Name: 神経解剖学的解析のためのマーモセット脳全体の連続2光子断層撮影法 (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-01-17T14:20:00.000+00:00
Duration: 4 min 2 s
Description: 学ぶ 連続2光子断層撮影法を用いたマーモセット脳全体の高解像度3Dイメージングによる神経解剖学的解析。この手法は霊長類の脳構造と神経接続性を理解する上で重要な知見を提供します。

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<meta charset="utf8"></head><body>マーモセット脳における体積イメージングと軸索投影マッピング

<ol><li>Oh, S. W., Harris, J. A., Ng, L., Winslow, B., Cain, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+mesoscale+connectome+of+the+mouse+brain%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">A mesoscale connectome of the mouse brain.</a> Nature. 508 (7495), 207-214 (2014).</li>
<li>Ragan, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Serial+two-photon+tomography+for+automated+ex+vivo+mouse+brain+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Serial two-photon tomography for automated ex vivo mouse brain imaging.</a> Nat Methods. 9 (3), 255-258 (2012).</li>
<li>Liang, Z., Arefin, T. M., Lee, C. H., Zhang, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Using+mesoscopic+tract-tracing+data+to+guide+the+estimation+of+fiber+orientation+distributions+in+the+mouse+brain+from+diffusion+MRI%5BTitle%5D)+AND+%22Neuroimage%22%5BJournal%5D)">Using mesoscopic tract-tracing data to guide the estimation of fiber orientation distributions in the mouse brain from diffusion MRI.</a> Neuroimage. 270, 119999(2023).</li>
<li>Watakabe, A., Hirokawa, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cortical+networks+of+the+mouse+brain+elaborate+within+the+gray+matter%5BTitle%5D)+AND+%22Brain+Struct+Funct%22%5BJournal%5D)">Cortical networks of the mouse brain elaborate within the gray matter.</a> Brain Struct Funct. 223 (8), 3633-3652 (2018).</li>
<li>Ypma, R. J. F., Bullmore, E. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Statistical+analysis+of+tract-tracing+experiments+demonstrates+a+dense%2C+complex+cortical+network+in+the+mouse%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Comput+Biol%22%5BJournal%5D)">Statistical analysis of tract-tracing experiments demonstrates a dense, complex cortical network in the mouse.</a> PLoS Comput Biol. 12 (9), e1005104(2016).</li>
<li>Wang, Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Allen+mouse+brain+common+coordinate+framework%3A+A+3D+reference+atlas%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">The Allen mouse brain common coordinate framework: A 3D reference atlas.</a> Cell. 181 (4), 936-953.e20 (2020).</li>
<li>Köbbert, C., Apps, R., Bechmann, I., Lanciego, J. L., Mey, J., Thanos, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Current+concepts+in+neuroanatomical+tracing%5BTitle%5D)+AND+%22Prog+Neurobiol%22%5BJournal%5D)">Current concepts in neuroanatomical tracing.</a> Prog Neurobiol. 62 (4), 327-351 (2000).</li>
<li>Lanciego, J. L., Wouterlood, F. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Neuroanatomical+tract-tracing+techniques+that+did+go+viral%5BTitle%5D)+AND+%22Brain+Struct+Funct%22%5BJournal%5D)">Neuroanatomical tract-tracing techniques that did go viral.</a> Brain Struct Funct. 225 (4), 1193-1224 (2020).</li>
<li>Bakker, R., Wachtler, T., Diesmann, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CoCoMac+2.0+and+the+future+of+tract-tracing+databases%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Neuroinform%22%5BJournal%5D)">CoCoMac 2.0 and the future of tract-tracing databases.</a> Front Neuroinform. 6, (2012).</li>
<li>Watakabe, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Local+and+long-distance+organization+of+prefrontal+cortex+circuits+in+the+marmoset+brain%5BTitle%5D)+AND+%22Neuron%22%5BJournal%5D)">Local and long-distance organization of prefrontal cortex circuits in the marmoset brain.</a> Neuron. 111 (14), 2258-2273.e10 (2023).</li>
<li>Skibbe, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Brain%2FMINDS+marmoset+connectivity+resource%3A+An+open-access+platform+for+cellular-level+tracing+and+tractography+in+the+primate+brain%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biol%22%5BJournal%5D)">The Brain/MINDS marmoset connectivity resource: An open-access platform for cellular-level tracing and tractography in the primate brain.</a> PLoS Biol. 21 (6), e3002158(2023).</li>
<li>Mitchell, J. F., Leopold, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+marmoset+monkey+as+a+model+for+visual+neuroscience%5BTitle%5D)+AND+%22Neurosci+Res%22%5BJournal%5D)">The marmoset monkey as a model for visual neuroscience.</a> Neurosci Res. 93, 20-46 (2015).</li>
<li>Okano, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Current+status+of+and+perspectives+on+the+application+of+marmosets+in+neurobiology%5BTitle%5D)+AND+%22Annu+Rev+Neurosci%22%5BJournal%5D)">Current status of and perspectives on the application of marmosets in neurobiology.</a> Annu Rev Neurosci. 44, 27-48 (2021).</li>
<li>Watakabe, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparative+analyses+of+adeno-associated+viral+vector+serotypes+1%2C+2%2C+5%2C+8+and+9+in+marmoset%2C+mouse+and+macaque+cerebral+cortex%5BTitle%5D)+AND+%22Neurosci+Res%22%5BJournal%5D)">Comparative analyses of adeno-associated viral vector serotypes 1, 2, 5, 8 and 9 in marmoset, mouse and macaque cerebral cortex.</a> Neurosci Res. 93, 144-157 (2015).</li>
<li>Hata, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multi-modal+brain+magnetic+resonance+imaging+database+covering+marmosets+with+a+wide+age+range%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Data%22%5BJournal%5D)">Multi-modal brain magnetic resonance imaging database covering marmosets with a wide age range.</a> Sci Data. 10, 221(2023).</li>
<li>Liwang, J. K., Bennett, H. C., Pi, H. -J., Kim, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protocol+for+using+serial+two-photon+tomography+to+map+cell+types+and+cerebrovasculature+at+single-cell+resolution+in+the+whole+adult+mouse+brain%5BTitle%5D)+AND+%22STAR+Protoc%22%5BJournal%5D)">Protocol for using serial two-photon tomography to map cell types and cerebrovasculature at single-cell resolution in the whole adult mouse brain.</a> STAR Protoc. 4 (1), 102048(2023).</li>
<li>Okamoto, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Exclusive+labeling+of+direct+and+indirect+pathway+neurons+in+the+mouse+neostriatum+by+an+adeno-associated+virus+vector+with+Cre%2Flox+system%5BTitle%5D)+AND+%22STAR+Protoc%22%5BJournal%5D)">Exclusive labeling of direct and indirect pathway neurons in the mouse neostriatum by an adeno-associated virus vector with Cre/lox system.</a> STAR Protoc. 2 (1), 100230(2021).</li>
<li>Viswanathan, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-performance+probes+for+light+and+electron+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">High-performance probes for light and electron microscopy.</a> Nat Methods. 12 (6), 568-576 (2015).</li>
<li>Kuan, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Neuroinformatics+of+the+Allen+mouse+brain+connectivity+atlas%5BTitle%5D)+AND+%22Methods%22%5BJournal%5D)">Neuroinformatics of the Allen mouse brain connectivity atlas.</a> Methods. 73, 4-17 (2015).</li>
<li>Paxinos, G., Watson, C., Petrides, M., Rosa, M., Tokuno, H. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aPaxinos%2C+G+%22The+Marmoset+Brain+in+Stereotaxic+Coordinates%22">The Marmoset Brain in Stereotaxic Coordinates</a>. , Academic Press. London, Waltham, MA. (2012).</li>
<li>Abe, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((3D+reconstruction+of+brain+section+images+for+creating+axonal+projection+maps+in+marmosets%5BTitle%5D)+AND+%22J+Neurosci+Methods%22%5BJournal%5D)">3D reconstruction of brain section images for creating axonal projection maps in marmosets.</a> J Neurosci Methods. 286, 102-113 (2017).</li>
<li>Wan, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((FluoRender%3A+Joint+freehand+segmentation+and+visualization+for+many-channel+fluorescence+data+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Bioinformatics%22%5BJournal%5D)">FluoRender: Joint freehand segmentation and visualization for many-channel fluorescence data analysis.</a> BMC Bioinformatics. 18 (1), 280(2017).</li>
<li>Majka, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Towards+a+comprehensive+atlas+of+cortical+connections+in+a+primate+brain%3A+Mapping+tracer+injection+studies+of+the+common+marmoset+into+a+reference+digital+template%5BTitle%5D)+AND+%22J+Comp+Neurol%22%5BJournal%5D)">Towards a comprehensive atlas of cortical connections in a primate brain: Mapping tracer injection studies of the common marmoset into a reference digital template.</a> J Comp Neurol. 524 (11), 2161-2181 (2016).</li>
<li>Liu, C., Yen, C. C. -C., Szczupak, D., Tian, X., Glen, D., Silva, A. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Marmoset+brain+mapping+V3%3A+Population+multi-modal+standard+volumetric+and+surface-based+templates%5BTitle%5D)+AND+%22Neuroimage%22%5BJournal%5D)">Marmoset brain mapping V3: Population multi-modal standard volumetric and surface-based templates.</a> Neuroimage. 226, 117620(2021).</li>
<li>Liu, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+digital+3D+atlas+of+the+marmoset+brain+based+on+multi-modal+MRI%5BTitle%5D)+AND+%22Neuroimage%22%5BJournal%5D)">A digital 3D atlas of the marmoset brain based on multi-modal MRI.</a> Neuroimage. 169, 106-116 (2018).</li>
<li>Liu, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+resource+for+the+detailed+3D+mapping+of+white+matter+pathways+in+the+marmoset+brain%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Neurosci%22%5BJournal%5D)">A resource for the detailed 3D mapping of white matter pathways in the marmoset brain.</a> Nat Neurosci. 23 (2), 271-280 (2020).</li>
<li>Woodward, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Brain%2FMINDS+3D+digital+marmoset+brain+atlas%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Data%22%5BJournal%5D)">The Brain/MINDS 3D digital marmoset brain atlas.</a> Sci Data. 5, 180009(2018).</li>
<li>Saleem, K. S., Avram, A. V., Glen, D., Schram, V., Basser, P. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+subcortical+atlas+of+the+marmoset+%28%26%2334%3BSAM%26%2334%3B%29+monkey+based+on+high-resolution+MRI+and+histology%5BTitle%5D)+AND+%22Cereb+Cortex%22%5BJournal%5D)">The subcortical atlas of the marmoset (&#34;SAM&#34;) monkey based on high-resolution MRI and histology.</a> Cereb Cortex. 34 (4), bhae120(2024).</li>
<li>Watakabe, A., Hirokawa, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cortical+networks+of+the+mouse+brain+elaborate+within+the+gray+matter%5BTitle%5D)+AND+%22Brain+Struct+Funct%22%5BJournal%5D)">Cortical networks of the mouse brain elaborate within the gray matter.</a> Brain Struct Funct. 223 (8), 3633-3652 (2018).</li>
<li>Lin, M. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+high-throughput+neurohistological+pipeline+for+brain-wide+mesoscale+connectivity+mapping+of+the+common+marmoset%5BTitle%5D)+AND+%22eLife%22%5BJournal%5D)">A high-throughput neurohistological pipeline for brain-wide mesoscale connectivity mapping of the common marmoset.</a> eLife. 8, e40042(2019).</li>
<li>Skibbe, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((PAT-probabilistic+axon+tracking+for+densely+labeled+neurons+in+large+3-D+micrographs%5BTitle%5D)+AND+%22IEEE+Trans+Med+Imaging%22%5BJournal%5D)">PAT-probabilistic axon tracking for densely labeled neurons in large 3-D micrographs.</a> IEEE Trans Med Imaging. 38 (1), 69-78 (2019).</li>
<li>Economo, M. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+platform+for+brain-wide+imaging+and+reconstruction+of+individual+neurons%5BTitle%5D)+AND+%22eLife%22%5BJournal%5D)">A platform for brain-wide imaging and reconstruction of individual neurons.</a> eLife. 5, e10566(2016).</li>
<li>Winnubst, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reconstruction+of+1%2C000+projection+neurons+reveals+new+cell+types+and+organization+of+long-range+connectivity+in+the+mouse+brain%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Reconstruction of 1,000 projection neurons reveals new cell types and organization of long-range connectivity in the mouse brain.</a> Cell. 179 (1), 268-281.e13 (2019).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>アガロースI.型</td><td>&nbsp;Sigma</td><td>A6013</td><td></td></tr><tr><td>オールインワン蛍光顕微鏡</td><td>キーエンス</td><td>BZ-Xシリーズ</td><td>本研究では、BZ-X710</td></tr><tr><td>抗マウスCy3</td><td>Jackson Immuno Research Laboratories, Inc.を使用しました。</td><td>115-165-003</td><td></td></tr><tr><td>抗myc抗体</td><td>MBL</td><td>M192</td><td>マウスモノクローナル</td></tr><tr><td>ブトルファノール&nbsp;</td><td>明治アニマルヘルス</td><td>ヴェトルファレ</td><td></td></tr><tr><td>セラミックブレード</td><td>ティッシュビジョン&nbsp;</td><td>N/A</td><td></td></tr><tr><td>コラゲナーゼI型</td><td>和光ケミカル</td><td>#031-17601</td><td>100 & micro;L x 10 100 mg/mL の PBS&nbsp;</td></tr><tr><td>綿棒(HUBY-340)</td><td>HUBY</td><td>BB-013SP</td><td>マイクロ綿</td></tr>棒 <tr><td>オーダーメイドチャンバー</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>チャンバーは、サイドプレート4枚とボトムプレート1枚で構成されており、すべて厚さ1cmのアクリル板でできており、ネジボルトでしっかりと固定することができます。追加のアクリル板がチャンバー内に配置され、3本の金属ポールがあります&nbsp;それを通して挿入され、マーモセットの脳を逆さまの位置に保持します。</td></tr><tr><td>Cy3-ストレプトアビジン&nbsp;</td><td>ジャクソン・イムノ・リサーチ・ラボラトリーズ(株)</td><td>016-160-084</td><td></td></tr><tr><td>デュモン #5 鉗子、イノックス</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td></td></tr><tr><td>エポキシ インスタント ミックス</td><td>ロックタイト</td><td>N/A</td><td></td></tr><tr><td></td><td>FIJI NIH</td><td></td><td></td></tr> https://imagej.net/software/fiji/downloads <tr><td>kn_pipeline_check_mosaic.py</td><td>N/A</td><td>N/A</td> github.com/watkarbey/STPT_depo<td>;これは、TissueCyteデータのチェックスクリプトです。</td></tr><tr><td>メデトミジン&nbsp;</td><td>Zenoaq</td><td>Domitor</td><td></td></tr><tr><td>Midazolam</td><td>Sandoz</td><td>N/A</td><td></td></tr><tr><td>NaBH4</td><td>&nbsp;シグマ</td><td>#452882</td><td></td></tr><tr><td>NaIO4</td><td>&nbsp;シグマ</td><td>S1878</td><td></td></tr><tr><td>灌流針&nbsp;</td><td>夏目製作所株式会社</td><td>&nbsp;KN-348, 20G-50</td><td></td></tr><tr><td>スライドグラス (76 mm x 52 mm)</td><td>松波</td><td>S9111</td><td></td></tr><tr><td>StAvHRP&nbsp;</td><td>ジャクソン・イムノ・リサーチ・ラボラトリーズ(株)</td><td>016-030-084</td><td>HRP-ストレプトアビジン(滴定は慎重に決定する必要があります)</td></tr><tr><td>TissueCyte1000</td><td>TissueVision&nbsp;</td><td></td><td></td>https://www.tissuevision.com/tissuecyte</tr><tr><td>TSAブロッキング試薬</td><td>キコテック</td><td>FP1012</td><td>TSA-ビオチンキット(アコヤバイオサイエンス)を参照TSA</td></tr><tr><td>-ビオチン</td><td>自家製</td><td>N/A</td><td>岡本ら(文献16)ベ</td></tr><tr><td>クタシールド HardSet 封入剤</td><td>Vector laboratories</td><td>Inc N/A</td><td>退色防止封入剤</td></tr></tbody></table>

神経解剖学的解析のためのマーモセット脳全体の連続2光子断層撮影法

Serial Two-Photon Tomography of the Whole Marmoset Brain for Neuroanatomical Analyses

Serial Two-photon tomography (STPT) is a technique to image a mass of tissue in its three-dimensional shape by combining two-photon imaging with automatic ...

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神経解剖学的解析のためのマーモセット脳全体の連続2光子断層撮影法

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