トランスクリプトーム解析を用いた無秩序発がん性転写因子の構造機能関係のマッピング
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2020年6月27日
DOI :10.3791/61564-v
2020年6月27日
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Iftekhar A. Showpnil1,2 , Kyle R. Miller1 , Cenny Taslim1 , Kathleen I. Pishas1 , Stephen L. Lessnick1,3 , Emily R. Theisen1,4
1Center for Childhood Cancer and Blood Diseases, Abigail Wexner Research Institute at Nationwide Children's Hospital, 2Molecular, Cellular, and Developmental Biology Program, The Ohio State University, 3Division of Pediatric Hematology/Oncology/Blood & Marrow Transplant, The Ohio State University, 4Department of Pediatrics, The Ohio State University
本質的に障害が発生したドメインは、発癌性融合転写因子機能にとって重要である。これらのタンパク質を治療的に標的にするためには、これらのドメインで採用される調節機構のより詳細な理解が必要である。ここでは、Ewing肉腫における本質的に無秩序なEWSドメインの重要な構造的特徴をマッピングするために、トランスクリプトミクスを使用する。
Chapters in this video
0:04
Introduction
0:55
In Vitro Construct Panel Setup
2:07
Cell Collection
2:47
Construct Expression Validation and Correlative Phenotypic Assay Setup
3:50
Alignment and Transcript Counting Pipeline
5:32
Differential Expression
7:40
Results: Representative Disordered Oncogenic Transcription Factor Structure-Function Relationship Mapping
9:31
Conclusion
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