Name: クロマチンおよびエピジェネティック老化の画像バイオマーカーを用いた単細胞老化の測定 (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-01-30T13:15:00.000+00:00
Duration: 9 min 10 s
Description: 学ぶImAge技術による単細胞解像度でのクロマチン・エピジェネティック老化の定量化。画像解析と計算ワークフローを用いて、非破壊的かつ大規模・縦断研究に適した生物学的年齢推定法を確立します。

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<ol><li>Alvarez-Kuglen, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ImAge+quantitates+aging+and+rejuvenation%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Aging%22%5BJournal%5D)">ImAge quantitates aging and rejuvenation.</a> Nat Aging. 4, 1308-1327 (2024).</li>
<li>Zampino, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biomarkers+of+aging+in+real+life%3A+three+questions+on+aging+and+the+comprehensive+geriatric+assessment%5BTitle%5D)+AND+%22GeroScience%22%5BJournal%5D)">Biomarkers of aging in real life: three questions on aging and the comprehensive geriatric assessment.</a> GeroScience. 44 (6), 2611-2622 (2022).</li>
<li>Moqri, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biomarkers+of+aging+for+the+identification+and+evaluation+of+longevity+interventions%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Biomarkers of aging for the identification and evaluation of longevity interventions.</a> Cell. 186 (18), 3758-3775 (2023).</li>
<li>Bell, C. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+methylation+aging+clocks%3A+challenges+and+recommendations%5BTitle%5D)+AND+%22Genome+Biol%22%5BJournal%5D)">DNA methylation aging clocks: challenges and recommendations.</a> Genome Biol. 20 (1), 249(2019).</li>
<li>Horvath, S., Raj, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+methylation-based+biomarkers+and+the+epigenetic+clock+theory+of+ageing%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Genet%22%5BJournal%5D)">DNA methylation-based biomarkers and the epigenetic clock theory of ageing.</a> Nat Rev Genet. 19 (6), 371-384 (2018).</li>
<li>Field, A. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+methylation+clocks+in+aging%3A+Categories%2C+causes%2C+and+consequences%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell%22%5BJournal%5D)">DNA methylation clocks in aging: Categories, causes, and consequences.</a> Mol Cell. 71 (6), 882-895 (2018).</li>
<li>Galow, A. M., Peleg, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((How+to+slow+down+the+ticking+clock%3A+Age-associated+epigenetic+alterations+and+related+interventions+to+extend+life+span%5BTitle%5D)+AND+%22Cells%22%5BJournal%5D)">How to slow down the ticking clock: Age-associated epigenetic alterations and related interventions to extend life span.</a> Cells. 11 (3), 468(2022).</li>
<li>Westneat, D. F., Wright, J., Dingemanse, N. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+biology+hidden+inside+residual+within-individual+phenotypic+variation%5BTitle%5D)+AND+%22Biol+Rev+Camb+Philos+Soc%22%5BJournal%5D)">The biology hidden inside residual within-individual phenotypic variation.</a> Biol Rev Camb Philos Soc. 90 (3), 729-743 (2015).</li>
<li>Lähnemann, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Eleven+grand+challenges+in+single-cell+data+science%5BTitle%5D)+AND+%22Genome+Biol%22%5BJournal%5D)">Eleven grand challenges in single-cell data science.</a> Genome Biol. 21 (1), 31(2020).</li>
<li>Ninomiya, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ImAge%3A+quantifying+epigenetic+ageing+with+single-cell+images%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Cancer%22%5BJournal%5D)">ImAge: quantifying epigenetic ageing with single-cell images.</a> Nat Rev Cancer. 25, 755(2025).</li>
<li>Stepanov, A. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genetically+encoded+epigenetic+sensors+for+visualization+of+H3K9me3%2C+H3K9ac+and+H3K4me1+histone+modifications+in+living+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Biochem+Biophys+Res+Commun%22%5BJournal%5D)">Genetically encoded epigenetic sensors for visualization of H3K9me3, H3K9ac and H3K4me1 histone modifications in living cells.</a> Biochem Biophys Res Commun. 733, 150715(2024).</li>
<li>Farhy, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improving+drug+discovery+using+image-based+multiparametric+analysis+of+the+epigenetic+landscape%5BTitle%5D)+AND+%22Elife%22%5BJournal%5D)">Improving drug discovery using image-based multiparametric analysis of the epigenetic landscape.</a> Elife. 8, e49683(2019).</li>
<li>ImAge_workflow. , 
 <a target="_blank" href="https://github.com/terskikh-lab/ImAge_workflow">https://github.com/terskikh-lab/ImAge_workflow</a> (2025).</li>
<li>Chondronasiou, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multi-omic+rejuvenation+of+naturally+aged+tissues+by+a+single+cycle+of+transient+reprogramming%5BTitle%5D)+AND+%22Aging+Cell%22%5BJournal%5D)">Multi-omic rejuvenation of naturally aged tissues by a single cycle of transient reprogramming.</a> Aging Cell. 21 (3), e13578(2022).</li>
<li>Linkert, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Metadata+matters%3A+access+to+image+data+in+the+real+world%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Metadata matters: access to image data in the real world.</a> J Cell Biol. 189 (5), 777-782 (2010).</li>
<li>The Open Microscopy Environment. , bioformats. 
 <a target="_blank" href="https://github.com/ome/bioformats">https://github.com/ome/bioformats</a> (2025).</li>
<li>González-Ramírez, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Differential+contribution+to+gene+expression+prediction+of+histone+modifications+at+enhancers+or+promoters%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Comput+Biol%22%5BJournal%5D)">Differential contribution to gene expression prediction of histone modifications at enhancers or promoters.</a> PLoS Comput Biol. 17 (9), e1009368(2021).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>牛血清アルブミン</td><td>シグマ・オルドリッチ&nbsp;</td><td>A9647</td><td></td></tr><tr><td>ドンキー抗マウスIgG(H+L)高度に交差吸着した二次抗体、Alexa 488&nbsp;</td><td>インビトロジェン</td><td>A-21202</td><td></td></tr><tr><td>ドンキー抗ウサギIgG(H+L)高交差吸着二次抗体、Alexa 555</td><td>インビトロジェン</td><td>A-31572</td><td></td></tr><tr><td>グリシン</td><td>バイオ・ラッド</td><td>161-0718</td><td></td></tr><tr><td>ヒストンH3K27ac抗体(mAb)&nbsp;</td><td>アクティブモチーフ</td><td>39685</td><td></td></tr><tr><td>ヒストンH3K27me3抗体(pAb)&nbsp;</td><td>アクティブモチーフ</td><td>39155</td><td></td></tr><tr><td>ホエヒスト 33342</td><td>インビトロジェン</td><td>H3570</td><td></td></tr><tr><td>核分離キット:核 EZ 準備</td><td>シグマ・オルドリッチ</td><td>NUC101</td><td></td></tr><tr><td>オペレッタ CLS ハイコンテンクトイメージャー</td><td>リヴヴィティ</td><td>https://www.revvity.com/au-en/product/operetta-cls-system-hh16000020</td><td></td></tr><tr><td>パラホルマルデヒド 16%水溶液 EMグレード</td><td>電子顕微鏡科学</td><td>15710-S</td><td></td></tr><tr><td>PBS</td><td>サーモ・フィッシャー</td><td>AM9624</td><td></td></tr><tr><td>フェノプレート384ウェル・マイクロプレート</td><td>リヴヴィティ</td><td>6057302</td><td></td></tr><tr><td>トリトン-X</td><td>シグマ</td><td>T8787</td><td></td></tr><tr><td>トリパンブルー溶液、0.4%&nbsp;</td><td>Gibco&nbsp;</td><td>15250061&nbsp;</td><td></td></tr></tbody></table>

クロマチンおよびエピジェネティック老化の画像バイオマーカーを用いた単細胞老化の測定

Measuring Single-Cell Aging with an Imaging-based Biomarker of Chromatin and Epigenetic Aging

To advance personalized healthcare and assess potential rejuvenation strategies, biomarkers reflecting biological age are crucial. We have introduced ...

measuring-single-cell-aging-with-an-imaging-based-biomarker-chromatin

Research

JoVE Journal

Biology

生物学

我々は、光退色後蛍光回復（FRAP）や胚性幹（ES）細胞におけるクロマチン蛋白質の動態を監視する（FLIP）光退色で蛍光の損失を含む光退色の方法を説明します。クロマチン可塑性を研究する手段の一つであると考えられているクロマチン蛋白質のダイナミクスは、多能性細胞で強化されています。...

胚性幹細胞を生体内でクロマチン蛋白質のダイナミクスを測定するアッセイ（FRAP＆FLIP）を光退色

この記事では、マイクロ流体チップの生産と寿命と、単一の酵母細胞の細胞表現型を測定するためのマイクロ流体実験のセットアップのために最適化されたプロトコルを提示します。...

シングル出芽酵母細胞での寿命と細胞表現型を測定するためのマイクロ流体デバイスを使用しました

細胞老化、細胞周期停止の不可逆的な状態は、様々な細胞ストレスによって誘導することができます。ここでは、老化のマーカーを評価するために、細胞の老化や方法を誘導するためにプロトコルを記述します。...

誘導および定量化細胞老化するテクニック

ここでは、一連の誘発のためのプロトコルおよび培養細胞の細胞老化の検証について述べる。私たちはさまざまな老化を誘発する刺激に焦点を当てるし、一般的な老化関連マーカーの定量化を記述します。私たちはモデルとして線維芽細胞を使用して技術的な詳細を提供するが、プロトコルは、さまざまな携帯電話モデルに合わせることができます。...

ひと初代細胞における細胞老化の誘導性

細胞老化は、慢性加齢病理の発症における重要な因子である。老化細胞を標的とする治療薬の同定は、健康な老化を延長する約束を示す。ここでは、単一細胞における老化関連β-ガラクトシダーゼ活性の測定に基づくセノセラピューティクスの同定をスクリーニングするための新規アッセイを提示する。...

セノ治療薬同定のためのSA-β-ガラクトーシダーゼベーススクリーニングアッセイ

ここでは、スピンドル形成と人工的進行のダイナミクスを評価するプロトコルを提示する。当社のタイムラプスイメージングの応用により、ユーザーは、人芽細胞の様々な段階で細胞を同定し、人芽細胞の欠陥を追跡および同定し、抗マイト薬への曝露時にスピンドルダイナミクスと人工細胞の運命を分析することができます。...

水動紡錘摂動後のメタフェイズタイミングと細胞運命のダイナミクスを評価するライブ細胞イメージング

本プロトコルは、再利用可能な単一細胞を用いた反復エピゲノム解析のための単一細胞法を記載する。再利用可能なシングルセルにより、同じシングルセル内の複数のエピジェネティックマークの分析と結果の統計的検証が可能になります。...

反復エピゲノム解析のための再利用可能な単一細胞

ここでは、単一細胞における複数の老化関連マーカーの可視化および定量化のためのフローサイトメトリーベースの方法を提示する。...

治療誘発性老化癌細胞における複数の蛍光老化マーカーの同時イメージングおよびフローサイトメトリーベースの検出

多重免疫蛍光は、単一の組織切片内で複数の抗体マーカーを逐次標識し、組織構造や細胞集団の空間解析を支援します。ここでは、老化に関連する構造的および免疫マーカーの多重検出のためのワークフローを紹介し、手動および自動スライド準備、反復画像診断、デジタル病理ソフトウェアを用いた単細胞解析を含みます。...

生体内での老化マーカーの空間評価のための多重免疫蛍光アッセイ

本記事では、IMR-90ヒト線維芽細胞における老化期のリソソーム再構築を測定するための生細胞LysoTrackerプロトコルを紹介します。...

ヒト線維芽細胞における細胞老化の定量的評価のためのLysoTrackerを用いたリソソームプロファイリング

このプロセスは、シ ロイナ ナの蛍光標識核およびクロマチンマーカーラインと共焦点顕微鏡を用いて、シロイ ナナ...

シロイナ根における発生および環境ストレスにおける核形状とクロマチン動態の定量的ライブセルイメージング

学ぶImAge技術による単細胞解像度でのクロマチン・エピジェネティック老化の定量化。画像解析と計算ワークフローを用いて、非破壊的かつ大規模・縦断研究に適した生物学的年齢推定法を確立します。

クロマチンおよびエピジェネティック老化の画像バイオマーカーを用いた単細胞老化の測定

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