2015年9月23日
このプロトコルは、パラホルムアルデヒド接頭辞を持つ脳に理想的な迅速かつ簡素化されたin situハイブリダイゼーション法を説明しています。したがって、新鮮な凍結組織を使用しながら、長時間の複雑なステップの必要性を減らすことができます。 この方法は、ラットのセロトニン5-HT2A受容体遺伝子htr2aの同定を使用して検証されます。
この手順の全体的な目標は、パラフォームアルデヒド接頭辞付き脳組織でC2の迅速なハイブリダイゼーションを実行することです。これは、最初に脳組織切片を脱水し、前処理1、2、および3の試薬で切片を処理することによって達成されます。第2ステップは、切片を第一級オリゴヌクレオチドプローブとハイブリダイズし、次に第2、第3、第4のプローブとハイブリダイズすることです。
次に、高速赤色基質を添加して、ターゲットRNAを検出します。最後のステップは、Image JソフトウェアでmRNAシグナルのレベルを定量化することです。最終的には、実験群と対照群を比較することで、RNA遺伝子発現の変化を得ることができます。
この手法が既存の方法と比較した場合の主な利点は、比較的単純で、安価で再現性があり、完了までに2日もかからないことです。この研究は、私とロス大学獣医学部のJohn Jay Lenan氏、フロリダアトランティック大学医学部のJean Soza氏とRU Tao氏によって開発されました。この手順では、彼女の脱水症は、マイナス摂氏80度の冷凍庫に保管された顕微鏡スライドボックスから4枚のスライドを取ります。
P-P-I-B-D-A-P-BおよびHTの2つのA遺伝子の検査に切片を割り当て、ボールペンで標識します。次に、スライドをアルコール100%に室温で5分間浸します。その後、各セクションに1つの試薬を前処理ピペット20マイクロリットルのヒュームフードでスライドを5分間乾燥させ、水分トレイのラックレールにスライドを置きます。
水平シェーカーでモイスチャートレイを低速で10分間静かに振ってください。次に、スライドを二重蒸留水で2分間2回洗います。スライドを前処理2試薬の450ミリリットルを含む1000ミリリットルのビーカーに浸します。
次に、スライドを100°Cで合計5分間煮沸し、RNA構造を回復させます。その後、スライドを二重蒸留水で2回、毎回2分間洗浄します。スライドを100%アルコールに5分間置きます。
次に、スライドを5分間乾かします。ヒュームフードで、疎水性ペンを使用して、ティッシュセクションの選択した領域の周りに円を描きます。続いて、前処理3試薬の10マイクロリットルを各選択領域にピペットで注入し、プローブの浸透性を高め、水分トレイを蓋で覆う。
次に、水平シェーカーを備えたハイブリダイゼーションオーブンにトレイを置きます。オーブンの温度を摂氏40度に設定し、トレイを30分間静かに振ってくださいその後、スライドを二重蒸留水で毎回2分間2回洗います。このステップでは、選択した領域に10マイクロリットルのP-P-I-B-D-A-P-BまたはHTR two Aプローブをピペットで固定します。
次に、試薬の蒸発を防ぐために、水分トレイを蓋で覆います。水平シェーカーでスライドを低速で静かに振とうし、オーブンで摂氏40度で2時間インキュベートします。次に、スライドを洗浄バッファーで2回ずつ2分間ずつ洗浄し、選択した各領域に10マイクロリットルの増幅試薬をピペットで移す。
スライドを振って、摂氏40度で30分間インキュベートします。次いで、スライドを洗浄バッファーで2回ずつ2回洗浄し、選択した各領域に増幅2試薬の10マイクロリットルをピペットで注入する。スライドを振って、摂氏40度で15分間インキュベートします。
その後、スライドを洗浄バッファーで2分間2回洗浄します。毎回、選択した各領域に増幅3試薬の10マイクロリットルをピペットで移します。スライドを振って、摂氏40度で30分間インキュベー
トします。次に、スライドを洗浄バッファーで2分間2回洗浄します。選択した各領域に増幅4つの試薬を10マイクロリットルピペットで取り付けます。スライドを振って、摂氏40度で15分間インキュベートします。
次に、スライドを洗浄バッファーで2分間2回洗浄します。選択した各領域に増幅5つの試薬を10マイクロリットルピペットします。スライドを振盪し、室温で30分間インキュベー
トします。その後、スライドを洗浄バッファーで2分間2回洗浄します。選択した各領域に増幅6試薬の10マイクロリットルをピペットします。スライドを振盪し、室温で15分間インキュベー
トします。次に、スライドを再度2回、洗浄バッファーで毎回2分間洗浄します。次に、選択した各領域に10マイクロリットルの赤い試薬をピペットで移動し、スライドを水平シェーカーの水分トレイに室温で置き、低速で10分間静かに振とうします。次に、スライドを二重蒸留水で10分間2回洗います。
毎回、スライドをオーブンで摂氏60度で15分間乾燥させます。その後、スライドをキシレンのヒュームフードに5分間置きます。次に、選択した各領域に20マイクロリットルのキシレンベースの封入剤をピペットで固定し、カバースリップで覆います。
この手順では、画像ファイルをメイン画像Jウィンドウにドラッグアンドドロップします。メニューバーに移動し、画像を選択します。次に、ドロップダウンメニューからタイプを選択し、8ビットを選択します。
次に、[調整]を選択し、[しきい値]を選択してダイアログボックスを開きます。ダイアログボックスの下側のバーの値を調整して、不要な背景が削除されるようにします。メニューバーに移動して「分析」を選択し、「パーティクルの分析」を選択して 2 つ目のダイアログボックスを開きます。
粒子サイズを 10 に設定します。次に、[アウトラインの表示] を選択し、[結果の表示] と [集計ボックス] を選択します。最後に、[OK] をクリックして、ダイアログ ボックスにパーティクル データを表示します。
スプレッドシート計算では、データをExcelシートに入力し、生理食塩水グループ内の粒子の数をベースラインとして平均化します。次に、各セクションのパーセンテージレベルを計算し、それに応じてグラフを作成します。これは、赤い点で示されているハイブリダイゼーションシグナルの光顕微鏡図です。
以前に生理食塩水とMDMAで治療された深く麻酔されたラットでは、組織にパラホルムアルデヒドが接頭辞として付けられました。使用されるオリゴヌクレオチドプローブは、D-A-P-B-P-P-I-B、およびHT two A.この図は、以前にMDMAで治療したラットにおける視床下部HT two A遺伝子発現への影響を示し、HT twoの発現が観察された。この技術により、神経科学の分野の研究者は、脳組織の高さを接頭辞として付加したパラフォームのin situ化を使用して、メッセンジャーRの遺伝子発現を測定することが容易になります。
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本プロトコルでは、パラホルムアルデヒド固定脳組織に最適な、迅速かつ簡便なin situハイブリダイゼーション法について説明します。この手法は、新鮮凍結組織を使用することで、長期にわたる複雑な工程の必要性を軽減しており、ラットにおけるセロトニン5-HT 2A受容体遺伝子htr2aの同定を通じて検証されています。
パラホルムアルデヒド固定脳組織におけるオリゴヌクレオチドプローブを用いた迅速なin situ ハイブリダイゼーションにより、疾患関連モデルにおける遺伝子発現変化の効率的かつ定量的な評価が可能になります。この簡略化されたプロトコルは、ワークフローの複雑さとターンアラウンドタイムを軽減し、神経薬理学のパイプラインにおける信頼性の高いターゲットバリデーションおよびメカニズムのデリスキングを支援します。この手法は、前臨床研究において再現可能でスケーラブルなmRNA定量を可能にすることで、ポートフォリオの意思決定を向上させます。
本手法は、パラホルムアルデヒド固定組織における迅速かつ定量的な遺伝子発現解析を可能にすることで、ターゲットのバリデーションとメカニズム研究の両方を支援し、創薬から前臨床に至る連続的なプロセスに組み込まれます。