわち尿道カテーテルの初期コロニー形成と膀胱への上昇をよりよく再現するために、将来のアッセイで変更される可能性があります。in vitroモデルをセットアップする前に、既知の細菌接種物でフォーリーカテーテルを手動で汚染することで、CAUTIの初期段階についての洞察が得られる可能性があります。実際、接種密度は以前の研究で変更され、初期段階の感染を再現しています。例えば、Nzakizwanayo et al. in vitro 膀胱モデルに、開始 CFU/mL (ca. 103 CFU/mL)を使用して、初期段階の感染を再現する47。ただし、接種密度を変更すると、閉塞までの時間が長くなる可能性があり、実験前に追加の検証が必要になることに注意してください。
さらに、プロトコルでは、in vitroモデルに細菌の単一培養を接種することについて詳しく説明していますが、モデルに真菌病原体を接種する余地があります。過去の研究では、CAUTIの最大8%がカンジダ属の感染に起因することが示唆されており、カンジダ属は抗真菌治療にしばしば抵抗性であるバイオフィルムを生成することができる27,63。さらに、in vitro膀胱モデルは、多微生物CAUTIの研究に対応するために変更することができます。実際、CAUTIの最大86%が多微生物性であることが示唆されており、これらの感染症はしばしば単種感染よりも重篤な症状と高い死亡率と関連しています27,64,65,69。in vitroモデルに複数の種を接種して、多微生物バイオフィルムの形成とCAUTIの進行を研究することができますが、接種前に多微生物群集の慎重な検証と接種密度の変更を行う必要があります。以前の研究では、in vitro膀胱モデルを利用して、単一種のP. mirabilis CAUTIとE. faecalisの二重種CAUTIと比較したバイオフィルム形成の違いを監視し、株間の代謝相互作用を強調しています。これにより、単一種の感染と比較してバイオフィルム形成が促進されました70。
in vitro 膀胱モデルを使用して CAUTI を研究する主な利点は、標準的な尿道カテーテルの表面でのバイオフィルム形成を観察できることです。CAUTIにおけるバイオフィルムの形成は、尿路病原体が付着できる尿の有機成分からなるカテーテル内腔上のコンディショニングフィルムの形成によって開始されることが多く、その後、増殖して成熟したバイオフィルム2,18,71,72,73を形成する。バイオフィルム形成の研究に使用される標準的なアッセイは、多くの場合、AUMではなく標準的な細菌増殖培地を利用し、ポリスチレンマイクロプレートまたはペグ、つまりカルガリーデバイスへの付着に基づいています。しかし、過去の研究では、システムの栄養環境、pH、酸素レベル、および流れや表面構造の違い(シリコーン対プラスチック)などの物理的特性がバイオフィルム形成に影響を与える可能性があることが示唆されています36,37,74,75,76,77,78。さらに、P. mirabilisのような広範なウレアーゼ活性を持つ細菌をAUMの閉鎖系で培養すると、有毒な代謝物が蓄積し、細胞死を引き起こす可能性がある78,79。これは、in vitro膀胱モデルでは、中央チャンバー内のAUMが培地回路を介して常に新鮮な培地と交換されるため、より臨床的に関連性のある条件下でのCAUTIバイオフィルムの研究が可能になる45。in vitro膀胱モデルの日常的な実行とモデルに選択されるエンドポイントは、モデルにウレアーゼ陽性または陰性の生物が接種されているかどうかに大きく依存します。理論的には、in vitroモデルは、十分な量のAUMが供給され、モデルの無菌性が維持されていれば、無期限に実行できます。ただし、実験の前にエンドポイントを選択することをお勧めします (それが閉塞であるか、任意の日数であるかにかかわらず)。ウレアーゼ陰性生物を接種したin vitroモデルは、臨床環境をシミュレートするために≤7日間実行することが一般的に推奨されます。これは通常、ほとんどの生物でバイオフィルム形成を観察するのに十分であり、臨床介入に沿って維持します。標準的なベストプラクティスでは、目に見えて感染したらカテーテルを交換する必要があることが示されています1,2。3、47、48。ウレアーゼ陽性生物は結晶性バイオフィルムを生成する可能性が高いが、in vitro膀胱モデル閉塞までの時間内にウレアーゼ陽性株内には大きな変動があり、プロテウス・ミラビリスの一部の株は10時間以内にカテーテル閉塞を引き起こし、他の株は39,46をブロックするのに30時間以上かかる。標準的なウレアーゼ試験は、in vitro膀胱モデル実験の前に使用して、モデルを閉塞または事前定義されたエンドポイント80に対して実行するかどうかを決定することができる。
おそらく、in vitro 膀胱モデルを使用してバイオフィルム形成を研究する主な制限は、バイオフィルムの測定がエンドポイントの読み取りであり、尿道カテーテルの除去と解剖が必要であることです。逆に、実験中の任意の時点で、in vitro膀胱モデルから浮遊性サンプルを採取できます。さらに、in vitro膀胱モデルからバイオフィルムサンプルを採取すると、バイオフィルムの生成をより定量化するために、多数の追加のダウンストリーム技術を使用することができます。過去の研究では、結晶性バイオフィルム中に存在するカルシウムとマグネシウムの量を定量化するためにフレームフォトメトリーを利用しており、より複雑な染色を使用して、ウレアーゼ陰性バイオフィルム45,73,81,82,83,84のEPSマトリックスの成分を正確に同定することができます。
この研究では、CAUTIの治療を目的とした治療薬の効果を研究するためのin vitro膀胱モデルの適用についても説明しています。in vitro膀胱モデルは、AUMの使用、臨床的に関連するバイオフィルムの形成、CAUTIで見られる有機負荷の増加など、CAUTIニッチの重要な側面をシミュレートします。抗生物質などの治療薬は、臨床的に関連する薬物のバイオアベイラビリティをシミュレートするためにAUMタンクに直接追加することができ、過去の研究では、チオリダジンやフルオキセチンなどの再利用された薬物を利用して抗バイオフィルム効果を実証している81。さらに、殺生物剤の抗菌活性を推測するために、最小阻害濃度アッセイと細菌懸濁試験がよく使用されますが、アッセイが実際の殺生物剤感受性と相関することを示唆する証拠はほとんどありません41,85,86,87,88。in vitro膀胱モデルは、尿道カテーテルの存在とCAUTIニッチのより代表的なシミュレーションにより、抗菌潤滑剤ジェルや灌漑液などの製品をメーカーの指示に従って試験できるため、CAUTIの治療または予防を目的とした殺生物性製品の試験に有利です。過去の研究では、ファージ療法の有効性を判断するためにin vitro膀胱モデルも使用されており、ファージ治療により、P. mirabilisがin vitro膀胱モデルをブロックできる時間が100時間以上延長できることが実証されています47。また、in vitro膀胱モデルに標準サイズのフォーリーカテーテルを使用することで、新しいコーティングされたカテーテルの抗菌活性をアッセイすることができます。Slateらによる過去の研究。 セラノスティック シプロフロキサシン コーティングでコーティングされたカテーテルが、in vitro 膀胱モデル48 で P. mirabilis の閉塞までの時間を ~60 時間延長できることを実証しました。このことは、CAUTIの治療を目的とした新規治療法の研究におけるin vitro膀胱モデルの潜在的な応用を浮き彫りにしており、生物学的に関連性のある模擬CAUTIニッチにおける抗菌薬のより正確な評価を可能にします。
著者は何も開示していません。
このプロトコルの開発において専門知識を共有してくださったJonathan Nzakizwanayo博士とAnthony J. Slate博士に感謝します。バース大学での研究は、V.B. (MR/N0137941/1) の学生として、医学研究評議会 GW4 Biomed DTP によって資金提供されました。B.V.J.は、ダンヒル・メディカル・トラスト(RPGF1906\171)からの資金提供も受けています。O.E.C.による研究は、Kidney Research Northwest(RCN:1144798)によって資金提供されました。 図 1 は Biorender.com を使用して作成されています。
| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| 313 ラピッドロードポンプヘッドエクステンション | Watson-Marlow | 313 | 蠕動ポンプ - 追加のポンプヘッドエクステンション |
| 323S/D手動制御可変速ポンプ | Watson-Marlow | 323S/D | 蠕動ポンプ |
| 3Lベッドバッグ、レバータップ付き滅菌 | グレートベアヘルスケア | GDW173 | |
| 内径3mmプラチナ硬化シリコーンチューブ | フィッシャー | 10111801 | 小型AUM回路チューブ(ポンプチューブをモデルに接続) |
| 径5mmプラチナ硬化シリコンチューブ | フィッシャー | 10539201 | 中AUM回路チューブ(ポンプチューブをAUMリザーバーに接続) |
| 塩化アンモニウム(NH4Cl) | ッシャー | 11473713 | |
| 無水硫酸ナトリウム (Na2SO4) | Fisher | 11498717 | |
| Azlon テーパーコネクタ | フィッシャー | 10712807 | AUM回路の異なる長さのチューブを接続するために使用されます |
| ベッドバッグハンガー | グレートベアヘルスケア | 10705P | |
| Bochem ピンチ コック チューブ クランプ、直径 25 mm | ッシャー | 11805101 | |
| 塩化カルシウム (CaCl2) | フィッシャー | 10021681 | |
| クエン酸一水和物 | メルク | C1909-500G | 実験後のモデルから結晶バイオフィルムを除去するために使用されます |
| フィッシャーブランド ガラス目盛り付きクラスBタイプ1ピペット | フィッシャー 11992168 | 穴あけ栓ゼラチンを介してAUMのin vitroブレーダーモデルを供給するために使用されます | |
| VWR | 24360.233 | ||
| Graphpadプリズム10 | GraphPad | V10.0 | in vitro膀胱モデルの結果と統計分析をグラフ化するために使用される分析ソフトウェア。 |
| ハンナ HI 2211-02 pH 卓上メーター | フィリップ ハリス | PP00057414 | |
| In vitro 膀胱モデル | - | - | Nzakizwanayo et al. (2019) によって以前に説明されたように、特注の機器。 |
| Instillagel 6 mL 潤滑剤ゲル | mydoctorshop.co.uk | 40-006 | セクション 7.1 で使用した潤滑剤ゲル。他のサプライヤーも入手可能です。 |
| Kartell Plastilab 不均一テーパーコネクタ | Fisher | 11914289 | のチューブを接続するために使用 |
| ッシャー | 10472643 | がる細菌の単一コロニーの計数用、すなわちプロテウスミラビリス | |
| マグネシウム六水和物(MgCl2.6H2O) | フィッシャー | 10386743 | |
| リン酸一カリウム(KH2PO4) | Fisher | 10573181 | |
| Nalgene Y字型コネクタ | Fisher | 10186070 | 1つのAUMリザーバーから複数のAUM回路を実行するために使用されます(タンクごとに1〜4モデル) 。 |
| 塩化カリウム (KCl) | フィッシャー | 10375810 | |
| パイレックス アスピレーター ボトル、すりガラス サイド ソケット付き、容量: 5000 mL | フィッシャー | 11347884 | AUM リザーバー |
| ボア付きゴム栓、外径: 37mm、赤、直径: 37mm | フィッシャー | 11517612 | AUM リザーバーで使用され、AUM |
| を備えた in vitro モデルを供給するために使用サイズ14 フレンチ100%シリコンフォーリーカテーテル、インフレーション用滅菌水シリンジ付き | グレートベアヘルスケア | 4833-0514 | |
| 塩化ナトリウム (NaCl) | フィッシャー | 10735921 | |
| シュウ酸ナトリウム (Na2C2O4) | Fisher | 10442211 | |
| Teknon Biocleanse 濃縮殺生物性クリーナー 5L | フィッシャー 12447580 | 後のモデル滅菌に使用 | |
| クエン酸三ナトリウム (Na3C6H5O7) | フィッシャー | 11434993 | |
| トリプトン大豆ブロス | フィッシャー | 10198002 | |
| 尿素(CH4N2O) | フィッシャー | 10404185 | |
| Uro-Tainer M NaCl 0.9% | B.Braun | FB99833 | セクション 7.2 で使用される生理食塩水膀胱洗浄ポーチ。 |
| ワトソン・マーロウ ポンプシル 内径1.6mmプラチナ硬化シリコーンチューブ | フィッシャー | 12406280 | 厚いAUM回路チューブ(パースタルティックポンプ用) |
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