Name: 高スループットゼブラフィッシュエネルギー消費アッセイ (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-01-27T17:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 35 s
Description: 学ぶゼブラフィッシュ幼生の高スループットエネルギー消費アッセイ。レサズリン蛍光法でNADH2産生を測定し、薬物や遺伝子操作が代謝率に与える影響を評価します。肥満研究や創薬スクリーニングに応用可能です。

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著者は、以前に発表されたこのアッセイの適用を検証するための貢献に対して、Roger Cone博士とChao Zhang博士に感謝したいと思います。 本研究は NIH 1F32DK082167-01 (BJR) の支援を受けました。

注：このプロトコルは、研究の責任ある行動のためのアリゾナ大学の事務所のガイドラインに従っており、施設内動物管理使用委員会によって承認されました 1.ゼブラフィッシュの繁殖や胚のメンテナンス<ol><li> E3胚媒体 8 を準備します。 60Xストック溶液を作るために、1.95 L ddiH 2 O中に34.8グラムのNaCl、1.6グラムのKCl、5.8グラムの塩化カルシウム2●2H 2 O、および9.78グラムのMgCl 2●6H 2 Oを溶解ddiH 2 Oを使用して、2リットルにボリュームを調節NaOHおよびHClを用いてpHを7.2に調整します</li><li> 1倍のE3胚の培地を調製するために、1 L ddiH20に16.5ミリリットル60倍株式を希釈します。 100μlの1％のメチレンブルーを追加します。 </li><li>育種<ol><li>ハウス男性と女性ひな株式（7 - 生後18ヶ月）を別々に繁殖力を最大限に高めることができます。 </li><li>卵が所望される前日に前に2時間 - 1からライトをオンにします。 C言語で - セットアップ交配（2人の女性1男性と1）以前に9に記載されているようにケージをrossing。彼らは大人の魚は保持されたタンクインサートの穴あきベースを通過する卵が捕食を逃れるためにするための横断ケージができます。 </li><li>オプション：時限繁殖のために、（モルホリノ注入を含む研究のために必要とされるように）、透明なプラスチックの分周器によって、オスとメスの魚を分離し、卵と受精のタイミング敷設をもたらすことが午前中にこれを削除してください。モルホリノ研究のために、治療ごとに必要な魚の胚の数を評価するためにパワー計算を実行します。効果や変動の大きさの推定値がなければ、予備試験では、N = 8で実行することができます。 </li></ol></li><li> （ - 150胚/ 10cmのペトリ皿100）ペトリ皿に交差ケージから卵を注ぎます。卵は皿の底に沈殿し、水を注ぎ出すようにします。先端の細い使い捨てのトランスファーピペットを用いて、残りの水を除去します。ステップ1.1で行われたE3の胚培地を追加し直します。 </li><li> AFを作ります将来卵や魚転送用のラメポリッシュ使い捨てピペット。はさみを使用して、0.25ミリリットルの卒業で卒業使い捨てトランスファーピペットをカット。ラフなエッジを削除するには、炎はブンゼンバーナーの上にカットチップを磨きます。 </li><li>ゼブラフィッシュのE3胚の培地中のペトリ皿28.5○Cで受精後10センチメートル中（DPF）4日に胚魚を維持1日2回、洗練された火炎を使用するすべての未受精卵または死ん胚（不透明な白い外観）を除去するために使い捨てのトランスファーピペットを卒業。 1日に1回、E3胚培地を交換してください。 E3の胚培地を捨て、先端の細い使い捨てのトランスファーピペットを使用して残りの液体を除去し、予め温めた（28.5○C）のE3胚培地を再度追加。 </li></ol> 2.アッセイ溶液を調製<ol><li> 0.22μmのフィルターを使用して、表1の無菌フィルターアッセイ溶液によるアッセイ溶液を調製します。アッセイ開始前に、28.5○Cで滅菌アッセイ溶液を温めます水浴。 </li></ol><table fo:keep-together.within-page="1"><tbody><tr><td>成分</td><td>合計の％ </td><td>容量（μL/ 10ミリリットル） </td></tr><tr><td> 60X E3胚培地</td><td> 1.667 </td><td> 166.7 </td></tr><tr><td>二重脱イオン（DDI）、H 2 O </td><td> 96.233 </td><td> 9623.3 </td></tr><tr><td>アラマーブルー</td><td> 1 </td><td> 100 </td></tr><tr><td> 400mMのNaOHを</td><td> 1 </td><td> 100 </td></tr><tr><td> DMSO </td><td> 0.1 </td><td> 10 </td></tr></tbody></table> 表1アッセイ培地 3.アッセイを行います<ol><li>ゼブラフィッシュの胚を滅菌濾過したのE3胚培地で3回洗浄します。クラッチからのすべての実行可能なゼブラフィッシュの胚をビーカーに結合します。滅菌フィルタ75ミリリットルのE3胚培地。先端の細い使い捨てトランスファーピペット、再使用できるだけゼブラフィッシュ胚からのE3胚培地の多くを移動します。 20ミリリットルに戻って濾過滅菌のE3胚培地を追加します。削除およびE3胚培地を3回交換してください。 </li><li> 96ウェル黒色の93ウェルの各々にプレート1魚は明確な底板を両面。個別に炎の中に胚を捕捉することにより、プレートに胚魚を移し卒業プラスチック使い捨てトランスファーピペット（ステップ1.5）を研磨し、優しくウェルに放出します。 3ブランクウェルにすすぎ、魚の入ったビーカーから取り出したのE3胚培地を転送します。これは、ブランクウェルには魚が含まれている井戸とまったく同じ水にさらされていることを保証します。魚やブランクウェルを含める両方ウェルは、このステップの終了時（200μl）を1/2以上完全でなければなりません。 </li><li>ブランクウェルを含む96ウェル全てにおいて、アッセイ溶液でのE3胚培地を交換してください。このステップは、96ウェルプレート中12各列の時に1列を実行する必要があります。先端の細い使い捨てのトランスを使用しましたFERピペットは、プレートの1列（8ウエル）ですべてのウェルからのE3胚培地を除去します。ゼブラフィッシュの胚には手を触れないように注意してください。水を除去しただけでなく、そこからそれぞれにアッセイ溶液を300μlを追加します。プレートの全12列のためのアッセイ溶液でのE3胚培地と交換の除去を繰り返します。 </li><li>オプション：化合物に応答した代謝率の変更をテストするには、100倍（100X）所望の治療濃度で溶液を作製。注目すべきは、100X溶液は0.1％を超えないように、最終DMSO濃度を制限するために10％のDMSOを超えないことを保証します。治療の各ウェルに100倍液の3μLを追加します。 注：処理ウェルの数を評価するために、電力の計算を実行します。しかし、応答または変動の大きさの推定値なしに、予備試験は8化合物で処理し、魚が含まれている8ビヒクル処置対照ウェルで実行することができます。 <ol><li> （コントロールに何のDRUを車両制御の3μlを添加していませんグラム処理）魚が含まれている井戸。化合物に対する蛍光応答が魚内のアクションの結果であることを保証するために、96ウェルプレートに3ブランクウェルに薬物および車両の治療を適用します。 </li></ol></li><li> 590 nmで530 nmでの励起波長および発光波長で蛍光プレートリーダー上の魚満たさプレートをお読みください。 </li><li> 28.5○C（アッセイ溶液の光退色を避けるために、アッセイ全体の暗闇の中でプレートを維持する）に設定加湿インキュベーターに置きプレート。アッセイは、1時間から24時間の範囲の時間の持続時間のために実行することができます。アッセイの持続時間は、研究の目的に依存します。短い期間が最も適切である短時間作用型非安定な化合物への応答をテストするため。しかし、安定した化合物の検査や遺伝的影響のテストのために、分析時間を最大にすることの累積信号に関連する利点を活用することが好ましいです。 </li><li>所定の時間点で（タイミングを判断するためにステップ3.6参照）ステップ3.5と同じ設定で、再び魚で満たされたプレートの蛍光を読み取ります。 </li></ol> 4.治療と蛍光関連の相対的変化を評価します<ol><li>研究の結論での蛍光から時間0での蛍光を差し引くことにより、各ウェルの蛍光の変化を計算します。魚ないウェル（ブランク）はるかに魚が含まれているウェルからの値の下に、0に近い値を持つ必要があります。 時間0での蛍光 - 終了時に蛍光=蛍光の変化</li><li>対照ウェルは、その後、コントロールウェルの蛍光の平均変化によって、各ウェルの蛍光の変化を分割するための蛍光の相対的変化を確認するために、蛍光の平均変化を計算します。注目すべきは、コントロールは、車両コントロールまたは遺伝的コントロールのどちらかである可能性があります。 <img alt="式（1）" src="/files/ftp_upload/53297/53297eq1.jpg" /></li></ol>

<ol><li>Jao, L. E., Wente, S. R., Chen, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Efficient+multiplex+biallelic+zebrafish+genome+editing+using+a+CRISPR+nuclease+system%5BTitle%5D)+AND+%22PNAS%22%5BJournal%5D)">Efficient multiplex biallelic zebrafish genome editing using a CRISPR nuclease system.</a> PNAS. 110, 13904-13909 (2013).</li>
<li>Kimura, Y., Hisano, Y., Kawahara, A., Higashijima, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Efficient+generation+of+knock-in+transgenic+zebrafish+carrying+reporter%2Fdriver+genes+by+CRISPR%2FCas9-mediated+genome+engineering%5BTitle%5D)+AND+%22Sci.+Rep%22%5BJournal%5D)">Efficient generation of knock-in transgenic zebrafish carrying reporter/driver genes by CRISPR/Cas9-mediated genome engineering.</a> Sci. Rep. 4, 6545(2014).</li>
<li>Lieschke, G. J., Currie, P. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Animal+models+of+human+disease%3A+zebrafish+swim+into+view%5BTitle%5D)+AND+%22Nat.+Rev.+Genet%22%5BJournal%5D)">Animal models of human disease: zebrafish swim into view.</a> Nat. Rev. Genet. 8, 353-367 (2007).</li>
<li>Brand, M. D., Couture, P., Else, P. L., Withers, K. W., Hulbert, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolution+of+energy+metabolism.+Proton+permeability+of+the+inner+membrane+of+liver+mitochondria+is+greater+in+a+mammal+than+in+a+reptile%5BTitle%5D)+AND+%22Biochem.+J%22%5BJournal%5D)">Evolution of energy metabolism. Proton permeability of the inner membrane of liver mitochondria is greater in a mammal than in a reptile.</a> Biochem. J. 275 (Pt 1), 81-86 (1991).</li>
<li>Renquist, B. J., Zhang, C., Williams, S. Y., Cone, R. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+of+an+assay+for+high-throughput+energy+expenditure+monitoring+in+the+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Zebrafish%22%5BJournal%5D)">Development of an assay for high-throughput energy expenditure monitoring in the zebrafish.</a> Zebrafish. 10, 343-352 (2013).</li>
<li>Livingston, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+volumetric+respirometer+for+long-term+studies+of+small+aquatic+animals%5BTitle%5D)+AND+%22J.Mar.+Biol.+Assoc.+U.K%22%5BJournal%5D)">A volumetric respirometer for long-term studies of small aquatic animals.</a> J.Mar. Biol. Assoc. U.K. 48, 485-497 (1968).</li>
<li>Makky, K., Duvnjak, P., Pramanik, K., Ramchandran, R., Mayer, A. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+whole-animal+microplate+assay+for+metabolic+rate+using+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Biomol.+Screen%22%5BJournal%5D)">A whole-animal microplate assay for metabolic rate using zebrafish.</a> J. Biomol. Screen. 13, 960-967 (2008).</li>
<li>E3 medium (for zebrafish embryos) Cold Spring Harb. Protoc. , <a target="_blank" href="http://cshprotocols.cshlp.org/citmgr?gca=protocols%3B2011%2F10%2Fpdb.rec66449">http://cshprotocols.cshlp.org/citmgr?gca=protocols%3B2011%2F10%2Fpdb.rec66449</a> (2011).</li>
<li>Nasiadka, A., Clark, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Zebrafish+breeding+in+the+laboratory+environment%5BTitle%5D)+AND+%22ILAR+J%22%5BJournal%5D)">Zebrafish breeding in the laboratory environment.</a> ILAR J. 53, 161-168 (2012).</li>
<li>Brand, M., Granato, M., Nusslein-Volhard, C. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBrand%2C+M+%22Zebrafish%2C+A+practical+approach%22">Zebrafish, A practical approach</a>. Nusslein-Volhard, C., Dahm, R. , Oxford University Press. (2002).</li>
<li>Fry, F. E. J., Hart, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cruising+speed+of+goldfish+in+relation+to+water+temperature%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Fish.+Res.+Board+Can%22%5BJournal%5D)">Cruising speed of goldfish in relation to water temperature.</a> J. Fish. Res. Board Can. 7, 169-175 (1948).</li>
<li>Oka, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diet-induced+obesity+in+zebrafish+shares+common+pathophysiological+pathways+with+mammalian+obesity%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+physiol%22%5BJournal%5D)">Diet-induced obesity in zebrafish shares common pathophysiological pathways with mammalian obesity.</a> BMC physiol. 10 (21), (2010).</li>
<li>Song, Y., Cone, R. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Creation+of+a+genetic+model+of+obesity+in+a+teleost%5BTitle%5D)+AND+%22FASEB+J%22%5BJournal%5D)">Creation of a genetic model of obesity in a teleost.</a> FASEB J. 21, 2042-2049 (2007).</li>
<li>Maddison, L. A., Joest, K. E., Kammeyer, R. M., Chen, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Skeletal+muscle+insulin+resistance+in+zebrafish+induces+alterations+in+beta-cell+number+and+glucose+tolerance+in+an+age+and+diet+dependent+manner%5BTitle%5D)+AND+%22Am.+J.+physiol.+Endocrinol%22%5BJournal%5D)">Skeletal muscle insulin resistance in zebrafish induces alterations in beta-cell number and glucose tolerance in an age and diet dependent manner.</a> Am. J. physiol. Endocrinol. , (2015).</li>
<li>Flynn, E. J. 3rd, Trent , C. M., Rawls, J. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ontogeny+and+nutritional+control+of+adipogenesis+in+zebrafish+%28Danio+rerio%29%5BTitle%5D)+AND+%22J.+lipid+res%22%5BJournal%5D)">Ontogeny and nutritional control of adipogenesis in zebrafish (Danio rerio).</a> J. lipid res. 50, 1641-1652 (2009).</li>
<li>Shimada, Y., Hirano, M., Nishimura, Y., Tanaka, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+high-throughput+fluorescence-based+assay+system+for+appetite-regulating+gene+and+drug+screening%5BTitle%5D)+AND+%22PloS+one%22%5BJournal%5D)">A high-throughput fluorescence-based assay system for appetite-regulating gene and drug screening.</a> PloS one. 7, e52549(2012).</li>
<li>Tingaud-Sequeira, A., Ouadah, N., Babin, P. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Zebrafish+obesogenic+test%3A+a+tool+for+screening+molecules+that+target+adiposity%5BTitle%5D)+AND+%22J.+lipid+res%22%5BJournal%5D)">Zebrafish obesogenic test: a tool for screening molecules that target adiposity.</a> J. lipid res. 52, 1765-1772 (2011).</li>
</ol>

著者らには、開示すべき競合する金銭的利益はありません。

細菌や真菌の混入が大幅にこのアッセイの適用を制限します。 E3胚培地中でメチレンブルーは、真菌汚染の可能性を制限します。胚全体に飼育ケアは毎日二度死んだ胚を除去するために取られることが重要です。加えて、徹底的に分析開始の日に、無菌のE3胚培地で胚を洗浄することが不可欠です。これらの2つのステップは、胚の細菌汚染の可能性を制限します。ステップ3.2に記載のブランクウェルを含めることは、任意の細菌汚染の検出を可能にします。測定可能な信号を生成する細菌汚染は稀です。ブランクウェルには強いシグナルを示して行う場合は、アッセイは、胚の清浄度を維持するために注意しながら繰り返されるべきです。ユーザーは汚染が前胚コレクションに起因していることを想定している場合、胚は、先に説明した（p。22）10として漂白することができます。また、実験者はそれを疑う場合汚染は、ユーザーが4 DPF（P。23）10に後方にペニシリンおよびストレプトマイシンを胚をE2を使用することができ、コレクションの後に発生されます。 このアッセイは胚におけるアプリケーションの価値がある...

マウスは現在、肥満研究のための主要なモデルです。ショート発生間隔とマウスで利用可能な遺伝子ツールは、これまでに比類のないされています。しかし、ゼブラフィッシュも短く発生間隔があり（3から4ヶ月）と遺伝子操作1,2の容易さであっても、マウスを凌駕しています。これまでの遺伝子と薬剤スクリーニング3で使用するための子孫と潜在的な数でマウスを越えるとゼブラフィッシュは、哺乳動物遺伝子の約90％を維持しています。 肥満研究のためのゼブラフィッシュモデルの可能性をタップするには、アッセイは、エネルギー消費を含む体重調節に影響を与える要因を調査するために開発されなければなりません。代謝産物は、β酸化によって処理され、トリカルボン酸サイクルの酸素が ​​消費され、NADH 2が生成されます。このように、NADH 2は、代謝経路（代謝物の酸化）を介して、代謝物のフラックスの直接的な指標です。 poikilで恒温動物4に比べて5倍低い- otherms、H + ATP合成からNADH 2酸化を脱共役ミトコンドリア内膜、漏れるは、4です。したがって、2ゼブラフィッシュNADHには非常にしっかりと酸化的リン酸化を介してATP産生にリンクされています。ここで、我々は、エネルギー消費5のプロキシとして幼虫のゼブラフィッシュにおけるNADH 2産生を測定するアッセイを説明します。 酸素消費量は、エネルギー消費を測定するためのゴールドスタンダードです。しかし、最高のゼブラフィッシュの高スループットの可能性を活用するために、エネルギー消費のアッセイは、ハイスループットに従順でなければなりません。密閉チャンバー循環系に依存酸素消費システムは、利用可能なチャンバ6の数でスループットが制限されます。外気O 2消費量/ CO 2産生のアッセイはまた、ゼブラフィッシュ5,7に適用されています。これらのオープンエアの96ウェルプレートベースDシステムは、ハイスループットに適しています。残念ながら、環境とのガス交換は、これらのアッセイの感度を制限します。我々は最近、酸化還元指示薬アラマーブルー5を使用して、NADH 2をモニターするアッセイのアプリケーションを発表しました。このアッセイは、スループットおよびゼブラフィッシュにおける酸素消費量の分析に共通の感度の限界を克服します。 ゼブラフィッシュは、全身のエネルギー恒常性の研究のためにますます重要なモデルとなってきています。一部では、ゼブラフィッシュため、前方の遺伝子スクリーニングおよび薬物スクリーニングでの使用に適しています。また、ノックダウンとノックインを含む遺伝子操作を、ターゲットに、迅速に適用することができます。我々は以前に、このアッセイは、化合物および代謝率5を変更する遺伝子を同定するためにバス薬物適用および遺伝子ノックダウンまたはノックアウトと組み合わせることができることを示しています。さらに、このアッセイは、ゼブラフィッシュに固有の高スループットの利点を活用するように設計されています。 </P&gt;

<table><tbody><tr><td>AlamarBlue</td><td>Fisher Scientific</td><td>10-230-103</td><td>Thermo Scientific</td></tr><tr><td>Fine Tip DisposableTransfer Pipette</td><td>Fisher Scientific</td><td>13-711-26</td><td>Thermo Scientific</td></tr><tr><td>Fisherbrand製造 目盛り付き使い捨てトランスファーピペット</td><td>Fisher Scientific</td><td>13-771-9AM</td><td>Thermo Scientific</td></tr>製 <tr><td>ブラックサイドクリアボトム96ウェルプレート</td><td>フィッシャーサイエンティフィック</td><td>50-320-785E</td><td>&製Kサイエンティフィックプロダクツ株式会社</td></tr></tbody></table>

高スループット<em&gt;ゼブラフィッシュ</em&gt;エネルギー消費アッセイ

High Throughput Danio Rerio Energy Expenditure Assay

ゼブラフィッシュは、ゼブラフィッシュエネルギー恒常性と肥満の研究に広く適用モデルにする可能性を持っている固有の利点と重要なモデル生物です。ゼブラフィッシュの小さなサイズは、96または384ウェルプレート形式で実施される胚でのアッセイを可能にする、モルホリノ及びCRISPRベースの技術は、バス・アプリケーションによって遺伝子操作の容易性、および薬物治療を促進する実行可能です。また、ゼブラフィッシュは、新規遺伝子の発見を可能にし、前方の遺伝子スクリーニングに最適です。肥満のモデルとしてゼブラフィッシュの相対的新規性を考えると、それは完全にこれらの利点を活用するツールを開発することが必要です。ここで、我々は同時に、胚ゼブラフィッシュの数千にエネルギー消費を測定するための方法が記載されています。我々は個々の魚を隔離するために96ウェルプレートを使用した全動物のマイクロプレートプラットフォームを開発していると我々は、市販の細胞培養の生存率の再を使用して、累積NADH 2産生を評価しますエージェントアラマーブルー。 poikilothermsでNADH 2生産とエネルギー消費の関係が緊密にリンクされています。このエネルギー消費アッセイは急速に直接エネルギー消費を変更するか、適用された薬剤（例えば、インスリン増感剤）に対する応答を変化させる薬理学的または遺伝子操作をスクリーニングする可能性が作成されます。

アッセイ溶液は、胚魚（ 図1）の非存在下で蛍光を増加させません。しかし、このアッセイは、ウェル内の代謝率の小さな変化に非常に敏感です。ウェル内の単一の魚は1時間（P &lt;0.0001）内のブランクウェルと著しく異なる信号を生成する。 図2は、インキュベーションの24時間後に胚魚によって生成された信号を視覚的に表現しています。この写真の目的のために明確な両面ウェルを用いました。しかし、黒側のウェルは、近くのウェルからの蛍光シグナルの浸出を防止するために、アッセイの性能のために好ましいです。 アラマーブルーのNADH 2誘導性の減少は非可逆的であるため、信号は時間とともに蓄積します。小さな変化が増幅されることを可能にします。差が蓄積​​し、従って時間と共に増加することを示すために、我々は、（2、1で1〜5の魚によって誘発される蛍光の相対的な変化を監視し、4時間図3）。魚/ウェルの蛍光の相対的変化の各​​番号にはかなりの時間（P &lt;0.001）と増加しました。信号が時間とともに蓄積するので...

ゼブラフィッシュは、エネルギー恒常性の研究にとって重要なモデル生物です。 NADH2感受性酸化還元インジケーターであるalamar Blueを利用することで、ゼブラフィッシュの幼生の代謝率を96ウェルプレート形式で測定するアッセイを開発し、薬物や遺伝子の発見に適用することができます。

Zebrafish are an important model organism with inherent advantages that have the potential to make zebrafish a widely applied model for the study of ...

このハイスループットなレザズリンベースの蛍光測定アッセイの全体的な目的は、代謝率の指標となるNADH2産生に対する遺伝学的または薬理学的操作の影響をモニタリングすることです。本手法は、特定の薬剤や遺伝子が代謝率に及ぼす影響など、肥満研究分野における重要な問いに答えるのに役立ちます。さらに、このアッセイは、個体レベルのシステムにおける潜在的な薬物相互作用や薬物・遺伝子相互作用のスクリーニングに適用することが可能です。酸素消費量測定法と比較した本アッセイの主な利点は、ハイスループットであることと、時間の経過とともにシグナルが蓄積されることで、代謝率のわずかな差を検出できることです。本手順の実演は、私の研究室の大学院生であるCaroline Foyが行います。テキストのプロトコルに従ってE3培地の60倍ストック溶液を調製した後、ストック溶液16.5 mLと2回蒸留水1 Lを混ぜて1倍E3培地を調製します。次に、1%メチレンブルーを100 µL加えます。卵および魚の移送用フランムポリッシュ済み使い捨てピペットを作成するには、目盛り付き使い捨て移送ピペットを、0.25 mLの目盛り位置でハサミで切断します。その後、切り口の粗いエッジを取り除くため、ブンゼンバーナーを使用して切断端を火炎研磨（フレームポリッシュ）します。ゼブラフィッシュの交配を行い卵を回収した後、卵をディッシュの底に沈殿させ、水を捨てます。先端の細い使い捨て転送ピペットを使用して、残っている水をすべて取り除いてください。その後、E3 mediumを再び加えます。受精卵を28.5 °Cで受精後4日（DPF）までインキュベートします。1日2回、火炎研磨した使い捨ての卒業分注ピペットを使用して、未受精卵または死滅した胚を除去します。その後、1日1回、E3培地を捨てます。先細のトランスファーピペットを用いて残っている培地をすべて取り除き、28.5 °Cに予熱した新鮮なE3培地と交換します。エネルギー消費測定を行うために、以下の表に従って測定溶液を調製します。0.22 µmフィルターを用いて溶液をろ過滅菌し、ウォーターバスで28.5 °Cに温めてから測定に使用します。ペトリ皿の中で、そのクラッチの生存しているゼブラフィッシュ胚をすべてまとめます。75 mLのE3培地をフィルター滅菌した後、先細りの使い捨て転送ピペットを用いて、ペトリ皿から可能な限り多くのE3培地を除去します。そこに滅菌済みのE3を20 mL加えます。その後、滅菌済みE3の除去と置換をさらに2回繰り返します。次に、火炎研磨したプラスチック製の使い捨て graduatied 転送ピペットを用いて、個々の魚胚を96ウェルプレートの各ウェルに移します。プレートの列ごとに作業を行い、まず第1列の8つのウェルからE3培地を除去します。この際、転送ピペットで魚胚に触れないよう注意してください。その後、各ウェルに300 µL のアッセイ溶液を加えます。プレートの全12カラムで同様の操作を繰り返します。薬剤処理を行う場合は、目的化合物の100倍濃度の溶液を調製した後、各処理ウェルに3 µLずつ添加してください。次に、魚のコントロールウェルにビークルコントロールを3 µLずつ添加します。化合物に対する蛍光反応が魚体内の活性によるものであることを確認するため、96ウェルプレートの3つのブランクウェルずつに、薬剤および溶媒（ビークル）による処理を設定します。次に、励起波長530 nm、蛍光波長590 nmに設定した蛍光プレートリーダーを用いて、魚が入ったプレートのウェルを読み取ります。その後、プレートを28.5 °Cに設定した加湿インキュベーターに入れます。アッセイの内容および試験化合物の安定性に応じて、あらかじめ設定したタイムポイントで再度蛍光値を読み取ります。蛍光強度の相対的な変化を評価するために、コントロールウェルの平均蛍光変化量を算出してください。その後、各ウェルの蛍光変化量をコントロールウェルの平均蛍光変化量で除します。以下は、96ウェルプレートの2列を使用した例です。列Aのウェルには溶媒処理した対照群のゼブラフィッシュを、列Bのウェルにはインスリン処理したゼブラフィッシュを加えています。表Aに、時間0で測定した蛍光強度を示します。表Bには、24時間後に測定した蛍光値が示されています。表Cでは、蛍光の変化を評価するため、24時間後の蛍光値から0時間時点の蛍光値を差し引いています。次に、コントロールウェルにおける蛍光変化の平均値を算出してください。表Dは、各ウェルの蛍光変化量をコントロールウェルの平均変化量で除したものです。ここでは、10 micromolarのインスリン処理により、ゼブラフィッシュによって生成されるシグナルが24時間で2.77倍に増加したことが、P値0.0001未満で示されています。こちらに見られるように、胚が存在しない場合、アッセイ溶液の色や絶対蛍光レベルは変化しません。しかし、このアッセイはウェル内の代謝率のわずかな変化に対して非常に敏感です。この図は、24時間インキュベートした後のティラピア胚によって生成されたシグナルを示しています。ピンク色のウェルは、代謝率の高い魚であることを示しています。紫色のウェルは代謝率が中程度の魚を、青色のウェルは代謝率が低い魚を示しています。これは本アッセイの汎用性と、硬骨魚類全般への適用可能性を示すものです。NADH2によって誘導されるalamar blueの還元は不可逆的であるため、信号が時間とともに蓄積し、微小な変化を増幅させることが可能です。ここでは、1匹から5匹の魚によって誘発される、1時間、2時間、および4時間後の蛍光の相対変化を示しています。魚の数が増えるにつれて、蛍光の相対変化は時間とともに有意に増加し、魚の数が多いほど、時間経過に伴う蛍光変化の大きさも大きくなります。この手法を習得すれば、1日あたり最大5,000匹の胚魚に対して実施することが可能です。この手順を行う際は、魚の胚を傷つけないよう細心の注意を払うことが重要です。このアッセイの後、中性脂質のNile red測定や、フルオロアッセイで標識したゾウリムシの取り込みによる食欲（phagic drive）の測定などの他の手順を実施することができます。これにより、代謝率と脂質代謝の関係、あるいは代謝率と食欲の関係を比較することが可能になります。この技術の開発により、エネルギー代謝および代謝性疾患分野の研究者が、スループットの制限なくゼブラフィッシュのエネルギー消費を研究することが可能になりました。このビデオを視聴することで、蛍光試薬であるレサズリンを用いてゼブラフィッシュにおけるNADH2産生量を測定する方法について、十分に理解できるはずです。

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高スループット

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