Name: 脂質混合アッセイ用リポソームへの組換えショウジョウバエアラストシンの洗剤支援再構成 (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2019-07-03T13:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 43 s
Description: 学ぶリポソームへの洗剤支援再構成法とFRETベースの脂質混合アッセイを用いたDrosophila atlastinの膜融合能測定。この手法は膜融合タンパク質の機能解析に有用です。

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私たちは、マイケル・スターン博士と彼の研究室に対して、アラストイン関連プロジェクトに関する洞察とフィードバックに感謝します。この研究は、国立総合医学研究所[R01GM101377]と国立神経障害・脳卒中研究所[R01NS102676]によって支援されました。

1. GST-DAtl-His8の精製
<ol><li>
タンパク質発現とリサート製剤
	<ol>
<li>pGEX4-T32のGST-DAtl-His8コンストラクトでBL21(DE3)大腸菌を変換し、アンピシリンプレート上で選択します。</li>
		<li>14 mL培養チューブでLB+アンピシリン(100mg/mLアンピシリンの5μL)を単一の形質転換体を選択し、6-8時間の200rpmで振盪して25°Cでインキュベートします。 注:漏れ発現のため、より高い温度でインキュベートすることはお勧めしません。25 °Cでの成長は、この成長期間中のタンパク質の凝集を減少させます。</li>
		<li>LB+アンピシリンの200mLを5mL培養の1mLで接種し、25°Cで一晩(〜15〜18時間)インキュベートします。</li>
		<li>翌朝、遠心分離(2,000 x g~10分)で細胞を収穫し、LBの5mLで再中断する。</li>
		<li>LB+アンピシリンの4Lを接種し、OD 600(0.05~0.15)を測定します。振りながら25°Cでインキュベートします。 注:細菌を追加する前に、OD600測定のブランクとして機能するいくつかのメディアを予約します。</li>
		<li>ODは0.4 ~ 0.5 の間の OD に達するまで、1 時間ごとに OD 600 を測定します。この時点で、温度を16°Cに下げます。</li>
		<li>0.2 mM IPTG(1Mストックの800 μL)で誘導し、インキュベーターが16°Cに達してから10分後に誘導する。16°Cで一晩(~15~18時間)インキュベートします。 注:温度が低いほど、アラストシンの凝集を減らすことによって機能性タンパク質の収率が向上します。</li>
		<li>翌朝、4°Cで7,500 x gで遠心分離して細胞を収穫する。</li>
		<li>A200(25 mM HEPES(pH 7.4)および200 mM KCl)の200 mLで細胞を再中断します。</li>
		<li>4°Cで5分間11,000 x gで細胞を遠心分離します。</li>
		<li>破断バッファーの40 mLでペレットを再中断する(A200プラス10%グリセロール、2 mM 2-メルカプトエタノール、4%トリトンX-100(TX100)、40mMイミダゾール、および1 EDTAフリープロテアーゼ阻害剤カクテル錠剤)。 注:気泡や泡の発生を避けるために、再中断後にTX-100を追加します。</li>
		<li>18 G の針を通過し、約 10,000 psi で細胞破壊を 3 回実行します。</li>
		<li>1時間125,000 x gで抽出物を遠心分離します。 注:必要に応じてペレット1:2(w:v)を8M尿素に溶解し、室温で一晩ナットします。脱窒剤としての尿素は、SDS-PAGE分析のために不溶性ペレットタンパク質をゆっくりと溶解します。SDS-PAGEおよびクーマッシー染色分析のために1 μLを節約する。</li>
		<li>0.45 μmのセルロース硝酸塩生殖不能膜フィルターを通して抽出物を濾過し、細菌や大きな細菌の破片を除去します。 注:必要に応じて、SDS PAGEおよびクーマッシー染色分析用に1 μLを保存します。</li>
	</ol>
</li>
	<li>
親和性クロマトグラフィーによるタンパク質精製
	<ol>
<li>濾過されたライサテを固定化された金属親和性クロマトグラフィー(IMAC)樹脂カラムにロードし、Ni2+を帯電し、低イミダゾールバッファー(A100プラス10%グリセロール、2mM 2-メルカプトエタノール、1%TX-100、40mM imidazole)で予め平衡化4 °Cで分る。</li>
		<li>A100プラス10%グリセロール、2 mM 2-メルカプトエタノール、0.1%アナポーX-100、40 mMイミダゾールの25 mLでカラムを洗い、4°Cで1mL/minの割合で洗います。40 mMから500mMのイミダゾールの30 mL線形勾配でタンパク質を溶出し、500mMで最終的な5mL洗浄を行います。</li>
		<li>ピーク画分を一緒にプールし、4°Cで1時間のインキュベートを4°Cで膨らませ、以前は水に腫れ、10%グリセロール、2mM 2-メルカプトエタノール、0.1%アナポエX-100、および1mM EDTAでA100で平衡化した。 注:GSH-アガロースビーズは、前日に50mLの水で膨らませ、4°Cで一晩、またはRTで1時間インキュベートすることができます。水と平衡バッファーを除去するには、ブレーキなしで1分間500 x gのスイングバケツローターで遠心分離機を使用します。26 G針で上清を吸引します。</li>
		<li>ペレットGSH-アガロースビーズは、ブレーキなしで500 x gのスイングバケツローターで遠心分離し、26Gの針で吸引によってリサート上清を除去します。</li>
		<li>ビーズを10mLポリプレップカラムに移し、5mLの平衡バッファー(10%グリセロール付きA100、2mM 2-メルカプトエタノール、0.1%アナポーX-100、および1mM EDTA)を500x gで遠心分離することにより5回洗浄します。
</li>
		<li>10 mM減少グルタチオンを補充した平衡バッファーの1-1.5 mLでタンパク質を溶出させる。アリコトは液体窒素中のタンパク質とフラッシュ凍結を放流した。タンパク質は-80°Cで無期限に保存できます。 注:溶出バッファーの pH を 7.4 に調整します。</li>
		<li>アミドブラックタンパク質アッセイ9によるタンパク質濃度を定量し、SDS-PAGEおよびクマシー染色により純度を評価する。</li>
	</ol>
</li>
</ol>2. 組換えアラストシンをリポソームに再構成
<ol><li>押し出し法によるリポソーム製造10歳<ol>
<li>クロロホルム(10mM総脂質)で脂質ミックスストックを作ります。必要な脂質は、1-パルミトイル-2-オレオイルグリセロ-3-ホスホコリン(POPC)、1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスホ-セリン(DOPS)、、 1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン-N-(7-ニトロ-2-1,3-ベンゾキサジアゾロール-4-yl)(NBD-DPPE)、および1,2-ジパルミトイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン-N-(リッサミンロダミンBスルホニル)(Rh-DPPE)。受け入れリポソームは、POPC:DOPS(85:15モル比)とPOPC:DOPS:Rh-PE:NBD-PE(83:15:1.5:1.5モル比)のドナーリポソームで構成されています。 注:POPC:DOPS脂質ミックスは、伝統的にインビトロ脂質混合アッセイに使用されてきましたが、代替脂質組成物は、異なる実験目的に適合してもよい。POPC:DOPSリポソームは非常に安定しており、融合しにくいため、融合には非常に厳しいシステムです。</li>
		<li>L-α-ジパルミトイル-ホスファチジルコリン(コリンメチル-3H)の1 μCi/mLを脂質混合に加え、液体シンチレーション計数により後工程で脂質濃度を決定する。この在庫の少なくとも 8 μL を予約します。</li>
		<li>フリントガラスチューブに脂質ミックスの所望の量を転送します。</li>
		<li>クロロホルムが見えなくなるまで、N2ガスの穏やかな流れの下で脂質ミックスを10分間乾燥させます。</li>
		<li>30分間真空でデシケータでさらに脂質フィルムを乾燥させます。</li>
		<li>脂質フィルムに10%グリセロール、2 mM 2-メルカプトエタノール、および1 mM EDTAを加え、濃度を10mMに戻す。室温で15分間軽く渦を塗って脂質フィルムを再濁させる。フリントガラスチューブを収容できるボルテキサーをお勧めします。</li>
		<li>液体窒素中の水和脂質を10回凍結解凍する。液体窒素中で凍結した後、溶液を室温で30sに座らせてリポソームを解凍し、その後、より速く解凍するために水に移します。この凍結融解サイクリングは、マルチラメラ小胞を最小限に抑えます。 注意:チューブに0.5mLを超える体積が含まれ、液体窒素を水に直接移すと割れる場合があります。</li>
		<li>ミニ押出機を使用して100 nmの細孔サイズのポリカーボネートフィルターを通して脂質を渡します。</li>
		<li>シンチレーションカウントによるリポソームの総脂質濃度の決定 注:脂質の一部は、ガラス管やミニ押出機に残されることがあります。<ol>
<li>シンチレーションカクテルの3 mLに脂質ストックとリポソームの4 μLを追加します。</li>
			<li>ストックおよびリポソームの 1 分あたりの平均数 (CPMA) を測定します。そして、次の式でリポソーム濃度を計算します。<img alt="Equation 1" src="/files/ftp_upload/59867/59867equ01.jpg">
</li>
		</ol>
</li>
		<li>リポソームを4°Cで1週間保存します。リポソームは時間とともに集約され、再構成効率が低下する可能性があるため、保存時間を長くすることはお勧めしません。</li>
	</ol></li>
	<li>あらかじめ形成されたリポソームへの洗剤による再構成
	<ol>
<li>一緒に混合するバッファー、タンパク質、リポソームと余分な洗剤の量を計算します。<ol>
<li>必要な合計ボリュームを決定します。この容積は10%のグリセロール、2 mM 2-メルカプトエタノールおよび1 mM EDTAの緩衝A100から成っている。250 μL 未満の容積は、0.5 mL マイクロ遠心分離管ではうまく混合されません。</li>
			<li>約1mMの最終的な脂質濃度を与えるために必要なリポソームの体積を計算します。バッファー・ボリュームからボリュームを減算します。</li>
			<li>所望のタンパク質を脂質モル比に与えるために必要なタンパク質の体積を計算します(通常は1:400)。それに応じてバッファボリュームを減らす。</li>
			<li>リポソームを飽和させるために追加する必要がある追加の洗剤の量を決定します 0.64 - 0.8 の間の有効な洗剤の脂質比 (Reff)を目指します。タンパク質に添加される洗剤を考慮することを忘れないでください。(Reff)は、総洗剤<img alt="Equation 2" src="/files/ftp_upload/59867/59867equ02.jpg">濃度とD水量の合計が単体洗剤濃度(TX-100及びアナポエX-100の存在下で0.18mM)である式Dによって決定される4、 11.</li>
		</ol>
</li>
		<li>バッファー、洗剤、タンパク質、リポソーム:0.5 mLチューブで溶液を一緒に混ぜます。リポソームを迅速に加え、5s用にすぐに渦を加えて混合物を均質化する。</li>
		<li>4°Cで1時間のヌタターで反応をインキュベートします。</li>
		<li>0.2 g/mLの非極性ポリスチレン吸着ビーズ「スラリー」を水中に入れます。 注:ステップ2.2.3で1時間インキュベーションの前の間にポリスチレン吸着ビード「スラリー」を作ります。</li>
		<li>ポリスチレン吸着ビーズの0.2gを計量し、マイクロ遠心管に移します。</li>
		<li>チューブにメタノールの1 mLを追加することにより、ビーズをドガと1分間混合し、ドガセドビーズが沈みます。</li>
		<li>メタノールを吸引し、ビーズに水を加えます。ビーズを5分間水と混ぜ、水を吸引します。4回繰り返し、ポリスチレン吸着ビード「スラリー」を水で1mLの体積にし、最終的な濃度を0.2g/mLにします。 注:ビーズはまだチューブの底に落ち着く必要があります。そうでない場合は、再びドガ。21G以上の針を使用して、ビーズからメタノールと水を吸引します。</li>
		<li>各サンプルのすべての洗剤を吸収するために必要なポリスチレン吸着ビーズの量を計算します。ポリスチレン吸着ビーズの1gは、TX-100の70mgを吸収します。各反応に必要なポリスチレン吸着ビードスラリーの体積を計算するには、反応中の全洗剤(ステップ2.2.1.4)を70mgで割り、次いでビーズスラリーの濃度(0.2 g/mL(ステップ2.2.7)で割ります。</li>
		<li>計算されたポリスチレン吸着ビーズスラリーの量を0.5mLチューブに移し、水を吸引する。 注:ビーズを転送するために20〜200 μLの先端の端をカットし、落ち着いたビーズを再中断するためにピペッティングの直前にチューブを渦。</li>
		<li>ポリスチレン吸着ビーズを含む0.5 mLチューブにサンプルを追加し、4°Cで1時間のナタチングサンプルをインキュベートします。</li>
		<li>古いビーズを残して、新鮮なビーズにサンプルを転送する2回繰り返します。</li>
		<li>新鮮なビーズで4番目のチューブにサンプルを追加し、4°Cで一晩(〜15〜18時間)インキュベートします。</li>
	</ol></li>
	<li>午前中は、4°Cで16,000 x gで10分間遠心分離することにより、ポリスチレン吸着ビーズおよびペレット不溶性タンパク質凝集体からサンプルを除去する。</li>
	<li>上清を回収し、液体シンチレーション計数で最終的な脂質濃度を決定します(ステップ2.1.9.2を参照)。任意に、タンパク質濃度は、アミド黒タンパク質アッセイ9によって決定されてもよい。 注:アラストシンプロテオリポソームの場合、酵素アッセイは新鮮なリポソームで行われるべきである。4°Cまたは凍結での長い貯蔵は、アラストシン活性の著しい損失につながる。</li>
</ol>3. 脂質混合アッセイ
<ol><li>ドナーおよびアクセプタープロテオリポソームをA100にそれぞれ0.15mMの濃度に持ち込み、10%のグリセロール、2 mM β-メルカプトエタノール、1 mM EDTAおよび5 mM MgCl2を含む。各反応(50μL)は、蛍光測定値に適した平らな白色96ウェルプレートでウェルに添加する必要があります。三つ三つ、および非GTP陰性制御を含む少なくとも4つの反応を準備する。</li>
	<li>プレートを予熱プレートリーダーに37°Cに置きます。NBD蛍光(励起460nmおよび発光535nm)を毎分5分間測定します。</li>
	<li>5 mM GTP (50 mM GTP の 5 μL) を加えて融合を誘導します。</li>
	<li>毎分1時間毎分NBD蛍光を測定します。</li>
	<li>2.5%w/v n-ドデシルβ-D-マルトシドの5 μLを加えてプロテオリポソームを溶解し、最大NBD蛍光量を測定する。毎分15分間NBD蛍光を読んでください。</li>
</ol>4. イオエキソール不連続勾配上のリポソーム浮動12
<ol><li>(オプション)浮動アッセイ13による再構成の効率を分析する。</li>
	<li>10%グリセロール、2 mM 2-メルカプトエタノール、および1 mM EDTAでA100に80%および30%w/v iohexolを調製します。イオエクソールは容易に溶解しないため、4°Cで一晩nutatingすることにより、前日に準備する必要があります。</li>
	<li>80%イオエキソールストックの150 μLを150μLのプロテオリポソームサンプルと完全に混合し、40%のイオエキソールに持ち込みます。5 x 41 mm2超クリアチューブに追加して気泡を避けます。</li>
	<li>30%イオエキソールストックの層250μLをサンプルの上にゆっくりと中間層を作る。任意の気泡を避け、下の層を乱します。中間層の上に、2 mM 2-メルカプトエタノールと1 mM EDTAでA100の50 μLをゆっくりと追加します。</li>
	<li>スイングバケットローターの勾配を220,000 x gで4°Cで4°Cで遠心分離し、ゆっくりと加速し、ブレークなし。</li>
	<li>グラデーションの層を収穫し、SDS-PAGEおよびクーマッシー染色物によって分析し、定量化は密度メトリーによって行われてもよい。再構成されたタンパク質は最上層に浮かぶ必要があり、タンパク質および脂質凝集体は底部または中間層に堆積する。</li>
</ol>5. トロンビンプロテオリシスによる再構成タンパク質の配向の解析
注:ここで報告されたアラストイン構造体は、N末端GSTタグの終端とアラストシンの始まりとの間にトロンビン切断部位を有する。正しい向きでアラストシンは、この切断部位がプロテアーゼにアクセス可能になり、間違った方向のタンパク質は脂質二重層によって保護される。
<ol><li>アラストシンプロテオリポソームの向きをアッセイするには、新鮮な再構成されたプロテオリポソームの少なくとも8 μLを予約する。</li>
	<li>プロテオリポソームの8 μLと1 ΜLの1 μLを加えます。37 °Cで1時間インキュベートします。</li>
	<li>EDTAフリープロテアーゼ阻害剤カクテルの5mg/mLの1 μLでプロテアーゼをクエンチし、37°Cで30分間インキュベートします。</li>
	<li>SDS-PAGEとクーマッシー染色でサンプルを分析します。クチビと不潔なタンパク質の割合は、デンシトメトリーによって決定されてもよい。</li>
</ol>

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</ol>

著者は何も開示していない。

ここでの方法は、アラストシン組換えの核融合活性を精製、再構成、測定するための効率的な方法を示す。機能的なアラストインの高い収率を確保するためにいくつかの重要なステップを考慮する必要があります。.アラストシンの発現は、凝集を避けるために低温(16°C)で行う必要があり、1つは0.4〜1.5 mg/mLの間の最終的な濃度を目指す必要があります。非常に希薄なタンパク質は、脂質比に対して1:400タンパク質で最適に再構成されません。再構成効率は、ここで説明する浮動アッセイによって必要に応じて分析することができる(図2)。リポソーム浮遊アッセイの利点の1つは、脂質二重層13に関連する可溶性タンパク質を分析するために拡張できることである。さらに、再構成されたタンパク質の配向は、プロテアーゼ消化14によっても分析されてもよいが、これは間違った方向で再構成された誤ったタンパク質または凝集タンパク質または再構成を区別しないかもしれない(図3)...

膜融合は、多くの生物学的反応において重要なプロセスです。生物学的条件下では、膜融合は自発的ではなく、そのような反応を触媒するために特殊な融合タンパク質を必要とする1.ERホモティピック膜融合は、ダイナミン関連GTPaseアラストシン2によって動物に媒介される。同質融合におけるアラストシンの役割は、末梢ERの三方接合部の基本であり、細胞全体に広がる管状の大規模な相互接続ネットワークを構成する。アラストニンは、大きなGTPase、3つのらせん束中ドメイン、疎水性膜アンカー、および短い細胞質C末端尾3からなる保存されたドメイン形態を有する。組換えショウジョウバエアラトミンを伴うインビトロ研究では、リポソームに再構成すると、そのフソジェニック特性を維持することが示されている。ヒトホモロを含む他のアラストチンは、インビトロでの融合を要約することができませんでした。ここでは、GSTとポリヒスチジンを精製する方法論について、アラストシンの組換えショウジョウバエをタグ付けし、リポソームに再構成し、融合をアッセイする方法論を説明する。
インビトロでの膜融合の研究は、通常、フソジェニックタンパク質が膜アンカーを持っているため、課題を提示します。それらを研究するためには、モデル脂質二重層にそれらを再構成する必要があります。大きなユニラメラ小胞(LUV)は、脂質タンパク質相互作用を研究するのに有用なツールです。ここでは、タンパク質再構成および融合アッセイ用の異なる脂質組成物のLuVを作るシステムを提示する。LUVへの一体タンパク質の再構成は、有機溶媒媒介性再構成、機械的メカニズム、または洗剤支援再構成4を含む様々な方法によって達成することができる。ここでは、洗剤除去により予め形成されたリポソームにショウジョウバエのアラストシンを再構成する方法を提示する。この再構成法の利点は、高い再構成収率と脂質二重層におけるアラストシンの適切な配向を含む。さらに、この方法を通じて、タンパク質は乾燥したり有機溶媒にさらされたりせず、構造や機能を維持します。その欠点の中で、洗剤の存在はすべてのタンパク質に理想的ではない可能性があり、最終的なプロテオリポソームは、脂質二重層に何らかの洗剤を組み込む可能性があります。さらに透析は、より多くの洗剤を排除するために使用されてもよい。しかし、透析には時間がかかるため、タンパク質活性が失われる可能性があります。
アラストシンの融合活性を評価することは、前述の2として脂質混合アッセイによって決定することができる。ここでは、N-(7-ニトロベンツ-2-オキサ-1,3-ジアゾル-4-yl(NBD)/リッサミンローダミンBスルホニル(ローダミン)標識脂質を介したアラストイン媒介融合を測定する方法を用いて述記する。このアッセイは、ドナー(標識された)プロテオリポソームと受諾器(ラベルなし)プロテオリポソームの融合を必要とする。FRET放出は、膜融合中の脂質混合の結果として、「標識された」リポソームから「標識されていない」リポソームへのドナー-受諾ペアの希釈として反応中に測定することができる(図1)5。このアッセイは膜融合の代理として機能するが、膜融合とヘミフュージョン(外側のリーフレットのみが混在する状態)を区別することに制限がある。この問題に対処するために、代替案は、ジチオニテによるNBDの外側のリーフレットクエンチングである。NBD/ロダミン脂質混合アッセイと同様の方法論に続いて、融合による任意のNBD FRET放出を外側のリーフレットを消光すると、内部リーフレット混合8に起因する。
内部水性含有量混合による代替融合アッセイアドレスフルフュージョンのみ5.その例としては、テルビウム(Tb)/ジピコリン酸(DPA)アッセイおよびアミノナフタレントリスルホン酸(ANTS)/p-キシレンビス(ピリジニウム)臭化物(DPX)アッセイがあります。Tb/DPAアッセイでは、カプセル化されたTbを持つリポソームのプールが混合され、封入されたDPAとリポソームと融合されます。融合時に、蛍光は[Tb(DPA)3]3-キレート複合体6内のDPAからTbへの内部エネルギー伝達を介して増加する。対照的に、ANTS/DPXアッセイの場合、ANTS蛍光はDPX7によって消光されます。これらのシステムは内部含有量の混合に対処する一方で、非カプセル化試薬の除去、ならびに蛍煙素の意図しない相互作用のために、リポソームのより詳細な調製が必要である。

<table><tbody><tr><td>10 mL ポリプレップクロマトグラフィーカラム</td><td>Biored</td><td>731-1550</td><td></td></tr><tr><td>10 mm x 75 mm フリントガラス管</td><td>VWR</td><td>608225-402</td><td></td></tr><tr><td>直径 47 mm、0.45 &mu;m 細孔 whatman 滅菌膜フィルター</td><td>Whatman</td><td>7141 104</td><td></td></tr><tr><td>96 ウェル ホワイト プレート</td><td>NUNC 437796</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Anapoe X-100</td><td>Anatrace</td><td>9002-931-1</td><td></td></tr><tr><td>細胞かく乱物質</td><td>アベスチン</td><td>アベスチン エマルシフレックス C3</td><td></td></tr><tr><td>DOPS (1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスホ-L-セリン (ナトリウム塩))</td><td>アバンティ</td><td>840035P-10mg</td><td>DOPS</td></tr><tr><td>EDTA</td><td>リサーチ・オーガニックス株式会社</td><td>6381-92-6</td><td>エチレンジアミン四酢酸</td></tr><tr><td>EDTAフリープロテアーゼ阻害剤カクテル</td><td>ロシュ</td><td>11873580001</td><td>完全プロテアーゼ阻害剤</td></tr><tr><td>押出機</td><td>シグマアルドリッチ</td><td>Z373400&nbsp;</td><td>Liposofastベーシックエクストルーダー</td></tr><tr><td>GE Akta Prime液体クロマトグラフィーシステム</td><td>GE Pharmacia</td><td>8149-30-0006</td><td></td></tr><tr><td>グルタチオンアガロースビーズ</td><td>Sigma aldrich</td><td>G4510-50ml</td><td></td></tr><tr><td>グリセロール</td><td>EMD</td><td>GX0185-5</td><td></td></tr><tr><td>GTP</td><td>Sigma Aldrich</td><td>36051-31-7</td><td>グアノシン5 '三リン酸ナトリウム塩水和物</td></tr><tr><td>HEPES、アシッド</td><td>フリーOmnipur</td><td>5330</td><td></td></tr><tr><td>イミダゾール</td><td>フルーカ</td><td>5670</td><td></td></tr>固定<tr><td>化金属アフィニティークロマトグラフィー(IMAC)樹脂カラム</td><td>GEヘルスケア</td><td>17040801</td><td>1mLハイトラップキレートHP固定化金属アフィニティークロマトグラフィーカラム</td></tr><tr><td>Iohexol</td><td>正確な化学および科学株式会社</td><td>AN 7050 BLK</td><td>Accudenz / Nycodenz</td></tr><tr><td>IPTG</td><td>研究製品国際株式会社</td><td>I56000-100.0</td><td>IPTG、ジオキサンフリー</td></tr><tr><td>L-グルタチオン還元</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G4251-5g</td><td></td></tr><tr><td>塩化マグネシウム</td><td>フィッシャー</td><td>7791-18-6</td><td></td></tr><tr><td>メタノール</td><td>オムニソルブ</td><td>MX0488-1</td><td></td></tr><tr><td>NBD-DPPE (1,2-ジパルミトイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン-N-(7-ニトロ-2-1,3-ベンゾオキサジアゾール-4-イル) (アンモニウム塩))</td><td>Avanti</td><td>236495</td><td>NBD-DPPE</td></tr><tr><td>n-ドデシル &β;-D-マルトシド</td><td>Chem-Impex International</td><td>21950</td><td></td></tr><tr><td>非極性ポリスチレン吸着剤 ビーズ</td><td>BioRad</td><td>152-3920</td><td>SM2 Biobeads</td></tr><tr><td>核細孔トラックエッチング ポリカーボネート 19 mm 0.1 &mu;m 細孔膜</td><td>Whatman</td><td>800309</td><td></td></tr><tr><td>Optima LE80K 超遠心分離機</td><td>ベックマン・コールター</td><td></td><td></td></tr><tr><td>ホスファチジルコリン, L-&α;-ジパルミトイル [コリンメチル-3H]</td><td>ARC</td><td>ART0284</td><td>滴定脂質</td></tr><tr><td>プレートリーダー</td><td></td><td>TECAN TECAN infinite M200 プレートリーダー</td><td></td></tr><tr><td>POPC (1-パルミトイル-2-オレオイル-グリセロ-3-ホスホコリン)</td><td>アバンティ</td><td>850457C-25mg</td><td>POPC</td></tr><tr><td>塩化カリウム</td><td>MP</td><td>151944</td><td></td></tr><tr><td>Rh-DPPE(1,2-ジパルミトイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン-N-(リサミンローダミンBスルホニル)(アンモニウム塩))</td><td>Avanti</td><td>236495</td><td>Rh-DPPE</td></tr><tr><td>シンチレーションカクテル</td><td>国立診断</td><td>LS-272</td><td>Ecoscint XR水性または非水性サンプル用シンチレーション溶液</td></tr><tr><td>シンチレーションバイアル</td><td>ベックマン</td><td></td><td>592928 高速ターンキャップ ミニ Poly-Q バイアル</td></tr><tr><td>トロンビン</td><td>シグマ</td><td>T1063-1kU</td><td>ヒト血漿からのトロンビン</td></tr><tr><td>トリトン X-100</td><td>フィッシャー</td><td>BP151-500</td><td></td></tr><tr><td>超透明遠心分離管 5 mm x 41 mm</td><td>ベックマン</td><td>344090</td><td></td></tr><tr><td>ボルテックス 9 〜 13 mm チューブホルダー</td><td>VWR</td><td>58816-138</td><td>フリントガラス管</td></tr><tr><td>をボルテックスするためのインサートボルテックス インサート リテーナー</td><td>VWR</td><td>58816-132</td><td>ボルテックス チューブ ホルダーに必要なリテーナー</td></tr><tr><td>ボルテックス</td><td>VWR</td><td>2.235074</td><td>ボルテックス ジーニー 2 モデル G560</td></tr><tr><td>&beta;-メルカプトエタノール分子生物学グレード</td><td>カルバイオケム</td><td>444203</td><td></td></tr></tbody></table>

脂質混合アッセイ用リポソームへの組換えショウジョウバエアラストシンの洗剤支援再構成

Detergent-assisted Reconstitution of Recombinant Drosophila Atlastin into Liposomes for Lipid-mixing Assays

膜融合は真核細胞における重要なプロセスです。融合を触媒するには特殊なタンパク質が必要です。アラストリンは、ERの同質性融合に関与する小プラズム網膜(ER)常駐タンパク質である。ここでは、グルタチオンS-トランスフェラーゼ(GST)とポリヒスチジンタグドロソフィラアラストシンを2ラウンドの親和性クロマトグラフィーで精製する方法を詳述する。インビトロで融合反応を研究するには、精製された融合タンパク質を脂質二重層に挿入する必要があります。リポソームは、脂質組成物およびサイズが調整されてもよいとして、理想的なモデル膜である。そのために、予め形成されたリポソームにショウジョウバエのアラストリンに対する洗剤除去による再構成法について述べた。いくつかの再構成方法が利用可能であるが、洗剤除去による再構成は、アラストシンおよび他の同様のタンパク質に適しているいくつかの利点を有する。この方法の利点は、高い再構成収率および再構成されたタンパク質の正しい向きを含む。この方法は、他の膜タンパク質およびプロテオリポソームを必要とする他のアプリケーションに拡張することができる。さらに、膜融合の測定として用いられるプロテオリポソームのFRETベース脂質混合アッセイについて述べる。

アラストシン再構成の効率を図2に示す。再構成されたプロテオリポソームは、イオエクソール不連続勾配で浮動させた。未組み込みタンパク質は、底層(B)または中間層(M)に堆積させた。再構成されたタンパク質は、最上層(T)に浮動するであろう。グラデーションのサンプルをSDS-PAGEおよびクーマシー染色によって採取し、分析した。デンシトメトリーによるゲルの定量は、ごくわずかな失いを伴う再構成の非常に高い効率を示しています。全タンパク質の96%は、最上層(T)に浮かぶプロテオリポソームとして見出された。タンパク質の1%未満が再構成されず、中間層(M)で見つかり、3%のみが再構成または凝集し、底層(B)に堆積した。
再構成の程度を記述することに加えて、再構成後のアラストシンの向きを分析し、トロンビン切断アッセイ14により定量化した。再構成されたタンパク質は、リポソームの内膜空間に直面して、間違った向きになる可能性があります。間違った方向のタンパク質は、脂質二重層によるタンパク質分化から保...

生体膜融合は、特殊な融合タンパク質によって触媒されます。タンパク質のフソジェニック特性の測定は、脂質混合アッセイによって達成することができる。ERの同質融合を媒実化するタンパク質である組換えショウジョウバエを精製し、あらかじめ形成されたリポソームに再構成し、融合能力を試験する方法を提示する。

Membrane fusion is a crucial process in the eukaryotic cell. Specialized proteins are necessary to catalyze fusion. Atlastins are endoplasmic reticulum ...

ここで詳述する再構成および融合プロトコルは、モデル脂質二重層および融合タンパク質による脂質混合における膜結合タンパク質を研究する効率的な方法である。ここでは、ER融合タンパク質である糖質ショウジョウバエ・アトラスチンを、前形ホスファチジルコリンリポソームに組み換えする洗剤支援再構成について説明する。次いで、アプラスチンプロテオリポソームの融合をFRET系脂質混合アッセイにより測定する。洗剤支援再構成の主な利点の1つは、洗剤中のタンパク質が乾燥や溶剤にさらされないことです。また、ここで、アトラスチンの再構成の向きが非常に効率的であることを示す。FRETベースの脂質混合アッセイのもう一つの利点は、リポソームに染料をロードする必要がなく、余分な透析ステップを必要としないことです。この手順を開始するには、テキストプロトコルで概説されているように、クロロホルムで脂質混合ストックを準備します。DPPCのミリリットル当たり1マイクロキュリーを脂質ミックスに加え、このストックの少なくとも8マイクロリットルを予約してください。必要な量の脂質をフリントガラスチューブに移します。その後、クロロホルムが見えなくなるまで、窒素ガスの穏やかな流れの下で約10分間脂質混合物を乾燥させます。得られた脂質フィルムをさらにデシケータで30分間真空にして乾燥させます。この後、10%グリセロール、2ミリモル2-メルカプトエタノール、および1ミリモルEDTAを用いて十分なA100を脂質フィルムに加え、濃度を10ミリモルに戻します。室温で15分間軽く渦を出して脂質膜を再懸濁する。水和した脂質を液体窒素中で凍結します。リポソームを解凍するには、溶液を室温で30秒間座らせ、水に戻してより速い解凍を行います。この凍結融解サイクルを合計 10 回繰り返します。この後、100ナノメートル、19倍の細孔サイズで、ポリカーボネートフィルターを介して脂質を渡すためにミニ押出機を使用してください。リポソームの総脂質濃度を決定するには、4マイクロリットルの脂質ストックとリソソームを3ミリリットルのシンチレーションカクテルに加えます。テキストプロトコルで概説されているように、ストックとリポソームの1分あたりの平均カウントを測定し、リポソーム濃度を計算します。リポソームは摂氏4度で1週間保存します。まず、テキストプロトコルで概説されているように、適切な量のバッファー、余分洗剤、およびタンパク質を0.5ミリリットルのチューブに混ぜます。迅速にリポソームを添加し、すぐに5秒間渦を加えて混合物を均質化する。反応を摂氏4度で1時間インキュベートします。このインキュベーション中に、0.2グラムのポリスチレン吸着剤ビーズを計量し、マイクロ遠心チューブに移します。チューブに1ミリリットルのメタノールを加え、1分間混ぜてビーズを脱気します。次いで、21ゲージ以上の針でメタノールを吸引する。ビーズの洗浄を開始するには、それらに水を追加します。ビーズを水と5分間混ぜ、水を吸い込みます。この水洗プロセスを4回繰り返します。この後、水を加えて、ポリスチレン吸着ビーズスラリーを1ミリリットルの体積に持ち込み、最終濃度は1ミリリットルあたり0.2グラムです。テキストプロトコルで概説されているように、各サンプルのすべての洗剤を吸着するために必要なポリスチレン吸着剤ビーズの量を計算します。ピペットチップを切ってビーズスラリーを回収します。計算されたビーズスラリーの量を0.5ミリリットルチューブに移し、水を吸引します。ビーズを含むチューブにサンプルを加え、1時間摂氏4度でヌテーターでインキュベートします。新しいビーズを含む新鮮なチューブにサンプルを転送し、古いビーズを残すことを確認します。同じ条件を使用して再度インキュベートする。このビーズの移入とインキュベートを2回繰り返します。この後、新鮮なビーズを含む新しいチューブにサンプルを移し、摂氏4度で一晩をヌートしてインキュベートします。翌日、ビーズと遠心分離機から16,000回gと摂氏4度で10分間サンプルを取り出し、不溶性タンパク質凝集体をペレット化します。上清を回収し、テキストプロトコルに概説されているように、液体シンチレーション計数によって最終的な脂質濃度を決定する。まず、ドナーとアクセプタープロテオリポソームをグリセロール、β-メルカプトエタノール、EDTA、塩化マグネシウムを含むA100のそれぞれ0.15ミリモルの濃度に持って来てください。蛍光読み取りに適した平らな96ウェルプレート内のウェルに各反応を移し、三重およびノーGTP陰性対照を含む少なくとも4つの反応を準備することを確認する。プレートを摂氏37度の予熱プレートリーダーに入れなさい。NBD蛍光を毎分5分間測定します。次いで、5ミリモルGTPを加え、融合を誘導する。以前と同じ励起と放出を使用して、1時間毎分NBD蛍光を測定します。その後、2.5%の5マイクロリットルを添加し、2.5%-ドデシルβ-D-マルトシドをウェルに加えてプロテオリポソームを溶解し、同じ励起と発光を使用して1分毎に最大蛍光を測定します。本研究では、組換えショウジョウバエアトラスチンを精製し、予め形成されたリポソームに再構成する。アブラスチン再構成の効率は、イオヘキソール不連続勾配における浮遊再構成されたプロテオリポソームによって決定される。上、中央、下の勾配レイヤーのサンプルは、SDS-PAGEとクマシー染色によって収穫され、分析されます。デンシトメトリーによるゲルの定量化は、極めて小さな損失で再構成の非常に高い効率を示し、全タンパク質の96%が最上層に浮遊するプロテオリポソームとして見つかっています。タンパク質の1%未満は再構成されず、中間層に見られ、3%だけが再構成されていないか、または凝集し、底層に沈沈入されます。再構成後のアプラスチンの向きはトロンビン切断アッセイにより定量される。サンプルはSDS-PAGEとクマシー染色で分析され、デンシトメトリーで定量されます。再構成されたタンパク質のほとんどは切断され、プロテアーゼから保護されているのはわずか7%です。キネティクスとアプラスチン媒介プロテオリポソーム融合の程度は、脂質混合アッセイによって分析される。ゼロタイムポイントでGTPとの融合を誘発する前に5分間のインキュベーションが行われます。1時間後、n-ドデシルβ-D-マルトシドを添加してプロテオリポソームを可溶化し、最大蛍光共鳴伝達放出を得た。ランにおける融合の最大値は、最大蛍光の11%であることが分かる。脂質はクロロホルムに溶解する。脂質混合を準備するときは、蒸発を避けるために、化学フードと氷の上で、迅速にこれを行うことを確認してください。顕微鏡法によりアプラスチンプロテオリポソームを解析し、膜アンカーがリポソームの形状や大きさに及ぼす影響を可視化することが可能です。この方法は、他の膜固定タンパク質とモデル脂質二重層でどのように振る舞うかを研究するために拡張されました。このプロトコルは、脂質の混合物を定量化するために滴定脂質を使用します。放射性物質を扱う際には、必ず必要な予防措置を講じてください。

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Research

JoVE Journal

Biochemistry

生物化学

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インビトロ 巨大単層小胞内のアクチン細胞骨格の再構成

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脂質混合アッセイ用リポソームへの組換えショウジョウバエアラストシンの洗剤支援再構成

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