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Research Article
Somayeh Mirzaaghaei1, Lidia Avalle1,2, Chiara Verrengia1, Jahnavi Srivatsa1, Laura Conti1, Marta Gai1, Chiara Fiameni3, Paolo Gontero4, Umberto Mortara5, Luca Molinaro5, Mauro Papotti5, Valeria Poli1
1Department of Molecular Biotechnology and Health Science,University of Torino, 2Department of Science and Technological Innovation,University of Piemonte Orientale, 3Division of Urology, Department of Surgical Sciences,University of Turin, 4Department of Surgical Sciences and Urology, Città della Salute e della Scienza di Torino,University of Turin, 5Department of Pathology,University of Turin, and AOU Città della Salute e della Scienza
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
このプロトコルは、根治的前立腺切除術から線維芽細胞を単離、増殖、および不死化するための包括的な手順を提供します。さらに、線維芽細胞と腫瘍細胞のクロストークの機能的効果を評価するために開発されたアッセイについても説明しており、条件付け培地による処理と共培養の両方を利用しています。
腫瘍間質は、腫瘍細胞によって積極的に形成され、腫瘍形成促進特性を採用できるため、がん研究の焦点となっています。間質成分の中で、がん関連線維芽細胞 (CAF) は、多くの場合、腫瘍微小環境 (TME) で最も豊富な細胞型であり、腫瘍細胞や他の間質成分との相互作用を通じてがんの進行を促進する上で極めて重要な役割を果たします。これらの相互作用の背後にあるメカニズムを解明するには、CAF を単離および特徴付けるための堅牢な方法が必要であり、これは新しい CAF 標的がん治療法の開発の基礎を築くこともできます。この研究は、前立腺がん (PCa) 患者から得られた根治的前立腺全摘除術標本の腫瘍と隣接する正常領域の両方から線維芽細胞を単離する方法を提示します。このアプローチにより、CAFとその正常な対応物(NF)を同じ個体から同時に分離することができ、ペアの実験システムを提供します。下流の in vitro 分析のための一次 CAF および NF の維持、および長期研究を促進するための不死化のための詳細なプロトコルが提供されています。また、増殖、遊走、固定非依存性増殖などのがん細胞の挙動に対するCAFとNFの効果を比較するように設計された機能アッセイについても説明します。線維芽細胞由来のコンディショニング培地(CM)によるがん細胞の治療、および線維芽細胞と腫瘍細胞との直接共培養の2つの補完的なアプローチが詳述されています。これらの方法論を組み合わせることで、PCa だけでなく、潜在的にさまざまなヒトがんにわたる CAF と腫瘍細胞の間の動的な相互作用を調査するための包括的なツールキットを表しています。さらに、これらの相互作用の分子特性評価により、CAF 駆動の発癌の重要なメディエーターが明らかになり、治療介入の有望な標的が提供される可能性があります。
前立腺がん (PCa) は、世界のほぼ 3 分の 2 の国で男性で最も頻繁に診断されるがんです。2022年には、世界で約150万人の新規感染者が報告され、39万7,000人が死亡した。これらの数字により、PCa は男性のがん関連死亡の 2 番目に多いがんであり、5 番目に多い原因となっています1.
PCa は多巣性で生物学的に複雑な疾患であり、腫瘍間の実質的な不均一性 2,3,4、多様な分子サブタイプ、およびさまざまな臨床転帰 5,6 を特徴とし、これらはすべて予後と治療反応に大きな影響を与えます7。
前立腺腫瘍の開始と進行における腫瘍微小環境 (TME) の重要な役割は十分に確立されていますが 8,9、腫瘍細胞と周囲の間質コンパートメントとの間の分子相互作用は完全には理解されていません。前立腺腫瘍微小環境 (TME) が腫瘍の発生と進行に重要な役割を果たすことは十分に確立されていますが、腫瘍細胞と周囲の間質との間の分子相互作用は十分に定義されていません。TMEは、間葉系および免疫起源の間質細胞を含むさまざまな間質細胞で構成され、腫瘍由来のシグナルに応答して活性化され、その後腫瘍促進機能を獲得します10,11。これらの中で、がん関連線維芽細胞 (CAF) は、多くの場合、最も豊富な間質集団を表します。CAFは、細胞外マトリックス(ECM)のリモデリングに寄与し、腫瘍の増殖を促進し、がん細胞の浸潤と遊走を促進します4,11,12,13。CAF は、分泌因子と直接的な細胞間相互作用を通じて、増殖、浸潤、および治療抵抗性にも影響を与えます。特に、CAF は不均一な集団です。一般に腫瘍形成促進機能に関連していますが、一部のサブタイプは腫瘍抑制の役割を果たす可能性があります14,15。重要なことに、CAFの固有のマーカーが存在しないため、CAFの正確な識別と多様な役割の機能的解剖に課題が生じます12,16。
CAFと腫瘍細胞の間の機能的クロストークを調査するための堅牢なアプローチには、初代CAFと一致する正常線維芽細胞(NF)を単離し、増殖、遊走、コロニー形成、固定非依存性増殖などの腫瘍細胞の挙動に対するそれぞれの影響を評価することが含まれます17,18,19.この記事では、高リスクPCa患者の根治的前立腺全摘除術標本からCAFおよびNFを単離するための、洗練された再現性の高いプロトコルについて説明します。このプロトコルの重要な要素は、専門の泌尿器病理学者による腫瘍および無腫瘍領域の正確な同定と解剖であり、同じ患者から CAF と NF を導き出すことができます。この対応のあるサンプルアプローチは、線維芽細胞の表現型に影響を与える可能性のある腫瘍間の不均一性と個々の患者固有の変数を制御するのに役立ちます20、21、22。十分な腫瘍組織が利用可能であることを確認するために、グリーソンスコアが ≥7 の患者の標本に焦点を当てます。
単離された線維芽細胞の信頼性の高い表現型特性評価には、それらを他の細胞型、特に重複するマーカー発現を共有する可能性のある上皮細胞と区別するために複数のマーカーを使用する必要があります16。初代PCa線維芽細胞は通常、10〜15回の継代後に老化を起こし、長期分析を複雑にするため、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素(hTERT)23の安定した発現による細胞不死化のプロトコルも提示します。
腫瘍細胞に対する CAF と NF の機能的効果を調査するために、いくつかの実験戦略をテストし、最適化しました。CAFが分泌因子と細胞間直接接触の両方を通じて影響を及ぼすことを考えると24、2つの補完的なアッセイシステムが開発されています:(1)線維芽細胞条件培地(CM)による癌細胞の治療、および(2)線維芽細胞と腫瘍細胞の直接共培養。これらのアッセイは、増殖、固定に依存しない増殖、遊走などの主要ながん細胞特性を評価します。分泌因子の影響を標準化するために、CAFおよびNFからのコンディショニング培地を濃縮し、総タンパク質含有量に基づいて定量(conCM)しました。
これらのアッセイを通じて重要な機能的効果を実証することは、CAF 主導の腫瘍形成の重要なメディエーターの同定をサポートし、治療介入の潜在的な標的を提供することができます。
この研究は、イタリアのトリノにあるチッタ デッラ サルート モリネット病院の生命倫理委員会によって承認された、臨床サンプルの使用に関する施設のガイドラインに完全に準拠して実施されました。すべてのサンプルは、参加患者によるインフォームドコンセントへの署名後に採取されました。次のセクションでは、がん関連線維芽細胞(CAF)およびそれらに一致する正常線維芽細胞(NF)の対応物を単離するための詳細なステップバイステップのプロトコルを提供します。このプロトコルには、腫瘍および隣接する非腫瘍領域の解剖、組織処理、細胞培養、および単離された細胞の表現型および機能的特性評価の両方が含まれます。すべての手順は、認定されたバイオセーフティキャビネット内の無菌条件下で実行する必要があります。細胞は、特に明記されていない限り、10%ウシ胎児血清(FBS)、100 U/mLペニシリン、および100 μg/mLストレプトマイシンを添加した完全なダルベッコ修飾イーグル培地(cDMEM)を使用して、5%CO2 を含む加湿雰囲気で37°Cで培養しました。すべての遠心分離ステップは、ブレーキをかけた状態で実行されます。プロトコル全体で使用される試薬、材料、および機器の包括的なリストについては、 材料表 を参照してください。この方法論は、グリーソンスコアが 4+3 以上の高リスク前立腺がん標本に最適化されています。
1. 外科的サンプルの解剖
注: この手順は、高悪性度前立腺がん (PCa) 患者に対して実施された根治的前立腺全摘除術 25 から採取された手術標本に対して実施され、内部の施設ガイドラインおよび確立された国際文献およびベスト プラクティス26、27、28 に基づいて、標準化されたプロトコルに従って管理されました。
2.線維芽細胞の分離
注:以下のすべての処理手順は、特に明記されていない限り、4°Cの氷上で実行する必要があります。スキームについては、図 1 A を参照してください。
3. 培養条件
4. FACS解析
注:このプロトコルは、線維芽細胞集団の信頼性の高い特性評価を保証し、上皮細胞、内皮細胞、または免疫細胞からの潜在的な汚染を特定します。FACS分析は、 図2Aに示すように、伝代2で実行されます。
5.線維芽細胞の不死化
注:CAFおよびNF集団の不死化は、hTERT発現レトロウイルスベクターによる安定した形質導入によって達成されます。以下は、感染性偽ウイルス粒子を調製し、細胞を形質導入するためのプロトコルです。
6.線維芽細胞の特性評価
7. コンディショニング培地の調製と濃縮
注:コンディショニング培地は、異なる細胞間の比較を容易にするために、収集後に濃縮され、正確に投与されます。
8. 増殖アッセイ
注:細胞増殖(DU145またはLNCaPヒトPCa細胞株を使用)は、腫瘍細胞をconCMで処理するか、CAFまたはNFと共培養するかの2つの異なる設定で生細胞分析装置を使用して評価しました。この場合、蛍光腫瘍細胞を使用する必要があります。代表的な結果を 図3に示します。
9. 創傷治癒移動アッセイ
注:ここでは、生細胞分析装置を使用して細胞遊走を測定するために、古典的なスクラッチアッセイ33の自動化バージョンが提示される。
10. 軟寒天アッセイによる固定非依存性成長
7 人の高悪性度 PCa 患者からの CAF と NF のペアは、このプロトコルで単離に成功しました。患者の手術年齢とグリーソンスコアを表 3 にまとめます。由来線維芽細胞集団の純度を評価するために、継代2つの一次CAFおよびNFを分離し、示された蛍光抗体またはヨウ化プロピジウムで染色し、アポトーシスを評価しました。その後のFACS分析の代表的な結果を図2Aに示し、ゲーティング戦略と各マーカーに対して陽性の細胞の割合を強調しています。分析には、上皮細胞 (EpCAM)、内皮細胞 (CD31)、免疫細胞 (CD45)、および活性化線維芽細胞 (CD90) のマーカーが含まれていました。この結果は、細胞が上皮、内皮、または免疫細胞マーカーに対してほとんど陰性であり、CAF活性化のマーカーと考えられているCD90に対してさまざまな陽性を示したため、純粋な線維芽細胞の単離が成功したことを確認しています35,36。多くの場合、特に初期継代では、図2Bに示すように、CAFはNFと比較してより紡錘体のような形態を示しました。しかし、これらの形態学的違いは、その後のパッセージで減少する傾向がありました。
DU145細胞増殖に対するCAFおよびNFの効果を評価するために、増殖アッセイは、PCa細胞をCAF/NFペアのconCMで処理するか(図3A、B)、またはPCa細胞と線維芽細胞を1:3の比率で共プレーティングするか(図3C、D)。生細胞分析装置オレンジフィルターで特異的に検出できる蛍光RFP-DU145細胞を使用することで、2つの細胞タイプを区別することができました。示された実験は、同じ患者に由来するCAFとNFを使用して実行されました。どちらのアプローチも、線維芽細胞の増殖促進活性を実証する可能性があります。ただし、CAFとNFの違いは、グラフに明確に示されているように、主にconCMアプローチで明らかでした(図3B、D)。異なるCAF/NFペアからのconCMのさまざまな効果を 図3Eに示します。
アンカレッジに依存しない成長は、転移能力の代用としてよく考えられる特徴です。PCa細胞の固定非依存性増殖に対するCAF/NFの効果を評価するいくつかの方法の中で、線維芽細胞と腫瘍細胞を直接接触せずに共培養することによって最良の結果が得られました。線維芽細胞を12ウェルプレートに播種し、cDMEM中の0.9%軟寒天培地の層で覆い、その上に0.45%軟寒天培地cDMEM中の腫瘍細胞を層状にしました。コロニー形成は12日間にわたって監視されました。得られたDU145コロニーの代表的な画像を、さまざまなサイズのコロニー数を分析した対応するグラフとともに、 図4Aに示します。注目すべきは、CAFとNFの両方が、線維芽細胞フィーダー層なしでプレーティングされた対照細胞と比較して、DU145細胞のコロニー形成能力を同様に刺激することができたことです。コロニーも大きくなる傾向があり、増殖の増加を示唆しています。このアッセイで時折遭遇する問題の1つは、おそらくプレーティング時の軟寒天の密度または温度が正しくないことが原因で、線維芽細胞層の早期剥離です。これらの場合、実験は中止されました(図4B)。
著者らは、競合する利益はないと宣言している。
このプロトコルは、根治的前立腺切除術から線維芽細胞を単離、増殖、および不死化するための包括的な手順を提供します。さらに、線維芽細胞と腫瘍細胞のクロストークの機能的効果を評価するために開発されたアッセイについても説明しており、条件付け培地による処理と共培養の両方を利用しています。
この研究は、イタリアがん研究協会 (AIRC) によって支援され、副大統領にIG16930およびIG24851されました。イタリア大学研究省(MIUR PRIN 2017および2022から副大統領へ)。リヒテンシュタインのトゥルース・アンド・ゲリット・ファン・リムスダイク財団、副大統領への寄付。ピエモンテ地方(偏向)。A.S.はイタリアがん研究財団(FIRC)のポスドクフェローシップの支援を受け、L.A.はウンベルト・ヴェロネージ財団の支援を受けました。 図2 BioRender.com で作った。
| 12ウェルプレート | ザルシュテット | 833921 | |
| 24ウェルプレート | ザルシュテット | 833922 | |
| 6ウェルプレート | ザルシュテット | 833920 | |
| 96ウェルプレート | ザルシュテット | 833924 | |
| 抗GAPDHマウスmAb(6C5) | シグマ・アルドリッチ | CB1001 | 出典:マウス;WBの希釈:1:1000 |
| aSMAの | シグマ・アルドリッチ | A5228 | 出典:マウス;WBの希釈:1:3000 |
| カベオリン | 細胞シグナル伝達技術 | CST3267 | 出典:ウサギ;WBの希釈:1:1000 |
| CD31-バイオブルー | ミルテニー・バイオテック | 130-119-980 | フローサイトメトリー抗体、内皮細胞マーカー |
| CD326-PE(EpCAM) | ミルテニー・バイオテック | 130113-826 | フローサイトメトリーAb、上皮細胞マーカー |
| CD45-FITC型 | ミルテニー・バイオテック | 130-110769 | フローサイトメトリーAb、パン白血球マーカー |
| CD90-APCの | ミルテニー・バイオテック | 130-114-903 | フローサイトメトリー Ab、線維芽細胞マーカー |
| コラーゲンVI(COL6A1) | アブカム | アブ182744 | 出典:ウサギ;WBの希釈:1:1000 |
| コニカルチューブ 15 mL | ザルシュテット | 62554502 | |
| コニカルチューブ 50 mL | ザルシュテット | 62547254 | |
| Cryopure 2 mLマイクロチューブ | ザルシュテット | 72380992 | |
| 培養プレート直径100mm | コーニング | 353003 | |
| 培養プレート直径100mm | コーニング | 353025 | |
| 培養プレート直径60mm | コーニング | 353002 | |
| ジメチルスルホキシド(DMSO) | シグマ・アルディルチ | D8418 | 生物学的フードでの使用 |
| ダルベッコ'の改造されたイーグル」s ミディアム (DMEM) | ギブコ | 11965092 | 4度で保管します。C、生物学的フードでの使用 |
| FAPの | アブカム | AB53066 | 出典:ウサギ;WBの希釈:1:500 |
| FcRブロッキング試薬、ヒト | ミルテニー・バイオテック | 130-059-901 | Fcブロッカー |
| ウシ胎児血清 (FBS) | ギブコ | 16000044 | 4度で保管します。C、生物学的フードでの使用 |
| フィルター付きチップ 10 & マイクロ;L | ザルシュテット | 703010255 | |
| フィルター付きチップ 100 & マイクロ;L | ザルシュテット | 703030255 | |
| フィルターチップ 1000 & micro;L | ザルシュテット | 703060255 | |
| フィルター付きチップ 20 & マイクロ;L | ザルシュテット | 703030265 | |
| フィルター付きチップ 200 & マイクロ;L | ザルシュテット | 703031255 | |
| フィルトロプール S プラス 0,20 & マイクロ;m | ザルシュテット | 831826102 | |
| 鉗子 | 2バイオール | 1102412 | |
| FSP1/S100A4 | 細胞シグナル伝達技術 | D9F9D (13018) | 出典:ウサギ;WBの希釈:1:2000 |
| IL6 | アブクローナル技術 | A0286 | 出典:ウサギ;WBの希釈:1:1000 |
| イメージJ | 国立衛生研究所 | バージョン1.53c | 画像解析用ソフトウェア |
| Incucyte ImageLock 96ウェルプレート | サルトリアス | BA-04857 | |
| Incucyte®SX5 | サルトリアス | SX5 | 生細胞分析装置 |
| リポフェクタミン 2000 トランスフェクション試薬 | サーモフィッシャーサイエンティフィック | 11668019 | 陽イオン脂質媒介トランスフェクション試薬 |
| MACS®ティッシュストレージソリューション | ミルテニー・バイオテック | 130-100-008 | |
| マイクロプレートリーダー(吸光度600nm) | プロメガ | GM3500型 | |
| マイクロチューブ 1.5 mL | ザルシュテット | 7269001 | |
| NCADの | アブカム | アブ18203 | 出典:ウサギ;WBの希釈:1:1000 |
| ニトロブルーテトラゾリウム | シグマ・アルディルチ | N5514 | |
| パラフィルム | シグマ・アルディルチ | HS234526B | |
| pBABE-puro-hTERT | アドジーン | 1771 | -20度で保管します。C、生物学的フードでの使用 |
| pCL-アンフォ | ノバスバイオロジカル | NBP2-29541 | -20度で保管します。C、生物学的フードでの使用 |
| PDGFRBの | サンタクルス | SC-432 | 出典:ウサギ;WBの希釈:1:1000 |
| ペニシリン-ストレプトマイシン (PS、10,000 &g/mL) | ギブコ | 15140122 | 4度で保管します。C、生物学的フードでの使用 |
| 位相差顕微鏡 | オリンパス | BX42 | |
| リン酸緩衝生理食塩水 (PBS) | ホームメード | NaCl、137 mM;KCl、2.7 mM;Na2HPO4、10 mM;KH2PO4、1.8 mM。オートクレーブしてRTで保管 | |
| ポリ-L-リジン溶液 | シグマ・アルディルチ | P8920 | 4度で保管します。C、生物学的フードでの使用 |
| ピューロマイシン二塩酸塩 | シグマ・アルディルチ | P8833 | |
| セキュラセミマイクロ天びん | ザルトリウス | SECURA125-1S | |
| 血清ピペット 10 mL | ザルシュテット | 861254001 | |
| 血清ピペット 2 mL | ザルシュテット | 861252001 | |
| 血清ピペット 25 mL | ザルシュテット | 861256001 | |
| 血清ピペット 5 mL | ザルシュテット | 861253001 | |
| ステータス3 | CST | 9139 | 出典:マウス;WBの希釈:1:1000 |
| STAT3 Y705 | CST | 9131 | 出典:ウサギ;WBの希釈:1:1000 |
| 実体顕微鏡 | ライカ | MZ125 | |
| シリンジ 10 mL | ペンタフェルテ | 00202260D12 | |
| テルモミキサー | エッペンドルフ | 22331 | |
| トリプシン-EDTA(0.5%)、フェノールレッドなし | ギブコ | 15400054 | |
| ヴィム | サンタクルス | SC-6260 | 出典:マウス;WBの希釈:1:2000 |
| Vivaspin 20遠心濃縮機 | シグマ・アルディルチ | Z614602 | MWCO 10,000 Da |
| ワーグナーハサミ | 2バイオール | 14070-12 |