Dual DNA Rulers to Study the Mechanism of Ribosome Translocation with Single-Nucleotide Resolution

Heng Yin; Shoujun Xu; Yuhong Wang

doi:10.3791/59918

単一ヌクレオチド分解能を持つリボソーム転移のメカニズムを研究するデュアルDNA定規

JoVE Journal
Biochemistry

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Dual DNA Rulers to Study the Mechanism of Ribosome Translocation with Single-Nucleotide Resolution

単一ヌクレオチド分解能を持つリボソーム転移のメカニズムを研究するデュアルDNA定規

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10:27 min

July 8, 2019

DOI: 10.3791/59918-v

Heng Yin¹, Shoujun Xu¹, Yuhong Wang²

¹Department of Chemistry,University of Houston, ²Department of Biology and Biochemistry,University of Houston

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

デュアルDNA定規アッセイは、形成されたDNA-mRNA二重鎖の解離力に依存するリボソーム転位時のmRNA位置を決定するために開発される。単一ヌクレオチド分解能とmRNAの両端に到達する能力を備え、リボソーム転位およびプローブ他の核酸変位に関する機械的洞察を提供できる。

二重DNA定規アッセイは、リボソーム転座の機械学的洞察を提供し、他の核酸変位を探査することができる。当社の二重DNA定規アッセイは、現在のところ、単一ヌクレオチド分解能を有するリボソーム複合体中のmRNAの入口側と出口側の両方を客観的に探査できる唯一の方法です。同様の方法は、DNA結合強度および化学療法薬の選択性を測定するためにも適用される。

この方法の視覚的なデモンストレーションは、私たちの技術の利点を直感的に示し、他の研究者がより多くのアプリケーションにそれを開発するのを助ける良い機会です。まず、4ミリメートル×3ミリメートル×2ミリメートルの寸法で中心に立方体を掘削することにより、スチレンストリップでプラスチックサンプルをうまく作ります。次に、エポキシを使用して、長さ約5ミリメートルのビオチンコーティングガラスを底面に接着する。

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