2024年9月27日
このプロトコルは、CMGヘリカーゼによるDNA巻き戻しのライブ可視化のための単一分子アッセイの実施を示しています。(1)DNA基質の調製、(2)蛍光標識 されたDrosophila melanogaster CMGヘリカーゼの精製、(3)全反射蛍光(TIRF)顕微鏡用のマイクロ流体フローセルの調製、および(4)単一分子DNA巻き戻しアッセイについて説明します。
私たちの研究室では、真核生物のDNA複製の分子メカニズムを研究しています。私たちは、ゲノム重複のダイナミクスを1分子レベルで理解したいと考えています。私たちは、精製されたタンパク質やXenopusの卵から抽出物を含む複数のシステムを使用してDNA複製を視覚化します。
DNA複製について私たちが知っていることの多くは、バルク実験、細胞イメージング、および構造生物学から得られています。これらの方法は非常に強力ですが、個々のタンパク質のダイナミクスや一過性の振る舞いについて教えてくれることは限られていることがよくあります。これが、単一分子技術が研究に非常に適しているものであり、その使用が現場で増加している理由です。
DNA巻き戻しをライブで可視化するための当社のプロトコルは、DNA複製のさまざまな側面を調査するために構築および変更できるプラットフォームの概要を示しています。これにより、選択したリボソーム成分と複製ストレスの存在下でのCMG活性の分子メカニズムをよりよく理解することができます。DNA複製中に作用する複雑なシステムを理解するために、主要なタンパク質を単離し、in vitroでそれらのリアルタイムの挙動を視覚化します。
私たちが得た洞察は、DNA複製のより完全な全体像に貢献します。
このプロトコルでは、CMGヘリカーゼによるDNA巻き戻しの生細胞可視化のための単分子アッセイについて解説します。DNA基質の調製、蛍光標識CMGヘリカーゼの精製、およびTIRF顕微鏡用のマイクロ流体フローセルのセットアップについて記述します。
CMGヘリカーゼによるDNA開裂の単一分子リアルタイム可視化は、ゲノム複製忠実度のメカニズムの基礎について、これまでにない知見をもたらします。この機能により、バイオ医薬品の研究開発(R&D)が可能になります。&ヘリカーゼのダイナミクス、複製ストレス応答、およびパスウェイの脆弱性を分子レベルで解析するためのDチームを編成する。このようなメカニズムの明確化により、標的バリデーションにおける予測の信頼性が高まり、初期探索および前臨床パイプライン全体におけるリスク調整後の意思決定に寄与する。
この単一分子TIRF顕微鏡アッセイは、初期のメカニズム研究から複製標的治療薬の前臨床検証に至るまで、創薬の連続的なプロセスに組み込まれています。