새로운 유전자의 진화는 종분화에 결정적이다. 엑손 셔플링(exon shuffling) 또는 도메인 셔플링(domain shuffling)으로도 알려진 엑손 재조합(exon recombination)은 새로운 유전자 형성의 중요한 수단입니다. 척추 동물, 무척추 동물, 그리고 감자와 해바라기와 같은 일부 식물에서 관찰됩니다. 엑손 재조합 동안 동일하거나 다른 유전자의 엑손은 재결합하여 새로운 유전자로 진화할 수 있는 새로운 엑손-인트론 조합을 생성합니다.
엑손 셔플링은 “스플라이스 프레임 규칙”을 따릅니다.각 엑손에는 3개의 판독 프레임이 있습니다. 유입되는 엑손은 3개의 판독 프레임 중 하나에서 재결합하고 결합할 수 있으며 프레임시프트 돌연변이를 일으킬 수 있습니다. 따라서 모든 재조합 이벤트가 유용한 것은 아닙니다. 일부는 조기 정지 코돈과 미성숙 단백질을 초래할 수도 있습니다.
인간 게놈에서 엑손 셔플링
유전자 복제 및 발산과 함께, 엑손 셔플링(exon shuffling)은 여러 인간 특이적 유전자의 진화에 기인합니다. 예를 들어, 약 2,500만 년 전, MCH(멜라닌 집중 호르몬)라는 유전자는 초기 영장류에서 역전위에 의한 엑손 재조합을 겪었습니다. 그것은 de novo intron-exon 경계를 만들었고, 이는 나중에 Hominidae 특이적 보존 유전자 PMCHL1로 진화했습니다 – 이것은 유사 유전자이지만 antisense RNA는 인간의 뇌에서 발현됩니다. 원래 MCH 유전자는 설치류의 에너지 요구량과 체중의 균형을 맞추는 데 관여하는 뉴로펩타이드를 암호화했기 때문에 PMCHL-1은 유사한 기능을 가질 것으로 예상됩니다.
불법 재조합(IR)은 엑손 재조합 또는 엑손 셔플링에서 가장 일반적으로 관찰되는 메커니즘 중 하나입니다. IR은 엑손의 중복으로 이어집니다. 이는 뒤셴(Duchenne)과 베커(Becker) 근이영양증, 가족성 고콜레스테롤혈증, 레쉬-니한 증후군(Lesch-Nyhan syndrome), 혈우병, 지단백질 리파아제 결핍증(lipoprotein lipase deficiency)과 같은 여러 인간 질병에서 관찰되었습니다.
Transcript
진핵생물 유전자는 엑손(exon)이라고 하는 단백질 암호화 서열과 인트론(intron)이라고 하는 비암호화 서열의 교대 블록으로 구성됩니다.
엑손 재조합은 동일하거나 다른 유전자의 엑손이 재결합하여 새로운 유전자로 진화할 수 있는 엑손-인트론 염기서열의 새로운 조합을 생성하는 과정입니다.
엑손 재조합은 비상동 재조합 또는 역전치(retro-transposition)에 의해 매개될 수 있습니다.
비상동성 또는 불법 재조합 중에 염기서열 유사성이 없는 DNA 가닥은 재결합하여 새로운 유전자 구조를 생성할 수 있습니다.
면역 체계의 유전 질환인 만성 육아종 질환이 좋은 예입니다. 이 질환을 앓고 있는 많은 환자들은 NADPH 산화효소를 암호화하는 phox 유전자에 희귀한 돌연변이를 가지고 있습니다.
야생형 NADPH 산화효소는 감염 시 슈퍼옥사이드와 같은 반응성 산소종을 생성하고 감염원의 식세포 매개 사멸을 돕습니다.
드문 경우지만, phox 유전자의 엑손 8과 11 사이의 비상동 염기서열이 재결합하여 엑손 9와 10의 중복을 유발합니다. 이것은 효소 NADPH 산화효소의 활성을 감소시킵니다. 손상된 효소는 박테리아 감염을 제거하기에 충분한 활성 산소 종을 생성하지 못하여 육아종 또는 대식세포 및 관련 면역 세포의 응집을 초래합니다.
역전위로 인한 엑손 재조합은 아프리카 초파리에서 Jingwei 유전자의 진화를 가장 잘 설명할 수 있습니다.
약 250만 년 전, Adh mRNA의 일부가 DNA로 역전사되고 Ynd 유전자의 엑손과 재결합하여 Jingwei라는 새로운 유전자를 생성했습니다.
Ynd 유전자는 초파리에서 고환의 발달을 담당하고 Adh 유전자는 알코올 탈수소효소를 암호화합니다. 새로운 유전자 Jingwei는 두 개의 도메인, 즉 하나는 Ynd에서 유래하고 다른 하나는 Adh에서 유래한 단백질을 암호화합니다.
그러므로, 단백질 Jingwei는 초파리 고환에서 발현되고 호르몬과 페로몬 생합성을 담당합니다.