Guest Editors
Venkata Chirasani
The University of North Carolina at Chapel Hill
Chirasani博士は、タンパク質およびタンパク質-リガンド複合体の分子モデリングと分子動力学（MD）に精通しています。彼は計算科学的アプローチを用いて、がんや心血管疾患などの複雑なヒト疾患の病因や、さまざまな生物学的プロセスの根底にある分子メカニズムを研究しています。Campbell博士の研究室における現在の研究目的は、RASタンパク質、Actin-Vt、およびActin-MVt複合体などの生体分子の空間的および時間的な進化を調査することです。
Prasanna Revanasiddappa
Siddaganga Institute of Technology
Prasanna D R博士は、インドのトゥマクルにあるSiddaganga Institute of Technologyのバイオテクノロジー部門の准教授です。同氏は、分子動力学シミュレーション、コンピュータ支援薬物設計、ビッグデータ解析、およびゲノミクスにおいて、12年の教育経験と6年の研究経験を有しています。現在は、心血管疾患、G-クアドルプレックス、メタロ-β-ラクタマーゼ、およびSAICARシンターゼ酵素の分野で精力的に研究を行っています。また、複数の助成金を得たプロジェクトを遂行し、査読付き学術誌に論文を発表しています。現在は、自身の指導の下にある計算生物物理学研究室に所属し、「コレステロールエステル転送タンパク質に対する低分子阻害剤の合成、金属イオン存在下での逆並行G-クアドルプレックスの安定化」および「SAICARシンターゼ酵素の構造的洞察とメタロ-β-ラクタマーゼ阻害の新たな戦略の解明」に関するプロジェクトを監修しています。また、同氏の研究グループは、異なる環境条件下におけるウイルスキャプシドの挙動の解明にも取り組んでいます。
Collection Overview
B型肝炎は、B型肝炎ウイルス（HBV）によって引き起こされる慢性のウイルス感染症です。HBVは、世界中で3億人以上の人々に感染しています。 そして、感染は進行的に肝硬変や肝細胞癌による死に至らせます。慢性B型肝炎感染の診断および治療のために、いくつかのウイルス学的および血清学的アッセイが利用可能ですが、治療によって抑制できるのはウイルスの複製のみです。したがって、異なる標的を選択することでHBV感染に対抗する高度な治療法を開発することが急務となっています。 ウイルス酵素やカプシドなどの。一方で 構造解析技術によって、分子レベルでのHBVの構造と機能に関する理解が深まったが、これらの実験的手法には固有の限界があり、ウイルス粒子の柔軟な部位を解明するには至っていない。
この点において、粗視化（CG）分子動力学シミュレーションは、巨大な生体分子システムの構造とダイナミクスを研究するための重要なツールとして登場しました。本研究において完全なHBVに対して実施したCGシミュレーションから得られた主要な知見は、HBV表面のクリプティックポケットや隙間を探索するために利用されます。当社の革新的な計算アプローチに、HBVカプシド のドラッガブルサイトに対する低分子阻害剤を設計し検証する実験的研究を組み合わせることで、新しいクラスの抗HBV治療薬の探索が可能になります。