Name: 細胞拡散時の細胞エッジダイナミクスの定量的解析 (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2021-05-22T15:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 54 s
Description: 学ぶ細胞拡散時のエッジダイナミクス定量的解析法。マウス胎児線維芽細胞を用いたライブイメージングとPythonベースの自動解析ツールで、ラメリポディア突出の分子調節因子を大規模スクリーニングできます。

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この研究は、コノート基金の新調査官賞(S.P.、カナダイノベーション財団、NSERCディスカバリー補助金プログラム)(RGPIN-2015-05114とRGPIN-2020-05881)、マンチェスター大学とトロント大学共同研究基金、トロント大学XSeedプログラムによって支援されました。

<ol><li>Mullins, R. D., Heuser, J. A., Pollard, T. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+interaction+of+Arp2%2F3+complex+with+actin%3A+Nucleation%2C+high+affinity+pointed+end+capping%2C+and+formation+of+branching+networks+of+filaments%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences%22%5BJournal%5D)">The interaction of Arp2/3 complex with actin: Nucleation, high affinity pointed end capping, and formation of branching networks of filaments.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 95 (11), 6181-6186 (1998).</li>
<li>Yang, C., Czech, L., Gerboth, S., Kojima, S., Scita, G., Svitkina, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Novel+Roles+of+Formin+mDia2+in+Lamellipodia+and+Filopodia+Formation+in+Motile+Cells%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biology%22%5BJournal%5D)">Novel Roles of Formin mDia2 in Lamellipodia and Filopodia Formation in Motile Cells.</a> PLoS Biology. 5 (11), 317(2007).</li>
<li>Mogilner, A., Oster, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+motility+driven+by+actin+polymerization%5BTitle%5D)+AND+%22Biophysical+Journal%22%5BJournal%5D)">Cell motility driven by actin polymerization.</a> Biophysical Journal. 71 (6), 3030-3045 (1996).</li>
<li>Mogilner, A., Oster, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Force+Generation+by+Actin+Polymerization+II%3A+The+Elastic+Ratchet+and+Tethered+Filaments%5BTitle%5D)+AND+%22Biophysical+Journal%22%5BJournal%5D)">Force Generation by Actin Polymerization II: The Elastic Ratchet and Tethered Filaments.</a> Biophysical Journal. 84 (3), 1591-1605 (2003).</li>
<li>Pollard, T. D., Borisy, G. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cellular+Motility+Driven+by+Assembly+and+Disassembly+of+Actin+Filaments%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Cellular Motility Driven by Assembly and Disassembly of Actin Filaments.</a> Cell. 112 (4), 453-465 (2003).</li>
<li>Wu, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Arp2%2F3+is+critical+for+lamellipodia+and+response+to+extracellular+matrix+cues+but+is+dispensable+for+chemotaxis%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Arp2/3 is critical for lamellipodia and response to extracellular matrix cues but is dispensable for chemotaxis.</a> Cell. 148 (5), 973-987 (2012).</li>
<li>Steffen, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rac+function+is+crucial+for+cell+migration+but+is+not+required+for+spreading+and+focal+adhesion+formation%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+cell+science%22%5BJournal%5D)">Rac function is crucial for cell migration but is not required for spreading and focal adhesion formation.</a> Journal of cell science. 126, Pt 20 4572-4588 (2013).</li>
<li>Gupton, S. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+migration+without+a+lamellipodium%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Cell migration without a lamellipodium.</a> The Journal of Cell Biology. 168 (4), 619-631 (2005).</li>
<li>Dimchev, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Induced+Arp2%2F3+Complex+Depletion+Increases+FMNL2%2F3+Formin+Expression+and+Filopodia+Formation%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Cell+and+Developmental+Biology%22%5BJournal%5D)">Induced Arp2/3 Complex Depletion Increases FMNL2/3 Formin Expression and Filopodia Formation.</a> Frontiers in Cell and Developmental Biology. 9, 634708(2021).</li>
<li>Leithner, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diversified+actin+protrusions+promote+environmental+exploration+but+are+dispensable+for+locomotion+of+leukocytes%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+cell+biology%22%5BJournal%5D)">Diversified actin protrusions promote environmental exploration but are dispensable for locomotion of leukocytes.</a> Nature cell biology. 18 (11), 1253-1259 (2016).</li>
<li>Giannone, G., Dubin-Thaler, B. J., Döbereiner, H. -G., Kieffer, N., Bresnick, A. R., Sheetz, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Periodic+Lamellipodial+Contractions+Correlate+with+Rearward+Actin+Waves%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Periodic Lamellipodial Contractions Correlate with Rearward Actin Waves.</a> Cell. 116 (3), 431-443 (2004).</li>
<li>Dubin-Thaler, B. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantification+of+Cell+Edge+Velocities+and+Traction+Forces+Reveals+Distinct+Motility+Modules+during+Cell+Spreading%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+ONE%22%5BJournal%5D)">Quantification of Cell Edge Velocities and Traction Forces Reveals Distinct Motility Modules during Cell Spreading.</a> PLoS ONE. 3 (11), 3735(2008).</li>
<li>Suraneni, P., Rubinstein, B., Unruh, J. R., Durnin, M., Hanein, D., Li, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Arp2%2F3+complex+is+required+for+lamellipodia+extension+and+directional+fibroblast+cell+migration%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+cell+biology%22%5BJournal%5D)">The Arp2/3 complex is required for lamellipodia extension and directional fibroblast cell migration.</a> The Journal of cell biology. 197 (2), 239-251 (2012).</li>
<li>Wang, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Deconvolution+of+subcellular+protrusion+heterogeneity+and+the+underlying+actin+regulator+dynamics+from+live+cell+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Communications%22%5BJournal%5D)">Deconvolution of subcellular protrusion heterogeneity and the underlying actin regulator dynamics from live cell imaging.</a> Nature Communications. 9 (1), 1688(2018).</li>
<li>Dimchev, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lamellipodin+tunes+cell+migration+by+stabilizing+protrusions+and+promoting+adhesion+formation%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+cell+science%22%5BJournal%5D)">Lamellipodin tunes cell migration by stabilizing protrusions and promoting adhesion formation.</a> Journal of cell science. 133 (7), 239020(2020).</li>
<li>Burnette, D. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+role+for+actin+arcs+in+the+leading-edge+advance+of+migrating+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+cell+biology%22%5BJournal%5D)">A role for actin arcs in the leading-edge advance of migrating cells.</a> Nature cell biology. 13 (4), 371-381 (2011).</li>
<li>Yamada, K. M., Kennedy, D. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dualistic+nature+of+adhesive+protein+function%3A+fibronectin+and+its+biologically+active+peptide+fragments+can+autoinhibit+fibronectin+function%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Dualistic nature of adhesive protein function: fibronectin and its biologically active peptide fragments can autoinhibit fibronectin function.</a> The Journal of Cell Biology. 99 (1), 29-36 (1984).</li>
<li>Cai, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nonmuscle+Myosin+IIA-Dependent+Force+Inhibits+Cell+Spreading+and+Drives+F-Actin+Flow%5BTitle%5D)+AND+%22Biophysical+Journal%22%5BJournal%5D)">Nonmuscle Myosin IIA-Dependent Force Inhibits Cell Spreading and Drives F-Actin Flow.</a> Biophysical Journal. 91 (10), 3907-3920 (2006).</li>
<li>Humphries, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+adhesion+assays%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Cell adhesion assays.</a> Molecular Biotechnology. 18 (1), 57-61 (2001).</li>
<li>Cavalcanti-Adam, E. A., Volberg, T., Micoulet, A., Kessler, H., Geiger, B., Spatz, J. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+Spreading+and+Focal+Adhesion+Dynamics+Are+Regulated+by+Spacing+of+Integrin+Ligands%5BTitle%5D)+AND+%22Biophysical+Journal%22%5BJournal%5D)">Cell Spreading and Focal Adhesion Dynamics Are Regulated by Spacing of Integrin Ligands.</a> Biophysical Journal. 92 (8), 2964-2974 (2007).</li>
<li>Dubin-Thaler, B. J., Giannone, G., Döbereiner, H. -G., Sheetz, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanometer+Analysis+of+Cell+Spreading+on+Matrix-Coated+Surfaces+Reveals+Two+Distinct+Cell+States+and+STEPs%5BTitle%5D)+AND+%22Biophysical+Journal%22%5BJournal%5D)">Nanometer Analysis of Cell Spreading on Matrix-Coated Surfaces Reveals Two Distinct Cell States and STEPs.</a> Biophysical Journal. 86 (3), 1794-1806 (2004).</li>
<li>Gauthier, N. C., Fardin, M. A., Roca-Cusachs, P., Sheetz, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Temporary+increase+in+plasma+membrane+tension+coordinates+the+activation+of+exocytosis+and+contraction+during+cell+spreading%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences%22%5BJournal%5D)">Temporary increase in plasma membrane tension coordinates the activation of exocytosis and contraction during cell spreading.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 108 (35), 14467-14472 (2011).</li>
<li>Wolfenson, H., Iskratsch, T., Sheetz, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Early+Events+in+Cell+Spreading+as+a+Model+for+Quantitative+Analysis+of+Biomechanical+Events%5BTitle%5D)+AND+%22Biophysical+Journal%22%5BJournal%5D)">Early Events in Cell Spreading as a Model for Quantitative Analysis of Biomechanical Events.</a> Biophysical Journal. 107 (11), 2508-2514 (2014).</li>
<li>Guan, J. -L., Berrier, A. L., LaFlamme, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+Migration%2C+Developmental+Methods+and+Protocols%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+in+molecular+biology%22%5BJournal%5D)">Cell Migration, Developmental Methods and Protocols.</a> Methods in molecular biology. 294, Clifton, N.J. 55-68 (2004).</li>
<li>Raucher, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Phosphatidylinositol+4%2C5-Bisphosphate+Functions+as+a+Second+Messenger+that+Regulates+Cytoskeleton-Plasma+Membrane+Adhesion%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Phosphatidylinositol 4,5-Bisphosphate Functions as a Second Messenger that Regulates Cytoskeleton-Plasma Membrane Adhesion.</a> Cell. 100 (2), 221-228 (2000).</li>
<li>Machacek, M., Danuser, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Morphodynamic+Profiling+of+Protrusion+Phenotypes%5BTitle%5D)+AND+%22Biophysical+Journal%22%5BJournal%5D)">Morphodynamic Profiling of Protrusion Phenotypes.</a> Biophysical Journal. 90 (4), 1439-1452 (2006).</li>
<li>Zack, G. W., Rogers, W. E., Latt, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Automatic+measurement+of+sister+chromatid+exchange+frequency%5BTitle%5D)+AND+%22The+journal+of+histochemistry+and+cytochemistry+official+journal+of+the+Histochemistry+Society%22%5BJournal%5D)">Automatic measurement of sister chromatid exchange frequency.</a> The journal of histochemistry and cytochemistry official journal of the Histochemistry Society. 25 (7), 741-753 (1977).</li>
<li>Bardsley, W. G., Aplin, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Kinetic+analysis+of+cell+spreading.+I.+Theory+and+modelling+of+curves%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+cell+science%22%5BJournal%5D)">Kinetic analysis of cell spreading. I. Theory and modelling of curves.</a> Journal of cell science. 61, 365-373 (1983).</li>
</ol>

著者らは開示するものは何もない。

記載された細胞拡散アッセイは、形態変化(例えば、細胞サイズおよび形状)および細胞エッジの動き(すなわち、突起速度および引き込み頻度)の連続的追跡を可能にする。これは、ほとんどの細胞拡散プロトコル19、24において欠けている特徴である。一般的に使用されるエンドポイント細胞拡散アッセイは細胞拡散速度の決定を可能にするが、これらのアッセイは細胞エッジの動きの時間的ダイナミクスを解決することができない。時間情報の欠如は、ラメリポジア突起リトラクションサイクルの変化を検出し、定量化する能力を制限します。
当社の画像処理および解析ソフトウェアは、細胞セグメンテーションからデータ定量化まで、広がる細胞の合理化された分析を行います。細胞拡散の手動画像分析は、通常、しきい値の偏った選択または自動セグメンテーションアルゴリズムを適用することを含みます。したがって、当社のソフトウェアは、突起ダイナミクスと形態記述子を定量化することに加えて、自動化された...

ラメリポジア性突起は、移動細胞の前部に形成される顕著な細胞骨格構造である。ラメリポディアでは、Arp2/3複合体およびフォルミンの助けを借りてアクチンを重合すると、血漿膜1,2に対して押し出される急速に成長する分岐アクチンメッシュワークが作成される。アクチンメッシュワークによって生じる押し出し力は、細胞を1、3、4、5に物理的に推進する。ラメリポジア突起に不可欠なArp2/3複合体またはシグナル伝達経路の破壊の枯渇は、しばしば細胞の移動を損なう6,7。 また、ラメリポディア欠損細胞の移動も報告されているが、8,9、細胞遊離におけるラメリポディアの重要性は、この突起構造の枯渇が、細胞が複雑な生物学的微小環境6,10を移動する能力を妨げるとして明らかである。
細胞の移動におけるラメリポディアの調節を理解する大きな障害は、ラメリポアル突起動態、サイズ、および形状11、12、13、14における自然変動である。さらに、最近の研究では、ラメリポディアは、変動、周期的、および加速する突起14,15を含む複雑な突起行動を示すことが実証されている。細胞6,16を移動させる非常に可変的なラメリポディアと比較して、細胞の広がりの間に形成されるラメリポディアはより均一である12。細胞の広がりと移動の突起活性は、分岐アクチンネットワーク、収縮アクトミオシン束、およびインテグリンベースの細胞マトリックス接着を含む同一の高分子集合体によって駆動されるため、細胞の広がりは、ラメリポディアダイナミクスの調節を調べるためのモデルとして広く用いられてきた。
細胞拡散は、懸濁液中の細胞がまずインテグリン系付着17、19、20を介して基質に付着し、次いでアクチンベースの突起部21、22、23を伸ばして広がる動的メカノケミカルプロセスである。 広がり段階の間、細胞体から発するラメリポディアは、引き込みや失速をほとんどあるいは全く伴わない、等熱帯かつ持続的に突出する。最も一般的に使用される細胞拡散プロトコルはエンドポイントアッセイであり、広がる細胞はめっき19、24の後のさまざまな時間に固定される。これらのアッセイは、迅速かつ簡単ではあるが、ラメリポディアの動的特徴の変化を検出するために診断力に制限されている。ラメリポディアダイナミクスを制御する分子機構を決定するために、Sheetzグループは、生きた広がり細胞の定量分析の使用を開拓し、細胞エッジ突起11、12、22の多くの基本的特性を明らかにした。これらの研究は、生細胞拡散アッセイが細胞生物学研究所のツールボックスにおける堅牢で強力な技術であることを実証した。それにもかかわらず、ライブセル拡散アッセイのための詳細なプロトコルとオープンソース計算ツールは、現在、細胞生物学コミュニティでは利用できません。この作業を行うために、当社のプロトコルは、ライブ拡散セルのイメージング手順を概説し、自動画像解析ツールを提供します。この方法を検証するために、実験的な治療法としてArp2/3阻害を用い、Arp2/3複合体の機能を阻害しても細胞拡散は阻止されず、細胞突起速度の大幅な低下、細胞端突起の安定性が著しく低下し、細胞縁部がギザギザに生じることを示した。これらのデータは、ライブセルイメージングと自動画像解析の組み合わせが、細胞エッジダイナミクスを分析し、ラメリポディアを調節する分子成分を同定するのに有用なツールであることを示しています。

<table><tbody><tr><td>0.05% トリプシン (0.05%)、0.53 mM EDTA</td><td>Wisent Bioproducts</td><td>325-042-CL</td><td></td></tr><tr><td>10.0 cm ペトリ皿、ポリスチレン、TC 処理済み、通気口付き</td><td>Starstedt</td><td>83.3902</td><td></td></tr><tr><td>15 mL 高透明度 PP 遠心分離管、円錐形底部、ドームシールスクリューキャップ付き、滅菌</td><td>ファルコン</td><td>352097</td><td></td></tr><tr><td>1ウェルチャムライド CMS 22 mm x 22 mm Coverslip</td><td>Quorum Technologies</td><td>CM-S22-1</td><td></td></tr><tr><td>35 mm TC処理イージーグリップスタイル細胞培養ディッシュ</td><td>ファルコン</td><td>353001</td><td></td></tr><tr><td>50 mL遠心チューブ、透明、プラグシール</td><td>ネスト</td><td>602002</td><td></td></tr><tr><td>6.0 cm細胞培養ディッシュ、細胞接着増加処理、滅菌VWR</td><td></td><td>10861-658</td><td></td></tr><tr><td>Arp2/3 Complex Inhibitor I、CK-666</td><td>Millipore Sigma</td><td>182515</td><td></td></tr><tr><td>カメラ、プライム95B-25MM</td><td>フォトメトリクス</td><td></td><td></td></tr><tr><td>ジメチルスルホキシド、滅菌</td><td>BioShop</td><td>DMS666</td><td></td></tr><tr><td>DMEM、1x、4.5 g/L グルコース、L-グルタミン、ピルビン酸ナトリウム、フェノールレッド</td><td>Wisent Bioproducts</td><td>319-005 CL</td><td></td></tr><tr><td>DMEM/F-12、HEPES、フェノールレッドなし</td><td>Gibco</td><td>11039021</td><td></td></tr><tr><td>D-PBS、1X</td><td>Wisent Bioproducts</td><td>311-425 CL</td><td></td></tr><tr><td>ウシ胎児血清</td><td>Wisent Bioproducts</td><td>080-110</td><td></td></tr><tr><td>Fiji Software</td><td>ImageJ</td><td></td><td></td></tr><tr><td>HEPES (1 M)</td><td>Gibco</td><td>15630080</td><td></td></tr><tr><td>Human Plasma Fibronectin Purified Protein 1 mg</td><td>Millipore Sigma</td><td>FC010</td><td></td></tr><tr><td>Immersion Oil</td><td>Cargille</td><td>16241</td><td></td></tr><tr><td>L-Glutamine Solution (200 mM)</td><td>Wisent Bioproducts</td><td>609-065-EL</td><td></td></tr><tr><td>MEM 非必須アミノ酸溶液 (100X)</td><td>Gibco</td><td>11140050</td><td></td></tr><tr><td>マイクロカバー メガネ 角型 No. 11/2 22 x 22 mm</td><td>VWR</td><td>CA48366-227-1</td><td></td></tr><tr><td>顕微鏡本体 Eclipse Ti2-E</td><td>ニコン</td><td></td><td></td></tr><tr><td>対物レンズ CFI プラン アポ ラムダ 60X オイル</td><td>ニコン</td><td>MRD01605</td><td></td></tr><tr><td>ペニシリン-ストレプトマイシン</td><td>シグマ</td><td>P4333</td><td></td></tr><tr><td>スピニングディスク、クレストライト V2</td>、<td>クレストオプティクス</td><td></td><td></td></tr>、<tr><td>スパイダー</td><td>、アナコンダ</td><td></td><td></td></tr><tr><td>、ステージ、トップインキュベーター</td>、<td>東海ヒット</td><td></td><td></td></tr><tr><td>、統計ソフトウェア、プリズム</td><td>、グラフパッド</td><td></td><td></td></tr><tr><td>、ピンセット、スタイル2</td>、<td>電子顕微鏡、科学</td><td>78326-42</td><td></td></tr></tbody></table>

細胞拡散時の細胞エッジダイナミクスの定量的解析

Quantitative Analysis of Cell Edge Dynamics during Cell Spreading

細胞の拡散は、媒体に懸濁した細胞が基板に付着し、丸みを帯びた薄い広がり形状に平坦化する動的なプロセスです。細胞基板の付着に続いて、細胞は細胞体から発せられる薄いラメリポディアのシートを形成する。ラメリポディアでは、球状アクチン(G-アクチン)モノマーが、細胞膜に押し出される緻密な糸状アクチン(F-アクチン)メッシュワークに重合し、細胞が広がるのに必要な機械的力を提供する。特に、ラメリポディアにおけるアクチン重合を制御する分子奏者は、細胞移動やエンドサイトーシスなどの他の多くの細胞プロセスに不可欠です。 
広がる細胞は、細胞周辺全体に広がる連続的なラメリポディアを形成し、持続的に外側に拡大するので、細胞拡散アッセイは、ラメリポジア性突起の運動を評価するための効率的なツールとなっています。細胞拡散アッセイのいくつかの技術的実装が開発されているが、データ分析のためのステップバイステップのプロトコルと計算ツールの両方を含むワークフローの詳細な説明は、現在欠けている。ここでは、細胞拡散アッセイの実験手順を説明し、広がる際の細胞エッジダイナミクスの定量的かつ公平な分析のためのオープンソースツールを提示する。薬理学的操作および/または遺伝子サイレンシング技術と組み合わせると、このプロトコルは、ラメリポアル突起を調節する分子プレーヤーの大規模なスクリーンに適しています。

上記のプロトコルは、細胞拡散の生細胞イメージングのための実験手順と、細胞拡散ダイナミクスの定量的分析のための計算ツールを説明する。計算ツールは、低スループットまたはハイスループット形式で使用して、セルのリーディングエッジでアクチン重合機械を調節する分子プレーヤーを識別することができます。
実験手順の概略図を図 1に示します。細胞拡散アッセイは、eGFP25でタグ付けされたAktタンパク質キナーゼのプレクストリン相同性(PH)ドメインを安定的に発現する不死化マウス胚線維芽細胞に対して行った。細胞をトリプシン-EDTAで剥離し、45分間懸濁液中で回復させた。回復工程の間、細胞は、フィブロネクチン被覆唇への回収された細胞の迅速かつ同期的な付着によって示されるように、細胞膜上のインテグリン受容体を補充した(図2)。回復期間を経ずに、細胞の広い分布を示した広い細胞サイズは、細胞拡散の発症に高いばらつきを示した(<strong ...

本プロトコルでは、生細胞顕微鏡に基づく細胞拡散アッセイの実験手順を提示する。蛍光標識細胞の偏りのないセグメンテーションや細胞拡散時のラメリポディアダイナミクスの定量分析のためのオープンソース計算ツールを提供します。

Cell spreading is a dynamic process in which a cell suspended in media attaches to a substrate and flattens itself from a rounded to a thin and spread-out ...

このビデオで説明するプロトコルは、広がる細胞の実物大イメージングに必要な実験手順と、偏りのない自動化された方法でダイナミクスを広げる細胞を定量化する計算ツールの使用を定義します。細胞拡散資産は、細胞の広がりの間に細胞エッジの動きと形態変化の連続的追跡を可能にし、これはほとんどの既存の細胞拡散アッセイに欠けている特徴である。また、このプロトコルは、自動コンピュータの処理と分析の使用を実装し、細胞の円形性、領域および突出の広がりの周期に関する情報を提供します。このような自動処理は、データ分析におけるバイアスを低減し、多数の細胞の細胞拡散ダイナミクスを分析する堅牢な方法を提供します。薬物治療や遺伝子科学および技術と組み合わせると、このプロトコルは、細胞の突起を調節する分子プレーヤーの大規模な速度に適しています。特定のプロトコルについて、使用される細胞は、移植性膜の蛍光タグ付けを可能にするPH-Akt-GFPを遺伝的にコードするマウス胚性線維芽細胞である。細胞拡散アッセイの開始前に、細胞の1皿を90%合流まで培養する。細胞が適切な合流度を達成したら、22 x 22ミリメートルのカバースリップを炎上し、それを35ミリメートルの細胞培養皿に入れます。PBSで希釈したフィブロネクチンでカバースリップを1ミリリットル当たり2.5マイクログラムの濃度にコーティングします。カバースリップで皿を37度のインキュベーターに1時間置きます。1時間後にフィブロネクチンを吸引し、ピペットチップでカバースリップに触れないようにする。カバースリップを2~3回軽くピペットで洗浄して、PBSで皿を洗います。細胞の播種の場合は、まず細胞の皿から細胞培養培地を吸引することから始める。その後、温かいPBSで皿を洗います。650マイクロリットルのトリプシンEDTAを皿に加え、皿を傾けて酵素を均等に分配します。トリプシンと一緒に皿をインキュベーターに1分間入れます。インキュベーションの後、まず遠心分離チューブに10ミリリットルの細胞培養培地を加える必要があります。次に、トリプシンを急いでクエンクするために、さらに10ミリリットルのメディアを皿に素早く加えます。カバースリップに播種される細胞を希釈するには、皿の内容物の1ミリリットルを遠心管にピペットします。チューブから、約500〜1,000マイクロリットルの希釈された細胞をカバースリップで皿にピペット。カバースリップが1ミリリットル当たり10%のコンフルエンシーまたは50,000細胞であることを確認し、必要に応じて希釈された細胞の体積を調整します。これらの細胞の目的は、画像取得時に焦点面を確立することにある。皿の中の残りの細胞で、治療ごとに1つの小皿に細胞の5分の1を通過させる。これらは、ダイナミクスを広げるために分析される細胞になります。パッセージ皿とカバースリップ皿をインキュベーターに8~24時間置きます。細胞拡散のためのArp2/3の重要性をテストするために、まず5ミリリットルの細胞培養培地をコントロールおよび処理遠心管に加えます。次に、フェノールレッドを欠いている20ミリリットルのdmemを2つの大きな遠心分離管のそれぞれに加えます。ピペットは、Arp2/3複合体の阻害剤である薬物CK-666またはDMSOなどの制御された治療法を小さくて大きな管に入れた。細胞の薬理学的治療を開始するには、一晩インキュベートしていた通路の皿を取り除きます。すべての食器から細胞培養培地を吸引し、温かいPBSで皿を洗います。CK-666または制御補充された媒体を含む小さな管を取り、各通路の皿に関連管の内容を追加します。各皿に適切な薬物処理のラベルを付け、1時間のインキュベーションの後、さらに1時間インキュベーターに戻し、各皿から薬物補充培地を吸引します。次に、残りのフェノールレッドメディアをすべて完全に除去するために、すべての料理に温かいPBSを加えます。230マイクロリットルのトリプシンEDTAを加え、皿を1分間インキュベーターに入れる。インキュベーターからトリプシン化された皿を取り除き、チューブBとして指定されたチューブにフェノールレッドを欠いている薬物補充されたdmemの5ミリリットルを追加し、トリプシンをクエンチするために関連する皿に同じ培地の別の5ミリリットルを追加します。皿からすべての細胞を取り外すために何度かメディアを上下にピペット。画像処理に適した細胞希釈 A.In を調製するために、既にチューブとして指定されている別のチューブに皿のすべての内容物を移し、チューブAからチューブBに1ミリリットルの細胞を移管B.各治療のための希釈ステップのすべてを繰り返します。細胞がトリプシン化から回復できるように、すべてのチューブをインキュベーターに45分間入れます。22 x 22ミリメートルのカバースリップを収容できるセル磁気チャンバのすべての部品が、使用前に完全に洗浄されていることを確認します。インキュベーターからカバースリップで皿を取り除きます。細胞培養培地を吸引し、カバースリップを温かいPBSで洗浄する。鉗子のペアを使用してカバースリップを取り外し、カバースリップを磁気チャンバの底板にそっと置きます。次に、シリコーンガスケットを取り出し、カバースリップの上に置きます。磁気チャンバの本体を底板に取り付けます。磁性チャンバに関連する処理に対応するフェノールレッドを欠いているdmemの1ミリリットルを加える。糸くずのないティッシュを取り、漏れを確認するために本体と底板の間にエンクロージャを慎重にダブる。磁気チャンバを完成させるために、透明カバーを本体に下げます。最後に、カバースリップの底部を水を吹き付けたティッシュで拭き取り、もう1つは70%エタノールを吹き付けます。共焦点顕微鏡のステージトップインキュベーターを37度に予熱します。目的の上に磁気チャンバーを置きます。拡散ダイナミクスを取得する前に、緑色蛍光チャネル内の既に偏光した細胞に焦点を当てます。これにより、カバースリップに取り付けると、広がる細胞が焦点を合わせられます。インキュベーターから取り外したチューブBから、磁気チャンバとピペット500マイクロリットルの透明カバーを取り外します。透明なカバーを上に戻します。細胞拡散解析に最適な細胞を同定するために、カバースリップにまだ付着していないか、または最も早い結合段階にある細胞を表す緑色のハローを検索します。画像を取得し、ファイルを保存します。セル拡散の画像取得を完了した後、スパイダーなどの互換性のあるPython IDEを実行して開始します。セル拡散ダイナミクスの計算解析では、関連するスクリプトパッケージに用意されているセル拡散GUIファイルを見つけて開きます。バックグラウンドで分析GUIパネルを開く実行ボタンを押します。GUI には、分析に必要なすべての設定が含まれています。セル領域と円形を解析するには、取得ファイルと必要な設定をセルスプレッド領域タブに入力します。セルタイプと画像取得パラメータに応じて調整する必要があります。実行を押すと、スクリプトは、すべての広がるセルのセルの円形度と面積対時間プロットを作成します。キモグラフデータの場合は、キモグラフジェネレータと解析タブを押します。この分析では、入力ファイルを単一セルのイメージ スタックをトリミングする必要があります。すべての設定を挿入し、実行を押すと、スクリプトは指定されたセルに複数のカイモグラフを作成します。左側にはDMSOおよびCK-666処理の代表細胞があり、提供されたスクリプトを使用して自動的にセグメント化されます。コントロール細胞によって示される等方性および高度に円形の形態とは対照的に、Arp2/3阻害細胞は円形性の低下を示す。さらに、自動生成されたカイモグラフは、突起のダイナミクスを理解するために重要な時間的解像度を提供します。コントロール細胞は、引き込みがほとんどない、または全く引き込みなしで持続的に突き出ています。これに対し、Arp2/3阻害は、拡散中の引き込みイベントの増加によって示されるように、突起の安定性を破壊する。このビデオでは、細胞を適切に播種し、薬理学的治療を行い、細胞拡散ダイナミクスの定量化に必要なイメージングおよび計算ツールを準備する方法を理解する必要があります。このプロトコルは細胞骨格蛍光イメージングおよびマイグレーションアッセイとさらに組み合わせて、細胞突起を支配する分子プレーヤーを同定することができる。あなたの実験を見て、幸運をありがとう。

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