2014年7月1日
Informational connectivityは、異なる脳領域にわたるマルチボクセル情報の時間経過間の対応を測定します。マルチボクセルパターン識別可能性の時系列を領域から抽出して比較することで、一般的な機能的接続アプローチでは特定できないネットワークが明らかになります。
この手順の全体的な目標は、時間の経過に伴う脳領域の分布した活動パターンの変化に基づいて、脳領域間の接続性を測定することです。これは、最初にシード領域を選択することによって実現されます。次に、マルチボクセルパターンでは、シード領域と各サーチライトまたは関心領域の各時点について識別可能性が計算されます。
最後のステップは、シード領域の識別可能性時系列を各サーチライトと相関させることです。最終的に、情報接続性は、ボクセルのパターン全体に含まれる情報を持つ領域間の接続性を明らかにするために使用されます。この手法が機能的接続性などの他の手法と比較した場合の主な利点は、免疫応答に違いがないが、独自の多変量シグネチャを持つ条件を使用して接続性を検出できることです。
私が最初にこの方法を思いついたのは、多くの接続技術がマルチボクセル活動パターンにしか保持されない情報を無視していることに気づいた後でした。単変量アプローチがマルチボクセル活動パターンに保持される情報に対して完全に盲目であることが分かっているのと同じように、この手順を開始するには、運動パラメータと平均白質信号の予測子を持つ回帰モデルを作成することにより、前処理されたFMRIデータの時系列から運動と平均白質の信号を削除します。次に、結果の残差について次の分析を実行します。
生成された残差を、オープンソースの情報接続性 MATLAB ツールボックスなどを使用して、MATLAB や Python などの解析パッケージにインポートします。その後、各ボクセルの時系列をzcoに変換します。データセットの時点を、異なるスキャナーの実行など、独立したセットに分割します。
次に、条件ラベルのベクトルを生成して、時点に関連付けられた条件ラベルのレコードを作成します。つまり、イベントと記録された FMRI 信号の間の血行動態の遅れを説明するために、各実行で条件ラベルを 5 秒相当の繰り返しに何度も前方にシフトする終了時点です。シード領域を選択するには、お好みのソフトウェアでボクセルを選択するか、ラベル付きアトラスを使用して領域を機能的に位置特定するか、最もパフォーマンスの高い情報ブレインマッピングサーチライトを選択して、解剖学的領域を分離します。
次に、各回のMVPを比較します。すべての条件の典型的な MVP を示します。オープンソースの情報接続性 MATLAB ツールボックスを使用する。
1 つのフォールドを除くすべてのフォールドで各条件の時点を平均することにより、すべての条件のプロトタイプ MVP を計算します。次に、各時点の MVP を、トレーニング データから各条件の平均 MVP と関連付けます。これにより、各条件に対して毎回0.1の相関値が得られます。
ここで最も高い相関関係を持つ条件は、一般的な相関関係に基づく MVPA 分類子の予測であることに注意してください。その後。まず、その時点の状態を表す相関関係を特定することにより、各時点の MVP DISCRIMINABILITY を定量化します。次に、残りの相関関係の最も高いものを減算します。
その結果が、各時点の MVP の識別可能性です。サーチ ライト解析を行うには、各 vle の周囲に 3 次元クラスターを配置します。次に、各サーチ ライトに対して前の手順を繰り返して、すべてのサーチ ライトに MVP 識別可能性値の時系列が含まれるようにします。
次に、シードの MVP Discriminability 時系列を各サーチライトの DISCRIMINABILITY 時系列と関連付けます。スピアマンのランク相関を使用すると、結果として得られる RS 値はシードとサーチライトの間の IC になります。次に、各サーチライトの IC 値をサーチライトの中央ボクセルに割り当て、結果の個人の脳マップを書き出します。
データがまだ標準化された空間にない場合は、参加者の IC マップを同じ空間に変換します。オプションで、個々のサーチライトマップを滑らかにします。この図は、同期平均アクティブ化のない同期 MVP 判別機能を持つ 2 つの領域での MVP 識別可能性の例を示しています。
これらのデータポイントは、被験者が人工物の視覚的なプレゼンテーションを見ている間に収集されました。これは、マルチボクセルパターンによって区別できますが、平均応答ではありません。そして、ここに示されているのは、脳全体のフォームジャイラスとサーチライトの左図のシード間のIC値とFC値の例です。情報的および機能的な接続性の強度は、X 軸上の各サーチライトの平均応答と Y 軸上の MVPA 分類精度に対して Z 軸に示され、IC グラフの左上隅には、分類性能は高いが平均応答レベルが低い情報接続されたサーチ ライトが示されています。
FCグラフの左上隅にあるギャップは、これらの接続されたサーチライトが一般的なFCアプローチでは検出されていないことを示しています。接続マップの例を次に示します。各行は、シードに有意に接続されている領域を示しています 有意性は、順列テストから最小クラスター サイズを持つグループ T テストによって決定されます。
ICの結果は、この手順に従ってフリーサーファーで作成したサーフェスマップににきびを使用してここに表示されます。機能的接続性などの他の解析は、条件がマルチボクセルパターンによって一意に接続されているかどうか、または条件が平均応答で同期しているかどうかなど、追加の質問をするために実行できます。したがって、このビデオを見た後、マルチパターンに基づいてリージョン間の接続性を測定する方法を十分に理解しているはずです。
ご覧いただきありがとうございます。
本記事では、時間経過に伴うマルチボクセル活動パターンに基づいた、脳領域間の情報接続性を測定する方法について解説します。また、従来の機能的接続性手法と比較した際の本アプローチの利点についても強調します。
情報接続性(IC)は、単変量的な差がないものの明確なマルチボクセルパターンを示す条件下において、従来の機能的接続性(FC)では検出不可能な脳ネットワーク間の相互作用を検出することで、神経科学研究における重要な課題を解決します。この能力は、疾患表現型を駆動する認知または行動表現型に関連したメカニズム経路を明らかにすることにより、神経精神疾患の創薬におけるターゲットバリデーションを強化します。平均的な活性化ではなく、分散した情報ダイナミクスに基づいて接続性を分離することで、ICは創薬の早期段階におけるターゲットエンゲージメントおよび経路変調に対する予測的信頼性をサポートします。
情報的なコネクティビティ(Informational connectivity)は、仮説検証からリード化合物の同定に至る探索のコンティニュアム(連続体)に適合します。特に、分散した神経情報処理の理解がターゲットのバリデーションやメカニズムの解明に不可欠であるCNS(中枢神経系)創薬において、その重要性は高まります。