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미생물 생태학은 미생물 다양성과 다양한 생태계 내에서 미생물이 어떻게 상호작용하는지를 연구하는 학문입니다.
생태계는 미생물이 생물적 요인과 비생물적 요인 모두와 상호작용하는 기능적 단위입니다.
이 생태계에서는 잎, 뿌리, 토양과 같은 서식지에 많은 미생물이 서식합니다. 같은 종의 미생물들이 개체군을 형성합니다.
서로 다른 개체군이 서식지에서 공존하고 상호작용할 때, 이들은 미생물 군집을 형성합니다.
생태계 내 모든 미생물은 미생물군집을 구성하며, 이들의 유전 물질 전체를 미생물군계라고 부릅니다.
군집 내 미생물 다양성은 종의 풍부도와 상대적 풍부도로 측정되며, 이 두 가지는 영양소 가용성과 온도, pH, 산소 수준 등 환경 조건에 의해 영향을 받습니다.
예를 들어, 영양분이 풍부한 토양은 많은 미생물이 중간 정도의 풍부함으로 공존하는 높은 종 다양성을 지원합니다.
반면, 산성이고 철분이 풍부한 호수와 같은 극한 생태계는 종 다양성은 낮지만 Acidithiobacillus ferrooxidans와 같은 특수 미생물의 풍부도를 높입니다.
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