Name: 高スループット形式を用いた微生物二次代謝物に対する葉の応答評価 (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-12-05T13:00:00.000+00:00
Duration: 5 min 51 s
Description: 学ぶ高スループット法による植物イオン漏出・ペルオキシダーゼ活性・カロース産生の同時評価。微生物二次代謝物を用いたストレス応答解析で、限られた試料を効率的に活用し、作物耐性向上研究に貢献します。

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<ol><li>Yu, X., Feng, B., He, P., Shan, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((From+chaos+to+harmony%3A+responses+and+signaling+upon+microbial+pattern+recognition%5BTitle%5D)+AND+%22Annu+Rev+Phytopathol%22%5BJournal%5D)">From chaos to harmony: responses and signaling upon microbial pattern recognition.</a> Annu Rev Phytopathol. 55 (1), 109-137 (2017).</li>
<li>Brauer, E. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+cyclic+lipopeptide+from+Fusarium+graminearum+targets+plant+membranes+to+promote+virulence%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Rep%22%5BJournal%5D)">A cyclic lipopeptide from Fusarium graminearum targets plant membranes to promote virulence.</a> Cell Rep. 43 (7), 114384(2024).</li>
<li>Thoms, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Innate+immunity+can+distinguish+beneficial+from+pathogenic+rhizosphere+microbiota%5BTitle%5D)+AND+%22bioRxiv%22%5BJournal%5D)">Innate immunity can distinguish beneficial from pathogenic rhizosphere microbiota.</a> bioRxiv. , (2023).</li>
<li>Nishiuchi, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fusarium+phytotoxin+trichothecenes+have+an+elicitor-like+activity+in+Arabidopsis+thaliana%2C+but+the+activity+differed+significantly+among+their+molecular+species%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">Fusarium phytotoxin trichothecenes have an elicitor-like activity in Arabidopsis thaliana, but the activity differed significantly among their molecular species.</a> Mol Plant Microbe Interact. 19 (5), 512-520 (2006).</li>
<li>Schellenberger, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Apoplastic+invasion+patterns+triggering+plant+immunity%3A+plasma+membrane+sensing+at+the+frontline%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Pathol%22%5BJournal%5D)">Apoplastic invasion patterns triggering plant immunity: plasma membrane sensing at the frontline.</a> Mol Plant Pathol. 20 (11), 1602-1616 (2019).</li>
<li>Henry, G., Deleu, M., Jourdan, E., Thonart, P., Ongena, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+bacterial+lipopeptide+surfactin+targets+the+lipid+fraction+of+the+plant+plasma+membrane+to+trigger+immune-related+defence+responses%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Microbiol%22%5BJournal%5D)">The bacterial lipopeptide surfactin targets the lipid fraction of the plant plasma membrane to trigger immune-related defence responses.</a> Cell Microbiol. 13 (11), 1824-1837 (2011).</li>
<li>Pršić, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mechanosensing+and+sphingolipid-docking+mediate+lipopeptide-induced+immunity+in+Arabidopsis%5BTitle%5D)+AND+%22bioRxiv%22%5BJournal%5D)">Mechanosensing and sphingolipid-docking mediate lipopeptide-induced immunity in Arabidopsis.</a> bioRxiv. , (2023).</li>
<li>Crouzet, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biosurfactants+in+plant+protection+against+diseases%3A+rhamnolipids+and+lipopeptides+case+study%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Bioeng+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Biosurfactants in plant protection against diseases: rhamnolipids and lipopeptides case study.</a> Front Bioeng Biotechnol. 8, 1014(2020).</li>
<li>Khan, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Luminol-based+chemiluminescent+signals%3A+clinical+and+non-clinical+application+and+future+uses%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Biochem+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Luminol-based chemiluminescent signals: clinical and non-clinical application and future uses.</a> Appl Biochem Biotechnol. 173, 333-355 (2014).</li>
<li>Schenk, S. T., Schikora, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Staining+of+callose+depositions+in+root+and+leaf+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Bio-protoc%22%5BJournal%5D)">Staining of callose depositions in root and leaf tissues.</a> Bio-protoc. 5 (6), e1429(2015).</li>
<li>Mott, G. A., Desveaux, D., Guttman, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+high-sensitivity%2C+microtiter-based+plate+assay+for+plant+pattern-triggered+immunity%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">A high-sensitivity, microtiter-based plate assay for plant pattern-triggered immunity.</a> Mol Plant Microbe Interact. 31 (5), 499-504 (2018).</li>
<li>Hatsugai, N., Katagiri, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantification+of+plant+cell+death+by+electrolyte+leakage+assay%5BTitle%5D)+AND+%22Bio-protoc%22%5BJournal%5D)">Quantification of plant cell death by electrolyte leakage assay.</a> Bio-protoc. 8 (5), e2758(2018).</li>
<li>Zhang, X. H., Yu, X. Z., Yue, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Phytotoxicity+of+dimethyl+sulfoxide+%28DMSO%29+to+rice+seedlings%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Environ+Sci+Technol%22%5BJournal%5D)">Phytotoxicity of dimethyl sulfoxide (DMSO) to rice seedlings.</a> Int J Environ Sci Technol. 13, 607-614 (2016).</li>
<li>Mannan, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DMSO+triggers+the+generation+of+ROS+leading+to+an+increase+in+artemisinin+and+dihydroartemisinic+acid+in+Artemisia+annua+shoot+cultures%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Cell+Rep%22%5BJournal%5D)">DMSO triggers the generation of ROS leading to an increase in artemisinin and dihydroartemisinic acid in Artemisia annua shoot cultures.</a> Plant Cell Rep. 29, 143-152 (2010).</li>
<li>Felix, G., Duran, J. D., Volko, S., Boller, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plants+have+a+sensitive+perception+system+for+the+most+conserved+domain+of+bacterial+flagellin%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+J%22%5BJournal%5D)">Plants have a sensitive perception system for the most conserved domain of bacterial flagellin.</a> Plant J. 18 (3), 265-276 (1999).</li>
<li>Jourdan, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Insights+into+the+defense-related+events+occurring+in+plant+cells+following+perception+of+surfactin-type+lipopeptide+from+Bacillus+subtilis%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">Insights into the defense-related events occurring in plant cells following perception of surfactin-type lipopeptide from Bacillus subtilis.</a> Mol Plant Microbe Interact. 22 (4), 456-468 (2009).</li>
<li>Raaijmakers, J. M., De Bruijn, I., Nybroe, O., Ongena, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Natural+functions+of+lipopeptides+from+Bacillus+and+Pseudomonas%3A+more+than+surfactants+and+antibiotics%5BTitle%5D)+AND+%22FEMS+Microbiol+Rev%22%5BJournal%5D)">Natural functions of lipopeptides from Bacillus and Pseudomonas: more than surfactants and antibiotics.</a> FEMS Microbiol Rev. 34 (6), 1037-1062 (2010).</li>
<li>vábová, L., Lebeda, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vitro+selection+for+improved+plant+resistance+to+toxin-producing+pathogens%5BTitle%5D)+AND+%22J+Phytopathol%22%5BJournal%5D)">In vitro selection for improved plant resistance to toxin-producing pathogens.</a> J Phytopathol. 153 (1), 52-64 (2005).</li>
<li>Mousa, W. K., Raizada, M. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+diversity+of+antimicrobial+secondary+metabolites+produced+by+fungal+endophytes%3A+an+interdisciplinary+perspective%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">The diversity of antimicrobial secondary metabolites produced by fungal endophytes: an interdisciplinary perspective.</a> Front Microbiol. 4, 65(2013).</li>
<li>Bektas, Y., Eulgem, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synthetic+plant+defense+elicitors%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">Synthetic plant defense elicitors.</a> Front Plant Sci. 5, 804(2015).</li>
<li>Saeed, B., Trujillo, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+immunity-related+oxidative+bursts+by+a+luminol-based+assay%5BTitle%5D)+AND+%22Environ+Responses+Plants%3A+Methods+Protoc%22%5BJournal%5D)">Analysis of immunity-related oxidative bursts by a luminol-based assay.</a> Environ Responses Plants: Methods Protoc. , 339-346 (2022).</li>
<li>Brauer, E. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transcriptional+and+hormonal+profiling+of+Fusarium+graminearum-infected+wheat+reveals+an+association+between+auxin+and+susceptibility%5BTitle%5D)+AND+%22Physiol+Mol+Plant+Pathol%22%5BJournal%5D)">Transcriptional and hormonal profiling of Fusarium graminearum-infected wheat reveals an association between auxin and susceptibility.</a> Physiol Mol Plant Pathol. 107, 33-39 (2019).</li>
<li>Taylor, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+wetting+of+leaf+surfaces%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Opin+Colloid+Interface+Sci%22%5BJournal%5D)">The wetting of leaf surfaces.</a> Curr Opin Colloid Interface Sci. 16 (4), 326-334 (2011).</li>
<li>Mika, A., Boenisch, M. J., Hopff, D., Lüthje, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Membrane-bound+guaiacol+peroxidases+from+maize+%28Zea+mays+L.%29+roots+are+regulated+by+methyl+jasmonate%2C+salicylic+acid%2C+and+pathogen+elicitors%5BTitle%5D)+AND+%22J+Exp+Bot%22%5BJournal%5D)">Membrane-bound guaiacol peroxidases from maize (Zea mays L.) roots are regulated by methyl jasmonate, salicylic acid, and pathogen elicitors.</a> J Exp Bot. 61 (3), 831-841 (2010).</li>
<li>Brauer, E. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transcriptional+profiling+and+genetic+mapping+of+barley+responses+to+bacterial+flagellin%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">Transcriptional profiling and genetic mapping of barley responses to bacterial flagellin.</a> Mol Plant Microbe Interact. 38 (2), 344-352 (2025).</li>
<li>Takáč, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((TALEN-based+HvMPK3+knock-out+attenuates+proteome+and+root+hair+phenotypic+responses+to+flg22+in+barley%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">TALEN-based HvMPK3 knock-out attenuates proteome and root hair phenotypic responses to flg22 in barley.</a> Front Plant Sci. 12, 666229(2021).</li>
<li>Kim, M. G., Macoy, D. M., Lee, J. Y., Cha, J. Y., Kim, W. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interactions+between+plant+immunity%2C+temperature%2C+light%2C+and+circadian+rhythm%5BTitle%5D)+AND+%22J+Plant+Biochem+Physiol%22%5BJournal%5D)">Interactions between plant immunity, temperature, light, and circadian rhythm.</a> J Plant Biochem Physiol. 9, 260(2021).</li>
<li>Bahadoor, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gramillin+A+and+B%3A+cyclic+lipopeptides+identified+as+the+nonribosomal+biosynthetic+products+of+Fusarium+graminearum%5BTitle%5D)+AND+%22J+Am+Chem+Soc%22%5BJournal%5D)">Gramillin A and B: cyclic lipopeptides identified as the nonribosomal biosynthetic products of Fusarium graminearum.</a> J Am Chem Soc. 140 (48), 16783-16791 (2018).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>5-アミノサリチル酸</td><td>ミリポーア・シグマ&nbsp;</td><td>A79809</td><td></td></tr><tr><td>バーナート真空ポンプ</td><td>職人技術グループ</td><td>400-3910</td><td></td></tr><tr><td>COND-905マイクロ伝導率プローブ</td><td>ラザール研究所株式会社</td><td></td><td></td></tr><tr><td>FLG22ペプチド</td><td>アナスペック</td><td>AS-62633</td><td></td></tr><tr><td>インフィニット 200PRO F</td><td>テカン・グループ株式会社</td><td>30190086</td><td></td></tr><tr><td>サーファクチン</td><td>シグマ・オルドリッチ</td><td>S3523</td><td></td></tr><tr><td>T-2毒素</td><td>ケイマン・ケミカル・カンパニー株式会社</td><td>20433</td><td></td></tr></tbody></table>

高スループット形式を用いた微生物二次代謝物に対する葉の応答評価

Evaluating Leaf Responses to Microbial Secondary Metabolites Using A High-Throughput Format

Microbes secrete structurally diverse secondary metabolites during plant infection, some of which are detected by plant cells, which trigger stress ...

evaluating-leaf-responses-to-microbial-secondary-metabolites-using

Research

JoVE Journal

Biology

生物学

我々は、生菌に対する気孔の応答にアクセスするためのシンプルで再現性のプロトコルを開発しました。表皮皮の使用と比較して、この方法では、葉の傷や操作を最小限に抑えることが以前に報告した。...

全葉のイメージングを使用して細菌細胞をライブに気孔反応を評価する

出典: アリ、I.、 他 カ エノラブディティス・エレガン スの健康に影響を与える微生物分離株のハイスループットスクリーニング。 J. Vis. Exp. (2022年)このビデオでは、 Caenorhabditis elegans...

微生物と寄生虫の相互作用を研究するためのハイスループット蛍光アッセイ

植物の細胞壁の構造と化学的特性が評価され、バイオ燃料とバイオマテリアルの理想的な原料を特定します。標準メソッドを大規模なデータセットに適用すると、制限があります。これらのハイスループット前処理法、酵素糖化法、および熱分解分子ビーム質量分析法は、実験時間とコストを削減しながら、大量のバイオマスサンプルを比較します。...

リグノセルロース系バイオマス中の反抗バリエーションのハイスループットスクリーニング：総リグニン、リグニンモノマー、および酵素シュガーリリース

この原稿は、除草剤の代謝率が双子葉植物の雑草から切り出された葉で効果的に定量化され、それによって変動性を減らし、全植物アッセイで一般的に観察される除草剤の取り込みまたは転座の可能性のある交絡効果を取り除く方法を説明しています。...

摘出葉のアッセイで双子葉雑草除草剤代謝の速度を測定します

ここでは、液体クロマトグラフィーおよび質量分析を介して、 黄色ブドウ球菌およびそれらのその後の分析からの代謝産物を抽出するためのプロトコルを記載します。...

代謝産物分析のためのタンデム液体クロマトグラフィー - 質量分析に基づくアプローチ<em&gt;黄色ブドウ球菌</em

単純な汎用性、および低コストの in vitro水耕システムが正常に最適化されて、無菌条件下で大規模な実験を有効にします。このシステム...

無菌状態で小さな分子に対する植物の反応を評価するための柔軟な低コスト化の養液栽培システム

リーフ スプレー質量分析: 植物組織由来の代謝産物を直接評価するの急速な周囲のイオン化法

このプロトコルでは、相補的な分析とオミックス技術の天然有機物と異なる生態系における微生物のプロテオミクスの完全にペアの特性で最高潮に達する単一のスループットについて説明します。この方法は、代謝と環境変化への応答を予測する温室効果ガス生産を記述するため重要な変換を識別するための堅牢な比較を許可します。...

シングル スループット複雑な天然有機物の混合物の評価の補完的な高解像度分析の手法

提示された方法は、ジャガイモの剥離葉にマンドゥカセクスタ幼虫の適用を通じて自然な手持ちの損傷植物組織を作成します。植物組織は、昆虫のハーブに対する早期応答に関与する6つの転写因子ホモロの発現のためにアッセイされる。...

噛む昆虫マンドゥカセクスタによる侵入時のジャガイモの遺伝子発現研究を簡素化する剥離葉アッセイ

このプロトコルで提示される共培養相互作用アッセイは、安価で高いスループットとシンプルです。これらのアッセイは、共培養における微生物相互作用を観察し、相互作用パターンを同定し、ヒトおよび環境病原体に対する関心のある微生物株の阻害可能性を特徴付けるために使用することができる。...

微生物相互作用の調査のための高スループット共培養アッセイ

質量分析誘導ゲノムマイニングプロトコルが確立され、ここに記載されています。ゲノム配列情報とLC-MS/MS解析に基づき、複雑な微生物や植物抽出物からの分子の同定を容易にすることを目的としています。...

新しい天然物を発見するためのツールとしての質量分析誘導ゲノムマイニング

学ぶ高スループット法による植物イオン漏出・ペルオキシダーゼ活性・カロース産生の同時評価。微生物二次代謝物を用いたストレス応答解析で、限られた試料を効率的に活用し、作物耐性向上研究に貢献します。

高スループット形式を用いた微生物二次代謝物に対する葉の応答評価

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