ファイバーフォトメトリーは、深部脳神経集団からカルシウム活動を記録するために最も一般的に用いられる技術の一つです。ここでは、マウスの深部脳神経集団からのカルシウム活動およびその他の動的蛍光信号を、カスタマイズ可能な多部位二色画像診断のプロトコルを説明します。
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ファイバーフォトメトリーは、深部脳神経集団からカルシウム活動を記録するために最も一般的に用いられる技術の一つです。ここでは、マウスの深部脳神経集団からのカルシウム活動およびその他の動的蛍光信号を、カスタマイズ可能な多部位二色画像診断のプロトコルを説明します。
ファイバーフォトメトリーは、光ファイバーケーブルを通じて信号を一括記録するもので、自由に動く齧歯類のニューロン群からカルシウム活動を記録する有効な方法です。特に、この方法は、より腹側でアクセスしにくい脳領域にある遺伝的に特定されたニューロンの小集団を標的化するのが容易な問題となります。なぜなら、細胞分解能での記録が依然として困難だからです。この技術はバンドルされたマルチファイバー方式を用いて複数の部位から同時に記録できるようにスケール可能であり、各記録部位で遺伝的戦略を用いて複数の細胞タイプを標的にすることができます。ここでは、マウスの社会的行動ネットワーク(最大12サイト)をターゲットにするためのカスタマイズされたマルチファイバーアレイの構築と挿入方法のプロトコルを提供します。このプロトコルは、カスタマイズされたマルチファイバーアレイを用いた複数の部位の成功した標的化に必要な外科的操作手順と、各部位で2つの遺伝子識別された神経集団を同時に撮影するための緑偏移・赤偏偏蛍光指標のウイルスアプローチを詳細に示しています。私たちは、市販の相補金属酸化半導体(CMOS)カメラシステムを用いて、社会的行動中にこれらの領域から記録する方法を実演します。さらに、このプロトコルは品質管理の手法を示し、ノイズ補正と標準化のための前処理パイプラインについても詳述しています。最後に、大規模な脳ネットワークに関する新しい発見を明らかにするためのツールの潜在的な応用例について議論します。
光ファイバー光度法は、光ファイバーケーブルを通じて蛍光信号を大量に記録する技術であり、深部脳領域における神経集団活動を測定する強力な技術として浮上しています。これらの領域は、顕微内視鏡や従来の電気生理学的アプローチでは容易にアクセスできないことが多いです。1,2,3。現代のシステム神経科学における主要な目標の一つは、行動生成に関与する大規模な細胞型特異的な脳ネットワークが用いる計算を特定し解明することです。ニューロピクセルプローブや市販の多繊維フェルールは、線形に整列した神経集団4,5,6,7の記録に優れており、広視野皮質イメージングは表層皮質の動態8,9の優れたカバレッジを提供します。しかし、空間的に分散しつつ機能的に接続された皮質下神経集団からの同時記録は技術的に依然として困難であり続けています。さらに、複数の単線維フェルールを用いて複数の深部脳構造を標的にすることも可能ですが、この方法は複数のフェルールを埋め込むことができるほど十分に離れた神経集団に限定されます。オーダーメイドのマルチファイバー光度アレイは、自由に行動する動物の多くの皮質下領域から最小限の制約で同時に記録できることで、複雑な行動中のネットワークレベルの調整を独自に観察できるというギャップを埋めます。
社会行動ネットワーク(SBN)は、大規模な脳ネットワークの動態を調査するのに理想的なシステムです。SBNは、社会的行動の生成に関与する密に相互接続され進化的に保存された皮質下構造の集合であり、すべての脊椎動物クラス13、14、15で同定されています。これらの構造には伝統的に、外側中隔、視前領域、終末線条の床核、前内側および腹内側視床下核、内側扁桃体、側隔核、および水道管周囲の灰色13,14,15が含まれますが、これらに限定されません。SBN内では、分子マーカーによって定義される特定の神経集団が社会的行動の調節において重要な役割を果たします。SBN ɣ-アミノ酪酸作動性(GABA作動性)ニューロン(小胞性GABAトランスポーター(VGAT)の発現で示される)およびグルタミン酸作動性ニューロン(小胞性グルタミン酸トランスポーター、VGlutの発現で示される)は、ネットワーク内の主要な興奮性および抑制性細胞タイプであり、社会的行動の調節において解離的な役割を果たす可能性が高いです 16,17,18,19.これらの古典的な神経伝達物質システムを超えて、性ホルモンシグナル伝達はネットワークの機能において重要な役割を果たします。例えば、多くの男女の社会的行動はエストロゲン受容体αの発現を必要とし、SBNニューロンのこれらの受容体を発現する活動がこれらの行動を因果的に駆動します。16,20,21,22,23,24,25,26.さらに、SBNの神経集団はドーパミン、アルギニン・バソプレシン、オキシトシン、オピオイド、タキキニン、ニューロペプチドY、プロラクチン、オレキシン、アグーチ関連ペプチド、メラノコルチン、キスペプチン、ゴナドトロピン放出ホルモン17,18,19,27,28,29,30など、多くの神経調節系のリガンドや受容体で豊かにされています。31、そして最近の遺伝子符号化センサーの進歩により、これら多様なシグナル伝達分子の多くを追跡できるようになりました。32,33,34,35,36,37,38。SBNの神経集団は皮質下構造全体に空間的に分散しているため、従来の実験的準備(例:細胞外電気生理学、皮質表面イメージング、以前の多繊維光度測定法)では、この大規模な脳ネットワーク全体の瞬間ごとの活動動態を捉えることはできません。それにもかかわらず、遺伝子的に定義された神経集団におけるカルシウム動態と神経調節因子の放出パターンを監視することで、特注のマルチサイトファイバーフォトメトリープラットフォームは、特定の細胞タイプやシグナル分子が社会行動の特定の特徴をコードしているかを明らかにし、新たなメカニズム的洞察を提供します。
ここでは、自由に行動するマウスの最大12の脳領域から同時に記録できる、複数サイト・2色ファイバーフォトメトリー用のカスタマイズ可能なプラットフォームを開発しました。この手法を用いて、11のSBN脳領域に分布する22の特定された神経集団からカルシウム活性の2色光度測定を記録し、同時にGPCR活性化ベースDAセンサー(GRAB-DA1m)33を用いた側座核のドーパミン変動の測定も行いました(表1)。このプロトコル(図1)は、カスタマイズされたマルチファイバーアレイの構築、複数の深部脳部位を標的とする外科的手順、二重カルシウム指標(GCaMP39およびRCaMP40)を表現するためのウイルス送達戦略、市販のCMOSカメラベースのファイバーフォトメトリーシステムを用いたデータ収集、品質管理手法、ノイズ補正および信号標準化のための前処理パイプラインを詳述しています。特に、前処理パイプラインにはアイソスベスト制御波長記録が組み込まれており、これによりモーションアーティファクトの修正が可能です。回帰分析に基づくアプローチ41を用いて、移動アーティファクトを補正し、騎乗や戦闘などの激しい社会的行動中に信号の忠実度を確保します。我々の特注マルチファイバー光度法は、近位および遠位の深部脳構造に分散した活動を同時に監視しつつ、遺伝的ターゲット化による細胞型特異性を維持できるため、深部脳の大規模脳ネットワークにおける神経活動動態の記録において、他に比べて大きな利点を提供します。
このプロトコルは、空間的に分散した皮質下脳領域(≥4サイト)からの同時記録を必要とする自由行動動物の実験に最適です。特に遺伝的に定義された細胞型のネットワークレベルの動態を調査したり、神経活動と並行して神経調節因子の放出を追跡したりする際にです。このアプローチは、激しい動きを伴う自然主義的行動(例:社会的相互作用)の研究に特に有用であり、私たちのモーションアーティファクト訂正パイプラインによって信号の忠実度が保証されます。しかし、単一細胞分解能、体細胞信号と軸索信号の区別、表層皮質領域からの記録を求める研究者には、ミニチュア顕微鏡、ニューロピクセル、広視野イメージングなどの代替手法の方が適している場合があります。主な実務的考慮点には、手術の複雑さ、カスタムマルチファイバーアレイ製造の必要性、必要な材料インフラ(3Dプリンティング機能、光ファイバーツール)の確立が含まれます。
注:このプロトコルは8週から25週の成体マウスを用いて試験および検証されました。マウスは21〜26°C、湿度30%〜70%の環境で、12時間の逆暗光サイクル(オフ:午前10時;オン:午後10時)。実験は主観的な活動期(暗い)期間のみに行われました。食料と水は 自由に提供されました。すべての動物処置はプリンストン大学の施設動物ケア・使用委員会によって承認され、国立衛生研究所の基準に従っていました。
1. マルチファイバーアレイおよびパッチコードの製造(図1A)

2. 手術(図1B)
3. 多部位、二色カルシウムイメージング(図1C)
4. データ処理(図1D、補足ファイル9)


最大12のSBN脳領域から同時に記録するために、上記のプロトコルに従ってカスタマイズ可能なマルチファイバーアレイを構築しました。手術後の回復後、マウスは社会的相互作用中に記録されました(図5)。すべての実験において、CD1被験者のオスマウスは自宅ケージ内の雄Balb/cマウスと相互作用することが許可されました。Vgat-Creマウスを用いて、GABA作動性ニューロンで11のSBN脳領域でcre依存的にjRCaMP1b40を発現させ、同じ脳領域で非GABA作動細胞でCre排除方式でGCaMP6f39を発現させ、同じ脳領域45でGRAB-DA1m33を発現させました(表1)。線維ターゲティングの組織学的確認は、過去の論文42,43で確認できます。ここでは、動きのアーティファクト訂正のためのさまざまな手法の性能を検証しようとしました。具体的には、以下を比較しました:(1) 中央値フィルター単独;(2) 同じ繊維のアイソスベスト信号のみを用いたL1正則化を用いたラッソ回帰(単一予測器アプローチ)11および(3) すべての繊維からのアイソスベスト信号を予測子として用いるラッソ回帰(マルチ予測器アプローチ)41,42(図4A)。重要なのは、Lassoベースの手法は、アイソスティック周波数(415nm)LEDに応答して生成される活性非依存蛍光信号を用いて生信号を補正するのに対し、中央値フィルター平滑化は活性に依存しない信号を考慮しない点です。
モーション補正は絶対高周波ノイズとジッターの2つの異なる指標を用いて評価しました。高周波ノイズは、信号の一階微分の標準偏差として定義され、これは急速な信号変動の大きさを反映しています。ジッターは信号の微分の変動係数として定義され、フレームごとの信号変動の大きさを信号の微分の平均に対して反映しています。Lassoベースのアプローチ(単一予測器および多重予測器)は、高周波ノイズとジッターの低減において中央値フィルターを大幅に上回っており、マルチ予測因子補正は単一予測因子補正をわずかに上回ることが分かりました(図4C–D; 高周波ノイズ、18回の記録セッションで23信号に対してn=414:Kruskal-Wallisテスト、H = 501.9420、p < 0.001;ポストホックのMann-Whitney大学によるボンフェローニ補正:平滑化回帰 vs 単一サイト回帰 ***p < 0.001、平滑化回帰 vs 多サイト回帰 ***p < 0.001、単一サイト vs マルチサイト **p = 0.0073;ジッター:クルスカル・ウォリス検定、H = 495.6685、p < 0.001;ポストホック・マン・ホイットニー大学検定(ボンフェローニ補正付き):平滑化回帰 vs 単一サイト回帰 ***p < 0.001、平滑化回帰 vs 多サイト回帰 ***p < 0.001、単一サイト vs マルチサイト ***p = 0.0006)。具体的には、マルチプリメンタアプローチ(すべてのファイバーアイソスベストスを用いる)は、赤チャネル(RCaMP)信号に対して有益性を示しました。12個中5個の赤色信号は単一予測因子補正(n=18記録/領域)と比較して有意に低い残留ノイズを示しました。ジッターについては、BNST(t検定、t = 5.42、***p < 0.001)、POA(t検定、t = 2.68、*p = 0.011)、AH(t検定、t = 2.66、*p = 0.012)、PAG(マン・ホイットニーU検定、U = 279、***p < 0.001)で多重予測因子優位性が示されました。高周波ノイズに関しては、BNST(マン・ホイットニーU検定、U = 285、***p < 0.001)、POA(マン・ホイットニーU検定、U = 292、***p < 0.001)、AH(t検定、t = 7.10、***p < 0.001)、PAG(t検定、t = 13.72、***p < 0.001)、LHb(t検定、t = 5.47、***p < 0.001)が多重予測子の優位性を示しました。グリーンチャネル(GCaMP)信号では、ジッターまたは高周波ノイズ指標において12領域すべてにおいて、2つのLassoアプローチに有意な差は認められませんでした(いずれもp>0.05、統計検定の全リストは 表3参照)。これは、二色光度測定において、クロスチャネルのアイソスベスト情報を取り入れることで赤信号のモーション補正が改善されることを示唆しており、おそらくグリーンチャネルアイソスベストスティックがよりクリーンな動き情報を提供するためです。これらのデータは、アイソスベストスティックベースの回帰法を用いたモーションアーティファクト補正が単純なフィルタリング手法を大きく上回り、マルチチャンネル回帰がデュアルカラー録画に特有の利点をもたらすことを示しています。

図1。ソーシャル・ビヘイビア・ネットワークからの多拠点二色ファイバーフォトメトリーによる記録。(A) マルチファイバーアレイの構築方法の回路図表現。 (B) 手術ワークフローの回路図表現。 (C) 二色カルシウムイメージング実験の概略的表。 (D) アイソスベスト信号を用いて動作補正信号を計算する例。 この図の拡大版はこちらをクリックしてご覧ください。

図2。製造および手術のための主要な手技の画像。(A) 録音用に使えるパッチコード。 (B) 0.25 mm x 5.5 mmのドリルビットをファイバースルーホールの上に配置したカスタムの立体視定位ホルダーにマルチファイバーアレイを設置します。 (C) すべてのファイバー貫通孔をクリアし、六角ナットを接着したマルチファイバーアレイ。 (D) ファイバースクライクを使ってファイバーを切断する。 (E) すべてのファイバーをスーパーグルーで貼り付け、カスタム研磨パックに配置したマルチファイバーアレイ。 (F) パッチコードコネクタをマルチファイバーアレイに合わせてねじ込む拡大図。 (G) ダウエルピンを貼り付けた完成型マルチファイバーアレイ。 (H) 頭蓋骨を露出させるために頭皮を切開した立体定位フレームにマウスを固定。 (I) 手術中に多繊維アレイを操作するために立体定位マニピュレーターに接続された製作されたマルチファイバーアレイ。 (J) 脳内に降ろされるマルチファイバーアレイの拡大図。 (K) マルチファイバーアレイを完全に下げて頭蓋骨にデンタルセメントで固定。 (L) 記録前にパッチコードにしっかり接続された動物のマルチファイバーアレイ。 (男性) 収録前後にパッチコードで繋がれたケージ内の動物のズームアウトビュー。 この図の拡大版はこちらをクリックしてご覧ください。

図3。スペクトル分離。カルシウム指示器間のスペクトルクロストークが最小限であることを示すトレースの例。GCaMP6f(青色)信号は470 nm励起時に強靭な活性化を示しますが、560 nm励起では無視できるほどの応答を示します。jRCaMP1b(赤色)信号は逆パターンを示し、560 nmからは強い活性化を示しますが、470 nmの照射には最小限の応答を示します。(A) GCaMP6fおよびjRCaMP1b信号を470 nm照射のみで同時に記録。(B) (a)と同じですが、560 nmの照射のみです。この図の拡大版はこちらをクリックしてご覧ください。

図4。多ファイバー信号処理の異なる手法の比較。(A) 多サイト回帰に基づく光度信号補正を描いた回路図。このアプローチは、利用可能なすべての415nmアイソスベスト信号を各カルシウム依存信号に線形にマッピングする逐次処理ステップを含みます。この信号から予測された運動成分を差し引いて、最終的な活動の読み取り値を算出します。2つの信号から、動きアーティファクトが強く存在するzスコアのΔF/F信号。(B)上から下へ:同じファイバー/イメージングチャネルからのアイソスベスト信号(運動アーティファクトを描写)、平滑化のみのRCaMP(左)またはGCaMP(右)信号(中央値フィルタリング済み、緑)、同じファイバー/イメージングチャネル回帰補正信号(シアン)、多ファイバー回帰補正信号(青)。(C) 左:各記録信号(n = 21セッション)の平均高周波ノイズスコア。高周波ノイズは各信号の一次微分の標準偏差として計算されます。ノイズスコアは、1) ベースライン補正されたが補正されていない信号(グレー)、2) ベースライン補正かつ中央値フィルタリングされた信号(ピンク)、3) Savitsky-Golay平滑化によるベースラインおよび単一ファイバー回帰補正信号(シアン)、4) Savitsky-Golay平滑化によるベースラインおよび多ファイバー回帰補正信号(青)で示されています。中心:平滑化、単一ファイバー回帰、または多ファイバー回帰のみを用いた平均ノイズ除去割合で、23信号すべてに集約されたものです。除去されたノイズの割合は、補正によって生のノイズレベルと比べて、生のベースライン補正信号におけるノイズ全体のレベルに対して割合として計算されます。データはSEM±平均として報告されます(Kruskal-Wallis検定、H = 501.9420、p < 0.001;事後のMann-Whitney U検定とボンフェローニ補正:平滑化回帰 ***p < 0.001、平滑化回帰 vs 多サイト回帰 ***p < 0.001、単一サイト vs 多サイト **p = 0.0073)。右:単一ファイバーと多ファイバー回帰補正の結果、高周波ノイズが統計的に異なっている信号の割合(信号タイプ別に分けて)。23の信号それぞれについて、単一サイト補正後のノイズレベルを、独立t検定(正規分布の場合)またはマン・ホイットニーU検定(非パラメトリック代替法)を用いて複数サイト補正後のノイズレベルを比較しました。青色のセグメントは、複数サイト補正で単一サイト補正よりもノイズが有意に低い信号を示します(p < 0.05)。グレーの区間は補正方法間で有意な差がない信号を示します。シアンセグメントは、単一サイト補正によってノイズが大幅に減少した信号を示します。E: Vgat- GCaMP6f。DA:掴んで。I: Vgat+ jRCaMP1b。(D) (C) と同じですが、フレームごとの変動(ジッター)を示し、各信号の変動係数の微分として計算されます(Kruskal-Wallis 検定、H = 495.6685、p < 0.001;ポストホック・マン・ホイットニー U 判定(ボンフェローニ補正付き):平滑化回帰 vs 単一サイト回帰 ***p < 0.001、平滑化回帰 vs マルチサイト回帰 ***p < 0.001、単一サイト vs マルチサイト ***p = 0.0006)。統計検定および結果の完全な一覧については表3を参照してください。この図の拡大版はこちらをクリックしてご覧ください。

図5。二色ファイバーフォトメトリーのマルチサイト展示。 社会的行動中に同時に記録された複数の指標タイプの代表的な信号(居住者-侵入者テスト、侵入者進入時代)。トレースでは、同じ動物内の社会行動ネットワークサイトで正規化されずベースライン減算されたGCaMP6f(Cre陰性ニューロン)、jRCaMP1b(GABA作動性Vgat-Cre+ニューロン)、GRAB-DA1m(核伏位のドーパミンセンサー)が検出されました。 この図の拡大版はこちらをクリックしてご覧ください。
表1。各ターゲット社会行動ネットワーク脳領域ごとのウイルス座標と繊維長。この表をダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
表2。多サイトファイバー光度測定における運動アーティファクト補正手法の比較。 以下のモーションアーティファクト訂正手法の基礎原理、最適なユースケース、利点と限界:単純な線形回帰、L1正則化を用いたラッソ回帰(マルチ予測器アプローチ使用)、ベイズ生成モデリング、周波数ベースのスケーリング、反復重み付けされた最小二乗法。 この表をダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
表3。図4に用いられた統計検定の詳細と結果。この表をダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
補足ファイル1。パッチコードコネクタ用の3Dプリントファイル。このファイルをダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
補足ファイル2. 3D通孔のないパッチコードコネクターのプリントファイル。このファイルをダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
補足ファイル3. 3D立体定位掘削アクセサリーのプリントファイル。このファイルをダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
補足ファイル4。カスタム研磨パックの設計図。このファイルをダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
補足ファイル5. 3D 12のSBNサイトを対象としたマルチサイトフォトメトリーアレイのプリントファイル。このファイルをダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
補足ファイル6. 3Dスルーホールなしのマルチサイトフォトメトリーアレイのプリントファイル。このファイルをダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
補足ファイル7。DAQソフトウェア用のDAQ設定ファイル。このファイルをダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
補足ファイル8。フォトメトリーシステム用のビジュアルコーディングファイル。このファイルをダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
補足ファイル9。プロトコルStep 4およびモーションアーティファクト修正比較に使用されるPythonコード。 このファイルをダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
ファイバーフォトメトリーは、自由に動く動物の深部脳領域や特定の細胞タイプからの集団カルシウム活動を記録するための有用かつコスト効率の高い技術です。複数の脳領域から同時に記録することで、自然主義的行動や頭部固定型準備中の領域や投影間の動態を比較できます。ここでは、特注のファイバーアレイと市販カメラシステムを用いて、脳の皮質下「社会的行動ネットワーク」の最大12の脳領域から2色で記録する方法を詳述します。以下では、この手法を実装する際の重要なステップ、可能な修正案やトラブルシューティング戦略、そして既存手法と比較したその重要性と限界について論じます。
このプロトコルは主に3つの段階から成り立っています。まず、マルチファイバーアレイやパッチコードの製造では、立体定位座標にカスタム3Dプリント部品を穴開けし、その後ファイバーの挿入、研磨、品質管理を行い、≥75%の光透過率を確保します。正確な穴あけの位置合わせ(±0.03mmの精度)と徹底的な研磨が不可欠です。一般的な故障には、光の透過率が低い(<75%)やファイバーの通過穴の詰まりがあります。低効率は通常、切断時の繊維の汚れや不適切な研磨が原因です。解決策としては、挿入前に明視野顕微鏡下で各ファイバー端が無傷であることを確認(ステップ1.1.6.2)、完全なグリットグラデーション(6μm→0.01μm、ステップ1.1.6.1)による再研磨、ファイバークリーバーブレードの鋭さの確保などがあります。スループットを向上させるために、精密翻訳ステージを用いたカスタムファイバーカッティングジグやレーザーベースの切断システム(ステップ1.2.4)などのワークフロー変更を実施できます。高精度システムを備えた商業用3Dプリントメーカーは、手動の穴あけの必要性を減らすことができます(ステップ1.1.3–1.1.4、ステップ1.2.3)が、寸法精度はバッチごとに異なる場合があります。
次に、外科的埋め込みは頭蓋骨レベリング(許容±0.03mm)、11〜12箇所へのウイルス注射、多繊維アレイの埋め込み、その後セメント固定を行います。スカルレベリングが許容範囲を超えると、ターゲティングの精度が損なわれます。これは、前後の複数のポイントで8.25 mm離れた位置でピッチを測定し、±2.0〜2.5 mmの側方位置でロールを測定しつつ、耳バーが頭蓋骨を完全に安定させることで軽減できます。ウイルス注入マイクロピペット内の気泡は正確な投与を妨げ、マイクロピペット準備の再開始(ステップ2.9)を要求します。マルチファイバーアレイの埋め込み中は、頭蓋骨表面から上方にセメントピラミッドを作ってセメントピラミッドを組み立て(ステップ2.10.3–2.10.5)、十分な乾燥時間を確保(≥15分)を確保し、ファイバーチップとのセメント接触を避けてください。
第三に、記録およびデータ処理にはDAQシステムによるカメラ同期、LED電力キャリブレーション(0.1 mW/ファイバー、1.2 mW/12ファイバーパッチコード)、およびアイソスベスト制御による信号前処理が含まれます。ここで紹介するモーションコレクションパイプラインはLasso回帰を用いており、これはマルチチャネル予測器構成に適しており、情報のない予測変数を自動的にゼロに縮小し、アーティファクト訂正に意味のあるものだけを保持します。この特性は二色光度測定に特に有利です。赤と緑の両方のチャネルからのアイソスベスト信号を予測子として含めることで、Lassoは本物の動き情報を持つチャネルを選択的に活用し、同じファイバー補正単独と比べて赤チャネル(RCaMP)信号のノイズ低減を大幅に向上させます(図4C–D)).Lassoは最も有益な予測因子を自動的に特定するため、利用可能なすべてのアイソスベストチャネルを入力として使用することを強く推奨します。とはいえ、ラッソ回帰はいくつかの有効な補正手法の一つであり、代替案にはベイズ生成モデル46、頻度ベーススケーリング47、反復重み最小二乗法(IRLS)48があり、いずれも同等のアーティファクト削減をもたらすと考えられており、実装ガイダンスは 表2に示されています。最適化された前処理にもかかわらず持続的に信号品質が悪いのは、ハードウェアや外科的な問題を示している可能性が高く、ステップ1〜2を再検討すべきです
これらの手続き上の考慮に加え、デュアルカラーフォトメトリーはスペクトル分離に関連する追加の技術的課題ももたらします。二色光度測定で重要な考慮事項は、緑色と赤色カルシウム表示器のスペクトル重なりの管理です。GCaMPとRCaMPの発光スペクトルが重なり合うためスペクトルクロストークを完全に除去するのは難しいですが、インターリーブLED励起(GCaMPは470 nm、RCaMPは560 nm、アイソスベストは415 nm)と最適化されたバンドパス発光フィルターを用いた時間的多重化アプローチにより、この問題を大幅に緩和しています。実際には、クロストークは最小限に抑えられます。470nm刺激では赤色チャネルではほとんど活性が見られず、逆に560nm刺激では緑チャネルではほとんど活性が見られません(図3)。残留スペクトル重なりを懸念する研究者は、特定の指示器の組み合わせに基づいて最大スペクトル分離を持つ狭帯域通過発光フィルターを選択することで、さらにシステムを最適化できます。
大規模な神経記録の他の手法と比べて、特注の2色マルチサイトファイバーフォトメトリーは多くの重要な利点を提供します。まず、単線ファイバー光度測定1,2,3、現代の細胞外記録4,6、または皮質表面イメージング8,9は単一または空間的に制約された脳領域(例:皮質表面)に限定されますが、ここで共有するカスタマイズ可能な3Dプリント設計は、200μm光ファイバーで脳のどこにでも最大12の脳領域をターゲット化することを可能にします。比較すると、市販のマルチファイバーフェルール5,7は100μmの光ファイバーのみをサポートし、同様にフェルールの線形配列の真腹側にある限られた脳領域に制限されています。特定の脳領域からの標的化と記録に関しては、主なトレードオフはファイバーの直径と光度計システムの視野との間で起こります。200μmファイバーを備えた3Dプリントマルチファイバーアレイは、市販のマルチファイバーフェルールに比べて各サイトでより広い面積を記録します。現行のプロトコルでは、フォトメトリーシステムのカメラ視野は記録を200μmで12本の光ファイバーに制限しています。この制約は、最大60本のファイバーに対してファイバー径を100μmに縮小するか、より大きなカメラ対物レンズを持つカスタムフォトメトリーシステムを構築することで克服できます。
最後に、このカスタマイズ可能な2色多サイトファイバーフォトメトリープラットフォームは、11〜12の脳領域にわたる2つの遺伝的に異なる神経集団の神経活動動態を縦断的に追跡するために用いられています。 Vgat-creマウスにおいて、SBN集団間でCre依存的なRCaMPおよびCre排除GCaMPを発現するCre-in/Cre排除戦略を用い、攻撃的経験と観察の両方が将来の防御的社会的相互作用においてSBN全体の活動動態の共有パターンを促進することが示されました。同じウイルス戦略を Esr1-creマウスで用いて、エストロゲン受容体アルファ発現ニューロンと非発現ニューロンから記録したところ、領域特異的な社会行動パターンはSBN全体の社会行動コードのホルモン感受性の急速な再スケーリングと関連し、ホーム領域での行動関連活動を促進しました43。これらの領域特異的な行動やネットワークコードの違いは、オスマウスにおける循環テストステロンを必要とします。これらの研究はウイルスアプローチと単一のCreラインを使用していましたが、今後の研究では、交差ウイルスアプローチ、遺伝的に発現したカルシウム指標、または神経調節物質および神経ペプチドシグナル伝達の蛍光報告体などを活用してこれらの手法を拡張する可能性があります。
資金はNIH K99MH135212(E.M.G.へ)、NIH F32MH126562(E.M.G.へ)、DP2MH126375(A.L.F.へ)、NIH R01MH126035(A.L.F.へ)、NYSCF(A.L.F.へ)、サイモンズ財団(SCGB)(A.L.F.へ)、クリンゲンシュタイン財団(A.L.F.へ)、アルフレッド・P・スローン・フェローシップ(A.L.F.へ)、マクナイト財団(A.L.F.へ)から提供されました。 アレン研究所(A.L.F)。A.L.F.はニューヨーク幹細胞財団のロバートソン研究者です。
| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| #76 ドリルビット | ドリルビットシティ | #76 | |
| #78 ドリルビット | ドリルビットシティ | #78 | |
| #92 ドリルビット | ドリルビットシティ | #92 | |
| 0.01 & mu;Mグリット研磨シート | ソーラボ | LFCF2 | |
| 0.25 mm x 5.5 mm ドリルビット | ドリルビットシティ | カスタム製品 | 0.25 x 5.5 mmのドリルビット、製造会社に連絡 |
| 1 & mu;Mグリット研磨シート | ソーラボ | LF1D | |
| 12ファイバー分岐パッチコード | ドーリック・レンズ | CustomBBP(12)_200/220/3000-0.37 _5m_SMA-12xCL_LAF | |
| 200 & mu;M光ファイバー | ソーラボ | FT200UMT | |
| 3 & mu;Mグリット研磨シート | ソーラボ | LF3D | |
| 30 & mu;Mグリット研磨シート | ソーラボ | LF30D | |
| 6 & mu;Mグリット研磨シート | ソーラボ | LF6D | |
| 吸収性縫合 | エティコン | J421H | |
| 適応的反復重み付けされたペナルティ最小二乗文書 | グーグル | 該当なし | https://code.google.com/archive/p/airpls/ |
| 合金鋼のダウエルピン | マクマスター・カー | 98381a983 | |
| 行動監視カメラ | テレダインFLIR | ブラックフライS | |
| 盆栽 | 盆栽ソフトウェア財団 | バージョン 2.9.0 | |
| ブライトフィールド顕微鏡 | ライカ | ES2 | |
| ブルドッグクランプ | ファインサイエンスツールズ | 18038-45 | |
| DAQ | 計測コンピューティング | MC USB-200シリーズDAQ | |
| DAQソフトウェア | 計測コンピューティング | ダカミ | |
| ドリル | コップ・インストゥルメンツ | モデル1911 立体走位ドリル | |
| ファイバークリーバー | ソーラボ | XL411/CLVB | |
| ファイバー光度測定システム | 神経光度測定 | FP3002 | |
| ファイバー光度測定システムマニュアル | 神経光度測定 | 該当なし | ウェブページホスティングデバイスマニュアル:https://neurophotometrics.com/documentation |
| ファイバースクライブ | ソーラボ | S90C | |
| ファイバーストリッパー | ソーラボ | T10S13 | |
| 細かい鉗子 | ファインサイエンスツールズ | 11252-00 | |
| 細いハサミ | ファインサイエンスツールズ | 14084-08 | |
| G5ドライブスクリュー | オープンEphys制作サイト | OEPS-7105 | |
| G5ドライバー | オープンEphys制作サイト | OEPS-7121 | |
| GCaMP6f | PNIウイルス神経工学研究室 | EF1a-CreはGCaMP6f-WPRE-hGHpA より上がる | |
| グラブダ | アッドジーネ | hSyn-GRAB_DA1m-WPRE-hGHpA | |
| ヒートパッド | アドロイト医療用品 | HTP-1500 | |
| 暖房システム | ケント・サイエンティフィック | RT-0515 | |
| イソフルラン | コヴェトルス | 29405 | |
| jRCaMP1b | アッドジーネ | pAAV.Syn.Flex.NES-jRCaMP1b.WPRE.SV40 | |
| M0.6 真鍮製六角ナット | MetricScrews.us | 21614 | |
| メタボンドセメント試薬とツール | パーケル | S380 | |
| MicroFine ABSに似た樹脂3Dプリント | プロトラボ | カスタム製品 | 補足コードファイル1-3、5、6を参照 |
| ナノリットルインジェクター | ドラモンド・サイエンティフィック・カンパニー | ナノジェクトII | ナノリットルインジェクター |
| パラフィンワックスシート | アムコア | パラフィルムM万能ラボフィルム | |
| ピペッター | サーモフィッシャー・サイエンティフィック | 4641310N | |
| 研磨パック | プリンストン大学物理学科機械工場 | カスタム製品 | 補足コードファイル4を参照 |
| パワーメーター | ソーラボ | PM100D | |
| プラルーベ眼軟膏 | デクラ | P1490-1 | |
| パイソン | Pythonソフトウェア財団 | 該当なし | |
| パッチコード用のソフトプラスチックチューブ | マクマスター・カー | 3774N4 | |
| スピンビュー | テレダインFLIR | バージョン 1.25.0.52 | 挙動カメラを制御するイメージングソフトウェア |
| 立体定位フレーム | コップ・インストゥルメンツ | モデル1900 | |
| TMACのドキュメント | 該当なし | 該当なし | TMACコード:https://github.com/Nondairy-Creamer/tmac |
| 立体定位フレーム用のチューブ | サン・ゴバン | E-3603 | |
| ヴェポライザー | ケント・サイエンティフィック | VetFlo蒸気化器 |
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