Name: 当然のことながら環境から磁性細菌の発生の収集、分離、濃縮 (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2012-11-15T11:55:00.000+00:00
Duration: 5 min 57 s
Description: 学ぶ淡水環境から磁性細菌を分離・濃縮する方法。堆積物サンプルを収集し、磁石を用いて磁性細菌を分離し、ガラスキャピラリーレーストラックで濃縮します。光学顕微鏡と透過型電子顕微鏡を用いて細菌の形態とマグネトソームを解析し、環境微生物学の研究に役立てます。

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この作品は、米国国立科学財団（EAR-0920299およびEAR-0745808）からの補助金によって支えられて、米国国立科学財団（東アジア·太平洋担当）サマー研究所、アメリカ研究助成プログラムと大学院研究奨学金同窓会助成地質学会をオハイオ州立大学から。我々は彼らの洞察に満ちたコメントのためのエディタと二人の匿名査読者に感謝したいと思います。

1。 MTBのコレクション<ol><li>磁性細菌を収集する淡水サイト（MTB）を決定する際に、それが柔らかい泥質堆積物の層を有する池や動きの遅い流れから開始するのが最適であることが多い。このデモでは、コロンバスのオハイオ州立大学（OSU）、オハイオ州（アメリカ）のキャンパス内にOlentangy川の端でサンプルを収集した。これは私たちのデモのために便利な場所でしたが、ここで説明されたプロトコルは任意の水生場所に適用可能である。このプロトコルで使用される材料は、 表1に記載されています。水の深さは10〜100センチメートルである場所を探します。そのような場所では、土砂クリア、スクリュートップコンテナを使用しての最上部層を収集する必要があります。それは半分土砂と水で残量3分の1で満たされるまでコンテナに土砂と水をすくう。それが水で満たされるまで水没容器をそのままにして、しっかりと容器wを締めくくるi番目のそのねじぶた。これは、堆積物を混合する必要はありません。タオルで乾燥した容器の外側を拭いてから、研究室にサンプルを取る。それはあなたの研究室に戻ってサンプルを急いでする必要はありません。我々は、我々の研究室に戻し持ち込む前に数日間フィールドにプラスチック容器にMTBのサンプルを残してきた。あなたがフィールドに涼しい、日陰でサンプルを格納するようにMTBは限りヶ月に数週間のための実行可能でなければなりません。 </li><li>サンプルでは、​​あなたの研究室に入ったら、キャップを緩め、それが蒸発量を削減するための容器をカバーしておきます。暗い部屋で、引き出しの中に室温で容器を保管し、または完全にアルミホイルで容器をカバーしています。堆積物と微粒子が完全に数時間〜数日のために邪魔されずにサンプルを残すことによって、容器の底に沈殿することができます。それは堆積物を混合する必要はありませんが、MTBは邪​​魔されない環境を好む。プラスチック容器の透明な壁あなたは、粒子が底に沈殿していることを確認することができます。あなたのサンプルによって、MTBは何ヶ月も試料中に生き続けることができます。 </li></ol> 2。 MTBのアイソレーション<ol><li>あなたが約1cm堆積物-水界面（ 図1A）上記プラスチック容器の両側にMTB、場所の磁石を分離する準備ができたら。容器の底に沈殿を乱さないように注意してください。コンテナと反対側のもう1つの棒磁石の北側（ 図1A）の片側に棒磁石のS極を配置します。ほぼすべての磁石は、磁気攪拌棒や大型冷蔵庫のマグネットを使用することができる。何は、堆積物 - 水界面上に正しい高さに磁石をサポートするために使用することができます。我々は、段ボールやプラスチック製の箱の上に磁石を休んでいることが最善であることがわかりました、しかし、磁石は、プラスチック容器の外側にテープで固定されていることができます。いくつかに30分待って磁石に泳ぐ細菌のための時間。 </li><li>慎重に南極の棒磁石の位置の近くにコンテナ（ 図1A）、（北半球で収集されたサンプルのための）内側から水を集めるために滅菌ピペットを使用しています。この水は、南極の棒磁石に引き寄せされたMTBを含める必要があります。次に、キャピラリー競馬場は、さらにMTBを豊かにするために使用されるべきである。 </li></ol> 3。 MTBの競馬場<ol><li>走磁性細菌とサンプルを豊かにするために、毛細管競馬場が必要である（ 図1B及び1C）。これらはクリアプラスチック容器から細胞を単離する前に行う必要があります。 </li><li>競馬場を作るために5.75インチ（146ミリメートル）のガラスパスツールピペットを使用しています。ピペットの上部をカットするダイヤモンドペンまたはファイルを使用して、ピペットの長さは重要ではありませんが、それは水の約1〜2 mlを含んでいることができるはずです。次に、先端を溶かすためにブンゼンバーナーを使用するようにそれは（ 図1C）密封されたとなります。結果のピペットは、開放端と密封端を持っている必要があります。 </li><li>これらの競馬場のいくつかの後、オートクレーブを行います。また、綿、いくつかの長い金属針をオートクレーブする必要があります。 </li><li>ろ過シリンジに取り付け長い金属針を用いてオートクレーブした競馬場に、 図1Aに示すように土砂と水の界面付近から採取し、ろ過した試料水を追加します。フィルターの孔径は、水から破片や汚染物質を除去するために0.22ミリメートルである必要があります。ガラスキャピラリー内に気泡がないことを必ず確認することが重要です。 </li><li>滅菌綿棒（ 図1B）と競馬場の底に差し込みます。封印先端（ 図1C）から1cm -それが0.5であるので、競馬場の密封された端の方に綿をプッシュするために金属針を使用します。 </li><li>滅菌ピペットを用いて、試料にMTB含有水（2.2節）を追加R準備されたMTBのレーストラック（ 図1B）のeservoir（開放端）。 </li></ol> 4。 MTBの濃縮<ol><li>競馬場は、サンプル流体で満たされたら、水平な面の上に、その側にそれを置く（ 例えば 、卓上型）と競馬場の密封された先端部（ 図1Bの隣に（北半球の）棒磁石のS極を配置及び図1C）。 </li><li>綿を通って移動し、MTBの場合は5〜30分待ちます。その後、競馬場の先端付近の流体を収集する必要があります。長すぎる待って、キャピラリの先端にそのような他の運動性細菌などの汚染物質を、導入することができます。必要に応じて、競馬場の先端を見るとMTBが競馬場の先端に集めて見て光学顕微鏡を使用することができます。これは、あなたがそれを綿栓を通って移動し、MTBのにかかる時間を決定することができます。 </li><li>優しく綿栓の近くの小さな傷を作り、競馬場の端を折り、ダイヤモンドナイフを使用しています。 </li> &lt;LI&gt;競馬の先端から流体を除去するために細い針（25または27ゲージ）を1mlシリンジを使用してください。この液体試料は現在、濃縮MTBを含める必要があります。 </li></ol> 5。光学顕微鏡で観察MTB <ol><li>カバースリップ上に濃縮されたMTBのサンプルの液滴（10〜20μl）を置きます。 </li><li>迅速ので、ドロップが現在ダウンして直面しているとカバースリップの上からぶら下がってカバースリップを反転させます。 </li><li>スライドガラス上に載っているOリングの上にカバースリップを置きます。 Oリングは、その後わずかに小さい直径カバースリップ（; 図2約1cm）を持っている必要があります。 </li><li>光顕微鏡ステージ上にこのハンギングドロップを置き、ドロップのいずれかの端に焦点を当てる。しかし、ハンギングドロップ法（ 図2）のために使用することは困難である石油を必要としないが、ほとんどは、高開口数（ 例えば 、0.93 NA）を持っているので、60X乾燥対物レンズは非常によく動作します。 </li><li>絞首刑dに近い棒磁石の南の端を置きますROPとMTBは磁石（ 図3）に最も近いドロップの端に向かって移動を開始します。数分以内に多くのMTBはドロップの端（ 図3）であるべきである。細菌は磁石の極を反転させることにより、磁気であることを自分で証明してから、細菌が反対方向に泳ぐ観察する。 </li></ol> 6。透過型電子顕微鏡（TEM）によるMTB観測<ol><li>銅グリッド上に濃縮されたMTBの滴（約20μL）を配置し、細菌が10分のために解決することができます。 </li><li>クリーンフィルタ一枚の紙で余分な水分をオフウィック。 </li><li>必要に応じて、グリッドに悪影響を2％酢酸ウラニル、2％リンタングステン酸のpH 7.2、または2.5％のモリブデン酸ナトリウム、7,8,9で染色することができます。これは、濃縮されたMTBでグリッドをインキュベートした後、直ちに染色一滴の上に銅グリッドを配置することによって行われます。負の汚れでグリッドをインキュベートし、倍はstに応じて異なりますアインは、使用した後、きれいなろ紙の切れ端で流体を切る芯。 </li><li>透過型電子顕微鏡（TEM、 図4）を使用して、MTBを守ってください。ここでMTBを説明された仕事のためにFormvar安定化と炭素コーティングされた200メッシュの銅グリッド（テッド·ペラ＃01800）に吸着させた。グリッドは、最大10分までのために細胞懸濁液の一滴にカーボン側を下に置かれ、その後すぐに30秒間水の一滴にグリッドを配置することによって、1時間洗浄した。染色のために、グリッドは30秒〜5分間、2％酢酸ウラニル（テッド·ペラ＃19481）のドロップに置かれ、その後完全に濾紙を用いて乾燥した。グリッドは、TEMは200kVで高角度環状暗視野STEMを用いて80kVまたはFEI Tecnai F20のいずれかで、FEI Tecnaiスピリットを用いて分析した。 </li></ol>

<ol><li>Blakemore, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Magnetotactic+bacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Magnetotactic bacteria.</a> Science. 190, 377-379 (1975).</li>
<li>Blakemore, R. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Magnetotactic+bacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Annual+Reviews+in+Microbiology%22%5BJournal%5D)">Magnetotactic bacteria.</a> Annual Reviews in Microbiology. 36, 217-238 (1982).</li>
<li>Bazylinski, D. A., Frankel, R. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Controlled+Biomineralization+of+Magnetite+%28Fe3O4%29+and+Greigite+%28Fe3S4%29+in+a+Magnetotactic+Bacterium%5BTitle%5D)+AND+%22Applied+and+Environmental+Microbiology%22%5BJournal%5D)">Controlled Biomineralization of Magnetite (Fe3O4) and Greigite (Fe3S4) in a Magnetotactic Bacterium.</a> Applied and Environmental Microbiology. 61, 3232-3239 (1995).</li>
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<li>Lin, W., Li, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Newly+Isolated+but+Uncultivated+Magnetotactic+Bacterium+of+the+Phylum+Nitrospirae+from+Beijing%2C+China%5BTitle%5D)+AND+%22Applied+and+Environmental+Microbiology%22%5BJournal%5D)">Newly Isolated but Uncultivated Magnetotactic Bacterium of the Phylum Nitrospirae from Beijing, China.</a> Applied and Environmental Microbiology. 78, 668-675 (2012).</li>
<li>Li, J., Pan, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biomineralization%2C+crystallography+and+magnetic+properties+of+bullet-shaped+magnetite+magnetosomes+in+giant+rod+magnetotactic+bacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Earth+and+Planetary+Science+Letters%22%5BJournal%5D)">Biomineralization, crystallography and magnetic properties of bullet-shaped magnetite magnetosomes in giant rod magnetotactic bacteria.</a> Earth and Planetary Science Letters. 293, 368-376 (2010).</li>
<li>Oestreicher, Z., Valerde-Tercedor, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Magnetosomes+and+magnetite+crystals+produced+by+magnetotactic+bacteria+as+resolved+by+atomic+force+microscopy+and+transmission+electron+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Micron%22%5BJournal%5D)">Magnetosomes and magnetite crystals produced by magnetotactic bacteria as resolved by atomic force microscopy and transmission electron microscopy.</a> Micron. 43, 1331-1335 (2012).</li>
</ol>

特別な利害関係は宣言されません。

走磁性細菌は、必ずしもすべての水生環境8で発見されていないが、それらが発生した場合、それらは100のオーダーで見つけることができます- 2ミリリットル当たり1000個の細胞。光学顕微鏡を用いて、MTBを観察するためには、あなた自身のサ ​​ンプル8で約50細菌/ mlが必要になります。あなたのサンプル中にないか、または少数のMTBがない場合は、どちらかあなたのサンプルを収集したり、次のセクションで説明したテクニックの1以上を試行しなければならない新たな環境のサイトを選択する必要があります。 まず、大規模なプラスチック浴槽8を使用している環境からより多くの沈殿物を収集してみてください。 unculturable MTBの多数が必要とされる場合に特に便利です。環境試料に応じて、サンプルを採取した後、直ちに50細菌/ mlの濃度を有するMTBサンプルを単離することができない場合があります。したがって、ラに戻ってあなたの環境サンプルを持ってきたときboratory、それは棒磁石を使...

<table border="1"><tbody><tr><td> アイテム名 </td><td> 会社 </td><td> カタログ番号 </td><td> コメント（オプション） </td></tr><tr><td>スライドガラス</td><td>フィッシャー·サイエンティフィック</td><td> S95933 </td><td></td></tr><tr><td>ガラスパスツールピペット</td><td>フィッシャー·サイエンティフィック</td><td> 13から678-6A </td><td></td></tr><tr><td> Oリング</td><td>金物店</td><td></td><td></td></tr><tr><td>カバースリップ</td><td>フィッシャー·サイエンティフィック</td><td> 12-542B </td><td></td></tr><tr><td>棒磁石</td><td>フィッシャー·サイエンティフィック</td><td> S95957 </td><td></td></tr><tr><td>コンテナ</td><td>任意の</td><td></td><td>すべてプラストICまたは少なくとも0.5リットルを保持することができ、密閉できるガラス容器</td></tr><tr><td>コットン</td><td>任意の</td><td></td><td></td></tr><tr><td> 60X乾式レンズ付顕微鏡</td><td>ツァイス</td><td></td><td> 60X乾いたレンズは絶対に必要というわけではないが、これは油を使用せずに高NAを与える</td></tr><tr><td>ダイヤモンドペン</td><td>フィッシャー·サイエンティフィック</td><td> 08から675 </td><td></td></tr><tr><td> 0.22ミリメートルフィルター</td><td>フィッシャー·サイエンティフィック</td><td> 09-719C </td><td></td></tr><tr><td> 1mlシリンジ</td><td>フィッシャー·サイエンティフィック</td><td> NC9788564 </td><td></td></tr><tr><td>微量遠心チューブ</td><td>フィッシャー·サイエンティフィック</td><td> 02-681-320 </td><td></td></tr><tr><td> Formvar /カーボン200メッシュ、銅グリッド</td><td>テッド·ペラ社</td><td> 01800 </td><td></td></tr><tr><td>酢酸ウラニル</td><td>テッド·ペラ社</td><td> 19481 </td><td></td></tr><tr><td> TecnaiスピリットTEM </td><td> FEI </td><td></td><td></td></tr><tr><td> Tecnai F20 S / TEM </td><td> FEI </td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

当然のことながら環境から磁性細菌の発生の収集、分離、濃縮

Collection, Isolation and Enrichment of Naturally Occurring Magnetotactic Bacteria from the Environment

走磁性細菌（MTB）は、最初、特にマサチューセッツ州（米国）の塩性湿地に収集する堆積物試料から1975年1に記載された水生微生物である。それ以来、MTBは世界2世界中から層状水と土砂の列が発見されました。すべてのマウンテンバイクに共通する一つの特徴は、マグネタイト（Fe 3 O 4）および/ ​​またはグレイジャイト鉄（Fe 3 S 4）、またはその両方3、4の細胞内、膜結合型磁気ナノ結晶であるmagnetosomesを含むことである。南半球では、それらは通常、磁石3,5の北の端に惹かれながら、北半球では、MTBは、典型的には、棒磁石の南の端に魅了されています。環境試料からMTBを隔離しようとするときに、このプロパティを利用することができる。 MTBを豊かにするための最も一般的な方法の1つは、天然源から堆積物と水を収集するために透明なプラスチック容器を使用することです淡水池など。北半球では、棒磁石の南の端は、堆積物 - 水界面でちょうど堆積物の上に容器の外側に接して配置されています。しばらくすると、細菌がピペットを用いて磁石の近くに容器内から削除することができ、その後キャピラリー競馬6と磁石を使用してさらに充実。かつて豊かに、細菌はハンギングドロップ法を用いた顕微鏡スライド上に配置し、光学顕微鏡で観察または銅グリッド上に堆積され、透過型電子顕微鏡（TEM）を用いて観察することができます。 この方法を使用して、孤立したMTBは、行動、鞭毛の種類と数、細胞の細胞形態、磁性結晶の形状、magnetosomes数、各セル内magnetosome鎖の数の組成を水泳などの特性を決定するために顕微鏡的に研究することができるnanomineral結晶、細胞内の液胞が存在する。

磁石は、環境試料（ 図1A）に含まれる磁性細菌（MTB）を単離するために使用することができる効果的なツールです。キャピラリー競馬場（ 図1B）は 、彼らはまた、環境試料中に含まれ、非走磁性微生物から分離することができる綿栓を介してそれらを誘致するためにMTBの磁気特性を使用しています。 <img alt="図1" src="/files/ftp_upload/50123/50123fig1.jpg" /> コロンバス、オハイオ州（アメリカ）でOlentangy川から採取した堆積物と水のサンプルが格納されている1。透明なプラスチックボトルフィギュア 。ボトルは約半分土砂と半分水が入っています。磁石の南の端（）は数時間のために堆積物上約1cmまで配置されます。容器の内側に磁石付近から流体の一部を除去した後、それが毛細血管rの内側に配置され棒磁石（B）の南の端に向かって...

我々は、天然水に適用できる磁性細菌（MTB）を収集する方法を示しています。 MTBを単離して、細菌の自然な磁気を利用しています比較的簡単なセットアップを使用して堆積物試料から濃縮することができます。孤立したMTBは、次に光学および電子顕微鏡の両方を用いて詳細に調べることができます。

Magnetotactic bacteria (MTB) are aquatic microorganisms that were first notably described in 19751 from sediment samples collected in salt marshes of ...

この手順の全体的な目標は、淡水環境からマグネトタクティクス細菌を分離することです。これは、最初に川や湖の端から水質堆積物サンプルを収集することによって達成されます。2番目のステップは、バー磁石を使用して環境サンプルに含まれるマグネトタクティクスバクテリアを分離することです。次に、マグネトタクティクス細菌は、ガラスキャピラリーレーストラックと磁石を使用して濃縮されます。最後に、マグネトタクティクス細菌は光学顕微鏡を使用して特徴付けられます。最終的に、透過型電子顕微鏡法を使用して、細菌とそのマグネタイトを含むマグネトーゾーンのサイズと形状を示します。この方法は、マグネトーが地球上でどのように進化したか、マグネトータクティクスバクテリアがナノメートルサイズの磁石をどのように合成したかなど、重要な問題、環境微生物学を理解するのに役立ちます。今日、その手順を実演するのは、ストライカーのザカリーです。ザカリーは私の研究室の博士課程の候補者です。彼は私の兄と私と一緒にオハイオ州立大学で働いています。マグネトタクティクスバクテリアやMTBを収集するための淡水サイトを決定するときは、多くの場合、柔らかい泥だらけの堆積物層がある池や動きの遅い小川から始めるのが最善です。このデモンストレーションでは、オハイオ州コロンバスにあるオハイオ州立大学のキャンパス内のオーランドタンジー川の端でサンプルを収集しました。水の深さが10〜100センチメートルの位置を見つけ、透明なスクリュートップコンテナを使用して、コンテナを最上層の堆積物と残りのスペースを水で満たし、ラボでコンテナを水中でキャップし、キャップを緩めてコンテナを覆ったままにして蒸発を減らし、沈殿物を許可するために数時間から数日間暗闇に保管しますそして、沈降する粒子を見つけます。MTBを充実させるためのレーストラックを作るために。まず、ダイヤモンドペンまたはヤスリを使用して、5.75インチのガラスパスティエピペットの上部を切り取り、1〜2ミリリットルの水に十分なスペースを確保します。次に、とバーナーを使用して先端オートクレーブをシールします。いくつかのレイズトラックと綿と長い金属針。MTBを分離する準備ができたら、プラスチック容器の側面、つまりコンテナの反対側の南極と北極との堆積物水界面の約1センチメートル上に磁石を配置します。沈殿物を乱さないように注意してください。バクテリアが磁石に泳ぐまで30分から数時間待ちます。次に、シリンジを使用して、沈殿物水界面近くのサンプル容器から液体を取り出します。シリンジにフィルターを取り付け、フィルターに金属針を取り付け、キャピラリーに気泡がないことを確認します。針を使用して、ろ過したサンプル水を滅菌綿と金属針でオートクレーブ競馬場に加えます。キャピラリー内の綿を密閉された端から0.5〜1センチメートル離してレーストラックを差し込みます。滅菌ピペットを使用して、磁石の南極付近に集まっている容器からマグネトタクティクスバクテリアを取り除き、水を含むMTBをレーストラックの開放端に追加します。レーストラックにサンプル液体が充填されたら、水平面に横向きに置き、バーマグネットの南極をレーストラックのシールチップの隣に置きます。MTBが綿花を通過するまで5〜30分待ちます。ダイヤモンドナイフを使用して、コットンプラグの近くに小さな引っかき傷をそっと作り、レーストラックの端をスナップオフします。細い針付きの1ミリリットルの注射器を使用して、MTBが豊富な液体をレーストラックの先端から取り除きます。光学顕微鏡でMTBを観察するには、濃縮したサンプルをカバースリップに一滴垂らします。カバースリップをスライドガラスの上に置かれているOリングに置きます。これをハンギングドロップと呼びます。Oリングの直径は、カバースリップよりもわずかに小さくする必要があります。次に、スライドを光学顕微鏡ステージに置き、液滴の一方の端に焦点を合わせます。次に、MTBをドロップの片側に引き付けるには、バーマグネットの南端を数分以内にその側の近くに配置して、多くのMTBをドロップの端に配置する必要があります。TEMでMTBを観察するには、安定化され、カーボンコーティングされた200メッシュの銅グリッドを濃縮されたバクテリアの滴に置き、サンプルを10分間沈殿させます。サンプルを水滴で30秒間洗浄した後、2%酢酸小便器の滴に30秒から5分間置き、濾紙を使用して200キロボルトの透過型電子顕微鏡を使用してサンプルを完全に乾燥させます。ここに示されているのは、環境堆積物サンプルから濃縮された単一のマグネト戦術細菌の透過型電子顕微鏡画像です。細胞とマグネトーゾーンのらせん状と形態は、単一のフレゲルとともにはっきりと見えます。マグネトタクティクス細菌が環境から収集された後、磁気分離技術が適切に実行された場合、約3時間かかります。この手順に続いて、16 sリボソームRNA分析などの他の方法を実行することができ、新たに発見されたマグネトタクティクス細菌と他の微生物との系統関係は何か、などの追加の質問に答えることができます。

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Research

JoVE Journal

Biology

生物学

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化学的に成層南極湖と炭素固定ポテンシャルの評価から微生物真核生物濃縮文化の確立

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マグネトスピリラム菌の増殖とその磁気移動性挙動の評価

出典: ワトソン、DC、 et.al。大腸菌と他の細菌からの細胞外小胞のスケーラブルな単離と精製 J. Vis. 経験。 (2021年)このビデオは、遺伝子組み換え細菌の外膜に由来する細胞外小胞(EV)の単離と濃縮を示しています。このプロセスには、細菌を培養して EV...

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地熱泉からの重金属耐性微生物の単離は、バイオレメディエーションおよび環境モニタリングバイオシステムの開発にとってホットな話題である。この研究は、温泉から重金属耐性菌を単離し同定するための方法論的アプローチを提供する。...

環境汚染に対処するための極限環境微生物のバイオプロスペクティング

ナチュラルキラー細胞はリンパ球の小集団である。ここでは、StemCell...

StemCell Technologies社からRosetteSepキットと人間の血液からNK細胞の濃縮

学ぶ淡水環境から磁性細菌を分離・濃縮する方法。堆積物サンプルを収集し、磁石を用いて磁性細菌を分離し、ガラスキャピラリーレーストラックで濃縮します。光学顕微鏡と透過型電子顕微鏡を用いて細菌の形態とマグネトソームを解析し、環境微生物学の研究に役立てます。

当然のことながら環境から磁性細菌の発生の収集、分離、濃縮

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