Name: オープンソースのラボロボットによるショットガンプロテオミクスサンプル処理 (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2021-10-28T14:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 12 s
Description: 学ぶ ショットガンプロテオミクスサンプル処理の自動化プロトコル。低コストの液体ハンドリングシステムとPythonスクリプトを用いて、質量分析前のタンパク質生化学処理のスループット向上と変動性低減を実現する方法です。

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著者には宣言する競合はありません。

プロトコル内の重要なステップ 最高のパフォーマンスを得るため、OT-2と互換性のあるOpentrons検証済みのラボウェア、モジュール、および消耗品を使用する必要があります。カスタムラボウェアは、Reference14でのOpentronsの指示に従って作成できます。OT-2デッキ、ピペット、ラボウェアを初めて使用する場合は必ず調整してください。また、ペプチドおよびタンパク質のクリーンアップのためのビーズを準備するために、SP3ビーズのメーカーのガイドラインに従うことは重要です。特に、ビーズとペプチド結合反応の間、結合反応におけるアセトニトリルの体積は≥95%である必要があり、ビーズ濃度は≥0.1 μg/μLである必要があります。ここでのペプチドクリーンアップスクリプトの最適化されたパラメータにより、アセトニトリル体積比は95%、ビーズ濃度は0.37 μg/μL、ペプチド濃度は14~37μg/mLの範囲です。ペプチド質量は、我々の経験から消化反応の100 μLで40〜100 μgと推定されます。SP3タンパク質のクリーンアップでは、5~10 μg~1...

質量分析ベースの散弾銃プロテオミクスは、生物学的サンプル中の多くのタンパク質の存在量を同時に測定する強力なツールです。バイオインフォマティクス解析を用いたプロテオミクス実験は、バイオマーカーを同定し、病理学的メカニズムを支える関連する生物学的複合体および経路を発見するために日常的に使用されています。高い分析物特異性と潜在的な定量精度により、ショットガンプロテオミクスは、抗体に頼ることなく臨床サンプル分析のための研究施設や診断ラボで採用される優れた可能性を秘めています1,2。
ショットガンプロテオミクス分析用のタンパク質サンプルを調製するには、通常、生体サンプルから抽出したタンパク質(細胞や組織)は、サンプルタンパク質濃度の測定、タンパク質還元、アルキル化、ペプチドへの酵素消化など、長いプロトコルを使用して処理する必要があります。さらに、洗剤を含む一般的な溶解バッファーで抽出されたタンパク質は、多くの場合、分析の前にバッファー交換または洗剤除去の追加のステップを必要とするため、洗剤はトリプシン消化を妨げ、下流の液体クロマトグラフィータンデム質量分析(LC-MS/MS)分析の性能を著しく低下させる可能性があります3.ペプチドは、典型的には、さらに脱塩、乾燥、および酵素消化に続くLC-MS/MS適合溶媒で再構成される。これらのタンパク質の生化学手順は、労働集約的で時間がかかる場合があります。したがって、彼らはプロテオミクスワークフローのスループットを制限し続け、取得したデータ4,5の変動に貢献します。人為的ミスとバイアスは、データの分散と再現性に影響を与える重要な要因として認識されてきました 6,7.質量分析サンプル調製ワークフローにおける人為的ミスを最小限に抑えるために、自動ピペットロボットシステムは、ショットガンプロテオミクスおよび標的質量分析によるタンパク質同定と定量のスループットと再現性を向上させるために利用され、そのような進歩は重要な研究および臨床現場でのプロテオミクス技術の普及を続けるためのインストゥルメンタルとして賞賛されている8 9,10,11,12,13.しかし、ほとんどの既存のプロトコルは、多額の投資とトレーニングを必要とするロボット液体処理プラットフォームを利用しており、学術環境の多くの研究室での有用性を制限したり、予算が限られているりします。
この記事では、低コストのオープンソースのロボット液体処理システムOT-2を利用して、典型的なショットガンプロテオミクスサンプル調製ワークフローを半自動化するプロトコルについて説明します。OT-2は他の多くのロボット液体ハンドリングシステムよりも低コストで、執筆時点では約5,000米ドルの費用がかかります。異なるモジュールやラボウェアの価格を考慮すると、執筆時点でこのプロトコルで実験を設定するための総コストは約$ 10,000であり、より高価なオプションよりもかなり広範なラボセットに手頃な価格になります。OT-2はPythonスクリプトを通したオープンソースプログラミングと互換性があり、ユーザー定義のDIYプロトコル設計に大きな柔軟性を提供します。3つの社内開発スクリプトを使用して、以下のプロトコルは、典型的なショットガンプロテオミクスサンプル調製ワークフローを、典型的なタンパク質標準(ウシ血清アルブミン)でOT-2ステーションで実行することをカバーしています。BSA)と正常なヒト心臓のタンパク質サンプルをライセート(図1)とした。(1)BSAサンプルおよび(2)複雑な心臓ライセートサンプルを処理する手順は、それぞれプロトコルセクション1、2、5、6および4、5、6で詳述されている。Sera-Magカルボキシレート変性磁気ビーズは、タンパク質およびペプチドサンプル中の洗剤および塩を除去するために、単一ポット固相強化サンプル調製(SP3)で利用されます。ウシ血清アルブミンおよびヒト心臓タンパク質からのトリプティック消化は、SP3ビーズによってさらに洗浄され、LC-MS/MS分析のために提出される。質量スペクトルは、ペプチドおよびタンパク質同定のためのMaxQuantソフトウェアを使用して分析されます。我々が行う代表的な結果は、プロトコルがベンチ時間を節約しながら、変動の優れた技術的係数(CV)を達成し、手の消化に劣り、示しています。

<table><tbody><tr><td>300 マイクロ;Lピペットチップ</td><td>Opentrons</td><td></td><td></td></tr><tr><td>4-in-1チューブラックセット</td><td>Opentrons各</td><td></td><td>セットには、ベーススタンド2個とチューブホルダートップ4個が含まれています(1.5mL、2mL、15mL+50mL、15mL、50mL)。この研究では、2mLと15mL + 50mLのトップスを使用します。</td></tr><tr><td>Acclaim PepMap 100 C18 HPLC カラム</td><td>Thermo Scientific</td><td>#164568</td><td>3 &mu;m粒子;100 &Aring;細孔;75 &mu;m x 150 mm</td></tr><tr><td>アセトニトリルLC-MSグレード</td><td>VWR</td> <td>#JT9829</td><td></td></tr><tr><td>アルミニウムブロックセット</td><td>Opentrons</td><td></td><td>このブロックセットには、96ウェル、2.0mLチューブと互換性のある3つのトップと、OT-2温度モジュールで使用するPCRストリップが含まれています。本稿では2.0mLチューブホルダーを使用しています。</td></tr><tr><td>重炭酸アンモニウム</td><td>Sigma-Aldrich</td><td># A6141</td><td></td></tr><tr><td>ウシ血清アルブミン標準液、2 mg/mL</td><td>Thermo Scientific</td><td>#23210</td><td></td></tr><tr><td>ジメチルスルホキシド(DMSO) LC-MS グレード</td><td>Thermo Scientific</td><td>#85190</td><td></td></tr><tr><td>Dithiothreitol</td><td>Sigma-Aldrich</td> <td>#D5545</td><td></td></tr><tr><td>EASY-Spray HPLC カラム</td><td>Thermo Scientific</td> <td>#ES800A</td><td></td></tr><tr><td>EasynLC 1200 Nano LC</td><td>Thermo Scientific</td> <td>#LC140</td><td></td></tr><tr><td>エタノールプルーフ 195-200</td><td>Fisher</td><td>#04-355-720</td><td></td></tr><tr><td>ギ酸 LC-MS グレード</td><td>Thermo Scientific</td><td>#85178</td><td></td></tr><tr><td>ヒト心臓溶解物</td><td>Novus Biologicals</td><td>NB820-59217</td><td></td></tr><tr><td>ヨードアセトアミド</td><td>Sigma-Aldrich</td> <td>#I1149</td><td></td></tr><tr><td>磁気チューブラック</td><td>Thermo Scientific</td> <td>#MR02</td><td></td></tr><tr><td>MAXQuant v.1.6.10.43</td><td></td><td></td><td>Tyanova et al., 2016 (https://www.maxquant.org/)</td></tr><tr><td>mySPIN 6 Mini Centrifuge</td><td>Thermo Scientific</td><td>#75004061</td><td>benchtop mini centrifuge for quick spin</td></tr><tr><td>NEST 2 mL 96-Well Deep Well Plate, V Bottom</td><td>Opentrons</td><td></td><td></td></tr><tr><td>OT-2 磁気モジュール</td><td>Opentrons</td><td></td><td>GEN1</td></tr><tr><td>OT-2 P300 シングルチャンネルピペット</td><td>Opentrons</td><td></td><td>GEN1</td></tr><tr><td>OT-2 P50 シングルチャンネルピペット</td><td>Opentrons</td><td></td><td>GEN1</td></tr><tr><td>OT-2 ロボットピペッティングロボット</td><td>Opentrons</td><td>OT-2</td><td></td></tr><tr><td>OT-2 温度モジュール</td><td>Opentrons</td><td></td><td>GEN1</td></tr><tr><td>Pierce Quantitative Colorimetric Peptide Assay</td><td>Thermo Scientific</td><td>#23275</td><td></td></tr><tr><td>Protein LoBind tubes 2.0 mL</td><td>Eppendorf</td><td>#022431102</td><td></td></tr><tr><td>Protein Sequence Database</td><td>UniProt/SwissProt</td><td></td><td>https://www.uniprot.org/uniprot/?query=proteome:UP000005640% 20レビュー済み:yes</td></tr><tr><td>Sera-Mag SpeedBead Carboxylate-Modified Magnetic Particles, Hydrophobic</td><td>Cytiva</td><td>#65152105050250</td><td></td></tr><tr><td>Sera-Mag SpeedBead Carboxylate-Modified Magnetic Particles,Hydrophylic</td><td>Cytiva</td><td>#45152105050250</td><td></td></tr><tr><td>SpeedVac</td><td>Thermo Scientific</td><td></td><td>真空蒸発器</td></tr><tr><td>Thermo Q Exactive HF 質量分析計</td><td>Thermo Scientific</td> <td>#IQLAAEGAAPFALGMBFZ</td><td></td></tr><tr><td>トリプシン MS グレード</td><td>Thermo Scientific</td><td>#90057</td><td></td></tr><tr><td>水 LC-MS グレード</td><td>VWR</td> <td>#BDH83645.400</td><td></td></tr></tbody></table>

オープンソースのラボロボットによるショットガンプロテオミクスサンプル処理

Shotgun Proteomics Sample Processing Automated by an Open-Source Lab Robot

質量分析ベースの散弾銃プロテオミクス実験では、酵素タンパク質消化やクリーンアップなど、複数のサンプル調製ステップが必要であり、ベンチ労働の時間を要し、バッチ間の変動の原因を提示することができます。ピペットロボットによるラボの自動化により、手作業を削減し、スループットを最大化し、研究の再現性を向上させることができます。それでも、標準的なオートメーションステーションの急激な開始価格は、多くの学術研究所にとって手頃な価格ではありません。この記事では、半自動タンパク質還元、アルキル化、消化、およびクリーンアップ手順を設定するための指示を含む、手頃な価格のオープンソースオートメーションシステム(Opentrons OT-2)を使用したプロテオミクスサンプル調製ワークフローについて説明します。OT-2システムをアプリケーションプログラミングインタフェースでプログラミングするためのオープンソースのPythonスクリプトを伴います。

OT-2ロボットと互換性があり、単一のタンパク質標準ウシ血清アルブミン(技術的複製n = 5消化)と洗剤含有ヒト心臓ライセートサンプル(n = 5消化)を用いた質量分析プロテオミクスのサンプル調製を行う3つのPythonスクリプトが提供されています。各消化産物は、2つのペプチドのクリーンアップ反応に分割されます。BSAおよび心臓サンプルの各ランにおける同定されたペプチドスペクトルマッチ(PSM)、ペプチド、およびタンパク質の数を 図4 および 図5に示す。BSAサンプルでは、728個のPSMと65個のペプチドの中央値をそれぞれ5.2%および3.2%の変動係数(CV)で同定した。複合心臓サンプルでは、7.6%、5.9%、3.6%の変動係数を持つ10回で、9,526 PSM、7,558個のペプチド、1,336個のタンパク質の中央値が同定されました。合計1,935個のタンパク質が心臓サンプルの10回から同定され、その中で1,677個のタンパク質が2回以上同定された。ペプチド定量における変動性を決定するために、抽出されたイオン...

オープンソースのロボット液体処理システムを操作して、半自動タンパク質サンプル調製を行い、洗剤の除去、タンパク質消化、ペプチド脱塩のステップをカバーするための詳細なプロトコルと3つのPythonスクリプトが提供されています。

Mass spectrometry-based shotgun proteomics experiments require multiple sample preparation steps, including enzymatic protein digestion and clean-up, ...

このプロトコルは、質量分析の実験の前にタンパク質の生化学の準備を実行するために自動化を使用し、より高いスループットとプロテオミクス研究のためのより低い変動性を可能にします。このプロトコルは、より多くの実験室に手頃な価格である低コスト、プログラム可能な液体処理システムを使用しています。私たちは、さらなる開発のために変更することができるオープンソースのPythonスクリプトを提供します。この手順のデモンストレーションは、当研究室の修士課程の学生であるミルトン・アマヤです。開始するには、noSP3_Digestionを開きます。py スクリプトをテキストエディタで実行し、必要に応じて「ここでのみカスタマイズ」セクションで実験固有の変数を指定します。次に、Opentrons アプリを開き、Opentrons アプリの [プロトコル] タブにスクリプトをアップロードします。次に、Python スクリプトで指定された OT2 デッキの対応する場所に、必要なラボウェアとピペットを配置します。次に、15ミリリットルプラス50ミリリットルチューブホルダートップを備えた4インワンチューブラックのA1ウェルに炭酸水素アンモニウム溶液を置き、2ミリリットルチューブホルダートップを備えた4インワンチューブラックのA1ウェルにタンパク質サンプルを配置します。温度モジュールの上に置かれたアルミニウムブロックの井戸に2ミリリットルのタンパク質低結合チューブを手動で配置し、A1から垂直に下に移動します。次に、DTT溶液を2ミリリットルチューブホルダートップを備えた4インワンチューブラックのA6ウェルに入れます。ロボットがアルミニウムブロック内のサンプルチューブに適量の重炭酸アンモネートバッファーを転送している間に観察します。次に、手動でロボットプログラムが一時停止していることを確認し、プロトコルを再開する前にスロット4にある2ミリリットルチューブラックのA6にDTTがロードされていることを確認するメッセージを表示します。DTTチューブの位置を確認し、チューブキャップを開けた後、Opentronsアプリの再開ボタンをクリックして続行します。ロボットがDTT溶液の10マイクロリットルを各サンプルにうまく転送し、その後に5回の混合ラウンドを行うことを確認します。次に、ロボットプログラムが一時停止していることを確認し、「サンプルチューブのキャップを閉じるようにする」というメッセージが表示されます。次に、チューブのキャップを手動で閉じ、[再開]をクリックして続行します。ロボットの温度モジュールがアルミニウムブロックを加熱し始め、温度が摂氏55度に達するまで待ち、その後5分間のインキュベーションを行い、サンプルを摂氏55度にします。ロボットはこの温度を30分間保持し、DTTによるタンパク質還元を可能にします。インキュベーション中に、ヨドアセトアミド溶液を調製し、手動でアルミニウム箔で包み、光への暴露を避けます。インキュベーションの後、ロボットのプログラムが一時停止し、警告メッセージが表示されたら、サンプルチューブのキャップを開き、サンプルチューブのキャップを解除し、再開をクリックして続行します。次に、手動でロボットのプログラムが警告メッセージで一時停止されていることを確認し、プロトコルを再開する前に、スロット4にある2ミリリットルチューブラックのB6にIodoacetamideがロードされていることを確認します。ヨウアセトアセトアミドチューブのラック位置を確認し、チューブキャップを開けた後、Resumeをクリックして、ロボットが各サンプルチューブに10マイクロリットルのヨードアセトアセトアミド溶液を転送し、その後5回の混合ラウンドを確実に行います。ロボットのプログラムが一時停止し、メッセージを表示すると、サンプルチューブのキャップを閉じて、サンプルチューブをキャップし、ホイルでそれらをカバーし、きれいな箔でアルミニウムブロック全体をカバーし、続行するために再開をクリックします。サンプルが摂氏22度で30分間インキュベートされるまで待ち、ヨウドアセトアミドインキュベートが完了するとロボットの温度モジュールが非活性化することを確認します。ロボットのプログラムが一時停止し、警告メッセージが表示されたら、プロトコルを再開する前にスロット4に配置された2ミリリットルチューブラックのC6にトリプシンがロードされていることを確認し、チューブキャップを開いた状態で2ミリリットルチューブラックのC6ウェルにトリプシン溶液を配置し、再開をクリックして続行します。次に、ロボットのプログラムが一時停止し、警告メッセージが表示されたら、温度モジュールのサンプルチューブのキャップを開き、サンプルチューブのキャップを解除し、再開をクリックして続行します。スタンバイしながら、ロボットは各サンプルチューブにトリプシンの10マイクロリットルを転送し、その後5つの混合ラウンドが続きます。一晩トリプシン消化した後、ベンチトップマイクロ遠心分離機を使用してサンプルを簡単に回転させ、サンプルを磁気チューブラックに置きます。2分後、上清をピペットで慎重に低結合マイクロ遠心チューブの新しいセットに移し、サンプルを冷蔵庫に保管します。次に、SP3_peptide_cleanupを開きます。py Python スクリプトをテキスト エディタで実行し、必要に応じて「ここでのみカスタマイズ」セクションで実験変数を指定します。次に、Opentrons アプリの [プロトコル] タブにスクリプトをアップロードします。必要なラボウェアとピペットを、Python スクリプトで指定された OT2 デッキの対応する場所に配置し、磁気モジュールの電源がオンになって、ロボットに接続されていることを確認します。磁気モジュールの上部に、新しい2ミリリットル、96ウェルの深いウェルプレートを置きます。次に、消化したサンプルをA1から始めて垂直に下に移動する2ミリリットルのチューブラックに入れます。次に、ロボットが磁性モジュールの深い井戸プレートのウェルに消化されたサンプルの55マイクロリットルを転送することを確認します。ロボットプロトコルが一時停止され、メッセージが表示されていることを確認し、プロトコルを再開する前にスロット4にある2ミリリットルチューブラックのA6に準備されたビーズがロードされていることを確認します。その後、渦を巻き、SP3ビーズをミニベンチトップ遠心分離機で短時間回転させ、キャップを開けた2ミリリットルチューブラックのA6ウェルに置きます。ロボットプログラムが一時停止され、メッセージが表示されていることを確認し、80%エタノールがプロトコルを再開する前にスロット5にある15ミリリットルプラス50ミリリットルのチューブラックのA4にロードされていることを確認します。その後、80%エタノール溶液をチューブラックのA4ウェルに入れ、再開ボタンをクリックして続行します。ロボットがピペット速度を遅くしながら観察し、各井戸から上澄み物を吸引し、それを廃管に分配します。ロボットがピペットの速度をデフォルトに戻し、磁気モジュールを外すまで待ちます。ロボットプログラムが一時停止し、メッセージを表示すると、メッセージ、重炭酸アンモニウムチューブのオープンキャップ、重炭酸アンモニウム溶液のキャップを開き、続行するために再開をクリックします。ロボットが磁気モジュールを外している間にスタンバイ、各ウェルに炭酸アンモニウムバッファーの250マイクロリットルを転送し、すぐに10回混合します。次に、ロボットがピペット速度を遅くしながら観察し、各ウェルから上澄み液を廃棄物管に移します。ロボットが各井戸に炭酸アンモニウムバッファーの 100 マイクロリットルを転送し、すぐに 10 回混合するまで待ちます。ロボットプログラムが一時停止され、メッセージが表示されていることを確認します, 新しいコレクションチューブがプロトコルを再開する前に2ミリリットルアルミニウムブロックに配置されていることを確認します.次に、最後のサンプルチューブの直後にアルミニウムブロックに低タンパク質保持マイクロ遠心チューブの新しいセットを配置し、再開をクリックして続行します。ロボットが重炭酸アンモニウムバッファー内の各サンプルを新しい 2 ミリリットルチューブに移す間スタンバイ。ロボットのプログラムが一時停止し、メッセージを表示すると、プロトコルを再開する前にスロット4に配置された2ミリリットルチューブラックのC6にトリプシンがロードされていることを確認し、チューブキャップを開いた2ミリリットルチューブラックのC6ウェルにトリプシン溶液を配置し、再開をクリックして続行します。プログラムの実行が完了したら、サンプルチューブキャップをパラフィンフィルムで包み、すべてのサンプルを温度制御ミキサーに移し、1,000 RPMの揺れで摂氏37度で16〜20時間インキュベートします。BSAサンプルでは、それぞれ5.2%と3.2%の変動係数を持つ728ペプチドスペクトルマッチと65ペプチドの培地が同定されました。複合心臓サンプルでは、9、526個のペプチドスペクトルが一致する培地、7、558ペプチド、1、336個のタンパク質がそれぞれ7.6%5.9%と3.6%の変動係数で10回で同定されました。ペプチド定量のばらつきを決定するために、抽出されたイオンクロマトグラム強度の変動係数を、ユニークなタンパク質にマッピングする10個のペプチドについて計算した。ヒト対ロボット実験結果の変動性がBCAアッセイと比較してさらに比較された場合、ロボットBCAアッセイの変動係数の平均は、ヒトマニュアルBCAアッセイよりも低かった。このプロトコルは、各サンプルを処理するためのベンチ時間を短縮します。これは、複数の薬物治療の間の細胞株のパネルにおけるプロテオミクスの違いを探求する道を開きます。

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Research

JoVE Journal

Biochemistry

生物化学

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自動プロテオーム処理のためのデジタルマイクロ流体

このビデオでは、転写因子とDNAの相互作用を監視するのに役立つ高性能蛍光異方性について説明しています。このアッセイは、蛍光色素で標識されたDNAの分子回転または異方性による分極の程度を測定することにより、蛍光色素で標識されたDNA分子とその特異的転写因子との相互作用をモニターします。...

転写因子-DNA結合親和性を決定するための蛍光異方性

TruTipは、多孔質モノリシック結合マトリックスがピペットチップ内に挿入される単純な核酸抽出技術である。これにより、試料調製フォーマットは、ほとんどの液体ハンドリング機器と互換性があり、高スループットの臨床応用およびサンプルタイプに多くの媒体を用いることができる。...

共通液ハンドリングロボットでTruTipテクノロジーを使用して臨床検体からのDNAやRNAのハイスループット、自動抽出

正確に高分解能質量分析計を接続した液体クロマトグラフィーによる定圧ラベリング、広範な分別、バイオインフォマティクス...

定圧ラベリング、豊富な液体クロマトグラフィー、質量分析法、およびソフトウェアによる定量化して深いプロテオームをプロファイリング

大規模な感度を考慮した結合親和性平衡、ソリューションを決定するための手法をご紹介します。これは、転写因子の DNA...

蛍光顕微鏡を使用して競争力のある滴定による転写因子の DNA 結合親和性の高感度測定

ここでは、質量分析ベースの定量プロテオミクス解析のための自動化された血漿タンパク質消化法を紹介する。このプロトコルでは、タンパク質変性、還元、アルキル化、トリプシン消化反応のための液体の移動およびインキュベーションステップが合理化され、自動化されています。所望の精密の96の井戸版を準備するのにおよそ5時間かかる。...

自動ワークステーションを用いた質量分析のためのプラズマサンプル調製

前駆体同位体標識とアイソバリックタグ(cPILOT)は、利用可能なアイソバリックタグで同時に分析できるサンプル数を増やすことができる、強化されたサンプル多重化戦略です。ロボットプラットフォームの組み込みにより、実験のスループット、再現性、定量的精度が大幅に向上しました。...

組み合わせ前駆体等位同位体ラベリングとアイソバリックタギング(cPILOT)を使用した自動サンプル多重化

記載されたプロトコルは、ラベルベースとラベルフリー定量の2つのアプローチを用いて、組織サンプルの最適化された定量プロテオミクス分析を提供します。ラベルベースのアプローチは、より正確なタンパク質定量の利点を有する一方で、ラベルフリーアプローチはより費用対効果が高く、コホートの何百ものサンプルを分析するために使用されます。...

組織サンプルの質量分析ベースのショットガンプロテオミクスの包括的ワークフロー

NMRによるフラグメントベースのスクリーニングは、生体高分子(DNA、RNA、またはタンパク質)に対する低分子バインダーを迅速に同定するための堅牢な方法です。自動化ベースのサンプル調製、NMR実験と取得条件、および分析ワークフローを説明するプロトコルが提示されています。この技術により、 1H と 19F の両方の NMR...

NMRベースのフラグメントスクリーニングは、最小サンプルで最大限の自動化モードで

Shotgun 質量分析ベースのリピドミクスは、さまざまなげっ歯類組織からの 1...

げっ歯類組織のショットガンリピドミクス

学ぶ ショットガンプロテオミクスサンプル処理の自動化プロトコル。低コストの液体ハンドリングシステムとPythonスクリプトを用いて、質量分析前のタンパク質生化学処理のスループット向上と変動性低減を実現する方法です。

オープンソースのラボロボットによるショットガンプロテオミクスサンプル処理

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