Name: レンズ無料のビデオ顕微鏡、付着性細胞培養の定量的解析 (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2018-02-23T14:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 4 s
Description: 学ぼう、レンズ無料ビデオ顕微鏡を用いた付着性細胞培養の定量的解析法。HeLa細胞を用いた2.7日間のタイムラプス撮影で、細胞周期ダイナミクスと形態学的特徴を追跡し、細胞増殖研究に応用する。

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

著者が認めることを何もありません。

1. 買収の監視培養
<ol><li>DMEM + グルタミン (例えばGlutaMAX) の HeLa 細胞を成長 10% (v/v) 熱不活化牛胎児血清および 1% ペニシリンとストレプトマイシン培。</li>
	<li>フィブロネクチン (25 μ g/mL) 1 h で 6 よくガラス底培養皿をコートします。ウェルあたり 2 x 10 の4セルをシードします。</li>
	<li>買収は、中に 3 日おきに媒体を変更します。</li>
	<li>時間経過の取得ビデオの無料のレンズ顕微鏡 (市販) を使用します。 注: これは、レンズ無料計算イメージング法に基づいて Ozcan et al.による記述で16 37 ° C12,15の温度制御でインキュベーターで継続的な監視を実行する変更されました。1.67 μ m の画素ピッチ 6.4 x 4.6 mm2のイメージング領域と相補的金属酸化物半導体 (CMOS) イメージ センサーを提供しています。複数の波長の照明は、マルチチップ光発光ダイオード (Led) デバイス、赤、緑、青の照明を提供するによって提供されます。波長が中心に、452、521, 636 nm それぞれ、25、45、25 のスペクトル帯域幅を持つ nm それぞれ。赤、緑、青 (RGB) Led は、セルから約 5 cm の距離で 150 μ m のピンホールの上にあります。LED に近い測定光は各波長で 10 μ と低く、照明時間は 1 秒当たりの取得。したがって、写真毒性の問題も、細胞培養、レンズ無料ビデオ顕微鏡下で観察すると必要ありません。</li>
	<li>CMOS センサー (図 1) と接触して置く細胞培養容器を入れなさい。レンズ無料取得の品質にとって重要である下部にガラス基板とコンテナーを使用します。プラスチック容器も使用できますが、レンズ無料獲得がこれらのコンテナーの光質の悪さにより低下します。</li>
	<li>ビデオ レンズ無料顕微鏡集録ソフトウェア (市販) が時間経過の取得とホログラフィック再構成を実行するを制御します。ソフトウェア インターフェイスでユーザーが入力する必要があるパラメーターがフレーム レート、実験、細胞培養、すなわち付着性のセルまたは浮遊細胞の種類の期間。</li>
	<li>集録ソフトウェアの入力パラメーターを設定します。1 つ取得 10 分ごとに、「付着」に細胞培養型を設定フレーム レートを設定します。 注: 追跡分析する結果のデータセットのサイズはまだ合理的な信頼性の高いセルに、1 つ取得 10 分ごとのフレーム レートは良い妥協案です。この顕微鏡のレンズ無料セットアップで達成可能な最速のフレーム レートは、1 つの取得は 5 分ごとです。培養細胞の生存率に影響を与えることができる CMOS センサーの過剰加熱の結果、フレーム レートがさらに向上します。</li>
	<li>コマ撮りの集録を開始し、ホログラフィック再構成アルゴリズム (市販) は、細胞培養の位相画像を取得するレンズ無料取得を自動的に処理します。ホログラフィック再構成アルゴリズムの多波長位相検索アルゴリズム17に基づいておりの範囲で RGB 再構成画像を提供します [-π、π +] 29.4 mm2のビューの大きなフィールドを単一セルごとに。レンズ無料で線ホログラフィーの原理は薄いサンプルを照らす (z = 0) (振幅 1 の正規化後) の平面波と短い距離 z 以降の回折強度画像 CMOS センサーで検出する = Z 後、通常 1 mm、サンプルです。セットアップ時に照明が順番に 3 波長に切り替えられた (λ1= 0.450 μ、λ20.540 μ、λ3を = = 0.647 μ m) 同じサンプルの 3 つの回折パターンを測定します。</li>
</ol>2. 細胞培養データ解析
<ol><li>セルの追跡を単一粒子18の自動追跡のためのオープン ソース フィジー プラグイン Trackmate アルゴリズムを使用します。At はまず、フィジー (負荷イメージ シーケンス コマンド) にコマ撮り完全買収を読み込みます。29.7 Mb 通常 400 RGB フレームの機能は、データセットのサイズが大きいため 8 ビットの形式でそれらをロードするより高速です。次に Trackmate フィジー プラグインは、すなわち細胞検出期細胞トラッカー期、細胞検出および計算のトラックに適用されるいくつかのフィルター、細胞追跡アルゴリズムのいくつかの段階でユーザーをガイドします。すべての段階でアルゴリズムを構成し、結果を表示すぐにして、必要に応じて、1 つ簡単に移動できます前後設定を再調整します。Trackmate インタ フェースのさまざまなメニューは HeLa 細胞実験に使用される実際の設定で図 2のとおりです。</li>
	<li>(図 2参照) を次のよう入力ソフトウェアの入力パラメーターを設定します。15 ピクセル、15 ピクセルにギャップを閉じる最大距離と 3.5 にトラックでのスポットの数に 15 ピクセルに推定される blob 直径 0.25 検出しきい値、リンクの最大距離を設定します。 メモ: これらの設定が別の特に '推定 blob 直径」(ここでは 1.67 μ m のピクセルで与えられる) セル サイズに対応する異なる 1 つの実験から明らかに。同じ発言は (ここでは 1.67 μ m のピクセルで与えられる) 2 つの連続するフレーム内のセルで、最大距離を占める旅「リンク最大距離」に適用されます。最適な値は、細胞運動、細胞密度にも依存します。</li>
	<li>細胞追跡プロセスの最後に、3 つのテキスト ファイルの形式で結果を生成 (「解析」ボタンを図 2を参照します).最も有用なファイル、'統計追跡のスポット' は、買収、フレーム数、トラック数 (x, y) それぞれの立場で検出されたすべてのセルの一覧で構成されます。このデータに基づいてセル分割を実行し、(サプルメンタリ コード ファイルを参照してください) 専用のアルゴリズムを使用して細胞分裂を検出します。他の 2 つのファイルがという名前の 'トラックの統計情報にリンク' と 'トラック' の統計情報とトラック、トラック期間など、検出されたギャップ数を扱うすべての結果を含む、最初のフレームなどを追跡。</li>
	<li>セル分割アルゴリズムを使用して、自動的に再構成画像からの細胞の形態を記述するいくつかの指標を抽出する (を参照してください補足コード ファイル)。これらの指標は、細胞表面積 (S)、細胞の長軸の長さ (L)、セルの短軸の長さ (l) とセルの縦横比 (l)。顕微鏡のレンズ無料から回復フェーズは、密度と前述のとおり15試料の層の厚さに比例です。</li>
	<li>細胞の形態学的特徴、に加えて再構成13,19,20から定量細胞乾燥質量 (CDM) 測定を抽出します。 <img alt="Equation 1" src="/files/ftp_upload/56580/56580eq1v3.jpg">イコライザー (1) φ(x,y) が再建された位相シフト19波長 λ と α = 1.8 × 10-4 m3/kg乾燥質量1、屈折率の変化を関連している特定の屈折 19。</li>
	<li>セルの屈折と培地の違いの推定を用いたセル厚を評価します。セル厚h(x,y) と位相シフトの関係は、20で与えられます。 <img alt="Equation 2" src="/files/ftp_upload/56580/56580eq2v3.jpg">式 (2.1) <img alt="Equation 3" src="/files/ftp_upload/56580/56580eq3v3.jpg">式 (2.2) Δn(x,y) = nセル(x、y) - n培地(x、y)、細胞と培地との間の屈折率差。以下では、Δ の定数値を想定n = 0.025、HeLa 細胞核で測定した屈折率からと推定されている (n = 1.35511)、リン酸緩衝生理食塩水 (PBS) 文化メディアの (n = 1.33)。セルの厚さ値は仮定に基づいているように示して、その相対的な変化が意味のある、分裂細胞を検出するために悪用される可能性が。</li>
	<li>専用のアルゴリズムを使用して測定した厚さ 8 μ m より大きいによる細胞の細胞分裂の発生を検出し、細胞分裂を検出するために検出された細胞の分裂に関連付けられているセルのトラックを抽出する (を参照してください補足コード ファイル)まず識別されます、確認してくださいかどうか新しい細胞が密接に空間し、時間。この方法で細胞分裂の検出は、2 つの堅牢な条件に依存します。Lensfree コマ獲得21,22,23に代替と細胞分裂の検出のためのより精巧な方法を適用できます。</li>
</ol>

<ol><li>Zangle, T. A., Teitell, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Live-cell+mass+profiling%3A+an+emerging+approach+in+quantitative+biophysics%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Live-cell mass profiling: an emerging approach in quantitative biophysics.</a> Nat Methods. 11 (12), 1221-1228 (2014).</li>
<li>Popescu, G., Park, K., Mir, M., Bashir, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((New+technologies+for+measuring+single+cell+mass%5BTitle%5D)+AND+%22Lab+Chip%22%5BJournal%5D)">New technologies for measuring single cell mass.</a> Lab Chip. 14 (4), 646-652 (2014).</li>
<li>Reed, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid%2C+massively+parallel+single-cell+drug+response+measurements+via+live+cell+interferometry%5BTitle%5D)+AND+%22Biophys+J%22%5BJournal%5D)">Rapid, massively parallel single-cell drug response measurements via live cell interferometry.</a> Biophys J. 101 (5), 1025-1031 (2011).</li>
<li>Mir, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optical+measurement+of+cycle-dependent+cell+growth%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci.+USA%22%5BJournal%5D)">Optical measurement of cycle-dependent cell growth.</a> Proc Natl Acad Sci. USA. 108 (32), 13124-13129 (2011).</li>
<li>Girshovitz, P., Shaked, N. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Generalized+cell+morphological+parameters+based+on+interferometric+phase+microscopy+and+their+application+to+cell+life+cycle+characterization%5BTitle%5D)+AND+%22Biomed+Opt+Express%22%5BJournal%5D)">Generalized cell morphological parameters based on interferometric phase microscopy and their application to cell life cycle characterization.</a> Biomed Opt Express. 3 (8), 1757-1773 (2012).</li>
<li>Kemper, B., Bauwens, A., Vollmer, A., Ketelhut, S., Langehanenberg, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Label-free+quantitative+cell+division+monitoring+of+endothelial+cells+by+digital+holographic+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biomed+Opt%22%5BJournal%5D)">Label-free quantitative cell division monitoring of endothelial cells by digital holographic microscopy.</a> J Biomed Opt. 15 (3), (2010).</li>
<li>Mir, M., Bergamaschi, A., Katzenellenbogen, B. S., Popescu, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Highly+sensitive+quantitative+imaging+for+monitoring+single+cancer+cell+growth+kinetics+and+drug+response%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Highly sensitive quantitative imaging for monitoring single cancer cell growth kinetics and drug response.</a> PLoS One. 9 (2), 1-8 (2014).</li>
<li>Bon, P., Savatier, J., Merlin, M., Wattellier, B., Monneret, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optical+detection+and+measurement+of+living+cell+morphometric+features+with+single-shot+quantitative+phase+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biomed+Opt%22%5BJournal%5D)">Optical detection and measurement of living cell morphometric features with single-shot quantitative phase microscopy.</a> J Biomed Opt. 17 (7), (2012).</li>
<li>Aknoun, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Living+cell+dry+mass+measurement+usinq+quantitative+phase+imaging+with+quadriwave+lateral+shearing+interferometry%3A+an+accuracy+and+sensitivity+discussion%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biomed+Opt%22%5BJournal%5D)">Living cell dry mass measurement usinq quantitative phase imaging with quadriwave lateral shearing interferometry: an accuracy and sensitivity discussion.</a> J Biomed Opt. 20 (1), 1-4 (2015).</li>
<li>Cotte, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Marker-free+phase+nanoscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Photonics%22%5BJournal%5D)">Marker-free phase nanoscopy.</a> Nature Photonics. 7 (2), 113-117 (2013).</li>
<li>Choi, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tomographic+phase+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Tomographic phase microscopy.</a> Nat Methods. 4 (9), 717-719 (2007).</li>
<li>Kesavan, S. V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+monitoring+of+major+cell+functions+by+means+of+lensfree+video+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">High-throughput monitoring of major cell functions by means of lensfree video microscopy.</a> Sci Rep. 4, 1-11 (2014).</li>
<li>Zheng, G., Lee, S. A., Antebi, Y., Elowitz, M. B., Yang, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+ePetri+dish%2C+an+on-chip+cell+imaging+platform+based+on+subpixel+perspective+sweeping+microscopy+%28SPSM%29%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+USA%22%5BJournal%5D)">The ePetri dish, an on-chip cell imaging platform based on subpixel perspective sweeping microscopy (SPSM).</a> Proc Natl Acad Sci USA. 108 (41), 16889-16894 (2011).</li>
<li>Pushkarsky, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Automated+single-cell+motility+analysis+on+a+chip+using+lensfree+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Automated single-cell motility analysis on a chip using lensfree microscopy.</a> Sci Rep. 4, 4717(2014).</li>
<li>Allier, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+of+dense+cell+cultures+by+multiwavelength+lens-free+video+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Cytom+Part+A%22%5BJournal%5D)">Imaging of dense cell cultures by multiwavelength lens-free video microscopy.</a> Cytom Part A. 91 (5), 1-10 (2017).</li>
<li>Su, T. -W., Seo, S., Erlinger, A., Ozcan, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+lensfree+imaging+and+characterization+of+a+heterogeneous+cell+solution+on+a+chip%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechnol+Bioeng%22%5BJournal%5D)">High-throughput lensfree imaging and characterization of a heterogeneous cell solution on a chip.</a> Biotechnol Bioeng. 102 (3), 856-868 (2009).</li>
<li>Delacroix, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cerebrospinal+fluid+lens-free+microscopy%3A+a+new+tool+for+the+laboratory+diagnosis+of+meningitis%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Cerebrospinal fluid lens-free microscopy: a new tool for the laboratory diagnosis of meningitis.</a> Sci Rep. 7, 39893(2017).</li>
<li>Tinevez, J. -Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((TrackMate%3A+an+open+and+extensible+platform+for+single-particle+tracking%5BTitle%5D)+AND+%22Methods%22%5BJournal%5D)">TrackMate: an open and extensible platform for single-particle tracking.</a> Methods. 115, 80-90 (2016).</li>
<li>Popescu, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optical+imaging+of+cell+mass+and+growth+dynamics%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Physiol+Physiol%22%5BJournal%5D)">Optical imaging of cell mass and growth dynamics.</a> Am J Physiol Physiol. 295 (2), 538-544 (2008).</li>
<li>Liu, P. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+refractive+index+for+cell+biology+and+disease+diagnosis%3A+past%2C+present+and+future%5BTitle%5D)+AND+%22Lab+Chip%22%5BJournal%5D)">Cell refractive index for cell biology and disease diagnosis: past, present and future.</a> Lab Chip. 16, 634-644 (2016).</li>
<li>Rapoport, D. H., Becker, T., Mamlouk, A. M., Schicktanz, S., Kruse, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+novel+validation+algorithm+allows+for+automated+cell+tracking+and+the+extraction+of+biologically+meaningful+parameters%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">A novel validation algorithm allows for automated cell tracking and the extraction of biologically meaningful parameters.</a> PLoS One. 6 (11), e27315(2011).</li>
<li>Al-Kofahi, O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Automated+cell+lineage+construction%3A+A+rapid+method+to+analyze+clonal+development+established+with+murine+neural+progenitor+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Cycle%22%5BJournal%5D)">Automated cell lineage construction: A rapid method to analyze clonal development established with murine neural progenitor cells.</a> Cell Cycle. 5 (3), 327-335 (2006).</li>
<li>Meijering, E., Dzyubachyk, O., Smal, I., van Cappellen, W. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tracking+in+cell+and+developmental+biology%5BTitle%5D)+AND+%22Semin+Cell+Dev+Biol%22%5BJournal%5D)">Tracking in cell and developmental biology.</a> Semin Cell Dev Biol. 20 (8), 894-902 (2009).</li>
<li>Posakony, J. W., England, J. M., Attardi, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mitochondrial+growth+and+division+during+the+cell+cycle+in+HeLa+cells%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Mitochondrial growth and division during the cell cycle in HeLa cells.</a> J Cell Biol. 74 (2), 468-491 (1977).</li>
<li>Zocchi, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Expression+of+CD38+Increases+Intracellular+Calcium+Concentration+and+Reduces+Doubling+Time+in+HeLa+and+3T3+Cells%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">Expression of CD38 Increases Intracellular Calcium Concentration and Reduces Doubling Time in HeLa and 3T3 Cells.</a> J Biol Chem. 273 (14), 8017-8024 (1979).</li>
<li>Reitzer, L. J., Wice, B. M., Kennell, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evidence+that+glutamine%2C+not+sugar%2C+is+the+major+energy+source+for+cultured+HeLa+cells%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">Evidence that glutamine, not sugar, is the major energy source for cultured HeLa cells.</a> J Biol Chem. 254 (8), 2669-2676 (1979).</li>
<li>Benedetti, A. D. E., Joshi-barve, S., Rinker-Schaeffer, C., Rhoads, R. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Expression+of+Antisense+RNA+against+Initiation+Factor+eIF-4E+mRNA+in+HeLa+Cells+Results+in+Lengthened+Cell+Division+Times%2C+Diminished+Translation+Rates%2C+and+Reduced+Levels+of+Both+eIF-4E+and+the+p220+Component+of+eIF-4F%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Expression of Antisense RNA against Initiation Factor eIF-4E mRNA in HeLa Cells Results in Lengthened Cell Division Times, Diminished Translation Rates, and Reduced Levels of Both eIF-4E and the p220 Component of eIF-4F.</a> Mol Cell Biol. 11 (11), 5435-5445 (1991).</li>
<li>Kumei, Y., Nakajima, T., Sato, A., Kamata, N., Enomoto, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reduction+of+G1+phase+duration+and+enhancement+of+c-myc+gene+expression+in+HeLa+cells+at+hypergravity%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Sci%22%5BJournal%5D)">Reduction of G1 phase duration and enhancement of c-myc gene expression in HeLa cells at hypergravity.</a> J Cell Sci. 93 (2), 221-226 (1989).</li>
<li>Ginzberg, M. B., Kafri, R., Kirschner, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((On+being+the+right+%28cell%29+size%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">On being the right (cell) size.</a> Science. 348 (6236), 1245075(2015).</li>
<li>Mathieu, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Time-lapse+lens-free+imaging+of+cell+migration+in+diverse+physical+microenvironments%5BTitle%5D)+AND+%22Lab+Chip%22%5BJournal%5D)">Time-lapse lens-free imaging of cell migration in diverse physical microenvironments.</a> Lab Chip. 16 (17), 3304-3316 (2016).</li>
</ol>

著者が明らかに何もありません。

本稿ではそのレンズ無料ビデオ顕微鏡は、細胞の何千もの速度をキャプチャするインキュベーター内使用ことができますを示す.全体的な方法論を記述するために、標準細胞追跡アルゴリズムの 2.7 日コマ撮りによる培養 HeLa 細胞の分析方法を説明しました。結果は、2.2 × 106セル測定と 10,584 細胞周期トラックを備えデータセットです。買収を行った比較的大規模な細胞間距離と Hela 細胞の培養 (細胞の密度 < 500 セル/mm2) とディスクが近似できる形態の細胞します。これらの 2 つの機能は、このような大規模なデータセットを収集することが可能になる自動細胞トラッキング解析の応用を促進します。他の細胞株細胞間距離が小さいまたはより複雑な形態を追跡するより難しいと以降のデータセットは小さくなります。
このアプローチは多くの研究、例えば細胞増殖と細胞サイズの研究は面白いと考えています。後者は基礎生物学の研究の重要な領域し、多くの質問が未解決のまま素敵なレビューでギンズバーグらで議論...

いくつかの細胞周期を通じて培養細胞を監視し、正確に測定セルのサイズとセルの乾燥質量はやりがいのある仕事です。いくつかラベル無料光技術がこのタスク1,2を実行することができる: 位相シフト干渉法3、デジタル ホログラフィー顕微鏡法 (DHM)4,5,6,7quadriwave 横方向せん断干渉8,9定量位相トモグラフィ10,11。これらのメソッドは、哺乳動物細胞の細胞周期の理解に多くの新しい洞察力につながっています。しかし、彼らは、ほとんど追尾法自動セルと結合し、そのスループットは制限を測定するときセル大容量の軌跡1 (N < それぞれ3,4、5の 20,6). 光学手法は大規模な統計と細胞質量軌跡の測定に必要なため (N > 1000)。
本稿では、同時に数千、インキュベーターの中に直接細胞のイメージを作成し、単一のセル数千もの個々 の細胞周期トラックに沿って指標を定量化しレンズ無料ビデオ顕微鏡の機能を示します。顕微鏡のレンズ無料は定量位相イメージング技術の非常に広い視野で密集細胞の位相画像の取得を可能にする (通常数十 mm2、ここの 29.4 mm2)12,13 ,14,15。単一セルのレベルでいくつかのメトリックが決定されます、例えば領域をセル、携帯の乾燥質量、セル厚、セルの長軸の長さとセルの縦横比12,15, それぞれのイメージから。その後、細胞追跡アルゴリズムを適用すると、これらの機能をプロットできますすべての単一セルの実験時間14,15の関数として。さらに、セルのトラックで細胞分裂の発生を検出することにより初期の細胞乾燥質量 (細胞分裂) の直後に、(細胞分裂) の直前に最後のセルの乾燥質量とセルの他の重要な情報を抽出することが可能です。期間、すなわち、2 つの連続した分割15間の時間を周期します。これらのすべての測定値を計算する非常によい統計量 (N > 1000) 以来、ビューの大きなフィールドが通常単一レンズ無料取得 200 に 10,000 細胞の解析を許可。
レンズ無料ビデオ顕微鏡検査に基づいたこの方法を説明するために監視および 2.7 日間の HeLa 細胞培養を定量化するプロトコルについて述べる。データ解析、多波長ホログラフィック再構成、細胞追跡、セル分割と細胞分裂のアルゴリズムに基づいた 4 つのステップ プロセスです。ここで空間分解能とこのレンズ無料ビデオ顕微鏡のセットアップで得られた比較的高速なフレーム レート (10 分ごと 1 つ取得) の標準的な細胞追跡アルゴリズムと互換性があることを示します。このデータセットの完全な分析は完全な細胞周期上 10,584 セル トラックの測定結果します。
要約すれば、レンズ無料ビデオ顕微鏡は何千ものラベル、同期されていないと実験; ごとそのままセルを自動的に監視する強力なツール各セルは、いくつかの細胞周期を追跡されています。我々 の測定はこのように細胞の大規模な人口でセル間変動より重要なことは、しかし、いくつかのセルのパラメーターの平均値を提供します。

<table><tbody><tr><td>Cytonoteレンズフリービデオマイクロスコープ&nbsp;</td><td>Iprasense</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Horus取得ソフトウェア</td><td>Iprasense</td><td></td><td></td></tr><tr><td>6ウェルガラス底培養プレート</td><td>MatTek株式会社</td><td>品番:P06G-0-14-F&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>DMEM + GlutaMAX ミディアム&nbsp;</td><td>Gibco</td><td></td><td></td></tr><tr><td>熱不活化子牛胎児血清&nbsp;</td><td>ユーロビオ</td><td></td><td></td></tr><tr><td>ペニシリンとストレプトマイシン&nbsp;</td><td>Gibco</td><td></td><td></td></tr><tr><td>フィブロネクチン&nbsp;</td><td>Sigma Aldrich</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Matlab、画像処理ツールボックス&nbsp;</td><td></td><td></td><td></td>数学</tr></tbody></table>

レンズ無料のビデオ顕微鏡、付着性細胞培養の定量的解析

Lens-free Video Microscopy for the Dynamic and Quantitative Analysis of Adherent Cell Culture

レンズ無料ビデオを紹介ここでは、顕微鏡により直接インキュベーター内の細胞の何千もの速度を同時にキャプチャおよび監視し、いくつかの細胞周期に沿って単一セルを定量化することが可能であります。完全な監視し、2.7 日間の HeLa 細胞培養を定量化に使用プロトコルについて述べる。まず、レンズ無料ビデオ顕微鏡、細胞文化獲得して実行され、次の 4 段階のプロセス データを分析し、: 多波長ホログラフィック再構成、細胞追跡、セル分割と細胞分裂検出アルゴリズム。その結果、以上 10,000 の細胞周期トラックと 2 x 10 以上6細胞形態計測のデータセットの特徴を収集することが可能だと紹介します。

ホログラフィック再構成プロセスのライト フィールドは、スカラー場によって記述されます (、 <img alt="Equation 4" src="/files/ftp_upload/56580/56580eq4v3.jpg"> Aのサンプル、および横の位置から距離z平面上の複雑な値は、 <img alt="Equation 5" src="/files/ftp_upload/56580/56580eq5v3.jpg"> 、波長 λ)。光の伝搬はプロパゲータ カーネルを提供する Huygens フレネル理論によるモデル化<img alt="Equation 6" src="/files/ftp_upload/56580/56580eq6v3.jpg">。したがって、フィールドの振幅検出器平面z光振幅0に関連は次の関係によって。 <img alt="Equation 7" src="/files/ftp_upload/56580/5658...

レンズ無料ビデオ顕微鏡は、インキュベーターの中に直接培養細胞を監視することが出来ます。ここで集録し、解析を培養 HeLa 細胞の 2.7 日間の長い取得するために使用完全なプロトコルについて述べる、2.2 x 10 のデータセットにつながる個々 の細胞の形態や 10584 細胞周期の6測定を追跡します。

Here, we demonstrate that lens-free video microscopy enables us to simultaneously capture the kinetics of thousands of cells directly inside the incubator ...

この方法論の全体的な目標は、レンズフリーのビデオ顕微鏡法によってモニターされた接着細胞の大規模な集団のダイナミクスを取得し、分析することです。ですから、この手法は、生物学の多くの分野で、細胞増殖や細胞膀胱炎、薬物スクリーニング、またはさまざまなバイオプロセスモニタリングの研究に興味深いと考えています。したがって、この手法はラベルフリーで、非常に簡単です。しかし、大きな細胞集団の研究には非常に効果的です。細菌を検出する分野から哺乳類の細胞をイメージングする分野にシフトしたとき、この方法のアイデアは何ですか。その後、生物学者が、回路をインキュベーターに直接タイムラプス取得する必要があることは役に立ちました。次に、インキュベーターと互換性のあるカスタマイズされたレンズフリービデオ顕微鏡を構築し、非常に広い視野に存在する何千もの細胞の画像を取得するためのホログラフィック再構成アルゴリズムを開発しました。この手順は、6ウェルガラスの底板にフィブロネクチンを室温で1時間コーティングすることから始めます。1時間後、余分なフィブロネクチンを取り除き、6ウェルガラスの底板をPBSで洗い流します。このデモンストレーションでは、DMEMで増殖したHela細胞とグルタミン培地、活性化ウシ胎児血清中の10%の熱、1%ペニシリンおよびストレプトマイシンが使用されています。培養プレートごとに2万個の細胞を播種します。底がガラスの容器を使用することが重要です。レンズフリーの撮影品質のために。培養プレートをレンズフリービデオ顕微鏡の上のインキュベーターに置きます。このタイムラプス撮影に用いたレンズフリーのビデオマイクロスコープは市販されています。撮像面積29.4平方ミリメートル、画素ピッチ1.67マイクロメートルの金属酸化物半導体イメージセンサーを搭載しています。多波長照明は、細胞から約5cmの距離にある150μmのピンホールの上方に位置するマルチチップ発光ダイオードデバイスによって提供されます。タイムラプス撮影を開始する前に、カバープレートに結露がないことを確認することが重要です。結露すると、取得の画質が低下するためです。培養プレートのカバーに結露が発生した場合は、カバーを清掃してください。ビデオレンズフリー顕微鏡は、市販のデータ収集ソフトウェアで制御します。これは、タイムラプス取得とホログラフィック再構成の両方を実行します。ソフトウェアインターフェースに必要な入力パラメータを入力します。フレームレートを 10 分ごとに 1 回、細胞培養タイプを接着型、実験期間を 3 日間に設定します。タイムラプス撮影を開始します。この画像は、1 フレームの 29.4 平方ミリメートルの領域に青チャネルで取得した raw データの全視野の例を示しています。パネルBはパネルAの詳細であり、パネルCはパネルBの詳細です.ホログラフィック再構成アルゴリズムは、レンズフリーの取得を自動的に処理して、細胞培養の位相画像を取得します。フェーズ アンラップ前のセルの例の画像を示し、その後にフェーズ アンラップ後の画像を示します。セルトラッキングは、単一粒子の自動トラッキングのためのオープンソースのフィジープラグインであるTrackMateアルゴリズムを使用して行われます。ロード後、フィジーへのフルタイムラプス取得と、テキストプロトコルで説明されているアルゴリズムの設定、入力パラメータの設定を行います。ブロブの推定直径を 15 ピクセル、検出器のしきい値を 0.25、リンクの最大距離を 15 ピクセル、ギャップを閉じる最大距離を 15 ピクセル、トラック内のスポットの数を 3.5 に設定します。細胞追跡アルゴリズムの最初のステップは、レンズフリー取得における細胞の検出です。セルトラッキングアルゴリズムの結果が表示され、すべてのセルトラックが50フレーム、つまり約8時間にわたって表示されます。中央速度に対応するカラーコード付き。下部パネルは、上部パネルから見た黄色の長方形の詳細な画像です。ここには、細胞追跡の代表的なビデオクリップを示します。セルトラッキングプロセスの最後に、分析ボタンを選択して、結果を3つのテキストファイルの形式で生成します。このデータに基づいて、テキストプロトコルおよび補足コードファイルに詳述されているように、専用のアルゴリズムを使用して細胞セグメンテーションを実行し、細胞分裂を検出します。すべてのシングルセル測定値をフルタイムラプス取得でまとめると、いくつかのメトリクスの散布図が時間の関数として生成されます。全視野内の細胞の総数は、2.7日で2000から15000に増加します。時間点の数を掛けると、検出されたセルの大規模なデータセットが得られます。それぞれが、乾燥質量、面積、平均厚さ、主要なアクセス長、アスペクト比などの座標と形態学的特徴によって特徴付けられます。細胞追跡アルゴリズムと細胞セグメンテーションアルゴリズムの組み合わせにより、単一細胞レベルでの速度論的測定が可能になります。この例は、約 66 時間続くセル トラックの解析を示し、黄色で囲んだ時点で 4 つの細胞分裂を示しています。いくつかの指標は、時間:細胞表面積、乾燥質量、平均厚さ、および細胞運動性の関数として計算されました。2.7日間の観察における細胞周期の持続時間の分布は、agouzianに近かった。平均16.5時間です。自動的に測定される細胞周期の長さは、手動で測定されたものとよく相関しています。細胞の初期乾燥質量、最終乾燥質量、細胞周期中の平均成長率など、他のパラメータも調べました。一度習得すると、タイムラプス取得の完全なデータ分析は、CPU構成とハードウェアのパフォーマンスにもよりますが、数時間で実行できます。この手順を試みる際には、初期細胞濃度を慎重に行うことが非常に重要です。初期細胞濃度が大きすぎると、細胞追跡アルゴリズムは細胞軌道を適切に定義できません。しかし、細胞濃度が低すぎると、完全な分析の統計も低すぎます。この手順に続いて、生物学、基礎生物学、または走化性の分野で他の質問に答えるために、細胞追跡分析のような自動化された分析を実行することができます。この新しい技術は、細胞系譜のモニタリングへの道を開き、細胞周期を研究するための興味深い洞察をもたらすことを願っています。このビデオを見れば、レンズフリーのビデオ顕微鏡によるタイムラプス取得の方法と、大量の細胞集団の分析方法について十分に理解できるはずです。

lens-free-video-microscopy-for-dynamic-quantitative-analysis-adherent

Research

JoVE Journal

Biology

生物学

細胞のLensfreeオンチップのイメージングと特性が示されている。このオンチップ細胞イメージングのアプローチは、リソースの乏しい環境のために特に適し、医療診断およびハイスループット細胞生物学のアプリケーション向けのコンパクトで費用効果の高いツールを提供します。...

細胞のLenslessオンチップイメージングは​​、ハイスループット細胞生物学および医学診断のための新しいツールを提供します。

lenslessオンチップの蛍光顕微鏡のプラットフォームは、復号アルゴリズムに基づいて圧縮サンプリングを使用して&lt;4μmの分解能を持つなどの超広角視野上の画像蛍光灯のオブジェクトを、&gt;...

チップ上Lensless蛍光顕微鏡

このメソッドは、実時間、速度、変位、速度など、さまざまな細胞への移行パラメータの定量的測定の細胞のモニタリングが可能になります。従来の方法とは異なり、このリアルタイムのアプローチは、エンドポイントの定量的な移行の測定値に基づいてされていません。代わりに監視し、継続的にさまざまなパラメータを計算することができます。...

タイムラプスビデオ顕微鏡を用いた細胞のランダムな移行の定量分析

私たちは、ミクロンスケールのくびれのシーケンスを通過する細胞のためのタイムスケールを測定するためのマイクロ流体ベースのアッセイを実証する。...

マイクロ流体技術は、Cell変形能の探査

高速・高分解能を可能にする高度な顕微鏡分離膜と周囲の細胞内のボリュームの両方の画像が表示されます。1 つのセットアップでディスクと全反射蛍光顕微鏡を回転の統合により、3.5 まで高い獲得率でライブ...

回転ディスク全内部反射蛍光顕微鏡による細胞の接着の形成の可視化詳細

Fӧrster共鳴エネルギー伝達(FRET)ベースのセンサの信号対雑音比(SNR)が低いため、cAMP信号の測定は特に3つの空間次元において困難でした。ここでは、3つの空間次元でcAMP分布を測定できるハイパースペクトルFRETイメージングおよび解析方法論について述べる。...

4次元(x、y、z、λ)ハイパースペクトルFRETイメージングと解析を用いた生体細胞における3次元cAMP分布の測定

1500の培養ユニット、強化された蠕動ポンプの配列、オンサイトミキシングモジュラスから構成される複雑な寿命機械の高スループット研究のためのマイクロ流体システムを発表します。マイクロ流体チップは、生体内の非常に複雑で動的な微小環境条件の解析を可能にします。...

ハイスループットマイクロ流体装置を用いた動的環境条件の生成

細胞信号を分析する統合ツールキット(iTACS)プラットフォームは、接着細胞内の多種多様な化学および機械的信号を同時に測定するプロセスを自動化します。iTACSは、コミュニティ主導の開発を容易にし、研究者が学歴に関係なくすべてのプラットフォーム機能を使用できるように設計されています。...

細胞信号を解析する統合ツールキット:力、運動、形態、蛍光

本稿では、界面形態を可視化しながら界面張力と表面拡張レオロジーを同時に測定するためのマイクロテンシオメータ/共焦点顕微鏡の設計と操作について述べる。これにより、技術や生理学において重要な界面の構造と特性の関係をリアルタイムに構築することができます。...

動的界面の共焦点顕微鏡可視化のためのマイクロテンシオメータ

提示されたプロトコルは、マイクロ流体動的培養チャネルおよび従来の固定ウェル静的培養チャンバーにおける接着細胞層構造を視覚化するための共焦点レーザー走査型顕微鏡(CLSM)を用いたファロイジンベースの糸状アクチン染色技術の開発と使用について説明しています。このアプローチは、細胞層のコンフルエント性、単層形成、および層厚の均一性を評価するのに役立ちます。...

生理的サイズのマイクロ流体培養装置における上皮細胞単層の作製と構造評価

ここでは、フォローアップのマルチパラメーター生細胞顕微鏡検査を実施するためのさまざまな多細胞スフェロイド形成方法について説明します。蛍光寿命イメージング顕微鏡(FLIM)、細胞自家蛍光、染色色素、およびナノ粒子を使用して、生きた三次元(3D)がんおよび幹細胞由来スフェロイドにおける細胞代謝、低酸素症、および細胞死の解析のためのアプローチを実証します。...

多細胞スフェロイドの作製およびマルチパラメーター生細胞蛍光寿命イメージング顕微鏡(FLIM)

学ぼう、レンズ無料ビデオ顕微鏡を用いた付着性細胞培養の定量的解析法。HeLa細胞を用いた2.7日間のタイムラプス撮影で、細胞周期ダイナミクスと形態学的特徴を追跡し、細胞増殖研究に応用する。

レンズ無料のビデオ顕微鏡、付着性細胞培養の定量的解析

さらに動画を探す