ここでは、セフトリアキソン、メロペネム、ゲンタマイシンと組み合わせてカルバペネム耐性 大腸 菌分離株に対して、寒天希釈法を用いて相乗活性を評価するプロトコルを提示します。メロペンネムとゲンタミシンでは相乗効果が観察されましたが、セフトリアキソンでは見られませんでした。
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ここでは、セフトリアキソン、メロペネム、ゲンタマイシンと組み合わせてカルバペネム耐性 大腸 菌分離株に対して、寒天希釈法を用いて相乗活性を評価するプロトコルを提示します。メロペンネムとゲンタミシンでは相乗効果が観察されましたが、セフトリアキソンでは見られませんでした。
カルバペネム耐性エンテロバクテラルの治療選択肢が限られているため、併用療法の重要性が高まっています。本研究は、フォスフォマイシン耐性率を調査し、メロペネム、ゲンタミシン、セフトリアキソンと組み合わせてカルバペネム耐性 大腸 菌分離株に対するin vitroでの相乗的相互作用を評価することを目的としました。Dicle大学医科大学病院の臨床病棟および集中治療室の患者から採取した、尿、血液、吸引液、創傷、脳脊髄液、気管内穿刺液など様々な臨床サンプルから分離した60株のカルバペネム耐性 大腸菌 株が本研究に含まれました。種の同定は自動微生物同定システムを用いて行われました。抗生物質感受性検査およびカルバペネム耐性の確認は、エルタペネム、イミペネム、メロポネムを用いた椎間板拡散によって行われました。フォスホマイシン耐性および抗生物質間の相互作用は寒天希釈によって評価されました。さらに、寒天希釈ベースのプロトコルを用いて連続的な2倍濃度勾配で抗生物質の組み合わせを評価し、相乗効果、無関心、拮抗作用を判断するために分数阻害濃度指数(FICI)を計算しました。耐性率は、フォスフォマイシンが76.6%、メロペネムが61.6%、ゲンタマイシンが85.0%、セフトリアキソンが98.3%でした。フォスフォマイシン–メロポネム併用では分離株の35%、フォスフォマイシン–ゲンタミシンの組み合わせで33.4%、フォスフォマイシン–セフトリアキソン併用で1.7%の相乗相互作用が観察されました。フォスフォマイシン–メロペンネムの組み合わせでは、1株のみでアンタゴニシが検出されました。フォスフォマイシンとメロペンネムおよびゲンタマイシンの組み合わせは、カルバペネム耐性大腸菌に対してin vitroで相乗効果を示しました。これらの発見を確認するためには、さらなるin vitro研究が必要です。
エンテロバクテラレスファミリーは非常に多様なグラム陰性菌群を含み、その多くは臨床的に重要な役割を果たします。その中でも、大 腸菌 は臨床微生物学の実験室で最も頻繁に分離される種であり、尿路感染症、創傷感染、免疫不全患者の肺炎、消化器炎、新生児髄膜炎など、ほぼすべての臓器系に関わる感染症と広く関連しています。また、グラム陰性敗血症や内毒素介在性敗血症性ショックの主要な原因でもあります。人間の医学を超えて、 大腸菌 は重要な獣医病原体であり、馬を含むさまざまな動物種に呼吸器および全身感染症を引き起こし、ヒトおよび動物宿主に対する大 腸菌 の病因の宿主範囲の視点を拡大します2,3,4。
拡張スペクトラムのベータラクタマーゼ(ESBL)産生腸内細菌、特に大腸菌や肺炎菌は、死亡率の増加、入院期間の延長、医療費の増加と関連しています。抗生物質の広範な使用は、これらの微生物における多剤耐性(MDR)の主な要因です。耐性機構にはカルバペネマーゼ産生、ESBLs、アミノグリコシド修飾酵素(AMEs)、キノロン耐性をもたらす変異、ポリン系および排出系の変化が含まれます。大腸菌および肺炎クレブシエラでは、耐性は主にプラスミド媒介であり、水平遺伝子移動を促進します。このような耐性形質は、牛の分離株を含む動物由来の大腸菌でも報告されており、ワンヘルスの概念を支持し、人獣共通感染症の感染リスクの可能性を示しています2,3。
カルバペネムは重度の多剤耐性感染症の最終段階薬剤と考えられています。しかし、カルバペネム耐性エンテロバクテラル(CRE)は、世界的な健康上の大きな懸念事項として浮上しています。この耐性は主にクラスBメタロベータラクタマーゼを含むカルバペネマーゼによって媒介されており、広範な薬剤耐性および汎耐性表現型5に寄与しています。
MDR大腸菌株は治療の選択肢を著しく制限し、感染管理を複雑にします。これは臨床成績を改善するためには、併用療法などの代替治療戦略の必要性を強調しています。さらに、これらの耐性株は臨床現場だけでなく、乳製品などの食品源からも報告されています。これにより抗菌薬耐性の伝播の疫学的文脈が広がり、その拡散や臨床的影響を緩和するための併用療法の戦略が支持されます6,7。アミノグリコシド、ティゲサイクリン、ポリミキシンはMDR感染症で一般的に用いられる治療薬です8。 フォスフォマイシンは特に尿路感染症においてESBL産生菌大腸菌に対しても活性が示されています9。
1969年に初めて発見されたフォスフォマイシンは、初期の細菌細胞壁合成を阻害し、組み合わせ治療で有望な薬剤として再登場しています。フォスフォマイシンとアミノグリコシドまたはβ-ラクタムとの相乗効果はMDR生物で報告されています11,12。さらに、フォスフォマイシンは大規模な臨床コホートで評価されており、単独または併用治療で重篤な感染症に対して有効性が示されています13。しかし、これまでの多くの研究は多様な細菌集団を含み、カルバペネム耐性大腸菌に特化したデータは限られています。
標準的な抗菌薬感受性検査には寒天希釈、ブロス希釈、ディスク拡散があります。寒天希釈ベースの併用検査により、MICsの決定とFICIの計算により抗菌相互作用の定量的評価が可能になります。タイムキルや勾配拡散などの代替手法は動的または簡略化された相互作用データを提供しますが、再現性や標準化に異なっている場合があります(13,14)。 このプロトコルは、定義された抗生物質の組み合わせのコントロールされたin vitro評価に最も適しています。しかし、生体内薬理動態の条件を十分に反映しているわけではありません。その中でも、寒天希釈はMIC決定の基準法と考えられています。しかし、カルバペネム耐性大腸菌に対するフォスフォマイシンの併用活性評価における利用は限られています。
本研究は、臨床的に確認されたカルバペネム耐性大 腸 菌分離株に対するフォスホマイシンベースの併用を体系的に評価します。標準化された寒天希釈チェッカーボード法を用い、制御されたin vitro条件下で直接比較相互作用データを生成しました。
したがって、本研究はフォスフォマイシンとメロペン、ゲンタミシン、またはセフトリアキソンを組み合わせて、CRE大腸菌分離株に対してin vitroで相乗効果を示すという仮説を検証します。
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本研究の承認は、ディクレ大学医学部の非介入臨床研究倫理委員会から取得されました(決定番号:100、日付:2021年1月1日)。
以下のプロトコルは、カルバペネム耐性 大腸菌 分離株に対するフォスフォマイシン併用シナジーを評価するための標準化された寒天希釈チェッカーボード法を説明しています。
分離株のコレクション
2021年2月15日から12月15日の間に、Dicle大学医科大学病院の入院患者から採取された尿、血液、吸引液、創傷、脳脊髄液、気管内穿刺液など様々な臨床検体から分離された合計60株のカルバペネム耐性大腸菌株が対象となりました。同定はMALDI-TOF質量分析システムを用いて行われました。同じ患者から複数の分離株が回収された場合、最初の分離株のみが含まれていました。外来クリニックおよび入院期間48時間未満の患者のサンプルは除外されました。研究期間中に事前に定められた納入基準を満たしたカルバペネム耐性大腸菌分離株はすべて連続して含まれました。したがって、サンプルサイズは利用可能な適格分離株の総数によって決定され、事前のサンプルサイズ計算は行われていません。大腸菌ATCC 13846および大腸菌ATCC 25922が品質管理株として使用されました。品質管理株は臨床分離株と並行して同一寒天希釈条件下で試験されました。すべてのランは2人の独立したオブザーバーによって評価されました。品質管理株の結果はすべての実験で期待される成長抑制パターンを示し、範囲外や無効な結果は観察されませんでした。
臨床分離株を含むすべての手技は、バイオセーフティレベル2(BSL-2)の条件下で実施されました。適切な個人用防護具(白衣、手袋、目の保護具)を使用し、すべての操作は認証された生物安全キャビネット内で行われました。
種の同定と抗菌薬感受性検査
カルバペネム耐性および抗菌感受性検査は、自動微生物同定・感受性検査システムを用いて実施されました。システムで検出されたカルバペネム耐性は、エルタペネム、イミペネム、メロペンネムのディスクを用いたディスク拡散試験で確認されました。ゾーン直径はEUCASTブレークポイント16,17(表1)に基づいて解釈されました。すべての分離株は20%グリセロールを含むトリプティック大豆ブロスに保存され、−20°Cで保存されました。
表1:ディスク拡散試験(DDT)により大 腸菌 のカルバペネムのゾーン径ブレークポイントが決定されました。 カルバペネム感受性検査に使用されるディスク拡散解釈基準。 この表をダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
小児および好気性サンプルに適した血液培養ボトルは、自動血液培養システムで培養されました。陽性ボトルはEMB寒天、5%羊血寒天、サブローデキストロース寒天に亜培養されました。
尿および気管内吸引液サンプルは定量的方法で培養され、他のサンプルは半定量的方法で処理されました。気管内吸引サンプルはグラム染色を用いて評価され、バートレットスコア>0、マレースコア>3のサンプルのみが有意とみなされ、18含まれました。
創傷サンプルについては、Qスコアリングシステムに従ってグラム染色評価が行われました。Qスコアが0を超えるサンプルは19名含まれました。
細菌分離株はマトリックス支援レーザー脱着/飛行電離時間質量分析法で同定されました。属および種レベルの同定において≥2.0のスコアが信頼できるとされ、1.7から2.0のスコアは属レベルの信頼できる同定を示す20,21。スコア≥2.0の分離株のみが含まれていました。
寒天希釈法によるフォスフォマイシン感受性の決定
欧州抗菌感受性検査委員会(EUCAST)によると、エンテロバクタレレアレファミリーのメンバーにおけるフォスフォマイシン感受性の判定には寒天希釈法が推奨されています16。
フォスフォマイシンおよびその他の抗生物質作用液の調製
寒天希釈法では、粉末状のフォスフォマイシン二ナトリウム塩水和物が用いられ、希釈には滅菌蒸留水が用いられました。各抗生物質に対して、EUCASTが定めるMIC限界値より4倍、さらに3倍の希釈が計画されていました。
フォスフォマイシンストック溶液(2560 μg/mLを含む)は、20 mLの無菌蒸留水に51.2 mgの無菌フォスフォマイシンジナトリウムを溶解し、体積/重量/効力の式(体積 (mL) = 重量(mg) × 有効性(μg/mg)/濃度(μg/mL))で計量し、無菌条件下で計量して調製しました。最終濃度はMHAを加えた際のストック溶液を10倍に希釈した結果、256 μg/mLと計画されていました。
これに応じて、フォスフォマイシン(2-256 μg/mL)、メロペネムおよびゲンタミシン(0.125–16 μg/mL)、セフトリアキソン(0.0625–8 μg/mL)の希釈範囲が決定されました。
希釈は、10mLの滅菌蒸留水を含む無菌円錐管で連続的に2倍希釈することで調製されました。チューブ内で合計7回の連続2倍希釈が行われ、濃度が2 μg/mLに達するまで実施されました。最後のチューブに残った10mLは廃棄されました。その結果、抗生物質濃度は256、128、64、32、16、8、4、2 μg/mLの8種類に分けられました。
他の抗生物質にも同様の方法が用いられ、初期のストック溶液を調製しました。セフトリアキソンは1.6mg、メロペネムとゲンタミシンは3.2mgを精密スケールで計量しました。各抗生物質ごとに7回の希釈が行われました。したがって、メロペネム、ゲンタミシン、セフトリアキソンに対して8種類の異なる抗生物質希釈濃度が得られました(図1)。

図1:フォスホマイシン希釈溶液の調製手順。 作業濃度を得るために連続希釈のステップが用いられました。 この図の拡大版はこちらをクリックしてご覧ください。
寒天培地の調製
陽イオン調整済みミューラー・ヒントンアガー(CAMHA)は、製造元の指示に従って調製されました。121°C、1気圧でオートクレーブで15〜20分間滅菌され、その後45〜55°Cの水浴で保存されました。
すべての生物材料は121°Cでオートクレーブ処理され、15〜20分間滅菌されてから廃棄されました。抗生物質を含む廃棄物は、機関のバイオセーフティおよび化学廃棄物プロトコルに従って処分されました。
重要なステップ: 抗生物質添加前に寒天温度を45〜55°Cの範囲に保ちます。過剰な加熱はフォスフォマイシンの活性を低下させ、MICの結果に影響を与える可能性があります。
G6Pのメディアへの追加
フォスフォマイシン感受性を判断するために、EUCASTは寒天およびブロス培地に25 μg/mLのグルコース6-リン酸(G6P)を加えることを推奨しています。1リットルの寒天に対して、25 mgのG6Pを20 mLのMHAに溶解し、ろ過して滅菌し、その後メイン寒天バッチに混合しました。
寒天希釈プレートの調製
フォスフォマイシン、メロペネム、ゲンタミシン、セフトリアキソンの単剤MIC値を測定するために、1回の希釈(例:フォスフォマイシンは2〜256 μg/mLの範囲)を8回の希釈で使用しました。抗生物質濃度はプレートに記録されていました。
併用試験では、フォスフォマイシンおよび他の抗生物質の濃度(例:フォスフォマイシン256 μg/mL、メロペネム32 μg/mL)がプレートに記録されました。したがって、各組み合わせごとに64枚のプレートが作成され、フォスフォマイシンおよび他の抗生物質の濃度がプレート上で記録されました。単剤治療用に合計32枚のメロペンネム・ゲンタミシネトリ製プレートと、組み合わせ用に192枚のプレートが準備されました。大理石の表面に56枚の小さな1cmの正方形を含む標準的な図面が描かれました。すべての図版はこの図面に直接接種されています。したがって、読み取りと接種は標準化されました(図2および図3参照)。

図2:接種および読書目的で作成された標準図。 接種および評価に用いられる標準化されたスキーム。この図の拡大版はこちらをクリックしてご覧ください。

図3:寒天希釈プレートの評価法。 MIC決定のための細菌増殖の評価。F = フォスフォマイシン;M = メロペネム。 この図の拡大版はこちらをクリックしてご覧ください。
抗生物質溶液2ミリリットルと溶融したCAMHA18mLを混合し、最終的な作動濃度を得ました。この媒体は製造元のパッケージインサートに従って調製され、温水浴で45−55°Cまで冷却されました。抗生物質混合物の1部(2 mL)を使用し、MHAを9部(18 mL)ペトリ皿に混合しました(抗生物質は1/10で希釈されました)。最終的な寒天プレートの容積は約20 mL(18 mL寒天+2 mL抗生物質溶液)に標準化され、希釈後に最終抗生物質濃度が計算されました。このようにして、寒天希釈プレートで抗生物質濃度(フォスフォマイシンは2–256 μg/mL、セフトリアキソンは0.0625–8 μg/mL、メロペネムおよびゲンタミシンは0.125–16 μg/mL)が達成されました。抗生物質溶液を使わず培地から製製したプレートが増殖対照群として使用されました(図4)。培地と抗生物質溶液からなる混合物は室温で固化させられました。

図4:抗生物質溶液なしの対照培地。抗生物質を使わない培地を用いて細菌の生存可能性を確認します。この図の拡大版はこちらをクリックしてご覧ください。
重要なステップ:寒天の深さが均一でなかったり、抗生物質の混合が不十分で、MIC解釈の不正確さや誤った相互作用結果につながる可能性があります。
分離株の調製と接種
以前に保存された純粋株は室温の5%羊血寒に転換され、37°Cで16〜24時間培養されました。新鮮な培養菌群は無菌の生理食塩水溶液に懸浮させ、光学リーダーを用いて0.5のマクファーランド濁度を測定しました。
寒天希釈法では、各スポットあたり約104 CFUの細菌接種が必要でした。0.5マクファーランド値には約108 CFU/mLの細菌が含まれています。細菌密度は107 CFU/mLとなり、溶液を無菌生理食塩水で1:10で希釈しました。
各細菌懸濁液を自動ピペットでチューブから2μL採取しました。この体積は、スポットあたり約2×104 CFUに相当します。接種は寒天表面の標的部位に行われ、最も低いフォスフォマイシン濃度のプレートから始めて、最も高い濃度へと進みました。
したがって、接種は各スポットあたりのCFUと定義され、各接種点には約104 CFUが含まれていました。各細菌懸濁液の接種は15分以内に完了しました。
フォスホマイシン含有プレートに接種する前に、汚染の有無を確認するために成長制御プレートを接種しました。接種は室温で乾燥させました。好気条件下で35〜37°Cで16〜24時間の孵化が行われ、濁度は校正された密度計で測定されました。
過剰な接種密度は、後遺症成長やエンドポイント決定の困難を引き起こす可能性があります。濁度を0.5マクファーランドに再調整し、合流成長が起きた場合は接種を繰り返します。
組み合わせ試験
粉末抗生物質のメロポネム、フォスフォマイシン、ゲンタミシン、セフトリアキソン、グルコース-6-リン酸が使用されました。
抗生物質の量は体積・重量・効力の公式を用いて計算されました。ストック溶液を準備した後、抗生物質溶液は感受性MIC範囲より3倍の2倍希釈濃度と4倍の濃度で調製されました。希釈範囲は、フォスフォマイシンが2–256 μg/mL、セフトリアキソンが0.0625–8 μg/mL、ゲンタミシンおよびメロペネムが0.125–16 μg/mLと計算されました(表2、表3、表4)。
表2: フォスホマイシン-ゲンタミシン併用剤の抗生物質溶液の調製。 ストックおよび作業用溶液に用いられる調合工程と濃度。 この表をダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
表3:フォスホマイシン-メロペンネム併用剤の抗生物質溶液の調製。 ストックおよび作業用溶液に用いられる調合工程と濃度。この表をダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
表4:フォスホマイシン-セフトリアクソン併用剤の抗生物質溶液の調製。 ストックおよび作業用溶液に用いられる調合工程と濃度。 この表をダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
本研究では、単剤および併用実験用に別々のフォスフォマイシンストック溶液を準備し、寒天ベースの最終希釈因子の違いを補正しました。単剤実験には標準的なストック溶液が使用され、抗生物質のプリミックス時の追加希釈を補うために、調整された高濃度ストック溶液が併用実験で使用されました。
連続希釈の初期段階としてストック溶液が準備されました。フォスフォマイシンについては、256 mgの粉末を無菌条件下で分析天秤を用いて正確に計量し、50 mLの無菌蒸留水に連続混合(磁気攪拌器)を用いて完全に溶解するまで溶解し、最終濃度は5120 μg/mLのフォスフォマイシン二ナトリウムとなりました。ゲンタミシン、メロペネム、セフトリアキソンの別々のストック溶液が調製されました。
連続の2倍希釈のために、25mLの滅菌蒸留水を含む7本の滅菌円錐管が準備されました。標準溶液から25mLを調整可能なピペットで最初のチューブに移し、その後、次のチューブへ順次移送して2回の連続希釈を実現しました。各チューブは、各移動ステップの後、5〜10秒間渦ミキサーでしっかりと混合されました。最終チューブからは25mLを廃棄し、均等な体積を保ちました。この方法で希釈系列が得られ、最低濃度40 μg/mLとなり、合計8種類の異なるフォスフォマイシン濃度が調製されました。
ゲンタミシン、メロペンネム、セフトリアクソンにも同様の処置が適用されました。しかし、標的濃度範囲の違いにより、ゲンタミシンとメロポネム16mg(0.125–16 μg/mLの範囲)およびセフトリアキソン8mg(0.0625–8 μg/mLの範囲)を別々に計量し、室温の無菌条件下で50 mLの滅菌蒸留水に溶解しました。上記の通り、連続的な2倍希釈が行われました。最終的な最低濃度はゲンタミシンとメロポネムで2.5 μg/mL、セフトリアキソンで1.25 μg/mLでした。各抗生物質に対して、異なる濃度の25 mLを含む8本のチューブが準備されました。フォスフォマイシンは3種類の抗生物質と併用して試験されたため、合計24本のフォスフォマイシン希釈チューブ(うち8本×3本)が準備されました。
寒天製剤として、18mLのミューラー–ヒントン寒天にグルコース6-リン酸(25μg/mL)を45〜50°Cまで予備冷却し、無菌ペトリ皿に投与しました。その後、無菌ピペットを用いてフォスフォマイシン溶液1mLと2つ目の抗生物質溶液1mLを追加しました。プレートは円回転で優しく混合され、均一な分布を確保し、室温で固化させました。等量混合と寒天添加により、抗生物質濃度は約9倍に減少しました。
組み合わせ試験では、最も低いフォスフォマイシン濃度(40 μg/mL)1 mLを8種類のゲンタミシン希釈液それぞれ1 mL(2.5–320 μg/mL)と混ぜ、分離したペトリ皿に加えて優しく混ぜました。同じ手順を次のフォスフォマイシン濃度(80 μg/mL)でも繰り返し、5120 μg/mLまで段階的に続け、すべての可能な濃度の組み合わせを検証しました。交差汚染を防ぐため、各移送ごとに新しい滅菌ピペットチップが使用されました。合計で64皿(8×8の組み合わせ)がフォスフォマイシン–ゲンタミシンの組み合わせのために準備されました(表5)。
同様の手順をメロペネムおよびセフトリアキソンと併用したフォスフォマイシンにも適用され、各抗生物質の組み合わせに対して64枚のプレートが生成されました(表6および表7)。
表5:MHA培地上のフォスホマイシン-ゲンタミシン併合の配置。ミューラー・ヒントン寒天における抗生物質濃度の配置。FF = フォスフォマイシン;GN = ゲンタミシン。この表をダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
表6:MHA培地上のフォスフォマイシン-メロペンネム配合の配置。 ミューラー・ヒントン寒天における抗生物質濃度の配置。FF = フォスフォマイシン;MEM = メロペンネム。この表をダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
表7:MHA培地上のフォスフォマイシン-セフトリアキソン併合の配置。ミューラー・ヒントン寒天における抗生物質濃度の配置。FF = フォスフォマイシン;CRO = セフトリアキソン。この表をダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
抗生物質混合物を準備した後、18mLの溶融したミューラー・ヒントン寒天(45–50°C)を各プレートに加え、1mLの抗生物質混合物を含むものを加え、温度条件が抗生物質活性を損なわないよう確認しました。これにより、初期の抗生物質溶液が約9倍に希釈されました。
系統的評価のために、プレートはチェッカーボード(二次元希釈)形式で配置されました。フォスフォマイシン濃度は縦軸(A〜H列)に沿って配置され、A列で最も高濃度、H列に向かって減少しています。2番目の抗生物質は水平軸(1〜8列)に配置され、1列から8列にかけて濃度が増加しました。したがって、各十分に等価な位置は、2つの抗生物質濃度の独自の組み合わせを表し、相互作用効果の包括的な評価を可能にしました。
結果評価
最小阻害濃度の結果はEUCAST v.11の推奨に従って評価されました。増殖制御プレートでは目に見える細菌増殖が認められ、無菌制御プレート(無接種)では増殖が認められませんでした。MICは目に見える増殖が見られない最低濃度と定義されました。組み合わせ試験では、相互作用効果をFICI値を用いて解釈しました。シナジーはFICI ≤ 0.5、無関心>0.5–4、アンタゴニシズム> 4と定義されました。フォスフォマイシンの場合、MIC値≤32 μg/mLが感受性とされ、32 μg/mL>は耐性とみなされました。ゲンタミシンおよびメロペンネム(髄膜炎感染)では、MIC値≤2 μg/mLが感受性とされ、2 μg/mL>値は耐性とみなされました。メロペンネム(非髄膜炎感染の場合)では、MIC値≤2 μg/mLが感受性とされました。8 μg/mL>値は耐性とされ、非髄膜炎感染の場合、セフトリアキソン≤ MIC 1 μg/mL(髄膜炎感染)が感受性、髄膜炎感染におけるMIC ≤ 2 μg/mLが感受性とされ、髄膜炎感染に対するMIC > 1 μg/mL(髄膜炎感染)が耐性16とされました。
研究データの統計解析は統計ソフトウェアを用いて実施されました。
統計:カテゴリ変数は数値とパーセンテージで表されました。ピアソンのカイ二乗検定は、すべての期待される細胞数が≥5である比較に用いられました。フィッシャーの正確検定は、サンプルサイズが小さい分析や、予想される細胞数が<5である場合に用いられました。具体的には、フォスフォマイシン耐性率の総合比較にはカイ二乗検定が用いられ、フィッシャーの正確検定は一部の組み合わせにおける低周波分布による相乗的、加法的相互作用率、抗圧的相互作用率のサブグループ解析に用いられました。 P値≤0.05は統計的に有意とされました。
解釈注: 阻害領域内の小さな単一コロニーは、繰り返しの試験で合流または再現可能でない限り成長とはみなされませんでした。
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合計60個のカルバペネム耐性大腸菌分離株が研究に含まれました。すべての分離株は、ディクレ大学医学部病院の集中治療室または臨床病棟に入院している患者から取得されました。成人患者は83.3%、小児患者は16.7%を占めていました(表8 および 表9)。分離株の80%(n = 48)で多剤耐性が観察されました。
表8:入院場所および年齢による 大腸菌 分離株の分布。 ICU=集中治療室。 この表をダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
表9:サンプルタイプ別の 大腸菌 分離株の分布。 CSF = 脳脊髄液;ET...
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著者たちは利益相反がないと宣言しています。
この研究は、プロジェクト番号SBE.21.004のディクレ大学科学研究プロジェクト調整ユニット(DÜBAP)の支援を受けました。
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