このプロトコルは、低運動に起因する腫瘍のGBD 2021推定値を抽出、処理、分析、可視化するための再現可能なワークフローを示します。このワークフローにより、研究者は標準化された人口レベルデータを用いて、負担指標、時間的傾向、分解要素、社会経済的不平等、モデルベースの予測を評価できます。
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このプロトコルは、低運動に起因する腫瘍のGBD 2021推定値を抽出、処理、分析、可視化するための再現可能なワークフローを示します。このワークフローにより、研究者は標準化された人口レベルデータを用いて、負担指標、時間的傾向、分解要素、社会経済的不平等、モデルベースの予測を評価できます。
本プロトコルは、Global Burden of Disease 2021のデータを用いて、低身体活動に起因する腫瘍の全体的な負担を推定するための再現可能な分析ワークフローを説明しています。ワークフローには、GBD結果ツールからのデータ抽出、適格アウトカムおよび曝露カテゴリーの定義、死亡推定、障害調整生年、年齢標準化率、推定年次変化率およびジョインポイント回帰を用いた時間的傾向分析、分解分析、社会経済的不平等評価、ベイズ年齢期間コホート予測が含まれます。また、モデル化された人口レベル推定の文脈で不確実性区間、分解成分、不平等指標の解釈方法も説明しています。代表的な応用例として、このワークフローは1990年から2021年までの204か国・地域で、低運動に起因する大腸がんおよび女性乳がんに適用され、2045年まで予測されました。このプロトコルは、研究者がリスク帰属負荷推定、トレンド特徴付け、不平等評価、予測分析のための構造化されたアプローチを必要とする他のGBDリスク-アウトカムペアにも適応可能です。
ネオプラズムは、世界の死亡率や障害に寄与する非伝染性疾患(NCD)の重要なカテゴリーであり、世界的に重大な公衆衛生上の課題となっています。Globocan 2022のデータによると、世界で1,996万件の新規腫瘍症例と974万人の死亡が確認されており、肺がん、乳がん(女性)、大腸がんが主な悪性腫瘍となっています。がん発生率は2050年までに年間3,500万人に達すると予測されており(2022年から77%増加)、人間開発指数(HDI)で低い国々は人口動態の変化により142%の急増が予想されています。人口増加、人口高齢化、スクリーニングシステムの不備、低HDI地域における治療アクセスの制約がこれらの傾向を推進し、世界の腫瘍資源の公平な配分が不可欠となっています。
低身体活動(LPA)は、悪性腫瘍、代謝障害、神経精神疾患(2,3,4)にまたがる主要なNCDの修正可能な決定因子として確立されています。LPAは世界的な健康負担として大きく、2000年以降6.6%の年齢標準化有病率上昇を示し、2022年の全死亡率の7.2%に寄与しています。中等度の身体活動(PA)は乳がん(HR 0.90; 95% CI: 0.87–0.93)、結腸(HR 0.84; 95% CI: 0.77–0.91)、直腸がん(HR 0.87; 95% CI: 0.80–0.95)に対して有意な保護をもたらし、部位特異的死亡率の並行して減少します7。必要なPAを世界的に推進するため、多くの国や地域(例:カナダ、英国、米国)がそれぞれの文脈に合わせた国家PAガイドラインを作成し、世界保健機関(WHO)や欧州連合などの組織を通じて広く普及しています。残念ながら、世界中の成人のうち、公衆衛生ガイドラインで定められた最低推奨PAレベルを満たしているのはわずか72.5%です。
身体活動による低負荷の腫瘍負荷の軽減は、国連持続可能な開発目標(SDGs)2030の目標、すなわち予防とケアによる早期NCD死亡率の3分の1削減を達成する上で極めて重要です。LPAと腫瘍の関係を明らかにするための確固たる証拠を生み出すことは、今後の医療政策の導きとなる上で不可欠です。2021年の世界疾病・傷害・リスク要因負担調査(GBD 2021)は、標準化された疫学的手法を用いて、1990年から2021年までの204か国・地域における死亡率、障害調整寿命(DALYs)、およびリスク帰属負担の比較可能な人口レベルの推定値を提供します。GBD 2021では、疾病および傷害の推定が371の疾患と傷害をカバーし、リスク要因分析では88のリスク因子の曝露、相対リスク、集団帰属割合、帰属負担を推定しています。しかし、GBD 2021の低身体活動による腫瘍データを抽出し、トレンド、分解、不平等、予測分析を単一のプロトコル内で適用するための段階的かつ再現性の高いワークフローを提供する研究は少ないです。本稿は、この特定のGBDリスク-アウトカムペアリングにおけるデータ抽出、変数定義、統計モデリング、解釈手順を詳述することで、この方法論的ギャップに対処しています。本プロトコルは、1990年から2021年までの204か国・地域における低身体活動に起因する腫瘍のGBD 2021推定値を再現可能な二次分析し、2045年までの予測を行っています。目的は、個人レベルの因果関係や直接的な介入効果を推論することなく、死亡数、DALYs、年齢的標準化率、時間的傾向、分解要素、社会経済的不平等、予測負担を定量化することでした。
このワークフローが選ばれたのは、複数の補完的な分析要素を単一の再現可能なフレームワークに統合しているためです。記述的なGBD推定値や単一の傾向指標のみを報告する研究と比較して、このプロトコルは負担推定、EAPC、ジョインポイント回帰、分解分析、不平等評価、BAPC予測を組み合わせており、負担の大きさだけでなく、時間的変化、人口動態の要因、社会経済的勾配、将来の傾向も検証できます。このプロトコルは、GBDリスク帰属推定の二次分析を行う研究者に適用可能であり、特に時間、性別、年齢層、国、地域、またはSDIカテゴリーを超えた負担パターンを比較することを目的とする場合に適用可能です。
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本研究では、公開されている非特定化されたGBD 2021の人口レベル推計を用いています。個人レベルのヒト参加者データはアクセスされませんでした。GBD 2021の研究はワシントン大学機関審査委員会からインフォームドコンセントの放棄を受けました。したがって、この二次分析に対して追加の倫理的承認は必要ありませんでした。
注:本プロトコルは、低運動に起因する新生物11 のGBD 2021推定値の二次解析を行うための再現可能なワークフローを記述しています。ワークフローにはデータ抽出、変数定義、負担推定、時間的傾向分析、分解分析、不平等評価、ベイズ年齢・期間・コホート予測が含まれます。結果は、主要な因果関係を確立するのではなく、プロトコルの適用を示すために提示されています。分析ワークフローは6つの連続したステップで構成されていました:GBD 2021推定の抽出、曝露、疾患転帰、SDI層の定義、死亡推定、DALYs、年齢標準化死亡率(ASMR)、年齢標準化DALYs率(ASDR)、推定年率変化(EAPC)およびジョインポイント回帰、分解および不平等分析を用いた時間的傾向分析、そして2045年までのベイズ年齢期間コホート予測です。各結果と図は、これらの関連する分析ステップのいずれかから生成されました。
1. データソースの特定とアクセス
2. 主要変数と分類基準の定義
3. 低身体活動に起因する腫瘍全体負荷の推定。
4. 時間的傾向分析
5. 分解解析
6. 健康不平等分析
7. ベイズ年齢・時代・コホートモデリング
8. 統計分析
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このプロトコルの成功した実装により、あらかじめ定められた場所、年、性別、年齢層、測定、指標にわたる統一されたGBD由来推定値の完全なセットが生成されるはずです。期待される出力には、95%不確実性区間を含む年齢標準化および年齢別負担推定、EAPCおよびジョインポイントトレンド推定、分解成分、SIIおよびCII不平等指標、そして後方不確実性区間を持つBAPCベースの予測が含まれます。最適でない実装は、層の欠如、年代や位置ラベルの不一致、データクレンジ後のGBD報告推定値の再現失敗、まばらな層における不安定な結合点モデル、または不合理な範囲の投影区間などが示されます。
LPAに起因する腫瘍の全体負担
2021年にはLPAに起因する腫瘍が世界で87,440人(95% UI:48,636–125,811人)を占め、1990年の基準値(44,675人、95% UI:24,963–64,997)から95.73%増加しました(表1、 補足表1...
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このGBD 2021分析では、低身体活動による腫瘍負荷において2つの対照的なパターンが示されています。LPAに起因する新生物のASMRおよびASDRは1990年から2021年にかけて有意に減少しました(ΔASMR = -19.72%;ΔASDR = -18.51%)一方で、絶対死亡数とDALYsはそれぞれ95.73%と84.79%増加しました。年齢標準化率の低下にもかかわらず、絶対負担の増加は主に人口増加と人口高齢化によって説明されました。ASRの低下は、がん検出、治療、リスク因子制御の改善など複数の要因を反映している可能性がありますが、これらの要因は本分析では直接分解されていません。特に、LPAは2021年の世界で87,000件以上の腫瘍関連死亡と174万件のDALYsの責任を負い続けています。これらの発見は、GBD帰属フレームワークにおける低身体活動の依然としての重要性を支持してい...
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著者たちは何も明かすことはありません。
私たちは、LPA疫学に起因する新生物に関する貢献をしたGlobal Burden of Disease Study(GBD 2021)の協力者に感謝します。これは、Institute for Health Metrics and Evaluation(IHME)のオープンアクセスデータによって促進されました。この作業は景頂医療技術(JD_GBDRソフトウェア認可および重要なデータ処理提供)の支援を受け、言語編集サービスはHome for Researchers(www.home-for-researchers.com)が提供しました。この研究は江蘇省伝統中医科学技術開発計画(QN202513年)および南京中医薬大学第二附属病院内科研究基金プロジェクト(SEZRC202504、SEZJY202505年)の支援を受けました。
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| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| ベイジアン年齢-期間-コホート(BAPC)Rパッケージ | R Foundation / CRANリポジトリ | https://cran.r-project.org/ | ベイジアン年齢-期間-コホート予測分析に使用。 |
| CSVデータファイル | Institute for Health Metrics and Evaluation (IHME) | N/A | GBD 2021 結果ツールからの負荷データセットを下流分析用にエクスポート。 |
| dplyr Rパッケージ | R Foundation / CRANリポジトリ | https://cran.r-project.org/package=dplyr | Rでのデータ操作とクリーニングに使用。 |
| GBD 2021データ入力ソースツール | Institute for Health Metrics and Evaluation (IHME) | https://ghdx.healthdata.org/gbd-2021 | GBDソース文書の公開リポジトリ。 |
| ggplot2 Rパッケージ | R Foundation / CRANリポジトリ | https://cran.r-project.org/package=ggplot2 | 時間的傾向と不平等分析のグラフィカルな可視化に使用。 |
| Global Burden of Disease(GBD)2021結果ツール | Institute for Health Metrics and Evaluation (IHME) | https://vizhub.healthdata.org/gbd-results/ | 死亡数、DALYs、ASMR、ASDRデータの抽出に使用される公開データベース。 |
| INLA Rパッケージ | R-INLAプロジェクト | https://www.r-inla.org/ | 年齢-期間-コホートモデリング内でのベイジアン推論に使用。 |
| JD_GBDRソフトウェア | Jingding Medical Technology Co., Ltd. | バージョン2.37.1 | GBD負荷推定、分解分析、標準化率の可視化に使用。 |
| Joinpoint回帰プログラム(バージョン5.3.0) | 国立がん研究所(NCI) | https://surveillance.cancer.gov/joinpoint/download | Joinpoint回帰分析、APC、およびAAPC推定に使用。 |
| Microsoft Excel | Microsoft Corporation | https://www.microsoft.com/excel | 分析前のCSVデータセットの整理とクリーニングに使用。 |
| パーソナルコンピュータワークステーション | 任意の標準コンピューティングワークステーション | N/A | 推奨される最小:8 GB RAM、統計分析と予測用のWindows 10/11またはmacOS。 |
| R統計ソフトウェア(バージョン4.4.2) | R Foundation for Statistical Computing | https://www.r-project.org/ | 統計分析、EAPC計算、不平等分析、可視化、およびベイジアン年齢-期間-コホートモデリングに使用。 |
| RStudioデスクトップ | Posit Software, PBC | https://posit.co/download/rstudio-desktop/ | R分析用の統合開発環境。 |
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