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단백질은 세포에서 많은 기계적 기능을 수행합니다. 이러한 단백질은 두 가지 일반적인 범주, 즉 기계적 힘을 생성하는 단백질과 기계적 힘을 받는 단백질로 분류될 수 있습니다. 케라틴과 같이 세포 구조에 기계적 지지를 제공하는 단백질은 기계적 힘을 받는 반면, 이온 펌프와 같이 세포 이동 및 세포막을 통한 분자 수송에 관여하는 단백질은 기계적 힘을 생성하는 예입니다.
세포 운동 및 근육 수축과 같은 기능에는 일반적으로 형태 변화를 통해 화학 에너지가 기계 에너지로 변환되어야 합니다. 예를 들어, ATP 및 GTP와 같은 뉴클레오사이드 삼인산의 가수분해는 주요 구조 변화로 증폭되는 작은 형태 변화를 초래할 수 있습니다. 예를 들어, EF-Tu는 tRNA 분자를 리보솜으로 전달하는 세 개의 서로 다른 도메인을 가진 단백질입니다. 도메인 중 하나는 GTP와 결합하고, GTP가 GDP로 가수분해되면 방출된 무기 인산염으로 인해 뉴클레오티드 결합 부위의 구조 변화가 발생합니다. 이는 GTP 도메인과 도메인의 상대적인 위치를 서로 변경하는 다른 두 도메인의 인터페이스에 위치한 알파 나선의 움직임을 촉발합니다. 이를 통해 단백질은 세 도메인에 의해 경계면에 고정되어 있는 tRNA를 방출하여 리보솜으로 이동할 수 있습니다.
액틴과 같은 일부 단백질은 다양한 유형의 기계적 기능을 제공합니다. 예를 들어, 액틴은 기계적 단백질인 미오신이 따라갈 수 있는 경로 역할을 합니다. 유형에 따라 미오신은 액틴 필라멘트를 당기거나 필라멘트를 따라 부착된 소기관을 운반하는 등 다양한 기능을 수행할 수 있습니다. 세포골격의 일부인 액틴 필라멘트는 세포 구조를 기계적으로 지지하는 역할을 합니다. 세포가 이동하는 동안 이러한 필라멘트는 세포막에 압력을 가하여 세포가 새로운 위치로 이동할 수 있도록 하는 세포막의 확장인 필로포디아(filopodia) 및 라멜리포디아(lamellipodia)를 형성하게 합니다. 과학자들은 막을 변형시킬 때 액틴이 생성하는 힘을 측정할 수 있는 광학 핀셋과 같은 기술을 개발했습니다.
단백질은 세포의 움직임과 근육 수축을 일으키는 기능뿐만 아니라 세포 내부와 외부의 다른 위치 사이의 분자 이동을 포함하여 다양한 기계적 기능을 수행합니다.
기계적 단백질 기능은 단백질 구조의 구조적 변화를 통해 화학 에너지를 기계적 일로 전환함으로써 강화됩니다.
단백질 도메인 내에서 ATP 또는 GTP와 같은 결합 분자의 가수분해와 같은 간단한 화학적 변화는 단백질에서 훨씬 더 큰 움직임을 생성하는 구조적 변화를 초래할 수 있습니다.
ATP 가수분해는 운동 단백질인 미오신 (myosin)에 동력을 공급하는데, 미오신 단백질은 지렛대 역할을 하여 액틴 필라멘트를 당기고 근육을 수축시킵니다. 복제 및 전사 중에 DNA를 푸는 헬리케이스도 ATP를 사용하여 수소 결합을 끊고 DNA 가닥을 따라 이동합니다.
리보솜에서는 많은 단백질이 새로운 단백질을 합성하는 기계처럼 함께 일합니다. GTP 가수분해는 신장 인자인 EF-Tu가 tRNA 분자를 리보솜으로 전달하여 성장하는 단백질 가닥에 아미노산을 추가할 수 있도록 합니다.
tRNA는 GTP가 결합될 때 EF-Tu와 연결됩니다. GTP가 GDP로 가수분해될 때 인산기의 방출로 인해 뉴클레오티드 결합 부위 내부 및 근처에서 작은 형태 변화가 발생합니다.
이 작은 이동으로 인해 GTPase 도메인과 다른 두 도메인의 인터페이스에 위치한 α 나선이 위치를 변경합니다. 이 나선의 움직임은 결합된 tRNA를 방출하기 위해 두 개의 도메인이 스윙 오픈되도록 합니다.
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