Scalable Nanohelices for Predictive Studies and Enhanced 3D Visualization

Kwyn A. Meagher; Benjamin N. Doblack; Mercedes Ramirez; Lilian P. Davila

doi:10.3791/51372

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Engineering

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Scalable Nanohelices for Predictive Studies and Enhanced 3D Visualization

予測研究および拡張の3D可視化のためのスケーラブルなNanohelices

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08:03 min

November 12, 2014

DOI: 10.3791/51372-v

Kwyn A. Meagher¹, Benjamin N. Doblack¹, Mercedes Ramirez², Lilian P. Davila¹

¹Materials Science and Engineering, School of Engineering,University of California Merced, ²Computer Science and Engineering, School of Engineering,University of California Merced

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

nanohelical構造の正確なモデリングは、新規ナノテクノロジー応用につながる予測シミュレーション研究のために重要である。現在、ソフトウェアパッケージおよびコードは、原子論らせんモデルを作成する際に制限されています。私たちは2つのシミュレーションのための原子論nanohelicalモデルを作成するように設計手順、および可視化を通じて、研究を強化するためのグラフィカル·インターフェースを提示する。

この手順の全体的な目標は、分子動力学またはMDシミュレーション用のオープンソースコードを使用して、ヘリカル、ナノスプリング、およびナノリボンの原子モデルを作成することです。このビデオでは、まず適切な原子バルクシリカ入力ファイルとオープンソースのナノスプリンギングカーバーのプログラムファイルを準備して、シリカガラスナノスプリンギングモデルを準備する方法について説明します。2番目のステップは、Linux PCでMATLABを起動し、nano springing carverグラフィカルユーザーインターフェイスを使用して、目的のnanoスプニングモデルを生成することです。

次に、ナノス・スプリング・カーバーの結果をオープンソースのビジュアライザーで検証します。最後のステップは、ばねのMD引張シミュレーションで結果を使用することです。最終的には、材料イノベーション研究に向けたMDシミュレーションのために、明確に定義されたスケーラブルなさまざまなナノヘリカルモデルを効果的に生成することができます。

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