前立腺癌におけるリン酸化プロテオームを調べる定量的ラベル無料質量と相まってリン酸化ペプチド濃縮

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2018年8月2日

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Larry C. Cheng^*¹^,² , Zhen Li^*³ , Thomas G. Graeber⁴ , Nicholas A. Graham⁵ , Justin M. Drake¹^,²^,³^,⁶^,⁷

¹Graduate Program in Cellular and Molecular Pharmacology, School of Graduate Studies, Rutgers University, The State University of New Jersey, ²Graduate Program in Quantitative Biomedicine, School of Graduate Studies, Rutgers University, The State University of New Jersey, ³Department of Medicine, Division of Medical Oncology, Rutgers Robert Wood Johnson Medical School, ⁴Crump Institute for Molecular Imaging, Department of Molecular and Medical Pharmacology, Jonsson Comprehensive Cancer Center, UCLA Metabolomics Center, and California NanoSystems Institute, David Geffen School of Medicine, University of California, Los Angeles, ⁵Mork Family Department of Chemical Engineering and Materials Science, University of Southern California, ⁶Pharmacology, Rutgers Robert Wood Johnson Medical School, ⁷Cancer Metabolism and Growth Program, Rutgers Cancer Institute of New Jersey

^* These authors contributed equally

このプロトコルでは、抽出し、前立腺癌細胞株あるいは質量分析を用いたプロテオミクスによるリン酸化プロテオーム解析のためのティッシュから調製したカゼインホスホペプチドを豊かにする手順について説明します。

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前立腺がんリン酸化プロテオーム

タンパク質消化

二酸化チタン濃縮

液体クロマトグラフィー質量分析

ホスホチロシン濃縮

ホスホセリン・トレオニン濃縮

質量分析解析

Chapters in this video

0:04

タイトル

0:38

組織の採取

1:31

ライセートの消化および逆相抽出

4:12

pYペプチドの免疫沈降および濃縮、ならびにpYビーズのプレウォッシュ

6:59

pYペプチドの二酸化チタン濃縮およびMS分析用脱塩

9:32

結果：前立腺がんにおけるホスホペプチドの濃縮および質量分析

11:29

結論

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