Nanomanipulation of Single RNA Molecules by Optical Tweezers

William Stephenson; Gorby Wan; Scott A. Tenenbaum; Pan T. X. Li

doi:10.3791/51542

JoVE Journal
Bioengineering

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Nanomanipulation of Single RNA Molecules by Optical Tweezers

光ピンセットによる単一のRNA分子のナノマニピュレーション

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06:59 min

August 20, 2014

DOI: 10.3791/51542-v

William Stephenson¹, Gorby Wan², Scott A. Tenenbaum^3,4, Pan T. X. Li^4,5

¹Nanoscale Engineering Graduate Program, College of Nanoscale Science and Engineering,University at Albany, State University of New York, ²Nanoscale Science Undergraduate Program, College of Nanoscale Science and Engineering,University at Albany, State University of New York, ³Nanobioscience Constellation, College of Nanoscale Science and Engineering,University at Albany, State University of New York, ⁴The RNA Institute,University at Albany, State University of New York, ⁵Department of Biological Sciences,University at Albany, State University of New York

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

光ピンセットは、個々の分子を5'末端と3'末端から引き伸ばすことにより、RNAの折り畳みを研究するために使用されてきました。ここでは、ピンセット用のRNA分子を合成するための一般的な手順、装置のキャリブレーション、および単一分子を操作する方法について説明します。

次の実験の全体的な目標は、RNA構造上の単一分子の機械的アンフォールディング実験を実証することです。最初のステップでは、フローチャンバーが構築され、装置に取り付けられます。第2ステップでは、ミクロンサイズのビーズを目的のRNAサンプルと混合し、次に2つの異なるサイズのビーズをフローチャンバーにロードします。

最後に、フローチャンバーと光トラップを使用してビーズを互いに接触させ、さまざまな単一分子相互作用を評価できます。最終的に、このナノマニピュレーション技術は、二次および三次構造レベルでのRNAの折り畳みを研究するために使用できます。この方法は、RNAがどのように折り畳まれ、展開されるのかなど、RNAフォールディング分野の重要な質問に答えるのに役立ちます。

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