1. 박테리아 및 숙주 세포의 준비
- 12mm 또는 14mm 유리 커버 슬립을 각각 24웰 또는 12웰 플레이트에 무균 핀셋으로 옮기며, 실험 조건당 한 개의 웰을 계산합니다. 이 제품을 조직 배양 후드에서 자외선(UV) 처리로 15분간 멸균합니다.
참고: 박테리아 도전과 외부 스트레스에 의한 응력 과립(SG) 유도를 위한 대조 우물을 포함합니다. - 24웰 플레이트에 12mm 커버슬립을 사용할 경우, 커버슬립 위에 1 x 10 5개의 포유 류 세포(예: HeLa 세포)를 시딩합니다; 멸균 피펫 팁으로 커버를 눌러 누르세요. 세포는 각 세포 유형에 적합한 배양지에서 37°C에서 5%CO2 조직 배양 인큐베이터에서 밤새 접착하게 합니다.
참고: 다음 날 세포 합류율이 40%에서 60% 사이에 되도록 세포를 배지합니다.- HeLa 세포의 경우, Dulbecco의 변형 Eagle 배지(DMEM)에 비필수 아미노산(NEAA)과 10% 상보전화된 태아 송아지 혈청(FCS)을 함께 배양합니다. FCS는 56°C 물욕에서 30분간 가열한 후 15분 후 한 번 혈청을 휘저어 탈보완합니다.
- 박테리아를 줄무늬로 제거하려면, 멸균 피펫 팁을 사용해 -80°C 냉동고에 보관된 박테리아 글리세롤 스톡(20% 글리세롤)에서 소량을 제거해 라벨이 붙은 플레이트에 올려놓으세요. 멸균 루프를 사용해 박테리아를 플레이트의 약 10% 전체에 퍼뜨리세요. 새 멸균 루프를 사용해 도말 부위에 드래그해서 반 플레이트 길이의 평행선 3개를 만드세요. 이 선들을 따라 줄을 그려 나머지 판을 덮어. 플레이트를 O/N을 37 °C에서 배양합니다.
- 갓 줄무늬 표시한 플레이트에서 단일 박테리아 군락(예: 시겔라 플렉스네리)을 선택하세요. 1주일 이상 된 박테리아 집락은 피하세요.
- S. flexneri 균주 M90T의 경우, 갓 줄무늬 제거한 트립틱 대두 한가-0.1% 콩고 적색 한천 플레이트에서 적색 콜로니를 15mL 튜브에 8mL 트립틱 대두 육수에 접종합니다; 뚜껑을 꽉 닫고 30°C에서 222rpm O/N에서 진동을 배양하세요. 주의: 큰 흰색 군락은 병원성 플라스미드를 잃었고 감염성이 없으므로 사용하지 마십시오.
2. 숙주 세포에 대한 박테리아 도전
- 감염 가능성을 극대화할 수 있도록 박테리아를 준비하세요.
- S. flexneri의 경우, 8mL 트립산 대두 한천에 150 μL O/N 배양물을 첨가하여 박테리아를 37 °C에서 222 rpm에서 진동시켜 후기(~2시간)까지 진동시켜 병원성 유전자 발현을 유도하고 감염을 증진시킵니다.
- 배양액이 0.6에서 0.9 사이(600 nm에서 측정)일 때, 1mL 배양물을 1.5 mL 튜브에 옮깁니다. 펠릿 박테리아를 8,000 x g에서 2분간 투여한 후 감염 배지(DMEM with NEAA, FCS 없음)에서 OD600 = 1에 재현탁합니다. 따라서 OD600 이 0.85라면 850 μL에서 재현탁합니다.
참고: S. flexneri의 경우, OD600 = 1에서 8mL 배양 시 8 x 10 8박테리아가 1mL당 8 x 108 박테리아가 존재합니다. 감염 중수(MOI)는 20이 적절합니다. 다른 병원체의 경우, OD600에서 mL당 박테리아 수와 적절한 MOI를 경험적으로 결정해야 합니다.
- 박테리아-숙주 상호작용을 강화하기 위해 박테리아에 폴리-L-라이신(PLL)을 코팅합니다.
참고: S. flexneri의 PLL 치료는 SG 역학에 영향을 미치지 않았습니다. 다른 병원체들은 PLL 치료에 대한 적합성을 평가해야 합니다.- 박테리아를 PLL로 코팅하려면, 8,000 x g에서 1mL 박테리아 배양 1mL를 2분간 원심분리한 후, 10 μg/mL PLL에 인산염 완충 식염수(PBS)에 OD600 = 1로 재현탁합니다.
- 박테리아 용액을 12웰 플레이트 내 웰 같은 작은 접시에 넣고, RT(~ 20 °C)에서 10분간 부드럽게 저으며 셰이커에서 배양합니다.
- 8,000 x g에서 2분간 박테리아를 먹이고, 과잉 PLL을 제거하세요. 펠릿을 1 mL PBS에 다시 현탁한 후 이 세척 과정을 두 번 반복하세요. 최종 세척 후에는 OD600 = 1에서 감염 배지에 재현탁합니다.
참고: 여기서 S. flexneri 의 감염 배지는 FCS가 없는 20 mM N-(2-하이드록시에틸)피페라진-N'-(2-에탄설폰산)(HEPES)을 포함한 숙주 세포 배지입니다.
- 세포를 박테리아 도전에 대비시키세요.
- 포유류 HeLa 세포에서 배지를 흡입 펌프를 사용해 제거하세요. 500 μL RT HeLa 세포 배지를 첨가하여 세포를 세척하고, 소용돌이치며, 흡입 펌프를 이용해 배지를 제거한 뒤, 500 μL 상온(RT) 감염 배지(예: FCS 없는 20 mM HEPES 숙주 배지)로 교체합니다.
- 참고: 모든 세척 단계에서는 빠르게 작업하고 한 번에 최대 4개의 커버슬립만 처리하여 세포가 건조해지지 않도록 하세요.
- 챌린지는 세포의 20-50%를 감염시키도록 박테리아로 HeLa 세포를 준비했습니다.
참고: 각 박테리아 종별로 적절한 시기와 MOI를 결정해야 합니다. 일반적으로 좋은 시작은 37°C에서 30분, MOI는 10입니다.- S. flexneri의 경우, 두 가지 방법 중 하나(2.3.1.1 또는 2.3.1.2)를 사용해 HeLa 세포에 도전하세요.
- PLL 처리되지 않은 박테리아(20 μL OD600 = 24웰 플레이트 1/웰, 500 μL 배지)를 세포 위에 13000 x g에서 10분간 스핀합니다.
- PLL 코팅 박테리아(15 μL OD600 = 24웰 플레이트 1/웰, 500 μL 배지)를 RT에서 15분간 추가하여 박테리아가 세포에 정착할 수 있도록 합니다.
- 침착한 박테리아가 있는 세포를 37°C 조직 배양 인큐베이터에 30분간 넣어 감염이 일어나도록 하세요.
참고: 짧은 시간 동안은 조직 배양 인큐베이터 대신 37°C 물에 플레이트를 15분간 넣어 S. flexneri 감염을 동기화합니다.
- 세포를 세척하여 감염을 막으세요.
- 세포를 세척하고 과도한 박테리아를 제거하려면 흡입 펌프를 이용해 배지를 제거하고, 1mL의 신선하게 예열된 (37 °C) HeLa 배양 배양지(DMEM, 10% FCS, NEAA)를 추가하세요. 미디엄을 돌리고 꺼내 새 미디엄으로 교체하세요. 두 번 반복하고 세포에 신선한 배지를 남겨둡니다.
- S. flexneri 또는 기타 세포내 박테리아의 경우, HeLa 세포와 세척물이 감염된 후에는 50 μg/mL 겐타마이신이 포함된 표준 조직 배양 배양액으로 배양지를 교체하여 세포외 박테리아를 죽이고 추가 세포 침범을 방지합니다.
참고: 세포외 박테리아를 위해 배지에 항생제를 첨가하지 마세요.
- 조직 배양 인큐베이터에서 원하는 시간 동안 박테리아와 세포를 배양합니다.
참고: S. flexneri의 경우 감염 기간이 세포 유형에 따라 최대 6시간까지 걸릴 수 있습니다. HeLa 세포의 경우, 감염이 1.5-2시간 진행된 후 SG 형성을 유도하기 위해 외부 스트레스를 추가합니다. 카코-2 감염은 시겔라 가 세포 간 전파되는 경우, 30분에서 6시간 동안 감염한 후 외부 스트레스를 추가해야 합니다. 이 시점에서 세포는 외부 스트레스를 추가하지 않고 고정하여 박테리아 감염으로 인한 SG 형성을 평가할 수 있습니다.
3. 응력 과립 형성의 고정 및 면역형광 분석
참고: 대조군과 실험용 커버슬립을 동시에 처리하여 이후 단계에서 이미지 분석에 영향을 줄 수 있는 염색 차이를 피하세요. 대조군 샘플에는 SG 유도 치료가 있는 무감염 샘플과 SG 유도 치료가 포함된 감염 샘플과 그렇지 않은 감염 샘플이 포함됩니다.
- 흡입 펌프를 사용해 배지를 완전히 제거하고, PBS에 0.5mL RT 4% 파라포름알데히드(PFA)를 첨가하여 샘플을 고정합니다. RT에서 30분간 부양하세요.
주의: PFA는 핸들러와 환경에 해롭습니다. 핸들러를 보호하고 화학 폐기물을 처리하기 위한 적절한 조치를 취하세요.
참고: 또는 15분간 고정한 후 -20 °C 프리콜드 메탄올로 10분간 교체하여 SG 마커의 세포질 위치를 더 잘 유지할 수 있습니다. - 피펫으로 PFA를 제거하고 적절한 폐기물에 폐기하세요. 커버슬립을 1mL 트리스 완충 식염수(TBS: 25 mM Tris, pH 7.3; 15 mM 염화나트륨, NaCl)로 세척합니다. 세척할 때 접시 셰이커에 부드럽게 흔들며 커버슬립을 2분간 부풀어 넣으세요.