Name: 分子ドッキングおよび脱ユビキチン化酵素プローブ技術に基づくUCHL3活性阻害のための漢方薬化合物のスクリーニング (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2024-11-22T14:40:00.000+00:00
Duration: 10 min 25 s
Description: 学ぶ分子ドッキングとプローブ技術を用いた漢方薬由来UCHL3阻害剤のスクリーニング法。Salvia miltiorrhizaからDanshensuを同定し、脱ユビキチン化酵素活性評価の新たなアプローチを確立する。

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

<meta charset="utf8"></head><body>分子ドッキングを使用したUCHL3阻害剤の仮想スクリーニングとバリデーション

<table><tbody><tr><td>30% アクリルアミド</td><td>Beijing Lablead Biotech Co., Ltd</td><td>A3291</td><td></td></tr><tr><td>過硫酸アンモニウム</td><td>China National Medicines Corporation Ltd</td><td>10002616</td><td></td></tr><tr><td>抗ウサギ IgG、HRP 結合抗体&nbsp;#7074</td><td>細胞シグナル伝達技術</td><td>7074P2</td><td></td></tr><tr><td>BeyoECL Plus</td><td>Beyotime</td><td>P0018S</td><td></td></tr><tr><td>Bradford Protein Assay Kit</td><td>Beyotime</td><td>P0006</td><td></td></tr><tr><td>ClonExpress Ultra ワンステップ クローニング キット</td><td>Vazyme</td><td>C115-01</td><td></td></tr><tr><td>Danshensu</td><td>Shanghai yuanye Bio-Technology Co., Ltd</td><td>B20254</td><td></td></tr><tr><td>DMSO</td><td>Ameresco, Inc.</td><td>21K2356571</td><td></td></tr><tr><td>電気泳動システム</td><td>Liuyi Biotechnology</td><td>112-0630</td><td></td></tr><tr><td>HEPES</td><td>Sigma</td><td>H3375</td><td></td></tr><tr><td>His タグ付きタンパク質精製キット (NTA-Ni アガロース磁気ビーズ)</td><td>Beyotime</td><td>P2247S</td><td></td></tr><tr><td>Immun-Blot PVDF メンブレン、ロール、26 cm x 3.3 m</td><td>Bio-Rad Laboratories (Shanghai) Co., Ltd</td><td>1620177</td><td></td></tr><tr><td>イソプロピルアルコール</td><td>Macklin</td><td>I811925</td><td></td></tr><tr><td>M5 Prestained Protein Ladder</td><td>Mei5 Biotechnology Co.Ltd</td><td>MF-212-01</td><td></td></tr><tr><td>Maestro</td><td>Schr&ouml;ディンガー」s</td><td>https://www.schrodinger.com/platform/products/maestro/</td><td></td></tr> メ<tr><td>チルアルコール</td><td>China National Medicines Corporation Ltd</td><td>10014108</td><td></td></tr><tr><td>MF-Millipore</td><td>Millipore</td><td>HAWP04700</td><td></td></tr><tr><td>MyFug&nbsp;小型遠心分離機</td><td>Sigma</td><td>Z764183</td><td></td></tr><tr><td>Pierce 希釈フリー ラピッドゴールド BCA プロテイン アッセイ</td><td>Thermo Scientific</td><td>A55860</td><td></td></tr><tr><td>PR-619</td><td>Cell Signaling Technology</td><td>26065S</td><td></td></tr><tr><td>Primary Antibody Dilution Buffer for Western Blot</td><td>Macklin</td><td>P917820</td><td></td></tr><tr><td>組換えヒト HA-ユビキチン ビニルスルホンタンパク質、CF</td><td>R&D Systems</td><td>U-212-025</td><td></td></tr><tr><td>組換えヒトユビキチンAMCタンパク質、CF</td><td>R&D Systems</td><td>U-550-050</td><td></td></tr><tr><td>スキムミルク</td><td>Becton,Dickinson and Company</td><td>232100</td><td></td></tr><tr><td>ドデシル硫酸ナトリウム (SDS)</td><td>Ameresco, Inc.</td><td>205-788-1</td><td></td></tr><tr><td>テメッド</td>・<td>アメレスコ株式会社</td><td>2545C134</td><td></td></tr><tr><td>Tween 20</td><td>Beijing Lablead Biotech Co., Ltd</td><td>0777-1</td><td></td></tr><tr><td>UCHL3 (D25E6) ウサギ mAb</td><td>細胞シグナル伝達技術</td><td>8141T</td><td></td></tr></tbody></table>

分子ドッキングおよび脱ユビキチン化酵素プローブ技術に基づくuchl3活性阻害のための漢方薬化合物のスクリーニング

Screening Traditional Chinese Medicine Compounds for Inhibiting UCHL3 Activity Based on Molecular Docking and Deubiquitinating Enzyme Probe Technology

Salvia miltiorrhiza BgeにおいてUCHL3を効果的に阻害する小分子をスクリーニングするために、TCMSPのウェブサイトから得られた低分子とUCHL3との間の分子ドッキングを行った。ドッキング結果の上位30の低分子とそのスコアを表1に示します。すべての低分子のドッキング結果を補足表1に示します。研究の代表的な低分子としてDanshensuを選択しました。図1に示すように、DanshensuとUCHL3はそれぞれARG-186、HIS-169、VAL-166、ASN-93と水素結合しており、両者のドッキングスコアは-4.75 kcal/molで良好な結合活性を示しています。
UCHL3に対するDanshensuの阻害活性を検証するために、図2Aに示すように、UCHL3の組換えタンパク質をin vitroで精製することを進めました。次に、精製され...

分子ドッキングおよび脱ユビキチン化酵素プローブ技術に基づくUCHL3活性阻害のための漢方薬化合物のスクリーニング

Deubiquitinating enzymes&#160;(DUBs) play a pivotal role in modulating ubiquitination homeostasis, with UCHL3 being an archetypal cysteine DUB intricately ...

screening-traditional-chinese-medicine-compounds-for-inhibiting-uchl3

Research

JoVE Journal

Medicine

医学

ここでは、細胞ベースのレポーター遺伝子アッセイを、3'...

転写後調節される遺伝子の化学モジュレーターのためのハイスループットスクリーニング

現在のプロトコルは、機能的に相同脱ユビキチン化酵素の活性を測定する方法を詳述します。特殊なプローブは、共有結合酵素を変更し、検出を可能にします。この方法は、新たな治療標的を同定する可能性を保持しています。...

細胞株および組織試料中の脱ユビキチン化酵素の活性を測定する方法

HCNチャネルとそれらの補助サブユニット間の相互作用は、大うつ病性障害における治療標的として同定されています。ここで、このタンパク質 - タンパク質相互作用の小分子阻害剤を同定するための蛍光偏光ベースの方法が提供されます。...

HCN1とTRIP8bの間のタンパク質 - タンパク質相互作用の小分子阻害剤を同定するための方法

本稿は、化学剤のスクリーン ライブラリに阻害剤と T 細胞受容体のシグナル伝達に影響を与えるそれらのターゲットを識別するためフロー ベース フローサイトメトリー分析を使用します。ここで説明する方法は、ハイスループットス...

T 細胞受容体を介してライブラリ化学阻害剤のスクリーニングのメディエーターの同定

本研究は、E3ユビキチンリガーゼ触媒活性の分析のための詳細な インビトロ ユビキトリメンテーションアッセイプロトコルを提供する。組換えタンパク質は 、大腸菌...

イン・ヴィトロ E3ユビキチンリガーゼ関数の解析

ここでは、ルシフェラーゼベースのレポーターアッセイを半自動のハイスループットスクリーニングフォーマットで使用するための詳細なプロトコルについて説明します。...

オートファジー関連4Bシステインペプチダーゼ阻害剤の細胞ベースの薬物スクリーニング

このプロトコルでは、組換えタンパク質精製とユビキチン鎖切断アッセイを組み合わせることにより、神経発達障害に関連する遺伝的変異が脱ユビキチン化酵素活性に及ぼす影響を測定する方法を説明しています。...

In vitroユビキチン鎖切断アッセイによる神経発達障害関連脱ユビキチン化酵素の酵素活性の測定

本プロトコルは、超高性能液体クロマトグラフィーとハイブリッド四重極-オービトラップ高分解能質量分析法(UHPLC-Q-Orbitrap...

UHPLC-Q-Orbitrap HRMSをネットワーク薬理学と統合したIgA腎症に対する一気清戒処方の物質的根拠の解明

浣腸は、重度の急性膵炎(SAP)の治療に使用される伝統的な漢方薬(TCM)療法の一種です。治療では、TCM液を肛門から直腸と結腸に注入して、液体を腸内に保ち、腸粘膜から吸収します。この研究は、SAP患者の浣腸手順を標準化することを目的としています。...

重症急性膵炎患者に対する漢方薬の浣腸

本研究では、プラントからDESI-MSIサンプルを調製するための一連の方法を提示し、DESIアセンブリの設置、MSIデータの取得、および処理の手順を詳細に説明します。このプロトコルは、植物における空間メタボローム情報を取得するためのいくつかの条件に適用することができる。...

DESI-MSIを用いた漢方薬の空間メタボロームで同定された代謝物の可視化

学ぶ分子ドッキングとプローブ技術を用いた漢方薬由来UCHL3阻害剤のスクリーニング法。Salvia miltiorrhizaからDanshensuを同定し、脱ユビキチン化酵素活性評価の新たなアプローチを確立する。

分子ドッキングおよび脱ユビキチン化酵素プローブ技術に基づくUCHL3活性阻害のための漢方薬化合物のスクリーニング

さらに動画を探す