A Murine Cell Line Based Model of Chronic CDK9 Inhibition to Study Widespread Non-Genetic Transcriptional Elongation Defects (TE<sup>deff</sup>) in Cancers

Vishnu Modur; Navneet Singh; Belal Muhammad

doi:10.3791/59910

癌における広範な非遺伝的転写伸長欠損(TE)を研究する慢性CDK9阻害のマウス細胞株ベースモデル

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Genetics

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A Murine Cell Line Based Model of Chronic CDK9 Inhibition to Study Widespread Non-Genetic Transcriptional Elongation Defects (TE^deff) in Cancers

癌における広範な非遺伝的転写伸長欠損(TE)を研究する慢性CDK9阻害のマウス細胞株ベースモデル

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10:49 min

September 26, 2019

DOI: 10.3791/59910-v

Vishnu Modur¹, Navneet Singh¹, Belal Muhammad¹

¹Division of Experimental Hematology and Cancer Biology, Cancer and Blood Diseases Institute,Cincinnati Children's Hospital Medical Center (CCHMC)

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

このプロトコルは、非遺伝的欠陥転写伸びのインビトロマウス癌モデルを詳述する。ここで、CDK9の慢性阻害は、全癌型の約20%に存在する臨床的に過剰なTE^{間違いなく}現象を模倣し、研究するために、炎症反応遺伝子に沿ったRNA Pol IIの生産的な伸びを抑制するために使用される。

TEdeffがんが免疫療法に対する重要な障害であることを考えると、当社の薬理学的モデルは、このような癌で観察される広範な転写およびエピジェネティック欠陥を適切に模倣し、これらの非遺伝的異常を研究して新しい洞察を得たり、既存の薬物の新しい用途を見つけたり、そのような癌に対する新しい戦略を見つけることができるので、有利なツールです。これは、がんの転写伸長欠損を研究するための容易で一般化可能なモデルであり、インビトロとインビボの両方で腫瘍免疫相互作用を研究することを可能にする。この方法は、ヒト癌株にも適用することができる。

T47DとCAL51で短期間テストを行い、同様のTEdeffのような特性を生み出しました。ここで説明するプロトコルは、慢性CDK9阻害によるTEdeff様特徴の生成に重要な既知の変数を最小限に抑えるための基本的なフレームワークを提供する。しかし, 他のマウスラインのフラボピリドールの正確な亜死量を最適化するために注意する必要があります。.

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