Glycomics-Guided Glycoproteomics Facilitates Comprehensive Profiling of the Glycoproteome in Complex Tumor Microenvironments

The Huong Chau; Naaz Bansal; Anastasia Chernykh; Rebeca Kawahara; Morten Thaysen-Andersen

doi:10.3791/67405

グライコミクスガイド下グライコプロテオミクスは、複雑な腫瘍微小環境におけるグリコプロテオームの包...

JoVE Journal
Cancer Research

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JoVE Journal Cancer Research

Glycomics-Guided Glycoproteomics Facilitates Comprehensive Profiling of the Glycoproteome in Complex Tumor Microenvironments

グライコミクスガイド下グライコプロテオミクスは、複雑な腫瘍微小環境におけるグリコプロテオームの包括的なプロファイリングを容易にします

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10:59 min

February 7, 2025

DOI: 10.3791/67405-v

The Huong Chau¹, Naaz Bansal¹, Anastasia Chernykh¹, Rebeca Kawahara^1,2, Morten Thaysen-Andersen^1,2

¹School of Natural Sciences, Faculty of Science and Engineering,Macquarie University, ²Institute for Glyco-core Research (iGCORE),Nagoya University

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

このプロトコールでは、がんの糖鎖生物学をより深く理解するために必要な複雑な腫瘍微小環境における不均一なグリコプロテオームに関する包括的な洞察を提供する統合オミクス技術である、グライコミクスガイド下グライコプロテオミクス法について詳しく説明します。

そこで、自然免疫系と免疫関連疾患における複雑な炭水化物(糖鎖)を研究し、現在は敗血症とがんに焦点を当てています。私たちの仕事には、ヒト糖タンパク質の詳細な特性評価のための、グライコミクス法やグライコプロテオミクス法などの分析方法とシステム糖鎖生物学が含まれます。グライコプロテオミクスは過去数十年で驚異的な進歩を遂げ、利用可能な高品質の質量分析データの不足によって進歩が制限されることはなくなりました。

むしろ、スペクトルデータから生物学的知識を解釈し、生成することが課題です。グライコミクスガイド下グライコプロテオミクス法により、糖鎖科学者はヒトの健康指標によるグリコプロテオームとハードバリアについて深く正確な洞察を得ることができ、グライコプロテオミクスは、グリコプロテオームに対するサイト特異的な洞察を生成することができる独自の能力を備えています。しかし、糖ペプチドの割合は依然として高いままです。

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