방법 논문

Side Population Assay: 제브라피시에서 종양 세포의 Side Population을 분리하는 방법

2023년 4월 30일

이 논문에서

초록

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출처: Pruitt, M. M., et al. 제브라피시에서 Myc-induced T-cell Acute Lymphoblastic Leukemia in the Side Population. J. Vis. 특급 (2017).

다음 프로토콜은 줄기세포로 구성된 T-세포 급성 림프구 백혈병(T-ALL) 종양 세포의 측면 집단을 성체 제브라피시에서 분리하는 방법을 설명합니다. 측면 모집단에는 눈에 띄는 세포 마커가 없기 때문에 Hoechst 33342 염료 유출 분석을 사용하여 분리합니다.

프로토콜

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1. 형광 표지된 T-ALL 세포를 Hoechst 33342로 염색하여 측면 집단 식별

  1. Hoechst 33342 1:10을 뉴클레아제가 없는 H2O로 희석하여 1 mg/mL 작업 농도를 만듭니다. 염료는 4 °C와 어두운 곳에 보관하십시오.
  2. 디메틸 설폭사이드(DMSO) 1mL에 49.1mg을 용해시켜 베라파밀 100mM 용액을 준비합니다.
    메모: 베라파밀은 ABC 수송체의 억제제이며 측면 개체군 실험을 위한 중요한 대조군입니다. 샘플에 베라파밀을 첨가하면 ABC 수송체가 Hoechst 33342 염료를 유출하는 능력이 억제됩니다. 따라서 실제 측 모집단은 베라파밀이 샘플에 추가될 때 사라집니다.
  3. 수조를 28°C로 설정합니다.
  4. 형광 활성화 세포 분류기(FACS) 튜브에 세포와 용액을 추가하여 어둠 속에서 샘플과 대조군을 준비합니다.
    1. FACS 튜브에 10개의6 세포, 15μL의 1mg/mL Hoechst 33342 및 2.5μL의 DMSO를 추가하여 샘플을 준비합니다. FBS/PBS를 사용하여 부피를 1mL로 조정합니다.
    2. FACS 튜브에10개의 6 세포, 15μL의 1mg/mL Hoechst 33342 및 2.5μL의 100mM 베라파밀을 추가하여 대조군을 준비합니다. FBS/PBS를 사용하여 부피를 1mL로 조정합니다.
      메모: 최소 10개의6 세포/샘플이 권장되지만, 특히 추가 분석을 위해 측면 집단 세포를 분류하는 경우 더 많은 세포를 염색하는 것이 좋습니다. 106 cells/mL를 초과하지 말고 Hoechst 33342 농도를 15μg/mL로 유지하십시오. 10 x 106 세포가 염색된 경우 총 반응 부피는 10mL입니다.
  5. 어둠 속에서 28°C 수조에서 120분 동안 배양합니다.
  6. 배양 후에는 세포를 즉시 얼음 위에 놓고 어두운 곳에 보관하십시오.
  7. 4 ° C에서 300 x g에서 6 분 동안 셀을 펠렛화합니다. 상층액을 제거합니다. 1mL의 FBS/PBS로 세척합니다.
  8. 4 ° C에서 300 x g에서 6 분 동안 셀을 펠렛화합니다. 상층액을 제거합니다. 1mL의 FBS/PBS에 세포를 재현탁합니다.
  9. 세포를 분류할 때까지 4°C를 유지하십시오.
  10. 세포 분류 15분 전에 FBS/PBS 각 1mL(최종 농도: 2μg/mL)에 2μL의 프로피듐 요오드화물(PI) 스톡(1mg/mL)을 추가합니다. 잘 섞는다.

2. FACS를 사용하여 형광 라벨링된 T-ALL 세포 집단 내의 측면 집단 찾기

  1. Hoechst 33342 염료 여기(dye excitation)를 위한 UV 레이저와 PI 여기 및 GFP+ T-ALL 세포 검출을 위한 488-nm 레이저가 장착된 세포 분류기에서 염색된 제브라피시 T-ALL 세포 현탁액을 분석합니다.

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공개 사항

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선언된 이해 상충이 없습니다.

재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
소 태아 혈청(FBS)하이클론 연구소, Inc.피셔 사이언티픽 - SH3007103500 밀리리터
인산염 완충 식염수(PBS)Life Technologies의 Gibco1001-023pH 7.4 (1x) - 500 mL
회스트: 33342생명 기술H357010 밀리리터
베라파밀시그마 생명과학V46291 지
디메틸설폭사이드(DMSO)시그마 생명과학D8418100 밀리리터
프로피듐 요오드화물생명 기술P356610 밀리리터
FACSAria Fusion 세포 분류기BD 바이오사이언스
년 (영문)

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