Transcriptomic Analysis of C. elegans RNA Sequencing Data Through the Tuxedo Suite on the Galaxy Project

Francis R. G. Amrit; Arjumand Ghazi

doi:10.3791/55473

ジャーナル

/

遺伝学

/

のトランスクリプトーム解析 C。エレガンス</emギャラクシープロジェクトのタキシードスイートを通じて> RNAシーケンスデータ

Transcriptomic Analysis of <em>C</em>. <em>elegans</em> RNA Sequencing Data Through the Tuxedo Suite on the Galaxy Project

JoVE Journal
遺伝学

このコンテンツを視聴するには、JoVE 購読が必要です。 サインイン又は無料トライアルを申し込む。

JoVE Journal 遺伝学

Transcriptomic Analysis of C. elegans RNA Sequencing Data Through the Tuxedo Suite on the Galaxy Project

のトランスクリプトーム解析 C。エレガンス</emギャラクシープロジェクトのタキシードスイートを通じて> RNAシーケンスデータ

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

17,358 Views

•

10:19 min

•

April 08, 2017

DOI:

10.3791/55473-v

DOI:

10.3791/55473-v

•

10:19 min

April 08, 2017

•

17340 Views

Francis R. G. Amrit¹, Arjumand Ghazi¹

¹小児科,University of Pittsburgh School of Medicine, Children’s Hospital of Pittsburgh

概要

ギャラクシーとDAVIDバイオインフォマティクストレーニングなしの研究者が分析し、RNA-配列データを解釈できるようにする一般的なツールとして浮上しています。私たちは、 線虫の研究者は、アクセスをRNA-配列実験を行い、銀河を使用してデータセットを処理し、DAVIDを用いた遺伝子リストから意味のある生体情報を取得するためのプロトコルを記述します。