방법 논문

FFPE 종양 조직 거대해부: 염색되지 않은 표본에서 특정 종양 조직을 얻는 기술

2023년 4월 30일

이 논문에서

초록

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

출처: Sugimoto, K. et al. 위장관암에서 DNA 메틸화의 게놈 전체 분석. J. Vis. 특급 (2020년)

이 비디오는 특정 암 조직을 얻기 위해 염색되지 않은 조직 표본에서 암 조직을 수동으로 거시해부하는 방법을 설명합니다. 조직 절편은 위장암에 대한 게놈 전체 연구를 위한 DNA를 얻기 위해 추가로 처리할 수 있습니다.

프로토콜

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1. 슬라이드 스크랩

하기

  1. 디에틸피로카보네이트(DEPC) 처리수 650mL, 에틸렌디아민테트라아세트산(EDTA) 100mL, 트리스 하이드로클로라이드(Tris-HCL) 50ml 2m pH 8.8, 10% 도데실황산나트륨(SDS) 200mL로 분해/용해 완충액을 준비합니다(재료 표 참조).
  2. 1.5mL 일회용 폴리프로필렌 튜브에 80μL의 분해/용해 버퍼를 채웁니다(재료 표 참조).
  3. 깨끗한 피펫 팁을 버퍼에 넣습니다.
  4. 적절한 H&E 염색 절편에 따라 거대박리에 가장 적합한 종양 부위의 암 조직을 식별합니다.
  5. 표시된 H&E 염색 단면을 기준으로 암 조직을 거시해부합니다.
    1. 깨끗한 면도날을 가지고 슬라이드에서 암 조직을 부드럽게 긁어내고 작업하기 쉽도록 한 조각으로 유지하십시오.
    2. 완충액이 들어 있는 일회용 폴리프로필렌 튜브에서 피펫 팁을 꺼내 스크랩된 조직을 완충액 바이알로 옮기는 데 사용합니다(재료 표 참조).
      알림: 젖은 팁은 조직을 끌어당겨야 전달이 더 쉬워집니다.
  6. 나머지 슬라이드에 대해 1.5단계를 반복합니다.
  7. 모든 조직이 일회용 폴리프로필렌 튜브에 들어간 후 팁을 사용하여 조직이 완전히 잠겨 있고 튜브 벽에 달라붙지 않았는지 확인합니다.
  8. 20μL의 서브틸리신 관련 세린 프로테아제를 바이알에 첨가하고 부드럽게 튕겨 혼합합니다(재료 표 참조).
  9. 바이알을 55°C 가열 블록에 최소 4시간 또는 하룻밤 동안 놓습니다. 2 시간 후에 약간 소용돌이가 발생하는지 확인하십시오.

액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.

공개 사항

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
선언된 이해 상충이 없습니다.

재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
10% 도데실황산나트륨(SDS) 고품질 생물학351-032-721 EA
DEPC 처리수 고품질 생물학Tel.: 351-068-131
에틸렌디아민테트라아세트산(EDTA) 코 닝46-034-CL
트리스 염산염 (Tris-HCL) 2m pH 8.8 고품질 생물학Tel.: 351-092-101
프로테라제 K 뉴잉글랜드 바이오랩스 P8107S
일회용 폴리프로필렌(Eppendorf) 튜브에펜도르프24533495

재인쇄 및 허가

이 JoVE 논문의 텍스트 또는 그림 재사용 허가 요청

허가 요청

태그

FFPEH EDNA

관련 논문