FFPE 종양 조직 거대해부: 염색되지 않은 표본에서 특정 종양 조직을 얻는 기술

초록

출처: Sugimoto, K. et al. 위장관암에서 DNA 메틸화의 게놈 전체 분석. J. Vis. 특급 (2020년)

이 비디오는 특정 암 조직을 얻기 위해 염색되지 않은 조직 표본에서 암 조직을 수동으로 거시해부하는 방법을 설명합니다. 조직 절편은 위장암에 대한 게놈 전체 연구를 위한 DNA를 얻기 위해 추가로 처리할 수 있습니다.

프로토콜

1. 슬라이드 스크랩

하기

1. 디에틸피로카보네이트(DEPC) 처리수 650mL, 에틸렌디아민테트라아세트산(EDTA) 100mL, 트리스 하이드로클로라이드(Tris-HCL) 50ml 2m pH 8.8, 10% 도데실황산나트륨(SDS) 200mL로 분해/용해 완충액을 준비합니다(재료 표 참조).
2. 1.5mL 일회용 폴리프로필렌 튜브에 80μL의 분해/용해 버퍼를 채웁니다(재료 표 참조).
3. 깨끗한 피펫 팁을 버퍼에 넣습니다.
4. 적절한 H&E 염색 절편에 따라 거대박리에 가장 적합한 종양 부위의 암 조직을 식별합니다.
5. 표시된 H&E 염색 단면을 기준으로 암 조직을 거시해부합니다.
   1. 깨끗한 면도날을 가지고 슬라이드에서 암 조직을 부드럽게 긁어내고 작업하기 쉽도록 한 조각으로 유지하십시오.
   2. 완충액이 들어 있는 일회용 폴리프로필렌 튜브에서 피펫 팁을 꺼내 스크랩된 조직을 완충액 바이알로 옮기는 데 사용합니다(재료 표 참조).
      알림: 젖은 팁은 조직을 끌어당겨야 전달이 더 쉬워집니다.

재료

이 논문에 사용된 재료 목록

이름	회사	카탈로그 번호	댓글
10% 도데실황산나트륨(SDS)	고품질 생물학	351-032-721 EA
DEPC 처리수	고품질 생물학	Tel.: 351-068-131
에틸렌디아민테트라아세트산(EDTA)	코 닝	46-034-CL
트리스 염산염 (Tris-HCL) 2m pH 8.8	고품질 생물학	Tel.: 351-092-101
프로테라제 K	뉴잉글랜드 바이오랩스	P8107S
일회용 폴리프로필렌(Eppendorf) 튜브	에펜도르프	24533495