Name: パラホルマルデヒド固定マウス肝組織のレーザーキャプチャ顕微解剖によるRNA解析 (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-04-17T12:33:00.000+00:00
Duration: 9 min 21 s
Description: 学ぶレーザーキャプチャ顕微解剖法によるパラホルマルデヒド固定マウス肝組織からの高品質RNA抽出技術。特定細胞集団を精密に分離し、qPCRやRNAシーケンス解析に適した転写体解析を可能にする。

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<ol><li>Shapiro, E., Biezuner, T., Linnarsson, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+sequencing-based+technologies+will+revolutionize+whole-organism+science%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Genet%22%5BJournal%5D)">Single-cell sequencing-based technologies will revolutionize whole-organism science.</a> Nat Rev Genet. 14 (9), 618-630 (2013).</li>
<li>Halpern, K. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+spatial+reconstruction+reveals+global+division+of+labour+in+the+mammalian+liver%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Single-cell spatial reconstruction reveals global division of labour in the mammalian liver.</a> Nature. 543 (7647), 352-356 (2017).</li>
<li>Aizarani, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+human+liver+cell+atlas+reveals+heterogeneity+and+epithelial+progenitors%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">A human liver cell atlas reveals heterogeneity and epithelial progenitors.</a> Nature. 572 (7768), 199-204 (2019).</li>
<li>Van Den Brink, S. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+sequencing+reveals+dissociation-induced+gene+expression+in+tissue+subpopulations%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Single-cell sequencing reveals dissociation-induced gene expression in tissue subpopulations.</a> Nat Methods. 14 (10), 935-936 (2017).</li>
<li>Baron, C. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+Type+Purification+by+Single-Cell+Transcriptome-Trained+Sorting%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Cell Type Purification by Single-Cell Transcriptome-Trained Sorting.</a> Cell. 179 (2), 527-542.e19 (2019).</li>
<li>Gross, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Technologies+for+Single-Cell+Isolation%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Mol+Sci%22%5BJournal%5D)">Technologies for Single-Cell Isolation.</a> Int J Mol Sci. 16 (8), 16897-16919 (2015).</li>
<li>Dries, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advances+in+spatial+transcriptomic+data+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Genome+Res%22%5BJournal%5D)">Advances in spatial transcriptomic data analysis.</a> Genome Res. 31 (10), 1706-1718 (2021).</li>
<li>Chen, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spatiotemporal+transcriptomic+atlas+of+mouse+organogenesis+using+DNA+nanoball-patterned+arrays%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using DNA nanoball-patterned arrays.</a> Cell. 185 (10), 1777-1792.e21 (2022).</li>
<li>Ståhl, P. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualization+and+analysis+of+gene+expression+in+tissue+sections+by+spatial+transcriptomics%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Visualization and analysis of gene expression in tissue sections by spatial transcriptomics.</a> Science. 353 (6294), 78-82 (2016).</li>
<li>Espina, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Laser-capture+microdissection%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">Laser-capture microdissection.</a> Nat Protoc. 1 (2), 586-603 (2006).</li>
<li>Baba, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gene+expression+profiling+in+biliary+epithelial+cells+of+primary+biliary+cirrhosis+using+laser+capture+microdissection+and+cDNA+microarray%5BTitle%5D)+AND+%22Transl+Res%22%5BJournal%5D)">Gene expression profiling in biliary epithelial cells of primary biliary cirrhosis using laser capture microdissection and cDNA microarray.</a> Transl Res. 148 (3), 103-113 (2006).</li>
<li>Mena, J. E. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Laser+capture+microdissection+after+%CE%B3-glutamyl+transferase+histochemistry%3A+An+optimization+for+gene+expression+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Biochem%22%5BJournal%5D)">Laser capture microdissection after γ-glutamyl transferase histochemistry: An optimization for gene expression analysis.</a> Anal Biochem. 447, 126-132 (2014).</li>
<li>Liu, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Next-generation+RNA+Sequencing+of+Archival+Formalin-fixed+Paraffin-embedded+Urothelial+Bladder+Cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Eur+Urol%22%5BJournal%5D)">Next-generation RNA Sequencing of Archival Formalin-fixed Paraffin-embedded Urothelial Bladder Cancer.</a> Eur Urol. 66 (6), 982-986 (2014).</li>
<li>Ludyga, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nucleic+acids+from+long-term+preserved+FFPE+tissues+are+suitable+for+downstream+analyses%5BTitle%5D)+AND+%22Virchows+Arch%22%5BJournal%5D)">Nucleic acids from long-term preserved FFPE tissues are suitable for downstream analyses.</a> Virchows Arch. 460 (2), 131-140 (2012).</li>
<li>Mägel, L., Bartels, S., Lehmann, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Next-Generation+Sequencing+Analysis+of+Laser-Microdissected+Formalin-Fixed+and+Paraffin-Embedded+%28FFPE%29+Tissue+Specimens%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Next-Generation Sequencing Analysis of Laser-Microdissected Formalin-Fixed and Paraffin-Embedded (FFPE) Tissue Specimens.</a> Methods Mol Biol. 1723, 111-118 (2018).</li>
<li>Von Ahlfen, S., Missel, A., Bendrat, K., Schlumpberger, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Determinants+of+RNA+Quality+from+FFPE+Samples%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Determinants of RNA Quality from FFPE Samples.</a> PLoS One. 2 (12), e1261(2007).</li>
<li>Böhm, M., Wieland, I., Schütze, K., Rübben, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microbeam+MOMeNT%3A+non-contact+laser+microdissection+of+membrane-mounted+native+tissue%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Pathol%22%5BJournal%5D)">Microbeam MOMeNT: non-contact laser microdissection of membrane-mounted native tissue.</a> Am J Pathol. 151 (1), 63-67 (1997).</li>
<li>Schütze, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cut+out+or+poke+in--the+key+to+the+world+of+single+genes%3A+laser+micromanipulation+as+a+valuable+tool+on+the+look-out+for+the+origin+of+disease%5BTitle%5D)+AND+%22Genet+Anal%22%5BJournal%5D)">Cut out or poke in--the key to the world of single genes: laser micromanipulation as a valuable tool on the look-out for the origin of disease.</a> Genet Anal. 14 (1), 1-8 (1997).</li>
<li>Datta, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Laser+capture+microdissection%3A+Big+data+from+small+samples%5BTitle%5D)+AND+%22Histol+Histopathol%22%5BJournal%5D)">Laser capture microdissection: Big data from small samples.</a> Histol Histopathol. 30 (11), 1255-1269 (2015).</li>
<li>Desjardins, P., Conklin, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((NanoDrop+microvolume+quantitation+of+nucleic+acids%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">NanoDrop microvolume quantitation of nucleic acids.</a> J Vis Exp. (45), e2565(2010).</li>
<li>Ge, S. J., Gan, W. Q., Karlinsey, K., Zhou, B. Y., Pachter, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Immuno-laser+capture+microdissection+of+perfusion-fixed+mouse+brain+tissue+coupled+to+RNA-seq%5BTitle%5D)+AND+%22J+Neurosci+Methods%22%5BJournal%5D)">Immuno-laser capture microdissection of perfusion-fixed mouse brain tissue coupled to RNA-seq.</a> J Neurosci Methods. 423, 110548(2025).</li>
<li>Takahashi, K., Beltran, W. A., Sudharsan, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+optimized+workflow+for+transcriptomic+analysis+from+archival+paraformaldehyde-fixed+retinal+tissues+collected+by+laser+capture+microdissection%5BTitle%5D)+AND+%22Exp+Eye+Res%22%5BJournal%5D)">An optimized workflow for transcriptomic analysis from archival paraformaldehyde-fixed retinal tissues collected by laser capture microdissection.</a> Exp Eye Res. 246, 109989(2024).</li>
<li>Mahalingam, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Laser+Capture+Microdissection%3A+Insights+into+Methods+and+Applications%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Laser Capture Microdissection: Insights into Methods and Applications.</a> Methods Mol Biol. 1723, 1-17 (2018).</li>
<li>Kim, S. O., Kim, J., Okajima, T., Cho, N. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mechanical+properties+of+paraformaldehyde-treated+individual+cells+investigated+by+atomic+force+microscopy+and+scanning+ion+conductance+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Nano+Converg%22%5BJournal%5D)">Mechanical properties of paraformaldehyde-treated individual cells investigated by atomic force microscopy and scanning ion conductance microscopy.</a> Nano Converg. 4 (1), (2017).</li>
<li>Erickson, H. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantitative+RT-PCR+gene+expression+analysis+of+laser+microdissected+tissue+samples%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">Quantitative RT-PCR gene expression analysis of laser microdissected tissue samples.</a> Nat Protoc. 4 (6), 902-922 (2009).</li>
<li>Pan, D. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Laser+Capture+Microdissection-Based+RNA+Microsequencing+Reveals+Optic+Nerve+Crush-Related+Early+mRNA+Alterations+in+Retinal+Ganglion+Cell+Layer%5BTitle%5D)+AND+%22Transl+Vis+Sci+Technol%22%5BJournal%5D)">Laser Capture Microdissection-Based RNA Microsequencing Reveals Optic Nerve Crush-Related Early mRNA Alterations in Retinal Ganglion Cell Layer.</a> Transl Vis Sci Technol. 9 (11), 30(2020).</li>
<li>Civita, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Laser+Capture+Microdissection+and+RNA-Seq+Analysis%3A+High+Sensitivity+Approaches+to+Explain+Histopathological+Heterogeneity+in+Human+Glioblastoma+FFPE+Archived+Tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Oncol%22%5BJournal%5D)">Laser Capture Microdissection and RNA-Seq Analysis: High Sensitivity Approaches to Explain Histopathological Heterogeneity in Human Glioblastoma FFPE Archived Tissues.</a> Front Oncol. 9, 482(2019).</li>
<li>Phan, H. V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+RNA+sequencing+of+paraformaldehyde-fixed+single+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">High-throughput RNA sequencing of paraformaldehyde-fixed single cells.</a> Nat Commun. 12 (1), 5636(2021).</li>
<li>Thomsen, E. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fixed+single-cell+transcriptomic+characterization+of+human+radial+glial+diversity%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Fixed single-cell transcriptomic characterization of human radial glial diversity.</a> Nat Methods. 13 (1), 87-93 (2016).</li>
<li>Lin, X. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+comparative+analysis+of+RNA+sequencing+methods+with+ribosome+RNA+depletion+for+degraded+and+low-input+total+RNA+from+formalin-fixed+and+paraffin-embedded+samples%5BTitle%5D)+AND+%22Bmc+Genomics%22%5BJournal%5D)">A comparative analysis of RNA sequencing methods with ribosome RNA depletion for degraded and low-input total RNA from formalin-fixed and paraffin-embedded samples.</a> Bmc Genomics. 20 (1), 831(2019).</li>
<li>Luzzi, V., Mahadevappa, M., Raja, R., Warrington, J. A., Watson, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Accurate+and+reproducible+gene+expression+profiles+from+laser+capture+microdissection%2C+transcript+amplification%2C+and+high+density+oligonucleotide+microarray+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mol+Diagn%22%5BJournal%5D)">Accurate and reproducible gene expression profiles from laser capture microdissection, transcript amplification, and high density oligonucleotide microarray analysis.</a> J Mol Diagn. 5 (1), 9-14 (2003).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td><ストロング>マテリアル<ストロング></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>0.2 ml 薄壁チューブ</td><td>アクシゲン</td><td>PCR-02-C</td><td>LCM収集用の管</td></tr><tr><td>1.5 mL遠心分離機チューブ</td><td>アクシゲン</td><td>339653</td><td></td></tr><tr><td>4% パラホルムアルデヒド</td><td>レーゲン</td><td>DF0135</td><td></td></tr><tr><td>50 mL遠心分離機チューブ</td><td>サーモフィッシャー・サイエンティフィック</td><td>339653</td><td></td></tr><tr><td>DEPC(ジエチルピロカーボネート)</td><td>シグマ</td><td>D-5758</td><td></td></tr><tr><td>DNase I 消化セット</td><td>キアゲン</td><td>73504</td><td>RNeasy FFPEキットのコンポーネントには、DNase Iストック溶液とDNaseブースターバッファーが含まれています</td></tr><tr><td>エタノール(100%)</td><td>サーモフィッシャー・サイエンティフィック</td><td>BP2818</td><td>分子生物学用に精製</td></tr><tr><td>エタノール系洗浄バッファー</td><td>キアゲン</td><td>73504</td><td>バッファRPE(RNeasy FFPEキットのコンポーネント)</td></tr><tr><td>高塩水洗浄バッファー</td><td>キアゲン</td><td>73504</td><td>バッファRBC(RNeasy FFPEキットのコンポーネント)</td></tr><tr><td>ロープロファイルミクロトームブレード</td><td>ライカ・バイオシステムズ</td><td>819</td><td></td></tr><tr><td>マイヤー」Sヘマトキシリン</td><td>レーゲン</td><td>DH0001</td><td></td></tr><tr><td>OCTコンパウンド</td><td>さくら</td><td>4583</td><td></td></tr><tr><td>PEN膜コーティングスライド</td><td>ライカ</td><td>11505188</td><td></td></tr><tr><td>リン酸塩緩衝塩水</td><td>レーゲン</td><td>CC0010</td><td>DNase/RNaseフリー</td></tr><tr><td>ポリLリジン</td><td>マックリン</td><td>P875131S</td><td></td></tr><tr><td>プロテナゼK消化バッファー</td><td>キアゲン</td><td>73504</td><td>バッファーPKD(RNeasy FFPEキットのコンポーネント)</td></tr><tr><td>精製柱</td><td>キアゲン</td><td>73504</td><td>RNeasy MinEluteスピンカラム(RNeasy FFPEキットの部品)</td></tr><tr><td>定量PCRマスターミックス</td><td>タカラバイオ</td><td>RR820A</td><td>TB グリーンプレミックス Ex Taq II(Tli RNaseH Plus)</td></tr><tr><td>逆転記キット</td><td>キアゲン</td><td>205411</td><td>QuantiNova 逆転写キット</td></tr><tr><td>RNA抽出キット</td><td>キアゲン</td><td>73504</td><td>RNeasy FFPEキット</td></tr><tr><td>RNAシーケンシングキット(低入力、鎖状)</td><td>タカラバイオ</td><td>634412</td><td>SMARTerストランドトータルRNA-seqキット - ピコ入力哺乳類V2</td></tr><tr><td>RNase除染剤</td><td>ソーラービオ</td><td>SR0040</td><td>清掃</td></tr><tr><td>ショ糖</td><td>マックリン</td><td>S818049</td><td></td></tr><tr><td><ストロング・アンド・アニマルズ>ダイエット</ストロング></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>マウス:C57BL/6J</td><td>広東省実験動物センター</td><td>03</td><td></td></tr><tr><td><ストロング>特別な食事と飲み水<強い></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>高脂肪・コリン欠乏食(ベースダイエット)</td><td>トロフィック動物飼料ハイテク株式会社</td><td>TP36310M</td><td>マクロ栄養素:タンパク質、14kcal%;炭水化物:26 kcal%;脂肪、60 kcal)</td></tr><tr><td>砂糖補助飲料水</td><td>マックリン</td><td>該当なし(社内準備)</td><td>D-グルコース(Macklin, Cat# F87500)とD-フルクトース(Macklin, Cat# S818049)の混合物が、最終濃度42 g/Lでオートクレーブされた飲料水に加えられ、グルコース対果糖の比率は55:45(w/w)でした</td></tr><tr><td>マウスプライマー</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>&beta;-actin(前書き:AGAGGGAAATCGTGGTGGTGAC)</td><td>BGIシーケンシング</td><td>カスタム</td><td>HPLC精製</td></tr><tr><td>&beta;-actin (逆:CAATAGTGATGACCTGGCCGT)</td><td>BGIシーケンシング</td><td>カスタム</td><td>HPLC精製</td></tr><tr><td><ストロング>装備</ストロング></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>クライオスタットマイクロトーム</td><td>ライカ・バイオシステムズ</td><td>CM3050 S</td><td></td></tr><tr><td>バイオアナライザーシステム</td><td>アジレント</td><td>G2939BA</td><td></td></tr><tr><td>ハイスループットシーケンシングプラットフォーム</td><td>イルミナ;Inc.</td><td>NovaSeq 6000システム</td><td></td></tr><tr><td>レーザーキャプチャマイクロディセクレーションシステム</td><td>ライカ・マイクロシステムズ</td><td>ライカLMD6500</td><td></td></tr><tr><td>定量PCRシステム</td><td>応用バイオシステム</td><td>QuantStudio 5 リアルタイムPCRシステム</td><td></td></tr><tr><td>分光光度計</td><td>サーモフィッシャー・サイエンティフィック</td><td>NP80</td><td>ナノドロップ</td></tr><tr><td>サーマルサイクラー</td><td>バイオラッド</td><td>T100</td><td></td></tr><tr><td>Software</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Adobe Illustrator CC 2019(バージョン 23.0.2)</td><td>アドビ</td><td>https://www.adobe.com/products/illustrator.html</td><td></td></tr><tr><td>GraphPad プリズム(バージョン 8.3.0)</td><td>GraphPadソフトウェア</td><td>https://www.graphpad.com</td><td></td></tr></tbody></table>

パラホルマルデヒド固定マウス肝組織のレーザーキャプチャ顕微解剖によるrna解析

Laser Capture Microdissection of Paraformaldehyde-Fixed Mouse Liver Tissue for RNA Analysis

パラホルマルデヒド固定マウス肝組織のレーザーキャプチャ顕微解剖によるRNA解析

Laser capture microdissection (LCM) provides spatial access to specific cell populations within complex tissues through in situ visualization and ...

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JoVE Journal

Biology

生物学

マウス脳の特定の領域におけるRNA発現プロファイリングには、正確で再現性のある組織採取戦略が必要です。ここでは、冠状断による脳切断と組織コーラーを用いたマイクロダイセクションの両方を併用するプロトコルについて説明します。得られたサンプルから抽出した全RNAの収量と品質により、本手法の有用性が確認されています。...

トータルRNAの単離およびダウンストリーム次世代シーケンシングと遺伝子発現プロファイリングのための離散マウスの脳領域のマイクロダイセクションのための非レーザーキャプチャー顕微鏡のアプローチ

特定の組織中の細胞のサブセットの遺伝子発現解析は、主要な課題である。この記事では、レーザーキャプチャーマイクロダイセクションで迅速な免疫標識法を組み合わせることにより、特定の細胞集団から高品質のトータルRNAを分離する方法について説明します。...

迅速な免疫標識と合わせてレーザーキャプチャーマイクロダイセクションを使用して、細胞特異的な亜集団からのRNAの単離

ここでは、定量的リアルタイムPCR(RT-PCR)およびin...

前立腺癌臨床組織におけるmiRNA発現解析

このプロトコルの目標は、下流のRNA分析のために不均一な前立腺組織から純粋な細胞型の集団を分離する効果的な方法として、レーザーキャプチャーマイクロダイセクションを使用することです。...

RNA分析のためのヒト前立腺上皮のレーザーキャプチャーマイクロダイセクション

ここでは、下流の RNA 解析のための小柱網 (TM) を隔離するため再現性のあるレーザー キャプチャ レーザーマイクロダイ セクション (LCM) のためのプロトコルについて述べる.TM での遺伝子発現の変化を分析する能力は、TM...

遺伝子発現解析のためのマウスの目から非常に純粋な小柱網のキャプチャ マイクロダイゼクション

フローサイトメトリーを必要としない固定/凍結保存組織サンプル内で、肝細胞数および核プロイドの変化を測定するための堅牢で費用対効果の高い柔軟な方法を提示します。私たちのアプローチは、肝臓の損傷や病気の進行を追跡するのに理想的な肝臓細胞学の強力なサンプル全体の署名を提供します。...

マウスにおける肝細胞核プロイドの推定に対するSitu法におけるハイスループット

骨細胞の遺伝子発現解析に十分な量の高品質RNAを得るために、レーザー捕捉微細解剖(LCM)プロトコルが開発されました。現在の研究は、マウス大腿骨のセクションに焦点を当てています。しかしながら、ここで報告されるLCMプロトコルは、任意の硬質組織の細胞における遺伝子発現を研究するために使用することができる。...

新鮮な凍結マウスの骨から高品質のRNAを得るレーザー捕捉微解剖プロトコル

リボソームアフィニティ精製(TRAP)の翻訳により、細胞型特異的翻訳mRNAの迅速かつ効率的な単離が可能になります。ここでは、肝再集団とTRAPのマウスモデルにおける流体力学的尾静脈注射を組み合わせた方法を示し、再入発性肝細胞の発現プロファイルを調べる。...

マウス肝臓における細胞型特異的遺伝子発現プロファイリング

このプロトコルは、マウス胚の新鮮な凍結切片から軟骨および骨を分離するためのレーザー捕捉マイクロセクションを記述する。軟骨および骨はクレシルバイオレット染色によって急速に視覚化され、正確に集めることができるので、トランスクリプト工学的分析のための高品質のRNAを得ることができます。...

遺伝子発現解析のためのマウス胚軟骨と骨のレーザー捕捉微小分片

レーザーマイクロディション(LMD)は、グリオーマの不均一性と侵入を媒介する経路を明らかにするために使用できる、敏感で再現性の高い技術です。ここでは、レーザーLMDを用いて、トランスクリプトーム解析を用いて、グリオーマ組織から離散領域を分離するための最適化されたプロトコルについて述べている。...

腫瘍性異種性、オンコストリーム、および浸潤の空間・分子特性解析のための神経膠腫部分領域のレーザー捕捉微小切除

ここに示されているのが、植物組織のレーザー捕捉マイクロ解剖(LCM)のプロトコルです。LCMは、汚染のない方法で組織の領域を単離するための顕微鏡的な技術です。手順は、組織固定、パラフィン埋め込み、切片、LCMおよびRNA抽出を含む。RNAは、下流組織特異的な、一時的に分解されたトランスクリプトムの分析に使用される。...

植物における空間的および時間的組織特異的な遺伝子発現解析のためのレーザー捕捉マイクロ解離RNAシーケンシング

学ぶレーザーキャプチャ顕微解剖法によるパラホルマルデヒド固定マウス肝組織からの高品質RNA抽出技術。特定細胞集団を精密に分離し、qPCRやRNAシーケンス解析に適した転写体解析を可能にする。

パラホルマルデヒド固定マウス肝組織のレーザーキャプチャ顕微解剖によるRNA解析

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