Name: 超高速フォースクランプ分光法によるミオシンのメカノ酵素的性質の解剖 (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2021-07-01T13:30:00.000+00:00
Duration: 9 min 38 s
Description: 学ぶ超高速フォースクランプ分光法によるミオシンの機械化学的性質の解析。レーザートゥイーザーを用いた単一分子技術で、荷重下の分子モーター動態を高時間分解能で測定し、ミオシン-アクチン相互作用の力依存性を解明する。

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この研究は、Laserlab-Europeの助成金契約番号871124に基づく欧州連合のHorizon 2020研究およびイノベーションプログラム、イタリア大学研究省(FIRB「Futuro in Ricerca」2013グラント番号RBFR13V4M2)、およびエンテカッサディリスパルミオディフィレンツェによってサポートされました。A.V. Kashchukは、ヒューマンフロンティアサイエンスプログラムの学際的フェローシップLT008 / 2020-Cの支援を受けました。

<ol><li>Ashkin, A., Dziedzic, J. M., Bjorkholm, J. E., Chu, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Observation+of+a+single-beam+gradient+force+optical+trap+for+dielectric+particles%5BTitle%5D)+AND+%22Optical+Angular+Momentum%22%5BJournal%5D)">Observation of a single-beam gradient force optical trap for dielectric particles.</a> Optical Angular Momentum. 11 (5), 196-198 (2016).</li>
<li>Capitanio, M., Pavone, F. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interrogating+biology+with+force%3A+Single+molecule+high-resolution+measurements+with+optical+tweezers%5BTitle%5D)+AND+%22Biophysical+Journal%22%5BJournal%5D)">Interrogating biology with force: Single molecule high-resolution measurements with optical tweezers.</a> Biophysical Journal. 105 (6), 1293-1303 (2013).</li>
<li>Capitanio, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ultrafast+force-clamp+spectroscopy+of+single+molecules+reveals+load+dependence+of+myosin+working+stroke%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">Ultrafast force-clamp spectroscopy of single molecules reveals load dependence of myosin working stroke.</a> Nature Methods. 9 (10), 1013-1019 (2012).</li>
<li>Gardini, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dissecting+myosin-5B+mechanosensitivity+and+calcium+regulation+at+the+single+molecule+level%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Communications%22%5BJournal%5D)">Dissecting myosin-5B mechanosensitivity and calcium regulation at the single molecule level.</a> Nature Communications. 9 (1), (2018).</li>
<li>Woody, M. S., Winkelmann, D. A., Capitanio, M., Ostap, E. M., Goldman, Y. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single+molecule+mechanics+resolves+the+earliest+events+in+force+generation+by+cardiac+myosin%5BTitle%5D)+AND+%22eLife%22%5BJournal%5D)">Single molecule mechanics resolves the earliest events in force generation by cardiac myosin.</a> eLife. 8, 49266(2019).</li>
<li>Clemen, A. E. -M., Vilfan, M., Jaud, J., Zhang, J., Bä, M., Rief, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Force-dependent+stepping+kinetics+of+myosin-V%5BTitle%5D)+AND+%22Biophysical+Journal%22%5BJournal%5D)">Force-dependent stepping kinetics of myosin-V.</a> Biophysical Journal. 88, 4402-4410 (2005).</li>
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<li>Pyrpassopoulos, S., Shuman, H., Ostap, E. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Modulation+of+kinesin%27s+load-bearing+capacity+by+force+geometry+and+the+microtubule+track%5BTitle%5D)+AND+%22Biophysical+Journal%22%5BJournal%5D)">Modulation of kinesin's load-bearing capacity by force geometry and the microtubule track.</a> Biophysical Journal. 118 (1), 243-253 (2020).</li>
<li>Capitanio, M., Maggi, D., Vanzi, F., Pavone, F. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((FIONA+in+the+trap%3A+The+advantages+of+combining+optical+tweezers+and+fluorescence%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Optics+A%3A+Pure+and+Applied+Optics%22%5BJournal%5D)">FIONA in the trap: The advantages of combining optical tweezers and fluorescence.</a> Journal of Optics A: Pure and Applied Optics. 9 (8), 157(2007).</li>
<li>Capitanio, M., Cicchi, R., Pavone, F. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Position+control+and+optical+manipulation+for+nanotechnology+applications%5BTitle%5D)+AND+%22European+Physical+Journal+B%22%5BJournal%5D)">Position control and optical manipulation for nanotechnology applications.</a> European Physical Journal B. 46 (1), 1-8 (2005).</li>
<li>Capitanio, M. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aCapitanio%2C+M+%22Optical+Tweezers.+An+introduction+to+Single+Molecule+Biophysics%22">Optical Tweezers. An introduction to Single Molecule Biophysics</a>. , CRC Press. (2017).</li>
<li>Capitanio, M., Cicchi, R., Saverio Pavone, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Continuous+and+time-shared+multiple+optical+tweezers+for+the+study+of+single+motor+proteins%5BTitle%5D)+AND+%22Optics+and+Lasers+in+Engineering%22%5BJournal%5D)">Continuous and time-shared multiple optical tweezers for the study of single motor proteins.</a> Optics and Lasers in Engineering. 45 (4), 450-457 (2007).</li>
<li>Gardini, L., Tempestini, A., Pavone, F. S., Capitanio, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-speed+optical+tweezers+for+the+study+of+single+molecular+motors%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+in+Molecular+Biology%22%5BJournal%5D)">High-speed optical tweezers for the study of single molecular motors.</a> Methods in Molecular Biology. 1805, (2018).</li>
<li>Capitanio, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Calibration+of+optical+tweezers+with+differential+interference+contrast+signals%5BTitle%5D)+AND+%22Review+of+Scientific+Instruments%22%5BJournal%5D)">Calibration of optical tweezers with differential interference contrast signals.</a> Review of Scientific Instruments. 73 (4), 1687(2002).</li>
<li>Monico, C., Belcastro, G., Vanzi, F., Pavone, F. S., Capitanio, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Combining+single-molecule+manipulation+and+imaging+for+the+study+of+protein-DNA+interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Combining single-molecule manipulation and imaging for the study of protein-DNA interactions.</a> Journal of Visualized Experiments. (90), e51446(2014).</li>
<li>Greenberg, M. J., Lin, T., Goldman, Y. E., Shuman, H., Ostap, E. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Myosin+IC+generates+power+over+a+range+of+loads+via+a+new+tension-sensing+mechanism%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">Myosin IC generates power over a range of loads via a new tension-sensing mechanism.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109 (37), 2433-2440 (2012).</li>
<li>Gardini, L., Arbore, C., Capitanio, M., Pavone, F. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+protocol+for+single+molecule+imaging+and+tracking+of+processive+myosin+motors%5BTitle%5D)+AND+%22MethodsX%22%5BJournal%5D)">A protocol for single molecule imaging and tracking of processive myosin motors.</a> MethodsX. 6, 1854-1862 (2019).</li>
<li>Ramaiya, A., Roy, B., Bugiel, M., Schäffer, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Kinesin+rotates+unidirectionally+and+generates+torque+while+walking+on+microtubules%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">Kinesin rotates unidirectionally and generates torque while walking on microtubules.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 114 (41), 10894-10899 (2017).</li>
</ol>

著者は競合する利益を宣言しません。

3ビーズアッセイなどの単一分子技術は技術的に困難でスループットが低いですが、UFFCSはデータの高いS/N比により分子相互作用の検出を改善します。UFFCSは、モータータンパク質の負荷依存性の研究を可能にし、モーターがフィラメントに結合する際に非常に迅速に力を加えるという主な利点により、制御された力の下での力の生成および弱い結合状態における早期かつ非常に迅速な事象をプローブする。走行中ずっと力を一定に保ち、力の方向性を完全に制御してモーターの依存性を調査します。最後の点に関しては、ここで使用する3ビード形状は、フィラメント方向に沿って力を適用および測定するのに非常に効率的であり、横方向または垂直方向のコンポーネントからの寄与を最小限に抑えます。しかしながら、モータータンパク質が積極的に横方向または垂直方向の力、あるいはトルクさえも生成すると予想される場合、単一ビーズ形状などの他の構成がより適切である2、7、18。さらに、その空間的および時間的分解能のお...

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Dissecting Mechanoenzymatic Properties of Processive Myosins with Ultrafast Force-Clamp Spectroscopy

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Erratum: Dissecting Mechanoenzymatic Properties of Processive Myosins with Ultra Force-Clamp Spectroscopy

過去数十年にわたり、光ピンセットは、立体構造変化と酵素速度論の同時操作と測定の顕著な可能性により、単一分子レベルでタンパク質相互作用のメカノケミストリーを解明するための貴重なツールでした1,2。特に、細胞内の分子モーターが及ぼす力の範囲の力を適用および測定する能力と、サブナノメートルの構造変化を測定する能力により、光ピンセットは、モータータンパク質の化学力学的特性とその機械的制御を解明するためのユニークな単一分子ツールになりました。
超高速フォースクランプ分光法(UFFCS)は、3ビーズ形状の負荷下での分子モーターの高速速度論を研究するために開発された、ピンセットに基づく単一分子力分光法です(図1a)3,4。UFFCSは、モータータンパク質への力の加わるタイムラグを光ピンセットの物理的限界、すなわちシステムの機械的緩和時間まで短縮し、ミオシンの実行開始後(数十マイクロ秒)に迅速に力を加えることを可能にします3。この能力を利用して、高速骨格3および心臓5筋ミオシンの初期の機械的イベントを調査し、パワーストロークの負荷依存性、弱結合状態と強結合状態、および生化学的(Pi)および機械的(パワーストローク)イベントの順序を明らかにしました。
3ビード形状は通常、非加工モーターの研究に採用され、フォースクランプを備えた単一ビーズ形状は、ミオシンVa6などの加工型非従来型ミオシンの研究に一般的に使用されています。ただし、プロセシブミオシンに対しても3ビーズUFFCSアッセイを好む理由はいくつかあります。第一に、アクチン-ミオシン結合直後の荷重の迅速な適用により、非プロセスモーターと同様に力発生の初期事象の測定が可能になります。さらに、処理型モータの場合、モータの走行距離と走行時間を一定の力で正確に測定することもできます(図1b)。さらに、フォースフィードバックのレートが高いため、システムはミオシン作業ストロークなどの位置の急速な変化中に力を一定に保つことができ、それによってモーターステッピング中の一定の負荷を保証します。システムの高時間分解能により、サブms相互作用の検出が可能になり、ミオシンのアクチンへの弱い結合を調査する可能性が開かれます。最後に、アッセイ形状は、力がアクチンフィラメントに沿って加えられることを保証し、力の横方向および垂直方向の成分はごくわずかです。垂直方向の力成分がモータの動力学7,8の負荷依存性に大きく影響することが示されているので、この点は特に関連性がある。この手法を用いることで、加工ミオシン-5Bにさまざまな補助荷重と抵抗荷重を適用し、広範囲の力に対する処理能力の荷重依存性を直接測定することができました4。
図1aに示すように、このシステムでは、単一のアクチンフィラメントが、二重光ピンセット(「ダンベル」)の焦点に閉じ込められた2つのポリスチレンビーズの間に吊り下げられています。不均衡な正味力F = F1-F 2は、高速フィードバックシステムを介してフィラメントに課され、フィラメントは、正味の力が反対方向に反転するユーザー定義の反転点に到達するまで、一方向に等速で移動します。モータータンパク質がフィラメントと相互作用していないとき、ダンベルは単一のモータータンパク質が付着している台座ビーズにまたがる三角形の波状(図1b、下のパネル)で自由に前後に動きます。相互作用が確立されると、ダンベルによって運ばれる力はモータータンパク質に非常に急速に伝達され、モーターはミオシンがアクチンから分離するまで、相互作用時にフィードバックシステムによって加えられた力の強さと方向の下でステップすることによってフィラメントを移動させ始めます。トラップされたアクチンフィラメントの極性に依存するモーターのステッピングによって生成される変位であるため、負荷は、加えられた力の方向に応じて、補助的、つまりモーター変位と同じ方向に押す(図1b上のパネルを押す)、または抵抗性、つまりモーターの変位に対して反対方向に引っ張る(図1bの引っ張り)のいずれかになります。 上パネル)は、加えられた負荷の強度と方向性の両方によって運動処理能力の化学力学的調節を研究することを可能にする。
次のセクションでは、1)光学セットアップのセットアップ、光学トラップのアライメントとキャリブレーションの手順、2)サンプルチャンバー内のすべてのコンポーネントの準備とそれらのアセンブリ、3)測定手順、 4)ランレングス、ステップサイズ、モータータンパク質の速度などの重要な物理的パラメータを抽出するための代表的なデータとデータ分析。

<table><tbody><tr><td>&nbsp;脂肪族アミンラテックスビーズ</td><td>サーモフィ</td><td>ッシャーA37362</td><td>1.0-&mu;m 直径 2% (w/v)</td></tr><tr><td>アセトン</td><td>Sigma</td><td>32201</td><td></td></tr><tr><td>アクチン重合バッファー</td><td>Cytoskeleton</td><td>BSA02</td><td>10X</td></tr><tr><td>AOD (音響光学デフレクター)</td><td>AA Opto Electronic</td><td>DTS-XY 250</td><td>レーザービームデフレクター</td></tr><tr><td>ATP</td><td>Sigma</td><td>A7699</td><td></td></tr><tr><td>ビオチン化-BSA</td><td>ThermoFisher</td><td>29130</td><td></td></tr><tr><td>BSA</td><td>Sigma</td><td>B4287</td><td></td></tr><tr><td>ブタの脳由来カルモジュリン (CaM)</td><td>メルク ミリポア</td><td>208783</td><td></td></tr><tr><td>ウシの肝臓由来カタラーゼ</td><td>Sigma</td><td>C40</td><td></td></tr><tr><td>コンデンサー</td><td>オリンパス</td><td>OlympusU-AAC, Aplanat, Achromat</td><td>NA 1.4, 油浸</td></tr><tr><td>クレアチンリン酸 二ナトリウム塩 四水和物</td><td>Sigma</td><td>27920</td><td></td></tr><tr><td>クレアチン ホスホキナーゼウサギの筋肉</td><td>からシグマ</td><td>C3755</td><td></td></tr><tr><td>DDs AAオプ</td><td>ト電子</td><td>AA。DDSです。XX</td><td>2チャンネルデジタルシンセサイ</td></tr><tr><td>ザーDL-Dithiothreitol(DTT)/td></td><td>Sigma</td><td>43819</td><td></td></tr><tr><td>EGTA</td><td>Sigma</td><td>E4378</td><td></td></tr><tr><td>G-actinタンパク質</td><td>Cytoskeleton</td><td>AKL99</td><td></td></tr><tr><td>Glucose</td><td>Sigma</td><td>G7528</td><td></td></tr><tr><td>Aspergillus niger Sigmaからのグルコースオキシダーゼ</td><td></td><td>&nbsp;G7141</td><td></td></tr><tr><td>HaloTag スクシンイミジルエステル O2配位子</td><td>Promega</td><td>P1691</td><td></td></tr><tr><td>高真空シリコーングリース 重</td><td>メルク ミリポア</td><td>107921</td><td></td></tr><tr><td>KCl</td><td>Sigma</td><td>P9541</td><td></td></tr><tr><td>KH2PO4/K2HPO4</td><td>Sigma</td><td>P5379/ P8281</td><td></td></tr><tr><td>Labview</td><td>National Instruments</td><td>version 8.1</td><td>データ収集</td></tr><tr><td>LabviewFPGAモジュール</td><td>National Instruments</td><td>version 8.1</td><td>Fast Force-Clamp</td></tr><tr><td>Matlab</td><td>MathWorks</td><td>2016</td><td>Data analysis</td></tr><tr><td>MgCl2</td><td>Fluka</td><td>63020</td><td></td></tr><tr><td>Microscope Objective</td><td>Nikon</td><td>Plan-Apo 60X</td><td>NA 1.2, WD 0.2 mm, water imm.</td></tr><tr><td>MOPS</td><td>シグマ</td><td>M1254</td><td></td></tr><tr><td>ニトロセルロー</td>ス<td>シグマ</td><td>N8267</td><td>0.45細孔サイズ</td></tr><tr><td>酢酸ペンチル溶液</td><td>シグマ</td><td>46022</td><td></td></tr><tr><td>ピュアエタノール</td><td>&nbsp;Sigma</td><td>2860</td><td></td></tr><tr><td>QPDSs</td><td>UDT</td><td>DLS-20</td><td>D Position Detecto</td></tr><tr><td>ローダミン BSA</td><td>分子プローブ</td><td>A23016</td><td></td></tr><tr><td>ローダミン ファロイジン</td><td>&nbsp;シグマ</td><td>P1951</td><td></td></tr><tr><td>シリカビーズ</td><td>バンスラブ</td><td>SS04N</td><td>1.21 mm、10%固形分ア</td></tr><tr><td>ジ化ナトリウム</td><td>&nbsp;Sigma</td><td>S2002</td><td></td></tr><tr><td>ストレプトアビジンタンパク質</td><td>&nbsp;シグマ</td><td>189730</td><td></td></tr></tbody></table>

超高速フォースクランプ分光法によるミオシンのメカノ酵素的性質の解剖

Dissecting Mechanoenzymatic Properties of Processive Myosins with Ultrafast Force-Clamp Spectroscopy

超高速フォースクランプ分光法(UFFCS)は、レーザーピンセットに基づく単一分子技術であり、前例のない時間分解能で負荷がかかった状態での従来型および非従来型ミオシンの両方の化学力学の研究を可能にします。特に、アクチン-ミオシン結合形成直後に一定の力でミオシンモーターをプローブする可能性は、フォースフィードバックの高速レート(200kHz)とともに、UFFCSがミオシン作業ストロークなどの高速ダイナミクスの負荷依存性を研究するための貴重なツールであることを示しています。さらに、UFFCSは、プロセス的および非プロセス的なミオシン-アクチン相互作用が、加えられた力の強度と方向によってどのように影響を受けるかの研究を可能にします。
このプロトコルに従うことで、プロセスミオシン-5モーターやさまざまな非従来型ミオシンで超高速フォースクランプ実験を行うことが可能になります。いくつかの調整により、プロトコルは、キネシンやダイニンなどの他のクラスの処理モーターの研究にも簡単に拡張できます。プロトコルには、実験装置のセットアップからサンプル調製、校正手順、データ取得、分析まで、必要なすべてのステップが含まれています。

代表的なデータは、図 4 に示すように、時間の経過に伴う位置レコードで構成されます。位置レコードには、2種類の変位が表示されます。まず、ミオシンモーターがアクチンフィラメントと相互作用していないとき、トラップされたビーズは溶液の粘性抗力に対して等速で移動しており、三角波3でオペレーターが設定した振動範囲内で振動する線形変位を示しています(時間スケールが長いため、図4では見えません)。第二に、ミオシンモーターがフィラメントと相互作用すると、移動するフィラメントによって運ばれる力が非常に急速にタンパク質に伝達され、システム速度はゼロに低下し(図4の赤い線)、ステッピングイベントは実行の終わりまで一定の力の下で発生します。図5に示すように、フィードバックシステムによって力が正の方向から負の方向(またはその逆に)切り替えられ、ビ...

ここでは、処理ミオシン-5モーターで超高速フォースクランプ実験を行うための包括的なプロトコルを提示し、他のクラスのプロセスモーターの研究に簡単に拡張できます。プロトコルは、実験装置のセットアップからサンプル調製、データ収集、分析まで、必要なすべてのステップを詳述しています。

Ultrafast force-clamp spectroscopy (UFFCS) is a single molecule technique based on laser tweezers that allows the investigation of the chemomechanics of ...

超高速フォースクランプ分光法は、レーザーピンセットに基づく単一分子技術であり、最高の時間分解能で負荷がかかった状態でのミオシンモーターの化学力学を調べることを可能にします。この技術により、力の方向性を完全に制御しながら、モーター相互作用のすべての段階で力を一定に維持することにより、力の生成における非常に迅速なイベントを調査できます。適切な調整を行うことにより、このプロトコルは、キネシンやダイニンなどの他の種類の処理モーターに簡単に適用して、強制的に規制を明らかにすることができます。音響光学デフレクターの1セットをリニアトランスレータに取り付けた後、アイリスを取り、対物レンズの背面開口部サイズに合わせて絞りを調整します。対物レンズを、ねじ付き対物レンズハウジングを中心としたアイリスに置き換えます。圧電結晶によってブロックされたビームの部分がアイリスの後に見えるまでトランスレータをレーザービームに向かって動かし、ビームがアイリス開口部を完全に満たすまでトランスレータを少し後方に回します。酢酸ペンチル中でシリカビーズを調製するには、まず1.2ミクロンの10%固体シリカビーズ20マイクロリットルを1〜1.5ミリリットルのアセトンでボルテックスおよび30秒間の超音波処理で希釈する。超音波処理後、遠心分離によってビーズを収集し、2回目の洗浄のために1ミリリットルの新鮮なアセトンにビーズペレットを再懸濁する。2回目のアセトン洗浄後、同じ遠心分離条件下で1回の洗浄につき1ミリリットルの新鮮な酢酸ペンチルでビーズを3回洗浄し、ペレットを100マイクロリットルの1%ニトロセルロースおよび900マイクロリットルの酢酸ペンチルに再懸濁する。次に、純粋なエタノールに浸したラボティッシュを使用して、24 x 24ミリメートルのガラスカバーガラスを注意深く拭いてから、きれいなピンセットを使用してガラスをエタノールで直接すすぎ、カバーガラスを穏やかな窒素流下で乾燥させます。調製したシリカビーズストックを30秒間ボルテックスして超音波処理し、エタノール洗浄した24 x 60ミリメートルのカバーガラスを使用して、2マイクロリットルのシリカビーズ溶液を小さいカバーガラスの表面に塗りつけます。ビーズが乾いている間に、示されているように26 x 76ミリメートルのスライドをきれいにし、スライドの長い端にテープで留められた3ミリメートルの両面テープで2本の太さ60〜100ミクロンの線を配置します。清潔なピンセットを使用して、ビーズをスライドチャンバーの内側に向けてビーズコーティングされたカバーガラスをテープの上に置き、チャンバーに15ミリモルのリン酸バッファーと浮遊ポリスチレンビーズ溶液を満たします。次に、チャンバーをシリコングリースで密封します。明視野カメラのピクセル対ナノメートル比を較正するには、視野の中心から約5ミクロンのカバーガラス表面上のシリカビーズの最初の画像を取得します。ステージを移動してビードを視野の中心に向かって10ミクロン移動させ、2番目の画像を撮影します。ビーズの2つの位置間のピクセル距離を測定して、カメラのキャリブレーション定数を計算します。トラップ位置を較正するには、1つの浮遊粒子を1つのトラップにトラップし、音響光学偏向器を0.2メガヘルツステップで動かし、粒子の画像と各ステップの偏向器の対応する周波数を取得します。その後、同様にして第2トラップについてキャリブレーションを繰り返す。トラップのパワーと剛性を校正するには、各トラップに単一の粒子をトラップし、音響光学偏向器を使用して両方のトラップを0.2メガヘルツステップで変位させ、象限フォトダイオード検出器とそれに対応する音響光学偏向器の周波数で両方のトラップの粒子のブラウン運動を記録します。記録されたブラウン運動のパワースペクトルにローレンツ関数を当てはめて、キャリブレーション定数を取得します。測定用のサンプルを組み立てるには、カバーガラス表面にシリカビーズが付いた新しいチャンバーにビオチン化BSA1ミリリットルあたり1ミリグラムを追加します。5分後、チャンバーをABバッファーで洗浄し、ストレプトアビジン1ミリリットルあたり1ミリグラムをチャンバーに加えます。5分後、実証されたようにチャンバーを洗浄し、2マイクロモルのカルモジュリンを添加したM5Bバッファーに3ナノモルのビオチン化ミオシン-5B重メロミオシンを追加します。5分後、AB緩衝液中の2マイクロモルカルモジュリンを添加したビオチン化BSA1ミリリットル当たり1ミリグラムでチャンバーを3回洗浄し、最終洗浄後3分間待ちます。反応混合物を流し、シリコングリースでチャンバーを密閉します。サンプルを測定するには、チャンバーを顕微鏡ステージに置き、浮遊アルファアクチニンビーズに焦点が合うまで対物レンズを動かします。1つのトラップのスイッチを入れ、1つのビーズをトラップします。最初のトラップが占有されたら、トランスレータを動かしてトラップされたビードをカバーガラス表面の近くに配置して、複数のビーズをトラップしないようにし、2番目のトラップにビードをトラップします。サンプルを長距離トランスレータに通して、溶液内に少なくとも5ミクロンの長さのアクチンフィラメントを配置します。フィラメントが発見されたら、サンプルを移動して、トラップされたビードがフィラメントの一方の端に近づくようにします。フィラメントを取り付けたら、ビーズの距離をおおよそのフィラメント長に調整し、ステージを動かして、バインドされていないビード方向に流れを作ります。フィラメントは流れによって引き伸ばされ、最終的に2番目のビーズに結合します。結果として生じる複合体は呼ばれます ダンベル「アクチン-ミオシン接触を確立するには、2つのトラップを静かに分離し、フィラメントを約3ピコニュートンまでのプリテンションレベルに設定します。ダンベルの剛性を調べるには、1つの音響光学偏向器の周波数を変更し、その結果、位置信号を介して後続のビードにモーションが伝達されることを確認することにより、トラップを三角波で振動させます。ステージを動かしてダンベルを台座シリカビーズの近くに配置し、アクチンフィラメントがシリカビーズ表面に接触するようにダンベルの高さを調整します。この代表的な位置記録に見られるように、ミオシンモーターがアクチンフィラメントと相互作用していないとき、トラップされたビーズは溶液の粘性抗力に対して等速で移動する。ミオシンモーターがフィラメントと相互作用し始めると、移動するフィラメントによって運ばれる力が非常に急速にタンパク質に伝達され、システム速度はゼロに低下し、ステッピングイベントは実行の終わりまで一定の力の下で発生します。力はフィードバックシステムによって正の方向から負の方向に切り替わり、ビードがユーザーが設定した振動範囲の端に達すると力の方向が切り替わります。ミオシンがフィラメントを結合して正の方向に変位させると、ビーズを振動範囲の上端に向かって押します。これが補助力の下で起こると、ミオシンのランは振動エッジでの力方向反転によって中断され、ランの長さがダンベル振動の振幅に制限されます。最適な空間分解能と時間分解能を達成するには光学系の正確な位置合わせが必要であり、加えられた力の値を正確に決定するには正確なキャリブレーションが必要です。この技術は、DNA中の転写因子のスライディングおよびターゲット検索、ならびに微小管フィラメント上に誘導するメカノトランスダクションタンパク質間の動的相互作用の研究に適応されています。

dissecting-mechanoenzymatic-properties-processive-myosins-with

Research

JoVE Journal

Biology

生物学

これは、目的、操作、そして斬新な重力の分光計からの代表的な結果を示すステップバイステップガイドです。...

繊維状タンパク質をストレッチし、測定する新しい重力分光器の使用を実証

この記事では、高度に並列化可能な方法で単一分子レベルでのタンパク質分解酵素に作用する力の影響を研究するために磁気ピンセットの使用方法について説明します。...

磁気ピンセットを用いた多重化単分子フォースタンパク質分解測定

セルロソームは、セルロースを消化するために設計された多酵素複合体です。AFMベースのSMFSを使用して、セルローム関連タンパク質集合体の機械的特性とフォールディング配置を研究しました。セルロソームの組み立てに関与する個々の受容体-リガンド複合体の相互作用を研究するための、タンパク質の固定化、データ取得、およびデータ解析のための完全なワークフローを紹介します。...

AFMベース1分子力分光法によるセルロソームの受容体リガンド系の探索

詳細な手順と機械的性質および原子間力顕微鏡を用いた単一タンパク質分子のアンフォールディング経路を機械的に測定するための戦略について述べる。また選択と良い単一蛋白質分子の録音の正当化のための参照として代表的な結果を述べる.

原子間力顕微鏡を用いた単一タンパク質分子の力分光法

ここで提示されるプロトコルは、ナノニュートン分解能を有する線条筋筋筋線維の収縮特性を評価する。このプロトコルは、干渉法ベースの光学力プローブを用いたセットアップを採用しています。この設定は、高い信号対雑音比を持つデータを生成し、myofibrilsの収縮運動の評価を可能にします。...

骨格筋生検からミオフィブリルを分離し、ナノニュートン分解力トランスデューサーによる収縮機能を決定する

ここで提示されるミオシン5aを発現および精製する手順は、その特徴付け、アンサンブルおよび単分子の両方を用いて蛍光顕微鏡ベースのアッセイ、およびこれらの方法を非筋筋筋筋2bの特徴付けのためにどのように修飾することができるかである。...

インビトロ蛍光顕微鏡ベースの運動アッセイのミオシン特異的適応

光ピンセットを用いたアクチンフィラメント束中のミオシンアンサンブル機構の探索

アンサンブル力分光法(EFS)は、生物物理学およびバイオセンシング分野における生体分子構造のアンサンブルセットの機械的アンフォールディングおよびリアルタイムセンシングのための堅牢な技術です。...

せん断力によるアンサンブル力分光法

この研究では、制御された条件下でのアクトミオシンゲルの多孔弾性を研究するために 、in vitro...

細胞骨格のモデル系としての(ポロ)弾性収縮性アクトミオシンネットワークの機構

ここでは、力に敏感な生体分子を最大1.2kHzの速度でナノメカニカル測定を行う高速磁気ピンセットのセットアップについて説明します。モデル系としてDNAヘアピンやSNARE複合体への応用を紹介しますが、メカノバイオイベントに関与する他の分子にも応用できます。...

力に敏感な素子のナノメカニカル測定のための高速磁気ピンセット

このプロトコルでは、MultiBac Baculovirusシステムを使用してヒトミオシン-7aホロ酵素を組換えで生成する手順と、調整されたin vitroフィラメントグライディングアッセイを使用してその運動性を研究する手順について詳しく説明します。...

MultiBacシステムベースのヒトミオシン-7aの精製と生物物理学的特性評価

学ぶ超高速フォースクランプ分光法によるミオシンの機械化学的性質の解析。レーザートゥイーザーを用いた単一分子技術で、荷重下の分子モーター動態を高時間分解能で測定し、ミオシン-アクチン相互作用の力依存性を解明する。

超高速フォースクランプ分光法によるミオシンのメカノ酵素的性質の解剖

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