Name: マッピングミクグリアパラメータソフトウェア(MMPS):定量的なミクログリア形態分析のためのオープンソースで使いやすいツール (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-07-24T12:55:00.000+00:00
Duration: 8 min 35 s
Description: 学ぶMMPSを用いたミクログリア形態の定量的解析手法。Pythonベースのオープンソースツールで、免疫蛍光画像から単細胞レベルの形態変化を検出し、神経炎症研究の再現性を向上させます。

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<table><tbody><tr><td>12ウェルプレート</td><td>Fisher Scientific</td><td>07-200-82</td><td>組織切片のインキュベーションと洗浄に使用するプレート。</td></tr><tr><td>アルミニウム箔</td><td>Fisher Scientific</td><td>01-213-101</td><td>蛍光サンプルを光線から保護するために使用。</td></tr><tr><td>抗原回収バッファー（10×）</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>00-4955-58</td><td>免疫蛍光染色中の抗原アクセシビリティを向上させるために使用。</td></tr><tr><td>抗Iba1一次抗体</td><td>FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation</td><td>019-19741</td><td>ミクログリアの免疫蛍光ラベリングに使用する一次抗体。</td></tr><tr><td>凍結切片機</td><td>Fisher Scientific</td><td>95-710-0L</td><td>凍結脳組織を定義された厚さで切片するために使用する機器。</td></tr><tr><td>ウサギ抗体に対するヤギIgG、Alexa Fluor 555</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>A-21428</td><td>ウサギ一次抗体の可視化に使用する蛍光二次抗体。</td></tr><tr><td>ヤギ血清</td><td>Fisher Scientific</td><td>50-413-115</td><td>非特異的な抗体結合を減少させるために使用するブロッキング試薬。</td></tr><tr><td>EVOS FL Auto 2イメージングシステム</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>AMAFD2000</td><td>画像取得に使用する蛍光顕微鏡。</td></tr><tr><td>Fiji（ImageJ）2.16.0</td><td>NIH</td><td>fiji.sc</td><td>下流の形態学分析とプラグインに使用する画像処理プラットフォーム。</td></tr><tr><td>Fluoromount-G</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>00-4959-52</td><td>蛍光を保存し、カバースライドを固定するために使用するマウンティング媒体。</td></tr><tr><td>イソフルラン</td><td>EntirelyPets Pharmacy</td><td>MWI502017</td><td>動物実験中に使用する吸入麻酔薬。</td></tr><tr><td>リポポリサッカライド</td><td>Millipore Sigma</td><td>L2630</td><td>げっ歯類の全身性神経炎症とミクログリア活性化を誘導するために使用。</td></tr><tr><td>Matplotlib</td><td>https://pypi.org/project/matplotlib/</td><td></td><td>データ可視化と図の生成に使用するPythonプロットライブラリ。</td></tr><tr><td>MMPS（Mapping Microglial Parameters Software）v1.00</td><td>この作品</td><td>https://github.com/NeurodegenerativePharmaceuticalLab/Mapping-Microglia-Parameters-Software/releases/tag/v1.00</td><td>ミクログリア形態学分析用に開発されたオープンソースソフトウェアプラットフォーム。</td></tr><tr><td>ネットウェル</td><td>Millipore Sigma</td><td>CLS3477</td><td>染色手順中にフリーフローティング組織切片を保持するために使用するインサート。</td></tr><tr><td>Numpy</td><td>https://pypi.org/project/numpy/</td><td></td><td>MMPS内での数値計算に使用するPythonライブラリ。</td></tr><tr><td>対物レンズ（4×）</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>AMEP4922</td><td>解剖学的方向と領域の識別に使用する低倍率対物レンズ。</td></tr><tr><td>対物レンズ（40×）</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>AMEP4625</td><td>ミクログリア形態学イメージングに使用する高倍率対物レンズ。</td></tr><tr><td>opencv-python</td><td>https://pypi.org/project/opencv-python/</td><td></td><td>MMPS内での画像処理機能に使用するコンピュータービジョンライブラリ。</td></tr><tr><td>パラホルムアルデヒド</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>169650025</td><td>切片化前の組織灌流と保存に使用する固定剤。</td></tr><tr><td>パーマウント</td><td>Fisher Scientific</td><td>SP15-100</td><td>スライド保存に使用する永久マウンティング媒体。</td></tr><tr><td>リン酸緩衝生理食塩水</td><td>Fisher Scientific</td><td>BP3991</td><td>組織洗浄と試薬調製に使用する緩衝溶液。</td></tr><tr><td>Pillow</td><td>https://pypi.org/project/Pillow/</td><td></td><td>画像処理操作に使用するPythonイメージングライブラリ。</td></tr><tr><td>PyQt5</td><td>https://pypi.org/project/PyQt5/</td><td></td><td>MMPSのグラフィカルユーザーインターフェースを生成するために使用するPython GUIフレームワーク。</td></tr><tr><td>Python 3.11</td><td>Python Software Foundation</td><td>python.org</td><td>MMPSを開発および実行するために使用するプログラミング言語環境。</td></tr><tr><td>R 4.3.2</td><td>R Foundation for Statistical Computing</td><td>r-project.org</td><td>データ分析とグラフ生成に使用する統計ソフトウェア。</td></tr><tr><td>Scikit-image</td><td>https://pypi.org/project/scikit-image/</td><td></td><td>画像処理とセグメンテーションに使用するPythonイメージ分析ライブラリ。</td></tr><tr><td>Scipy</td><td>https://pypi.org/project/scipy/</td><td></td><td>フィルタリングと画像処理操作に使用するPython科学計算パッケージ。</td></tr><tr><td>スプラーグ・ドーリーラット</td><td>Evingo</td><td>002</td><td>神経炎症モデルの検証に使用する実験動物。</td></tr><tr><td>スクロース</td><td>Fisher Scientific</td><td>S5-3</td><td>脳組織凍結前に使用する凍結保護剤。</td></tr><tr><td>Tifffile</td><td>https://pypi.org/project/tifffile/</td><td></td><td>TIFF画像ファイルを読み書きするために使用するPythonパッケージ。</td></tr><tr><td>Tissue-Tek O.C.T. Compound</td><td>Sakura Finetek</td><td>4583</td><td>凍結組織サンプルの凍結切片に使用する埋め込み媒体。</td></tr><tr><td>Triton X-100</td><td>Fisher Scientific</td><td>BP151-100</td><td>免疫蛍光中の膜透過性化に使用する界面活性剤。</td></tr></tbody></table>

マッピングミクグリアパラメータソフトウェア(mmps):定量的なミクログリア形態分析のためのオープンソースで使いやすいツール

Mapping Microglial Parameters Software (MMPS): An Open-Source, User-Friendly Tool for Quantitative Microglia Morphology Analysis

マッピングミクグリアパラメータソフトウェア(MMPS):定量的なミクログリア形態分析のためのオープンソースで使いやすいツール

Microglia are myeloid-derived immune cells of the central nervous system that mediate tissue degradation and remodeling following neurological injury and ...

mapping-microglial-parameters-software-mmps-an-open-source-user

Research

JoVE Journal

Neuroscience

神経科学

出典:Etienne, F. et al. Two-photon Imaging of Microglial processes' Attraction towards ATP or Serotonin in Acute Brain Slices. J. Vis. Exp.

マウス脳スライス中の化合物に対するミクログリアプロセス引力を研究するための2光子顕微鏡

ミクログリア生物学の成功の調査の一つの鍵は、CNS組織からの単離の間にex vivoでミクログリア免疫機能の維持である。蛍光イメージング、免疫細胞、および炎症誘発性刺激リポ多糖（LPS）とパム3 CSK 4（PAM）を用いたELISA次のミクログリアの活性化によって評価されるように、高純度と免疫機能細胞培養で回転振盪結果を経由してミクログリアを分離する。...

マウス新生児から保護免疫表現と機能皮質ミクログリアの分離

小膠細胞は、それらの細胞外環境に材料を貪食又は巻き込むための高い能力を有する中枢神経系（CNS）の居住者の免疫細胞である。ここでは、シナプスのコンポーネントのミクログリア媒介貪食を可視化し、測定するために広く適用可能で信頼性が高く、高度に定量的なアッセイが記載されている。...

貪食アッセイ：CNS食細胞と神経細胞間の相互作用を評価するためのプロトコル

ミクログリアの活性化および小膠は、慢性神経変性に重要な応答です。ここでは、in vivoで 、共焦点検眼鏡による網膜CX3CR1-GFP +ミクログリア細胞の長期的な可視化のための方法を提示し、閾値と形態計測のために識別し、それらの活性化を定量化するために分析します。我々は、年齢関連の緑内障の早期の段階でミクログリアの変化を監視します。...

共焦点検眼鏡イメージングとマウス緑内障における細胞の形態計測：神経変性中に網膜ミクログリアの活性化のインビボダイナミクス

このプロトコールは、成体マウス中枢神経系におけるマクロファージ亜集団のフローサイトメトリーによる分析を提供し、これらの細胞によって発現される複数のマーカーの研究に有用である。...

フローサイトメトリーによる中枢神経系からのミクログリアおよび単球由来マクロファージの解析

ミクログリアは、調査、定量的評価されるかもしれない形態の変化によって変えられた脳生理学に反応する脳の免疫細胞です。このプロトコルの概要、ImageJ...

免疫組織化学準備 ImageJ を用いた組織の顕微鏡写真からミクログリアの形態の定量化

このプロトコルは、IBA1およびTMEM119の免疫蛍光コシャリンのための段階的なワークフローを記述し、ミクログリア密度、分布、および形態の分析に加えて、ならびにマウス脳組織における末梢骨髄細胞浸潤の分析を説明する。...

マウス脳における微小グリア密度、形態および末梢骨髄細胞浸潤解析のためのIBA1およびTMEM119を用いた免疫蛍光染色

ここでは、覚醒マウスにおけるミクログリア動態と神経活動を同時にイメージングするためのアデノ随伴ウイルス注入と頭蓋窓移植を組み合わせたプロトコルについて説明します。...

覚醒マウスにおけるミクログリア動態と神経活動の同時イメージング

ここでは、フローサイトメトリーを使用してvGLUT1陽性シナプスとpHRodo...

フローサイトメトリーを用いたシナプス材料のミクログリア包絡の定量化

本論文は、スピニングディスク共焦点顕微鏡を用いて網膜におけるミクリアの運動性とシナプス後点との接触を可視化・定量化する方法を示します。...

病変マウス網膜におけるミクログリアの動態およびシナプスとの相互作用のライブイメージングおよび特徴付け

このプロトコルは、フローサイトメトリーとシングルセルRNAシーケンシングを組み合わせて、出生後早期マウス脳の小脳におけるミクログリア細胞の状態を単離し、特徴付けます。酵素解離、パーコール遠心分離、免疫染色を使用してミクログリアの不均一性を明らかにし、小脳の発達と疾患におけるミクログリアの役割の理解を深めます。...

出生後早期マウス脳発生におけるミクログリア活性化を特徴付けるためのフローサイトメトリーと単一細胞解析

学ぶMMPSを用いたミクログリア形態の定量的解析手法。Pythonベースのオープンソースツールで、免疫蛍光画像から単細胞レベルの形態変化を検出し、神経炎症研究の再現性を向上させます。

マッピングミクグリアパラメータソフトウェア(MMPS):定量的なミクログリア形態分析のためのオープンソースで使いやすいツール

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