Name: ガングリオシドの抽出、精製、プロファイリング (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2021-03-12T15:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 5 s
Description: 学ぶガングリオシドの抽出・精製・プロファイリング手法。神経細胞の細胞シグナル伝達と認識機構を研究するための有機溶媒抽出、逆相カラムクロマトグラフィー、薄層クロマトグラフィーによる定性・定量分析法を解説する。

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この研究は、米国国立衛生研究所(NIH)の共通基金(Common Fund for Glycoscience)助成金U01CA241953の支援を受けた。MJPは、ジョンズ・ホプキンス大学の化学-生物学界面プログラム(T32GM080189)の支援を受けた。

組織採取は、ジョンズ・ホプキンス動物ケア・使用委員会によって承認された条件下で行った。
1. 小規模ガングリオシド抽出と部分精製
警告: 揮発性および有毒な溶剤を使用する場合は、適切な換気を行ってください。全体にプラスチックを避けます;溶剤は、その後の分析を妨げる多くのプラスチックから化学成分を抽出します。ポリテトラフルオロエチレン(PTFE)は例外です。PTFEライニングされたクロージャーは、ガラス貯蔵バイアルをキャップするために使用する必要があります。
<ol><li>抽出<ol>
<li>1匹の新鮮または解凍したマウス脳(または矢状半脳、〜0.2〜0.5g)を計量し、氷のバケツで予冷したポッター・エルヴェヘムホモジナイザーに入れる。 注:以前に凍結した脳は、0〜4°Cで解凍した後に使用することができます。</li>
		<li>g組織湿重量の水あたり4.1mLを加え、10ストロークで均質化する。 注:正確な溶媒比は最適な抽出と分配の鍵であり、脳組織が80%水性であると仮定すると、目標はクロロホルム - メタノール - 水性(4:8:3)です。</li>
		<li>メタノールの組織湿重量gあたり13mLを加え、周囲温度(22°C)にシフトして混合する。 注: ソリューションが曇って表示されます。この工程でのメタノールの添加は、クロロホルムなしで、タンパク質沈殿を最適化する。その後のすべてのステップは周囲温度(22°C)です。</li>
		<li>PTFEライニングスクリューキャップを備えた厚肉ガラススクリューキャップチューブに周囲温度(22°C)で移し、十分に混合します。クロロホルムの組織湿重量gあたり6.5mLを加え、キャップし、十分に混合する。450 x g で15分間遠心分離する。透明な上清を新鮮なスクリューキャップ付きチューブに移し、体積を測定する、「回収抽出量」。</li>
	</ol>
</li>
	<li>分割<ol>
<li>透明な上清に0.173倍の「回収された抽出量」の水を加え、キャップ、渦を激しく加え、ステップ1.1.4で説明したように遠心分離する。 注:目標は、クロロホルム - メタノール - 水性を4:8:5.6の比率にすることです。混合物は白濁し、2つの相に分解される:上部水性リッチ相および下部クロロホルムリッチ相は〜4:1の比率で。完全な相分離のために60分間待つか、450 x gで遠心分離機で15分間待ちます。</li>
		<li>ガングリオシドを含む上部相を、PTFEライニングスクリューキャップを備えた新鮮なガラス管に移す。</li>
	</ol>
</li>
	<li>逆相カートリッジクロマトグラフィー<ol>
<li>5 mL のガラスシリンジを使用して、tC18 固相抽出カートリッジ (400 mg) を 3 mL のメタノールで洗浄し、次に 3 mL のクロロホルム - メタノール - 水 (2:43:55) で洗浄します。同じガラスシリンジを使用してステップ1.2.2の上相をtC18カートリッジにロードし、フロースルーを収集してカラムに再ロードして吸着を最適化します。</li>
		<li>ガラスシリンジを使用して、3 mLのクロロホルム - メタノール - 水(2:43:55)でカートリッジを洗浄し、次に3 mLのメタノール - 水(1:1)で洗浄する。</li>
		<li>ガングリオシドを3mLのメタノールで溶かし、新鮮なスクリューキャップ付きチューブに入れる。≤ 45°Cで窒素の穏やかな流れの下で蒸発乾固させる。 元の組織湿重量のgあたり1mLでメタノールに溶解する。</li>
	</ol>
</li>
</ol>2. 大規模ガングリオシドの抽出と精製
警告: 揮発性溶剤を扱う場合は、耐爆発性ブレンダーを使用してください。PTFE以外のプラスチックは使用しないでください。テトラヒドロフラン、クロロホルム、およびエチルエーテルは、有毒な揮発性有機化合物である。保護手袋と安全ゴーグルを備えたヒュームフードで作業してください。
<ol><li>抽出<ol>
<li>凍結したウシ脳を4°Cで数時間解凍する。髄膜と白質から灰白質を解剖する。 注:次の手順は、100〜20gの単離された脳灰白質±ついて説明されており、スケーラブルです。</li>
		<li>ブレンダーに脳灰白質100gを入れ、冷却した10mMリン酸カリウム緩衝液pH6.8の脳湿重量あたり1mLを加える。20秒間ローで均質化します。脳湿重量gあたり8mLのテトラヒドロフランを加え、10秒間低めに均質化する。ガラス遠沈ボトルにデカントし、周囲温度(22°C)で5,000 x g で15分間遠心分離します。</li>
		<li>上清を集め、その体積を測定し、ガラスの分液漏斗に移す。上清1 mLあたり0.3 mLのエチルエーテルを加える。激しく振ってから、30分間邪魔されずに座らせ、その間に2つの相、上部エーテル相と下部水相が分離する。ガングリオシドを含む下相をPTFEライニングキャップ付きのガラス瓶に集める。</li>
		<li>分液漏斗に残っている上部(エーテル)相に、元の上清のmLあたり0.1mLの水を加える(ステップ2.1.3)。激しく振って、相が分離するのを許し、より低い(水性の)相を集め、そして前のより低い相と結合する。結合された下部相を乾燥粉末に蒸発させ、重量を量る。</li>
	</ol></li>
	<li>鹸化<ol>
<li>密閉チューブに1g粉末あたり10mLの100mMNaOH水溶液を加える。混合し、37°Cで3時間インキュベートする。冷却し、100 mM HCl 水溶液を滴下して pH 4.5 に調整します。体積を測定し、ガラス分液ロートに移します。 注:シアル酸は酸不安定です。pH 4.5以下の酸性化を避けてください。</li>
		<li>水溶液容量に基づいて、2.67容量のメタノールを加え、穏やかに混合し、次いで1.33容量のクロロホルムを加えて、クロロホルム - メタノール - 水性の単相溶液(4:8:3)を作成する。よく混ぜる。</li>
		<li>元の水容量に基づいて、2.6容量の水を加えて、混合物をクロロホルム - メタノール - 水性に4:8:5.6の比率で持たせる。激しく振ってから、邪魔されずに座らせて、ガングリオシドを含む極上相と非極性下相の2つの相を分離する。PTFEライニングキャップ付きのガラス瓶に上相を集めます。 注:非シアリル化脂質は、レゾルシノールを使用して染色された薄層クロマトグラフィー(TLC)プレートには表示されませんが、 p-アニスアルデヒド染色を使用する場合に表示されます。このケン化の目的は、リン脂質などのOアセチル化化合物を除去することである。</li>
	</ol></li>
	<li>逆相クロマトグラフィー<ol>
<li>真空または圧力(&lt;1分各洗浄)を用いてカラムに以下の3つの溶媒のそれぞれ50mLを通すことによって、大規模(10g)tC18固相抽出カートリッジを予備洗浄する:メタノール、メタノール - 水(1:1)、次いでクロロホルム - メタノール - 水(2:43:55)。ステップ2.2.3から上相を真空または圧力でカラムにロードし、流れを集め、リロードし、流れを集めます。</li>
		<li>カラムを 30 mL のクロロホルム - メタノール - 水 (2:43:55)、次いで 30 mLのメタノール - 水 (1:1) で洗浄し、次いでガングリオシドを 50 mL のメタノールで溶出し、再度 10 mL のメタノールで洗浄し、各洗浄液と各溶出液を別々に回収する。TLC(下記)を用いて、ガングリオシドが流れから存在しないことを確認し、洗浄し、第1の溶出(50mLメタノール)で溶出した。溶出したガングリオシドを乾燥粉末に蒸発させ、秤量する。 注: tC18 クロマトグラフィーの目的は、ガングリオシドを極性の低い汚染物質と極性の高い汚染物質の両方から分離することです。ケン化後の混合脳ガングリオシド収量は、乾燥脳抽出物1gあたり~120 mgである(工程2.1.4)。TLCによるガングリオシドの出現は、フロースルーまたは洗浄において、固相抽出カラムが飽和していたことを示す。メタノール溶出後、カラムをさらにクロロホルム-メタノール(1:1)で溶出して極性の低い脂質を捕捉することができます。</li>
	</ol></li>
	<li>個々のガングリオシドのHPLC精製<ol>
<li>HPLCを調製する 溶媒A:アセトニトリル-5 mM リン酸ナトリウム水溶液緩衝液 pH 5.6 (83:17) および溶媒 B: アセトニトリル-20 mM リン酸ナトリウム緩衝液、pH 5.6 (1:1)。両方の溶媒を5分間脱気する。</li>
		<li>HPLCカラム(アミン結合(NH2)シリカ球体を充填した20 x 250 mmカラム、直径5 μm、細孔径100 Å)を100%溶媒Aで5 mL/minで20分間予備平衡化します。UV HPLCカラム廃液検出器を215nmに設定します。</li>
		<li>逆相溶出液からのガングリオシド粉末を5mg/mLの水に溶解する。0.5 mLのガングリオシド混合物をHPLCに注入し、溶媒勾配(表1)を5 mL/minで実行し、画分を採取する。ガングリオシドは、保持時間(主要な脳ガングリオシド)が25〜70分のA215 ピークとして現れます:GM1≈28分。GD1a≈38分。GD1b≈46分。GT1b≈65分。各ランの後に溶媒Aで20分間再平衡化する。薄層クロマトグラフィーで画分を分析します。</li>
	</ol></li>
</ol><table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody>
<tr>
<td>時間 (分)</td>
			<td>%A</td>
			<td>%B</td>
		</tr>
<tr>
<td>0</td>
			<td>100</td>
			<td>0</td>
		</tr>
<tr>
<td>7</td>
			<td>100</td>
			<td>0</td>
		</tr>
<tr>
<td>12</td>
			<td>63</td>
			<td>37</td>
		</tr>
<tr>
<td>82</td>
			<td>54</td>
			<td>46</td>
		</tr>
<tr>
<td>82.01</td>
			<td>0</td>
			<td>100</td>
		</tr>
<tr>
<td>92</td>
			<td>0</td>
			<td>100</td>
		</tr>
</tbody></table>表1:HPLCの溶媒勾配。
3. ガングリオシドの薄層クロマトグラフィー(TLC)分析
警告: クロロホルムは有毒な揮発性有機化合物です。保護手袋と安全ゴーグルを備えたヒュームフードで作業してください。
<ol><li>ランニング溶剤およびTLCプレート調製<ol>
<li>クロロホルム-メタノール-0.25%KCl水溶液(体積比60:35:8)のランニング溶媒を調製する。溶剤の深さが〜0.5cmになるように、ステンレス製のカバーを備えた10cm x 10cmのガラスTLCチャンバーに注ぎます。気流のない場所で&gt;10分間、カバーして平衡化させます。 メモ:TLCチャンバを気流から隔離するために、アクリル製の5面ボックスを構築または購入することができます(図2)。チャンバー内で溶剤飽和ろ紙を使用しないでください。</li>
		<li>10 cm x 10 cmまたは5 cm x 10 cmのシリカゲルコーティングされたガラス裏打ち高性能TLCプレートを、125°Cの乾燥オーブンに10分間置く。冷ます。鈍い#2鉛筆を使用して、プレートの底から1cm上、両側から少なくとも1cmの線に沿って、2mmの分離で5mmのスポッティングラインを描きます(図3)。マーキング中にシリカ層を乱さないでください。</li>
		<li>100μM GM1、GD1aおよびGD1bのそれぞれ50μMおよびGT1bの33μMを含むメタノール中に純粋なガングリオシドの標準混合物を調製する。 注:この混合物は、4つのガングリオシドのそれぞれについて、1μLあたり100pmolのガングリオシドシアル酸を含み、これはシアル酸依存性であるレゾルシノール染色によって強い比色シグナルを提供する量である。</li>
	</ol>
</li>
	<li>ガングリオシド解像度<ol>
<li>10 μL のハミルトン シリンジを斜めの針でメタノールで洗浄します。1 μL のメタノールをガラスシリンジに引き込んで針のデッドボリュームを満たし、次に 1 μL のサンプルまたは標準液を満たします。シリンジに&lt;1 μLの溶媒(メタノール)が残るまで、サンプルを5 mmのプレマークされたラインに均等に配置します。すべてのサンプルがスポットされた後、プレートを周囲温度(22°C)で乾燥させます。 注:サンプルローディングの間にシリンジをメタノールで洗浄してください。低に設定された非加熱送風機を使用して、乾燥を促進することができます。</li>
		<li>点在して乾燥させたプレートを、下端をランニング溶剤に浸した状態で予め平衡化したTLCチャンバーに入れ、空気流から保護して覆います(図2)。溶媒前部がプレートの上部から1cm以内に達するまで、走っている溶媒が毛細管現象によってプレートを上方に前進させる。プレートの端にある溶剤の前面を取り除き、鉛筆で印を付けます。溶媒が邪魔されずに、または穏やかな空気の流れの下で完全に蒸発するのを許してください。</li>
	</ol>
</li>
</ol><img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/62385/62385fig02.jpg"> 図2:ガングリオシドTLC機器とセットアップ ツイントラフチャンバーは、両側に0.5cm≈に充填され、ランニング溶剤で満たされます。プレートは、原点端がランニングバッファに浸漬された状態で片側に対して配置される。チャンバは、気流を避けるためにアクリルボックスで覆われています。パネルAは、プレート挿入前の側面図。溶媒レベルは、チャンバ底部から数mm上に見える。パネルB、開発中の正面図。溶剤前面は、プレートを上る道の約40%で見えます。 <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/62385/62385fig02large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。</a>
<ol start="3"><li>ガングリオシド染色 警告: 試薬の汚れは有毒です。塩酸は腐食性で有毒です。保護手袋と安全ゴーグルを備えたヒュームフードに試薬を準備してスプレーします。 メモ:プレートは、定性的な画像分析のために画像化することも、クランプを取り外してカバープレートを透明なテープで所定の位置に固定して保管することもできます。定量分析は、隣接するレーンにスポットされたガングリオシド標準物質のデンシトメトリーを測定することによって行うことができる。<ol>
<li>シアル酸に基づくガングリオシドの検出のためのレゾルシノールスプレー試薬を調製する。6gのレゾルシノールを100mLの水に溶解し、6%レゾルシノールストックとする。CuSO4 1 g を 100 mL の水に溶かし、1% のストックを作ります。64.7 mLの水に5 mLの6%レゾルシノールストック、0.31 mLの1% CuSO4 ストックを加え、濃縮HCl30 mLをゆっくりと加え、穏やかにかき混ぜる。4°Cで1ヶ月間保存してもよい。</li>
		<li>化学ヒュームフードに、分解されたガングリオシドを含むTLCプレートを、フードの壁を酸スプレーから保護するために、切り取られた段ボール箱に入れます。レゾルシノール噴霧試薬をガラスTLC噴霧器に入れ、加圧窒素源に取り付け、プレートを垂直方向および水平方向に斜めに軽く噴霧する。TLC吸着剤表面を均一に、しかし軽くスプレーする。</li>
		<li>直ちに同じ寸法の清潔な乾燥ガラス製カバープレートでプレートを覆い、バインダークリップでカバープレートを所定の位置に固定します(図3)。蓋付きプレートを125°Cで20分間加熱する。ガングリオシドは白い背景に対して濃い紫色に見えます。 メモ:スプレーが完了しても、プレートは濡れていないように見えるはずです。カバープレートは、シングルエッジカミソリの刃を使用して、以前に使用されたTLCプレートから吸着剤をこすり取ることによって製造することができる。 警告: シリカ粉末は肺に有毒です。マスクを使用し、密閉容器にシリカを廃棄してください。</li>
	</ol>
</li>
</ol><img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/62385/62385fig03.jpg"> 図3:分解された混合ガングリオシドのTLCプレート。 分解した混合ガングリオシ標準物質のTLCプレート(左レーン)および精製された混合ウシ灰白質ガングリオシド(右レーン)は、所定の位置にクリップしたガラスカバープレートでレゾルシノール染色および加熱を行った後である。標準的なガングリオシド(上から下)はGM3、GM2、GM1、GD3、GD1a、GD1b、GT1bおよびGQ1bである。冷却後、プレートを画像化したり、カバープレートを所定の位置にテープで固定したりして保管することができます。 <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/62385/62385fig03large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。</a>
<ol start="4"><li>ガングリオシドおよびリン脂質に対する一般的な脂質染色。 警告: 硫酸は有毒で腐食性があります。エタノールへの濃酸の添加は発熱性であり、ゆっくりと行わなければならない。ヒュームフードに保護手袋と安全ゴーグルで染色試薬を準備します。<ol>
<li>500mLのエタノールに15mLの濃硫酸をゆっくりと加えて p-アニスアルデヒド染色剤を調製する。30分間攪拌して、溶液を冷却してから先に進む。15mLの p-アニスアルデヒドを加え、穏やかにかき混ぜる。これは、室温(22°C)で6ヶ月まで保存することができる。</li>
		<li>化学ヒュームフードに、分解されたガングリオシド(起源の端が下がっているTLCプレート)を 、p-アニスアルデヒド染色を含むビーカーに浸します。ランニングフロントに2秒≥沈めます。汚れからTLCを取り除き、排水します。ホットプレート上のTLCプレートを低温で加熱して現像する。 注:脂質は紫色の背景に対して暗く表示されます。染色液は、繰り返し使用するために回収してもよい。</li>
	</ol>
</li>
</ol>

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<li>DeMarco, M. L., Woods, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Atomic-resolution+conformational+analysis+of+the+GM3+ganglioside+in+a+lipid+bilayer+and+its+implications+for+ganglioside-protein+recognition+at+membrane+surfaces%5BTitle%5D)+AND+%22Glycobiology%22%5BJournal%5D)">Atomic-resolution conformational analysis of the GM3 ganglioside in a lipid bilayer and its implications for ganglioside-protein recognition at membrane surfaces.</a> Glycobiology. 19 (4), 344-355 (2009).</li>
<li>Schnaar, R. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gangliosides+of+the+vertebrate+nervous+system%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Molecular+Biology%22%5BJournal%5D)">Gangliosides of the vertebrate nervous system.</a> Journal of Molecular Biology. 428, 3325-3336 (2016).</li>
<li>Klenk, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((%C3%9Cber+die+Ganglioside%2C+eine+neue+Gruppe+von+zuckerhaltigen+Gehirnlipoiden+%5BAbout+gangliosides%2C+a+new+group+of+sugar-containing+brain+lipids%5D%5BTitle%5D)+AND+%22Hoppe-Seyler%27s+Zeitschrift+f%C3%BCr+Physiologische+Chemie%22%5BJournal%5D)">Über die Ganglioside, eine neue Gruppe von zuckerhaltigen Gehirnlipoiden [About gangliosides, a new group of sugar-containing brain lipids].</a> Hoppe-Seyler's Zeitschrift für Physiologische Chemie. 273, 76-86 (1942).</li>
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<li>Lopez, P. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mice+lacking+sialyltransferase+ST3Gal-II+develop+late-onset+obesity+and+insulin+resistance%5BTitle%5D)+AND+%22Glycobiology%22%5BJournal%5D)">Mice lacking sialyltransferase ST3Gal-II develop late-onset obesity and insulin resistance.</a> Glycobiology. 27 (2), 129-139 (2017).</li>
</ol>

著者らは競合する利害関係を主張していない。

ここで報告された小規模および大規模のガングリオシドの抽出および単離の方法は、独自のものではなく、優れた結果を提供する多くの異なる溶媒抽出および精製アプローチがあります12。FredmanとSvennerholm13からの脳からの小規模精製のためにここで報告された方法は、回復を最適化することが示され、私たちの研究室で長年にわたって堅牢で簡単であることが証明されています。TLCおよびMSに適した単離および精製は、無傷の組織から単離されたガングリオシドまで、数時間で容易に完了することができる。MSは、天然の精製ガングリオシドに対して、ネガティブモードで、またはポジティブモードでのパーメチル化後に行うことができる(図7、例えば、Sturgill et al.9参照)。 収量は、ほ≈んどの哺乳類の新鮮な脳組織1gあたり1μmolのガングリオシド(≈2μmolのガングリオシド結合シアル酸)であり、非常に一貫している。Tettamaniらによって導入...

ガングリオシドは、1つ以上のシアル酸残基を有するスフィンゴ糖脂質1として定義される。それらは主に細胞表面で発現し、その疎水性セラミド脂質部分は原形質膜の外小葉に埋め込まれ、親水性グリカンは細胞外空間に広がっています2。脊椎動物の細胞や組織に広く分布していますが、脊椎動物の脳3に特に豊富に存在しており、そこで最初に発見され命名されました4。
ガングリオシドグリカンの構造はさまざまで、その命名法の基礎となっている(図1)。ガングリオシドグリカンは、シアル酸の異なる数および分布を有する中性糖コアからなる。最小のガングリオシドであるGM4は、2つの糖(ガラクトースに結合したシアル酸)のみを有する5。より大きな天然に存在するガングリオシドは、単一の中性コア上に1ダース以上の総糖6 または最大7つのシアル酸を含むことができる7。それらのセラミド脂質部分も変化し、異なるスフィンゴシン長および様々な脂肪酸アミドを有する。脊椎動物の脳では、4つのガングリオシド種、GM1、GD1a、GD1b、およびGT1bが優勢である。ガングリオシド発現は、発生的に調節され、組織特異的であり、かつ細胞型特異的である。
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/62385/62385fig01.jpg"> 図1:主要な脳ガングリオシドおよびその生合成前駆体。 構造は、グリカン11のシンボル命名法を用いて示されている。 <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/62385/62385fig01large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。</a>
ガングリオシドは、自身の膜にタンパク質を関与させ調節することによって(シス調節)、または他の細胞上の細菌毒素およびレクチンを含む細胞外環境におけるグリカン結合タンパク質を関与させること(トランス認識)によって分子レベルで機能する3。ガングリオシドの調節タンパク質への特異的結合および/または他の分子との脂質ラフトへの自己会合は、神経系の構造および機能、癌の進行、代謝、炎症、神経細胞タンパク質障害、および感染症に影響を与える細胞挙動の変化をもたらす8。それらの多様な細胞の役割のために、それらの単離および分析のための方法は、生理学的および病理学的プロセスの調節に関する強化された洞察を提供することができる。ここでは、迅速な小規模抽出および分析のための検証された方法、および脳からのガングリオシドの分取スケール単離が提供される。他の組織への適用のための機会と課題が議論される。

<table><tbody><tr><td>ウシの脳、剥がされた</td><td>PelFreez</td><td>57105-1</td><td></td></tr><tr><td>Ganglioside標準</td><td>Matreya</td><td>GM1、1061;GD1a、1062;GD1b、1501;GT1b、1063</td><td></td></tr><tr><td>PTFEライニングキャップ付きガラス瓶</td><td>フィッシャーサイエンティフィック</td><td>02-911-739</td><td></td></tr><tr><td>ガラス遠心分離瓶</td><td>フィッシャーサイエンティフィック</td><td>05-586B</td><td></td></tr><tr><td>ガラス培養チューブ、16 x 125 mm</td><td>VWR</td><td>60825-430</td><td>HPLCフラクションを収集</td></tr><tr><td>ガラスセパリー漏斗(2 L)</td><td>パイレックス</td><td>6400-2L</td><td></td></tr><tr><td>注射器-ハミルトン1750気密性500 & マイクロ;l</td><td>ハミルトン</td><td>81265</td><td></td></tr><tr><td>p-アニスアルデヒド、98%</td><td>シグマ-アルドリッチ</td><td>&nbsp;A88107</td><td></td></tr><tr><td>Potter-Elvhjem ホモジナイザー</td><td>フィッシャー サイエンティフィ</td>ック <td>08-414-14A</td><td>適切なボリューム オプションを選択</td></tr><tr><td>Reprosil 100 NH2 10&micro;m 5x4mm ガードコラム</td><td>Analytics-Shop</td><td>AAVRS1N-100540-5</td><td></td></tr><tr><td>Reprospher 100 NH2, 5 &mu;m, 250 mm x 20 mm HPLC カラム</td><td>分析-Shop</td><td>カスタムパック</td><td>他のサイズも利用可能</td></tr><tr><td>Resorcinol</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>30752-1</td><td></td></tr><tr><td>ロータリーエバポレーター</td><td>Buchi</td><td>R-300</td><td></td></tr><tr><td>Model 7725 インジェクター用サンプルループ (5 ml)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>57632</td><td></td></tr><tr><td>Sep-Pak tC18 Cartidges Vac 35 cc (10 g)</td><td>Waters</td><td>WAT043350</td><td></td></tr><tr><td>Sep-Pak tC18 Plus ショートカートリッジ、400 mg</td><td>Waters</td><td>WAT036810</td><td></td></tr><tr><td>スポッティングシリンジ - Hamilton 701N 10 &micro;l</td><td>ハミルトン</td><td>80300</td><td></td></tr><tr><td>厚肉直径 13 mm 試験管 PFTE ライニング キャップ付き</td><td>フィッシャー サイエンティフィック</td><td>14-933A</td><td></td></tr><tr><td>ねじ込み式 2 ml バイアル PFTE ライニング キャップ付き</td><td>フィッシャー サイエンティフィ</td>ック <td>14-955-323</td><td>ガングリオシド保存</td></tr><tr><td>用 TLC プレート、HPTLC シリカゲル 60 F254 マルチフォーマット</td><td>フィッシャー サイエンティフィ</td>ック <td>M1056350001</td><td>蛍光含浸 (F254) は吸着剤を安定させます表面</td></tr><tr><td>TLC試薬噴霧器</td><td>フィッシャーサイエンティフィック</td><td>05-723-26A</td><td></td></tr><tr><td>TLCランニングチャンバー 10 x 10 cmプレート用</td><td>Camag</td><td>22.5155</td><td></td></tr><tr><td>Waring 1リットルステンレススティール 耐爆ブレンダー</td><td>Waring</td><td>E8520</td><td></td></tr></tbody></table>

ガングリオシドの抽出、精製、プロファイリング

Ganglioside Extraction, Purification and Profiling

ガングリオシドは、1つ以上のシアル酸残基を含むスフィンゴ糖脂質である。それらはすべての脊椎動物の細胞および組織に見られるが、脳に特に豊富に存在する。主に細胞の原形質膜の外側小葉に発現し、横方向の会合を介して細胞表面タンパク質の活性を調節し、細胞間相互作用における受容体として作用し、病原体および毒素の標的である。ヒトにおけるガングリオシド生合成の遺伝的調節不全は、重度の先天性神経系障害をもたらす。ガングリオシドの両親媒性の性質上、ガングリオシドの抽出、精製、および分析には、発見以来80年間に多くの研究者によって最適化された技術が必要です。ここでは、数時間で完了できる組織および細胞からの主要なガングリオシドの抽出、精製、および予備的な定性的および定量的分析のためのベンチレベルの方法について説明する。我々はまた、脳からの主要なガングリオシド種のより大きなスケールの単離および精製のための方法を記述する。一緒に、これらの方法は、生理活性分子のこのクラスへの分析的および分取スケールアクセスを提供します。

セクション1(小規模)に記載された方法は、主要な脳ガングリオシドの定性的および定量的決定に十分な量および純度でガングリオシドを提供する。マウス脳からの回収率は、記載されたように調製した場合、脳湿重量gあたり〜1μmolガングリオシド(1nmol/μL)である。セクション3を用いた1 μL(1 nmol)のTLC分解能は、レゾルシノール検出のための十分な材料を提供し、 図4に野生型および遺伝子改変マウスについて示されているように、主要な脳ガングリオシドをすべて解決する。セクション1を用いて調製された混合ガングリオシドは他の主要脂質を含まないが、ガングリオシドは 、図5に示すように質量分析(MS)測定に十分な純度であり、天然精製ガングリオシドとして陰性モードまたはペルメチル化後に陽性モード9。セクション1はリン脂質を除去するためのアルカリ加水分解を回避するため、 O-アセチル化シアル酸などのアルカリ感受性の天然修飾を保持します(GT1b-OAc、 <stro...

ガングリオシドは、シアル酸を含むスフィンゴ糖脂質であり、脳内に特に豊富に存在する。それらの両親媒性の性質は、最適な回収と正確な分析を確実にするために有機/水性抽出および精製技術を必要とする。この記事では、分析および分取スケールのガングリオシドの抽出、精製、および薄層クロマトグラフィー分析の概要を提供します。

Gangliosides are glycosphingolipids that contain one or more sialic acid residues. They are found on all vertebrate cells and tissues but are especially ...

ガングリオシドは、すべての脊椎動物の細胞表面に発現しており、神経細胞に特に豊富に存在する。それらは細胞シグナル伝達および細胞 - 細胞認識を調節する。このプロトコルは、ガングリオシドの単離および分析を導入する。この技術は、精製を合理化しながら、大小のスケールでガングリオシド収率を最大化するために選択された。また、ガングリオシド分析を比較的迅速に行う方法も説明します。脂質、特にガングリオシドのような極性脂質に関する研究は、タンパク質や核酸を扱うのとは異なるツールや技術を必要とします。このビデオでは、これらの分子を操作する方法に慣れ親しんでいます。クロロホルムやテトラヒドロフランなどの溶媒は一般的なプラスチックを溶解するため、これらの手順では、テフロン(登録商標)ライニングキャップ、ガラスピペット、ガラス、ステンレス製マイクロシリンジ、テフロン(登録商標)ガラスホモジナイザーを備えたガラス瓶およびバイアルを使用する。これを怠ると、製品中のプラスチックポリマーが分析を妨げる可能性があります。まず、組織湿重量1グラムあたり4.1ミリリットルの水を加え、10ストロークで均質化します。組織1グラムあたり13ミリリットルのメタノールを加える。それを摂氏22度の周囲温度に移し、混合する。PTFEライニングスクリューキャップを備えた厚肉のガラス製スクリューキャップ付きチューブに組織を移し、徹底的に混合します。組織1グラムあたり6.5ミリリットルのクロロホルムを加え、蓋をし、徹底的に混ぜる。450倍gで15分間遠心分離する。次いで、透明な上清を新鮮なスクリューキャップ付きチューブに移し、その体積を回収抽出量として測定する。分配のために、回収された抽出量の水の0.173倍を透明な上清に加える。それからそれをキャップします。渦が勢いよく。450倍gで15分間遠心分離する。ガングリオシドを含む上部相を、PTFEライニングスクリューキャップを備えた新鮮なガラス管に移す。逆相カートリッジクロマトグラフィーを行うには、5 ミリリットルのガラスシリンジを使用して、tC18 固相抽出カートリッジを 3 ミリリットルのメタノールで洗浄します。次に、クロロホルム - メタノール - 水を2対43〜55の割合で3ミリリットル加える。前のステップの上相を同じガラスシリンジを通してtC18カートリッジにロードします。フロースルーを収集し、カラムにリロードして吸着を最適化します。カートリッジを3ミリリットルのクロロホルム - メタノール - 水で洗浄し、次に3ミリリットルのメタノール - 水で洗浄する。ガングリオシドを3ミリリットルのメタノールで溶かし、新鮮なスクリューキャップ付きチューブに入れます。摂氏45度以下の温度で窒素の穏やかな流れの下で蒸発乾固させる。元の組織湿重量のグラムあたり1ミリリットルでメタノールに溶解する。100グラムの脳灰白質をブレンダーに入れ、pH6.8の冷却された10ミリモルのリン酸カリウム緩衝液の脳湿重量あたり1ミリリットルを加える。その後、ローで20秒間均質化します。脳湿重量1グラムあたり8ミリリットルのテトラヒドロフランを加え、10秒間ローで均質化する。ガラス製遠心分離機ボトルにデカントし、5,000倍gで15分間遠心分離した。上清を集め、その体積を測定し、ガラスの分液漏斗に移します。上清1ミリリットル当たり0.3ミリリットルのエチルエーテルを加える。激しく振る。その後、30分間邪魔されずに座らせ、その間に2つの相、上部エーテル相および下部水相が分離する。ガングリオシドを含む下相をPTFEライニングキャップ付きのガラス瓶に集める。分液ロートに残っている上部エーテル相に、前のステップからの元の上清1ミリリットルあたり0.1ミリリットルの水を加える。激しく振る。フェーズの分離を許可します。次に、下部水相を収集し、以前に収集した下部相と組み合わせる。結合された下部相を乾燥粉末に蒸発させ、それを計量する。逆相クロマトグラフィーを行うには、真空または圧力を使用してカラムに 50 ミリリットルの溶媒を通し、洗浄につき 1 分未満で 50 ミリリットルの溶媒を通過させることにより、大規模な tC18 固相抽出カートリッジを予備洗浄します。ケン化後の相分離から上相を真空または圧力でカラムにロードします。次に、フロースルーを収集してリロードし、後続の解析のためにフロースルーを再度収集します。カラムをクロロホルム - メタノール - 水の各30ミリリットルで洗浄し、続いてメタノール - 水で洗浄する。次いで、ガングリオシドを50ミリリットルのメタノールで溶出し、次いで再び10ミリリットルのメタノールで溶出する。各洗浄液と溶出液を別々に集める。薄層クロマトグラフィー(TLC)を使用して、ガングリオシドがフロースルーおよび洗浄から存在せず、メタノールの最初の溶出で溶出することを確認します。溶出したガングリオシドを乾燥粉末に蒸発させ、それらを計量する。TLCを実行するには、溶剤の深さが0.5センチメートルになるように、ステンレス製のカバーを備えた10×10センチメートルのガラスTLCチャンバーに、ランニング溶剤を注ぎます。チャンバーを覆い、約10分間平衡化させます。10マイクロリットルのハミルトンシリンジをメタノールを使用して斜めの針で洗う。1マイクロリットルのメタノールをガラスシリンジに引き込んで針のデッドボリュームを満たし、次に1マイクロリットルのサンプルまたは標準液を満たします。シリンジにメタノール溶媒が1マイクロリットル未満になるまで、サンプルを5ミリメートルの所定のマークされた線に均等に配置します。すべてのサンプルが見つかったら、プレートを摂氏 22 度で乾燥させます。点着および乾燥プレートを、底端をランニング溶媒に浸漬した予め平衡化されたTLCチャンバー上に置く。溶媒前部がプレートの上部から1センチメートル以内に達するまで、実行中の溶媒が毛細管現象によってプレートを上方に前進させる。プレートの端にある溶剤の前面を取り除き、鉛筆で印を付けます。溶媒が邪魔されずに、または穏やかな空気の流れの下で完全に蒸発するのを許してください。化学ヒュームフードに、分解されたガングリオシドの起源を持つTLCプレートを逆さまにして、フードの壁を酸スプレーから保護するために、切り取られた段ボール箱に入れます。レゾルシノールスプレー試薬をガラスTLC噴霧器に入れる。加圧窒素源に取り付け、プレートを縦横方向に斜めに軽くスプレーします。すぐに同じ寸法の清潔で乾燥したガラスカバープレートでプレートを覆い、バインダークリップでカバープレートを所定の位置に固定します。蓋をしたプレートを摂氏125度で20分間加熱します。ガングリオシドは白い背景に対して濃い紫色に見えます。脂質染色を行うには、分解されたガングリオシド起源のTLCプレートをアニスアルデヒド染色を含むビーカーに浸漬する。ランニングフロントに2秒強沈めます。それからそれを排水するのを許しなさい。ホットプレート上のTLCプレートを低温で加熱し、現像する。このプロトコルは、定性的および定量的測定に十分な量および純度でガングリオシドを提供する。1マイクロリットルのTLC分解能は、レゾルシノール検出のための十分な材料を提供し、野生型および遺伝子改変マウスの主要な脳ガングリオシドをすべて解決する。調製された混合ガングリオシドは他の主要な脂質を含まないが、それらは、陰性モードでの天然精製ガングリオシドとして、または陽性様式におけるプレメチル化後のいずれかの質量分析決定に十分な純度を有する。大規模な精製には、抽出、ケン化、およびHPLC分解能が含まれ、生物学的実験およびさらなる化学的および酵素的修飾に適した精製された主要な脳ガングリオシドを提供する。例示的なHPLCプロファイルおよびその後のTLC分析が示されている。アルカリ処理、またはケン化は、汚染リン脂質を加水分解および除去するために必要であるが、O-アセチル化シアル酸などのガングリオシドの天然修飾も加水分解するものであり、これはいくつかの文脈において重要であり得る。抽出、溶媒分配、TLC 分解能の正確な溶媒比は、回収率、純度、および分析を強化するために不可欠です。がんから代謝、脳機能まで、ガングリオシドは生理学的調節剤および治療標的である。ガングリオシドの単離、精製、および分析は、生物医学的発見および治療開発の礎石です。

ganglioside-extraction-purification-and-profiling

Research

JoVE Journal

Biochemistry

生物化学

免疫臓器や細胞内のスフィンゴ糖脂質抗原の発現プロファイルを洞察するための特異的かつ高感度の方法が記載されている。この方法は、化学的に合成された基準と比較して、構造解析のためのスフィンゴ糖脂質分子の段階的な断片化を許可するイオントラップ質量分析法を活用しています。...

スフィンゴ糖脂質抗原の質量分析

O結合型糖鎖の多様性を包括的に探求するために、ペルメチル化および迅速な相分配法と組み合わせた新しいゲル内還元的β除去の手順を、SDS-PAGEによって分離され、その後の質量分析による糖鎖分析に適した糖タンパク質から直接放出されるO結合型糖鎖の分析に適用されます。...

質量分析法による総合的なO-結合およびスルホグライコミクスのための改良されたゲル内還元β脱離

血漿中のプロテオミクスとグライコミクスの精製、およびLC-MS/MS定量を組み合わせたハイスループットプロトコルが開発されました。N-結合型グリコシル化モチーフの脱アミド化解析は、脱グリコシル化部位に特異的でした。糖鎖ヒドラジドタグ法による標識では、フィルターを用いたN型糖鎖分離と個別性標準化を組み合わせることで、N型糖鎖の正確な定量が達成されました。...

定量的グライコミクスおよびプロテオミクス複合精製戦略

我々は、休止中のガングリオシドの膜発現と局在を決定するために顕微鏡で使用するための標準的な抗体染色プロトコルを記述し、ヒトナイーブCD4 + T細胞を活性化します。また、説明&lt;追加の低入力RNAキットを必要としない40,000個の細胞を用いたリアルタイムPCR実験です。...

CD4の調製<sup&gt; +</sup&gt;顕微鏡によるGD3およびGD2ガングリオシドの膜発現の分析のためのT細胞

本稿では、ECMタンパク質組成物の（1）分析、グリコシル化部位の（2）識別、およびグリカン形態の（3）組成の特徴付けを可能にするMS分析のために心臓血管組織サンプルを調製する方法を記載しています。この方法は、他の組織におけるECMの研究に、軽微な修正を適用することができます。...

細胞外マトリックスのグライコ：質量分析法を用いて無傷の糖ペプチドの分析のための方法

酸化アルミニウム コーティング ガラスに添付ファイルのN型糖鎖の合成にモジュラー アプローチは、糖鎖マイクロ アレイを開発し、広く中和抗体、HIV のプロファイリングの使用が示されている (ACG スライド)...

N型糖鎖アレイ開発および HIV 抗体のための化学酵素合成プロファイリング

免疫グロブリンG(IgG)N-グリカンは、親水性相互作用クロマトグラフィーUPLCを用いて特徴付けられている。 また、IgG...

超高性能液体クロマトグラフィーによる免疫グロブリンG N-グリカン分析

このプロトコールでは、がんの糖鎖生物学をより深く理解するために必要な複雑な腫瘍微小環境における不均一なグリコプロテオームに関する包括的な洞察を提供する統合オミクス技術である、グライコミクスガイド下グライコプロテオミクス法について詳しく説明します。...

グライコミクスガイド下グライコプロテオミクスは、複雑な腫瘍微小環境におけるグリコプロテオームの包括的なプロファイリングを容易にします 

マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間型質量分析法を用いたペルメチル化ムチン O型糖鎖のプロファイリング

ミクログリア細胞からの精製ミトコンドリアの調製、 N型糖鎖放出のためのミトコンドリアタンパク質の単離、および赤外マトリックス支援レーザー脱離エレクトロスプレーイオン化と高分解能精密質量分析装置質量分析法を組み合わせた細胞内ミトコンドリア糖鎖の迅速な検出のためのプロトコールが開発されました。...

糖鎖分析のためのミクログリアからのミトコンドリア調製

学ぶガングリオシドの抽出・精製・プロファイリング手法。神経細胞の細胞シグナル伝達と認識機構を研究するための有機溶媒抽出、逆相カラムクロマトグラフィー、薄層クロマトグラフィーによる定性・定量分析法を解説する。

ガングリオシドの抽出、精製、プロファイリング

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