Name: 淋菌ATP の使用率が集計を使用して商業試金およびライブ/デッド染色の抗生物質感受性の定量的検討 (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2019-02-08T14:30:00.000+00:00
Duration: 8 min 4 s
Description: 学ぶ淋菌のATP測定アッセイによる抗生物質感受性評価法。セフトリアキソン処理後の細菌生存率を定量化し、バイオフィルムにおける最小抑制濃度を決定する技術です。

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この作品は、D.C.S. と W.S. AI123340 に国立衛生研究所からの助成金によって支えられました。J.W.、l. c. w. a. c.、e. n. がパーツ/メリーランド大学によって資金を供給された「初年度イノベーション & 研究体験」プログラムに参加でサポートされていたとします。資金提供者を発行し、研究デザイン、データ収集、分析、決定または原稿の準備で役割がなかった。我々 はすべての顕微鏡実験のため UMD CBMG イメージング コアを認めます。

1 GC 系統の一般的なメンテナンス
<ol><li>淋菌株を連勝 GCK 1% 寒天培地にケロッグ サプリメント18 (表 1、表 2) 冷凍庫株からと 5% CO2 16 18 h. 使用 MS11 相変数 Opa (MS11Opa +)、ない Opa (MS11ΔOpa) を表現するために 37 ° C の孵化または切り捨てられたロス (MS11ΔLgtE)。</li>
	<li>Pili 負 (コロニー暗い縁なし) または解剖顕微鏡および新しい GCK プレート上に連勝を使用してコロニー形態19に基づいて各株から正 (暗いエッジを持つコロニー) 植民地を慎重に選択します。</li>
	<li>16-18 時間使用する前に 5% CO2と 37 ° C で孵化させなさい。</li>
</ol>2 GC の集計の生存率の定量化
<ol><li>滅菌アプリケータを使用して GC を収集します。綿棒プレートから GC と予め温めておいたスープ (GCP、表 3) で再停止 GC は 1% 4.2% NaHCO3とケロッグ ソリューション18を補った。650 の波長での吸光光度法を使用して nm (1 の OD650 = ~ 109 CFU/mL x 1) 浮遊菌の濃度を決定します。</li>
	<li>1 ~ 10 x に GC の濃度を調整する8 CFU/mL。</li>
	<li>96 ウェル プレートのウェルに調整された GC の懸濁液の 99 μ L を追加します。</li>
	<li>細菌を許可する 5% CO2と 37 ° C で 6 時間プレートをインキュベート集計します。</li>
	<li>シリアル希薄セフトリアキソンの 1 μ L を追加 (1000、100、50、25、12.5、6.2、3.1、1.5、0.8、0.4 0.2 μ G/ml) を各ウェルに。未処理のコントロールとして機能するいくつかの井戸を残します。</li>
	<li>5% CO2と 37 ° C で 24 時間のプレートを孵化させなさい。</li>
	<li>3 回 5 144 W で s と 20 kHz の各ウェルの懸濁液を超音波照射します。</li>
	<li>各ウェルに 100 μ L 市販 ATP 利用グロー試薬を追加、ピペットを- と 3 回にダウンし、5% CO2と 37 ° C で 15 分間インキュベートします。</li>
	<li>慎重に各ウェルから黒 96 ウェル マイクロ プレートで新しい井戸に 150 μ L の混合物を転送し、気泡を導入することを避けるため。</li>
	<li>560 で各ウェルの吸光度を測定プレート リーダーを使用して nm。</li>
	<li>未処理井戸からの読み取り中にシリアル セフトリアキソン治療後に得られる読書の割合によって生存率を計算します。</li>
</ol>3. 蛍光顕微解析 GC 骨材のライブ/デッド
<ol><li>滅菌アプリケータを使用して GC を収集します。プレートから綿棒 GC と予め温めておいた GCP メディア プラス 1% で再停止 GC ケロッグのサプリメントします。</li>
	<li>650 の波長吸光光度法による細菌数を決定する nm 〜 10 x 1 GC の濃度を調整し、7 CFU/mL。</li>
	<li>8 ウェル coverslip 下部チャンバ内に GC を懸濁液の 198 μ L を追加します。</li>
	<li>商工会議所集約の形成を許可する 5% CO2と 37 ° C で 6 時間孵化させなさい。</li>
	<li>各集計条件の中を各ウェルにセフトリアキソン (100 μ g/mL または様々 な希釈液) の 2 μ L を追加します。5% CO2と 37 ° C で希望の時間孵化させなさい。</li>
	<li>各ウェルに生きる/デッド染色溶液の 0.6 μ L を追加し、5% CO2と 37 ° C で 20 分間インキュベートします。</li>
	<li>(相当顕微鏡を使用することができます)、共焦点顕微鏡を用いた Z シリーズ画像を取得します。</li>
	<li>GC の骨材とライブに死者染色各集計の蛍光強度比 (FIR) 径計測の ImageJ ソフトウェアを使用して画像を分析します。</li>
</ol>4. 画像解析
<ol><li>細菌の集合体のサイズの推定。<ol>
<li>ImageJ、ImageJ メニュー バーに raw イメージ ファイルをドラッグして、イメージを開きます。</li>
		<li>ImageJ メニュー バーでフリーハンドの線をクリックし、サークルのイメージで各集計の領域。</li>
		<li>[分析 |メジャー ImageJ のメニュー バーにします。</li>
		<li>分野] 列の下で新しいウィンドウの番号を取得します。</li>
	</ol>
</li>
	<li>集計のライブに死者率の定量化<ol>
<li>ImageJ、ImageJ メニュー バーに raw イメージ ファイルをドラッグして、イメージを開きます。</li>
		<li>[分析 |測定を設定ImageJ のメニュー バーにします。</li>
		<li>ポップアップ ウィンドウに統合された密度を確認し、 [ok]をクリックします。</li>
		<li>画像をクリックして |カラー |チャンネルはツールメニュー バーの色を選択します。</li>
		<li>生きたバクテリア染色用蛍光としてチャネル 1を確認します。</li>
		<li>ImageJ メニュー バーでフリーハンドの線をクリックし、サークルの各集計の領域。</li>
		<li>[分析 |メジャー ImageJ のメニュー バーにします。</li>
		<li>[ IntDen ] 列の数を取得します。</li>
		<li>死んだ細菌染色用蛍光としてチャネル 2を確認してください。4.2.6-4.2.8 の手順を繰り返します。</li>
		<li>4.2.8 のステップからステップ 4.2.9 から番号の数で割ってライブに死者比率を取得します。</li>
	</ol>
</li>
	<li>統計解析<ol>
<li>グラフパッド プリズムを開き、目的の列に ImageJ から得られた数字を入力します。</li>
		<li>分析] をクリックし、列の解析でt 検定を選択します。</li>
		<li>比較の目的の列を確認し、 [ok]をクリックします。</li>
		<li>解析ウィンドウの下の P 値を取得します。</li>
		<li>4.3.3 のステップからXY 分析の下で線形回帰を選択します。</li>
		<li>R 二乗と [解析] ウィンドウの下のP 値を取得します。</li>
	</ol>
</li>
</ol>

<ol><li>CDC STD Facts. Centers for Disease Control and Prevention. , Available from: 
 <a target="_blank" href="http://www.cdc.gov/std/gonnorrhea/STDFact-gonorrhea-detailed.htm">http://www.cdc.gov/std/gonnorrhea/STDFact-gonorrhea-detailed.htm</a> (2017).</li>
<li>den Heijer, C. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+comprehensive+overview+of+urogenital%2C+anorectal+and+oropharyngeal+Neisseria+gonorrhoeae+testing+and+diagnoses+among+different+STI+care+providers%3A+a+cross-sectional+study%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Infectious+Diseases%22%5BJournal%5D)">A comprehensive overview of urogenital, anorectal and oropharyngeal Neisseria gonorrhoeae testing and diagnoses among different STI care providers: a cross-sectional study.</a> BMC Infectious Diseases. 17 (1), (2017).</li>
<li>Hein, K., Marks, A., Cohen, M. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Asymptomatic+gonorrhea%3A+prevalence+in+a+population+of+urban+adolescents%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+Pediatrics%22%5BJournal%5D)">Asymptomatic gonorrhea: prevalence in a population of urban adolescents.</a> The Journal of Pediatrics. 90 (4), 634-635 (1977).</li>
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<li>Merritt, J. H., Kadouri, D. E., O'Toole, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Growing+and+analyzing+static+biofilms%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Protoc+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Growing and analyzing static biofilms.</a> Curr Protoc Microbiol. , Chapter 1., Unit 1B.1 (2005).</li>
<li>Peeters, E., Nelis, H. J., Coenye, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparison+of+multiple+methods+for+quantification+of+microbial+biofilms+grown+in+microtiter+plates%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Microbiological+Methods%22%5BJournal%5D)">Comparison of multiple methods for quantification of microbial biofilms grown in microtiter plates.</a> Journal of Microbiological Methods. 72 (2), 157-165 (2008).</li>
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<li>Herten, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+in+Vitro+Quantification+of+S.+aureus+Biofilms+on+Vascular+Graft+Surfaces%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Microbiology%22%5BJournal%5D)">Rapid in Vitro Quantification of S. aureus Biofilms on Vascular Graft Surfaces.</a> Frontiers in Microbiology. 8, 2333(2017).</li>
<li>Gracia, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vitro+development+of+Staphylococcus+aureus+biofilms+using+slime-producing+variants+and+ATP-bioluminescence+for+automated+bacterial+quantification%5BTitle%5D)+AND+%22Luminescence%22%5BJournal%5D)">In vitro development of Staphylococcus aureus biofilms using slime-producing variants and ATP-bioluminescence for automated bacterial quantification.</a> Luminescence. 14 (1), 23-31 (1999).</li>
<li>Webb, J. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+death+in+Pseudomonas+aeruginosa+biofilm+development%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Bacteriology%22%5BJournal%5D)">Cell death in Pseudomonas aeruginosa biofilm development.</a> Journal of Bacteriology. 185 (15), 4585-4592 (2003).</li>
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<li>Wang, L. C., Litwin, M., Sahiholnasab, Z., Song, W., Stein, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Neisseria+gonorrhoeae+Aggregation+Reduces+Its+Ceftriaxone+Susceptibility%5BTitle%5D)+AND+%22Antibiotics+%28Basel%29%22%5BJournal%5D)">Neisseria gonorrhoeae Aggregation Reduces Its Ceftriaxone Susceptibility.</a> Antibiotics (Basel). 7 (2), (2018).</li>
<li>Lebeaux, D., Ghigo, J. M., Beloin, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biofilm-related+infections%3A+bridging+the+gap+between+clinical+management+and+fundamental+aspects+of+recalcitrance+toward+antibiotics%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiology+and+Molecular+Biology+Reviews%22%5BJournal%5D)">Biofilm-related infections: bridging the gap between clinical management and fundamental aspects of recalcitrance toward antibiotics.</a> Microbiology and Molecular Biology Reviews. 78 (3), 510-543 (2014).</li>
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</ol>

著者が明らかに何もありません。

細菌は、人間の体の感染時にバイオ フィルムを形成できます。従来のマイクのテストでは、バイオ フィルム中の細菌を根絶するために必要な濃度を表さない場合があります。バイオ フィルムに抗菌薬の効果をテストするため CFUs のめっきと同様にバイオ フィルムのバイオマスに基づくメソッドがバイオ フィルムの構造の影響により誤ったことができます。たとえば、めっき法は、バイオ フィルムを破壊することが場合のみ動作します。したがって、得られた CFU は生菌数の実際の数よりも低い可能性があります。バイオ フィルム内で可視化の死者と生きている細菌はバイオ フィルム内の細菌の生存率を測定するために確立されている、ただし、構造およびバイオ フィルムの密度によって染色できないバイオ フィルムに浸透して、不正確な過小評価の生存率。
ここにメソッドは、集計の治療後の細菌の生存を測定するのに量的と可視化分析を使用します。このメソッドの利点は、その対策は実際の感染で見られるものに近い環境で細菌の生存です。非集約と集約された細菌の生存率の違いは、私たち体内のマイクと相関する生体外でマイクを決定することができます。<...

淋病は、性感の一般的な感染症 (STI)1です。淋菌(GC)、グラム陰性菌 diplococcal 菌がこの病気の原因となるエージェントです。性器の感染症の症状は尿道分泌物、全身性器の痛み、排尿時の痛みになります。感染はしばしば無症候性2,の3,の4、5であり拡張植民地化できます。これらの未処理の伝染は、有機物の伝達を容易にする可能性がある、これは骨盤の炎症性病気 (PID) などの合併症につながることができ、播種性淋菌感染症 (DGI)6に主要な健康の心配。抗生物質耐性の淋病は主要な公衆衛生の危機および増加の社会経済的負担7 です。セファロスポリンに感受性の低下は、単一抗生物質から8セフトリアキソンとアジスロマイシンまたはドキシサイクリンを組み合わせたデュアル療法への治療レジメン変更になりました。セフトリアキソンとアジスロマイシン9,10, 無症候性感染症との組み合わせでの増加の障害は、淋病の治療の失敗を理解する必要性を強調表示します。
寒天培地希釈法とディスク拡散テストを含む、最小発育阻止濃度 (MIC) テストは、抗生物質への抵抗を識別する標準的な検査として使用されています。それにもかかわらず、マイクのテストは、生体内で細菌の抗生物質耐性を反映している場合は明らかです。抗生物質の殺菌濃度の存在下で細菌の生存に貢献する細菌バイオ フィルムの形成: マイクのテストはこの効果11を検出することができるではないです。我々 はその抗生物質仮説 GC は、粘膜の表面12バイオ フィルムを形作ることができる、ため凝集感受性は個人総合順位で見られると異なるでしょう。さらに、研究の 3 段階可変表面分子、Pili、不透明度関連タンパク質 (Opa)、異なった大きさで分類された骨材13,につながる細菌間の相互作用を調節する、lipooligosaccharides (ロサンゼルス)、示されています。14,15します。 適切な方法の不足のため抗生の抵抗をこれらのコンポーネントの貢献は検査されなかった。
現在、バイオ フィルム撲滅を測定するいくつかの方法があります。最も広く使用されている定量法は、クリスタル バイオレット染色16を用いたバイオマスの変化を測定することによってです。ただし、メソッドには、実験繰り返し17のエラー メッセージを生成することができます潜在的重要な実験操作が必要です。ここで使用されるライブ/デッド染色法では、ライブとデッドの細菌とバイオ フィルム内の分布の可視化ことができます。しかし、バイオ フィルムの構造は、染料の浸透を軽減する物理的な障壁として提起できます。したがって、グループ内でのライブ/デッド細菌を定量化する染色するは、小さなバイオ フィルムまたはその前駆体 microcolonies または集計に限定されます。寒天培地希釈法とディスク拡散テストを含む他の方法は、凝集の効果を測定することは。必要両方が測定できる定量細菌を生きていると、その分布を可視化する理想的な方法抗菌薬曝露後の集計内で GC の感受性を調べる。
ここで説明する手順を組み合わせた ATP 使用率測定して GC 感受性抗生物質の存在下で凝集を目視で調べてライブ/死んで染色定量的に分析します。

<table><tbody><tr><td>100x ケロッグのサプリメント</td><td></td><td></td><td></td></tr>寒<tr><td>天</td><td>United States Biological</td><td>A0930</td><td></td></tr><tr><td>BacTiter Assay&nbsp;</td><td>プロメガ</td><td>G8232</td><td></td></tr><tr><td>セフトリアキソン</td><td>TCI</td><td>C2226</td><td></td></tr><tr><td>ディフコ GC ミディアムベース&nbsp;</td><td>BD</td><td>228950</td><td></td></tr><tr><td>硝酸第二鉄、非水和物&nbsp;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>254223-10G</td><td></td></tr><tr><td>グルコース</td><td>サーモフィッシャーサイエンティフィック</td><td>BP350-1</td><td></td></tr><tr><td>L-グルタミン結晶粉</td><td>フィッシャーサイエンティフィック</td><td>BP379-100</td><td></td></tr><tr><td>BacLight ライブ/デッド染色</td><td>Invitrogen</td><td>L7012</td><td></td></tr><tr><td>MS11 ナイセリア淋病菌</td><td></td><td></td> ハー<td>マン・シュナイダー博士提供 ウォルター・リード陸軍研究所研究</td></tr><tr><td>リン酸二塩基性カリウム (K2HPO4)</td><td>Fisher Scientific</td><td>P290-500</td><td></td></tr><tr><td>リン酸カリウム一塩基性 (KH2PO4)</td><td>Fisher Scientific</td><td>BP329-1</td><td></td></tr><tr><td>プロテオース ペプトン&nbsp;</td><td>BD Biosciences</td><td>211693</td><td></td></tr><tr><td>塩化ナトリウム (NaCl)</td><td>フィッシャーサイエンティフィック</td><td>S671-10</td><td></td></tr><tr><td>可溶性デンプン</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S9765</td><td></td></tr><tr><td>チアミン ピロリン酸</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C8754-5G</td><td></td></tr><tr><td>機器</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>ペトリ皿</td><td>VWR</td><td>25384-302</td><td></td></tr><tr><td>8-wellカバースリップボトムチャンバー&nbsp;</td><td>サーモフィッシャーサイエンティフィック</td><td>155411</td><td></td></tr><tr><td>96ウェル組織培養プレート&nbsp;</td><td>コーニング、ファルコン</td><td>3370</td><td></td></tr><tr><td>バイオセーフティキャビネット(NU-425-600クラスII、A2層流バイオハザードフード)</td><td>Nuaire</td><td>32776</td><td></td></tr><tr><td>CO2インキュベーター</td><td>フィッシャーサイエンティフィ</td>ック<td>&nbsp;Model 3530</td><td></td></tr><tr>ライ<td>カ</td><td>SP5X</td><td></td>コーニングライブ<td>イメージングチャンバー付共焦点顕微鏡</td></tr><tr><td>&nbsp; 96ウェルブラックポリスチレンマイクロプレート&nbsp;</td><td>コーニング</td><td>3904</td><td></td></tr><tr><td>Glomax イルミネーター&nbsp;</td><td>Promega</td><td>E6521</td><td></td></tr><tr><td>ピペットチップ(0.1-10 &micro;L)</td><td>サーモフィッシャーサイエンティフィック</td><td>02-717-133</td><td></td></tr><tr><td>ピペットチップ (1000 & micro;L)</td><td>VWR</td><td>83007-382</td><td></td></tr><tr><td>ピペットチップ(200 & micro;L)</td><td>VWR</td><td>53509-007</td><td></td></tr><tr><td>分光光度計 Ultrospec 2000 UV</td><td>Pharmacia Biotech</td><td>80-2106-00</td><td></td></tr><tr><td>滅菌 15 ml 円錐管</td><td>VWR</td><td>21008-216</td><td></td></tr><tr><td>滅菌マイクロ遠心チューブ (1.7 mL)</td> <td>Sorenson BioScience</td><td>16070</td><td></td></tr><tr><td>滅菌ポリエステル先端アプリケーター</td><td>フィッシャーサイエンティフィック</td><td>23-400-122</td><td></td></tr><tr><td>ソニケー</td><td>ターKontes</td><td>は9110001</td><td></td>と同等</tr></tbody></table>

淋菌atp の使用率が集計を使用して商業試金およびライブ/デッド染色の抗生物質感受性の定量的検討

Quantitative Examination of Antibiotic Susceptibility of Neisseria gonorrhoeae Aggregates Using ATP-utilization Commercial Assays and Live/Dead Staining

抗生物質耐性淋菌(GC) の出現は、世界的な健康の脅威であるし、治療に失敗する人を識別する必要性を強調します。このグラム陰性細菌は、ヒトの排他的淋疾を引き起こします。感染、時にバイオ フィルムおよび/または集合体を形成することです。最小発育阻止濃度 (MIC) テストは、適切な治療の定義、抗生物質に対する感受性を決定するために使用されます。しかし、生体内での撲滅と検査結果の関係のメカニズムは知られていません。GC 集計の抗生物質感受性に影響を与えるし、骨材粒径と抗生物質感受性との関係を示していますどのように調べ方法が開発されました。GC 集計、彼らは抗生物質の殺害に抵抗力があるが、中心部の細菌の存続セフトリアキソン治療よりも周囲の。データを示す淋菌集計が標準寒天培地プレート ベース マイク メソッドを使用して反映されていないセフトリアキソンに感受性を減らすことができます。本研究で用いられた方法は臨床的に関連する条件の下で細菌の感受性をテストする研究者になります。

2 つの方法を用いて: atp 利用と生きる/デッド染色法。結果は結合または、個別に集計内抗生物質治療後の生存細菌を検査するため使用できます。黄色ブドウ球菌のバイオ フィルム20,21正確に生菌数を測定する atp 利用を示されています。ここでは、抗生物質感受性で GC 集合の役割を調べる MS11Opa + ピル + ひずみが使用されました。+ MS11Opa + Pil の非集計は、集計 MS11Opa + Pil +、または集計し、超音波 MS11Opa + Pil によって混乱 + セフトリアキソンと ATP のレベルを測定 (図 1A) のシリアル希薄を施した。パーセント生存抗生物質による治療と比較すると、事前に集計された GC は、等しいセフトリアキソン (寒天培地希釈テスト (からマイクの 0.015 μ G/ml ...

単純な ATP 測定法およびライブ/デッド染色法は、定量化し、セフトリアキソン、治療後の淋菌生存を視覚化する使用されました。このプロトコルを拡張して任意の抗生物質の抗菌効果を確認して、細菌バイオ フィルムにおける抗生物質の最小発育阻止濃度を定義する使用ことができます。

淋菌ATP の使用率が集計を使用して商業試金およびライブ/デッド染色の抗生物質感受性の定量的検討

The emergence of antibiotic resistant Neisseria gonorrhoeae (GC) is a worldwide health threat and highlights the need to identify individuals who fail ...

この技術は、より臨床的に関連する条件下での抗生物質感受性を測定することを可能にする。この技術はまた、凝集体で細菌を殺すことができる真の抗生物質濃度を決定することを可能にする。この手法は、GC凝集体を排除するために必要な濃度を決定するために適用することができる。この方法は、凝集体を形成することができる細菌の抗菌感受性を測定するために適用することもできる。ライシスが完了したことを確認するために、ライシスのステップに注意してください。さもなければ、ATP測定アッセイは生存可能な細菌の数を過小評価する。この方法を視覚化することで、他の研究者は一貫性を持ってこの実験に従い、複製することができます。37°Cと5%の二酸化炭素で16〜18時間のインキュベーションのために1%ケロッグを補充GCK寒天に、ナイセリア淋菌、またはGC株をストリーキングから始めます。翌朝、光顕微鏡を使用して、各プレートから暗いエッジを持つ暗い縁またはピリ陽性コロニーのないピリ陰性コロニーを慎重に選択し、選んだコロニーを新しいGCKプレートにストリークし、摂氏37度と5%の二酸化炭素で16〜18時間培養します。翌朝、滅菌アプリケーターを使用して各プレートからGCコロニーを採取し、4.2%重炭酸ナトリウムと1%ケロッグ溶液を補充した暖かいスープで各綿棒を再中断します。650ナノメートル(OD650)で光学濃度を測定し、懸濁菌の濃度を決定し、GC濃度を1ミリリットル当たり8コロニー形成単位に約10倍に調整する。次に、96ウェルプレートの個々の井戸に99マイクロリットルのGC懸濁液を加え、細菌が摂氏37度と5%の二酸化炭素で6時間凝集できるようにします。インキュベーションの最後に、各ウェルに連続希釈されたセフトリアキオンの1マイクロリットルを追加し、いくつかの井戸を未処理のままにしてコントロールとして機能し、プレートをさらに24時間インキュベーターに戻します。翌日、各井戸の懸濁液を1回144ワットで3回、超音波処理ごとに5秒間20キロヘルツを超音波処理し、各井戸に市販のATP使用率グロー試薬の100マイクロリットルを追加します。慎重に新しい96ウェル黒いマイクロプレートの個々の井戸に各井戸から混合物の150マイクロリットルを転送し、プレートリーダー上の560ナノメートルで各ウェルの吸光度を測定します。次に、連続抗生物質処理後に得られた測定値と未処理のウェルからの測定値の比により生存率を算出する。ライブ/デッド GC 凝集体の視覚化のために、滅菌アプリケーターを使用して、一晩培養されたプレートから GC を収集し、1%ケロッグを補充した事前温められた GCP 培地で GC を再中断します。分光光度法でOD650を測定し、1ミリリットル当たり7コロニー形成単位に約10倍の濃度に調整します。次に、GC懸濁液198マイクロリットルを8ウェルカバースリップボトムチャンバーに加え、チャンバー37°C、5%の二酸化炭素を6時間インキュベートします。インキュベーションの終了時に、凝集状態ごとに2マイクロリットルのセフトリアキコンで細菌を治療し、適切な実験インキュベーション期間のためにチャンバーをインキュベーターに戻します。インキュベーションの最後に、各ウェルに0.6マイクロリットルの生きた/死んだ染色液を加え、チャンバーをインキュベーターにさらに20分間戻します。次に、共焦点顕微鏡を使用してZシリーズ画像を得る。GC 集計のサイズを測定するには、ImageJ で最初の画像を開き、フリーハンドラインを選択して、画像内の各集約の領域を丸めます。[分析と測定] をクリックします。集計のサイズは、エリア列の下に示されます。各集合体の生染色から死死染色の蛍光強度比を定量化するには、分析をクリックして測定を設定し、ポップアップウィンドウで統合密度を確認します。[OK] をクリックし、[画像、色、チャンネル ツール] をクリックします。死んだ細菌染色のための蛍光として色とチャネル1を選択します。各凝集の面積を丸くするフリーハンドラインを選択し、クリックして分析して測定し、統合密度列の各集合体の蛍光強度比を取得します。生きた細菌染色のための蛍光にチャネル2を選択し、ちょうど実証したように各集合体の蛍光強度を測定する。次に生蛍光強度データを死発蛍光強度データで除算し、生蛍光強度比を得る。この代表的な実験では、非凝集したピリ陽性、凝集したピリ陽性または凝集および破壊されたピリ陽性細菌を、ATPレベルの測定前にセフトリアキシンの連続希釈で処理した。事前凝集GCは、セフトリアキコン以上の等濃度で処理した場合、非凝集または凝集破壊GCよりも有意に高い生存率を示した。より大きな凝集体を形成するピリ陽性株は、突然変異株と比較してセフトリアキシン処理後に最も高いATPレベルを示した。試験された株に関係なく、抗生物質治療前の生きた/死んだ染色は、主に培養物の外側層に位置する死んだ細菌を明らかにし、ライブGCは主にセフトリアキソン処理された凝集体のコア内で同定された。予想通り、ピリ陽性菌が最大の凝集体を形成し、ピリ陰性培養が最も小さかった。特に、ピリ陽性凝集体は抗生物質治療後もコア層で生きていたのに対し、小さくて緩い突然変異体凝集体のGCは死んでいた。GCの大きさと生存率に基づいて、相関グラフをプロットして、細菌の凝集サイズと抗生物質生存率との関係を調べることができる。超音波処理は、個々の細菌からのATPが密に結合された凝集体内で放出されることを確認するために重要です。そうでない場合、測定値は一貫していません。細菌が凝集した後に細菌をプレート化し、抗生物質で処理され、生存可能な細菌と複製可能な細菌の両方を測定することが重要です。この技術は、抗生物質感受性に対する細菌凝集の影響を測定し、研究者が疾患を治療するためのより良い薬物を開発することを可能にする。

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Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

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