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方法論記事

骨髄間葉幹細胞研究におけるシルトゥインファミリー:Web of ScienceとRを用いた文献計量分析

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DOI:

10.3791/68913

2025年12月30日

この記事について

サマリー

本研究は、Web of ScienceとRを用いて骨髄間葉質幹細胞研究においてSirtuinファミリーの研究傾向を特定するための文献計量プロトコルを提供します。

要約

本研究は、骨髄間葉系幹細胞研究におけるシルトゥイン(SIRTs)ファミリーの研究傾向と知識構造を体系的にマッピングするための包括的な文献計量プロトコルを提示します。このプロトコルは、Web of Scienceコアコレクションからあらかじめ定義された検索語を用いて構造化された文献検索、明示的な包含・除外基準の適用による英語論文やレビューのスクリーニング、そしてRのbibliometrixパッケージを通じた詳細な文献計量分析を含みます。主な方法論的ステップには、データの検索とクレンジング、記述的統計分析、キーワード共現評価、コラボレーションネットワークマッピング、テーマ別作成が含まれます進化と概念構造の地図。2009年から2024年までの496本の適格論文を分析したところ、年間論文数が著しく増加し、中国が主要な貢献国となりました。蘇州大学と著者のLI Yはそれぞれ最も生産的な機関と著者として選ばれました。高頻度キーワードには「間葉幹細胞」「酸化ストレス」「SIRT1」が含まれ、老化や酸化ストレスなどの運動テーマを強調するテーママッピングが行われました。この再現可能で透明性の高い方法論的枠組みは、現在の研究ホットスポットを明確にするだけでなく、大規模な文献統合のための厳密かつ拡張可能なアプローチを提供し、将来の科学的評価やトレンド評価を明確かつ再現性を高めて支援します。

概要

幹細胞は自己更新と分化が可能な未分化細胞であり、大きな治療的可能性を提供します。骨髄間葉系幹細胞(BMSC)などの成人幹細胞は、胚性幹細胞に比べてアクセスしやすく倫理的問題が少ないため、組織再生に広く利用されていますこれらは骨髄由来の非造血細胞であり、さまざまな細胞タイプに分化することができ、組織修復や疾患治療に関与しています2,3

成人幹細胞は骨髄、脂肪、皮膚など様々な組織に存在し、胚性幹細胞に関連する倫理的問題を回避します。これらの細胞は幹細胞プールを維持し、分化を通じて組織再生を支えます5,6。特に骨髄には間葉幹細胞が含まれており、損傷組織に移動し再生に寄与します7,8。応用例には、がん、椎間板変性症、免疫疾患の治療が含まれます。

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プロトコル

この研究は公開されている書誌データのみを使用し、人間や動物は対象外でした。したがって、倫理委員会の承認は必要ありませんでした。

1. 研究デザイン

  1. 骨髄間葉系幹細胞研究におけるSIRTsファミリーに関する公開文献の後ろ向き文献計量分析を実施します。
  2. WOSコアから文献を収集し、構造化された検索、スクリーニング、定量分析、書誌データの可視化を行います。

2. 文献の検索

  1. WOSコアを開き、SCI拡張データベースを選択します(すべての運用コードと検査ポイントは(補足ファイル1に記載されています)。
  2. 以下の検索戦略を用いてください:TS=(「間葉幹細胞*」または「間葉間質細胞*」または「骨髄間質細胞*」または「多能性間葉間質細胞」または「骨髄間充血幹細胞*」)およびTS=(「SIRT*」または「Sirtuin」または「Sirtuins」または「SIRT1」または「SIRT2」または「SIRT3」または「SIRT6」)
  3. 結果は英語の学術論文および総説論文のみを含むようにフィルターしてください。
  4. 出版日は2024年11月1日までに制限してください。
  5. 選択された参考文献を、....

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結果

一般出版データ

詳細な検索戦略を用いて、合計580本の記事がWOSコアコレクションから取得されました。事前定められた包含・除外基準を適用して、BMSCのSIRTに主に焦点を当てていない研究や、会議要旨などの無関係な出版物タイプを除除いた84件の記録や重複を除去した後、496件の適格論文が最終解析に含まれました。収録されたすべての記事は英語で発表され、BMSCの文脈におけるSIRTsファミリーに焦点を当てていました。

年間の出版量の傾向

最初の関連記事は2009年に掲載されました。2013年から出版量が大幅に増加し、2023年にピークを迎えました(n = 65)。この増加は、BMSC関連研究におけるSIRTの役割に対する世界的な関心の高まりを反映しています( 図1参照)。この傾向は.......

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ディスカッション

現在、SIRTsファミリーやBMSCに関する多くの研究がありますが、研究動向の包括的な総合は不足しています。シルトゥイン6は既知のSIRTsファミリーのユニークなメンバーであり、DNA修復、解糖、糖新生、腫瘍形成、神経変性、心臓肥大に関連するさまざまな分子経路で機能します(18,19)。その広範な規制上の役割は、加齢関連疾患やがん治療における主要なトランスレーショナルポテンシャルを示しています。SIRT6遺伝子のBMSCへのトランスフェクションは、特発性肺線維症における肝線維芽細胞の老化をパラクリンまたは分化機構を通じて緩和することが示されており、線維化性疾患に対する有望な細胞ベースの治療戦略を示唆しています。研究によると、SIRT6は活性化B細胞の核因子カッパ軽鎖増強子(NF-κB)シグナル伝達経路を活性化し、骨形成分化を促進することができる一方で、SIRT3はミトコンドリア機能を維持し.......

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開示事項

著者には開示すべき利益相反はありません。

謝辞

原稿準備中のご協力とフィードバックをいただいた研究グループの皆様に感謝いたします。

....

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材料

この記事で使用された材料の一覧
名前会社カタログ番号コメント
Windows 11オペレーティングシステムを搭載したコンピュータマイクロソフト社、ワシントン州レドモンド、アメリカ)
Rバージョン4.4.1、R Foundation for Statistical Computing、ウィーン、オーストリアBibliometrix(バージョン4.3.1)、GGPLOT2、igraph、ファクトエクストラ、ワードクラウドパッケージ

参考文献

  1. Henden, C., et al. NK cell cytotoxicity towards pluripotent stem cells and their neural progeny: impacts of activating and inhibitory receptors and KIR/HLA mismatch. Stem Cells. 42 (3), sxae083(2024).
  2. Zhang, Q., et al.

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再版と許可

タグ

間葉系幹細胞Rパッケージ酸化ストレスSIRT1老化キーワード共起