ヒト胚性幹細胞のコロニーの成長のビデオバイオインフォマティクス解析

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2010年5月20日

2010年5月20日

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Sabrina Lin¹^,²^,³ , Shawn Fonteno¹ , Shruthi Satish¹^,³ , Bir Bhanu⁴ , Prue Talbot¹^,²

¹UCR Stem Cell Center, University of California, ²Department of Cell Biology and Neuroscience, University of California, ³Cell, Molecular, and Developmental Biology Graduate Program, University of California, ⁴Center for Research in Intelligent Systems, University of California

ビデオバイオインフォマティクスは、自動処理、分析、理解、および顕微鏡ビデオから抽出した生物学的な時空間データのデータマイニングです。この記事の目的は、ビデオバイオインフォマティクスの手法を用いて、ヒト胚性幹細胞のコロニーの成長を測定するための方法を示すことです。

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ヒト胚性幹細胞

タイムラプスイメージング

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コロニー増殖解析

画像セグメンテーション

Adobe Photoshopによる検証

BioStation CTインキュベーター

Matrigelコーティング

ピクセル測定

Chapters in this video

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タイトル

1:02

はじめに

1:40

ビデオデータ取得のためのhESCの播種およびコロニー形成

6:40

CL-Quantソフトウェアを用いたビデオバイオインフォマティクス -- 補正レシピ

3:48

CL-Quantソフトウェアを用いたビデオバイオインフォマティクス -- セグメンテーションレシピ

8:19

CL-Quantソフトウェアを用いたビデオバイオインフォマティクス -- 測定テンプレート

11:22

hESCコロニー成長のビデオ解析におけるCL-QuantとAdobe® Photoshop®の比較

10:08

Adobe® Photoshop®によるhESCビデオデータの測定

12:27

結論

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