방법 논문

단백질 올리고머를 위한 Multi-Angle Light Scattering을 사용한 크기 배제 크로마토그래피

2025년 7월 8일

이 논문에서

초록

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

출처: Some, D. et al., 다각도 광 산란(SEC-MALS)에 결합된 크기 배제 크로마토그래피에 의한 단백질 특성화. J. Vis. 특급 (2019).

이 동영상에서는 SEC(Size-Exclusion Chromatography) 및 MALS(Multi-angle Light Scattering)의 기능을 활용하는 SEC-MALS에 대해 설명합니다. SEC-MALS에서 SEC는 크기에 따라 단백질 또는 단백질 복합체를 분리하고, MALS 검출기는 분자에 의해 산란되는 빛의 강도를 다양한 각도에서 측정하여 평균 분자량을 결정합니다.

프로토콜

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1. 시스템 준비

  1. MALS 및 dRI 검출기를 FPLC의 UV 검출기 다운스트림에 연결합니다. pH 및 전도도 검출기는 UV 검출기와 MALS 검출기 사이에 상당한 검출기 간 부피를 추가하므로 우회합니다. 컬럼에서 검출기까지 또는 검출기 사이에 0.25mm i.d.의 모세관 튜브를 사용하고, 검출기 출력부에 폐기물 또는 분획 분취기로 가는 0.75mm i.d. 모세관 튜브를 사용합니다.
  2. FPLC의 I/O 박스를 통해 UV 검출기에서 MALS 아날로그 입력으로의 아날로그 출력과 FPLC에서 MALS 자동 주입으로의 디지털 출력을 포함하여 FPLC와 검출기 사이에 필요한 신호 연결이 설정되었는지 확인합니다.
  3. 최소 20kDa에서 500kDa의 분획 범위를 포괄하는 적절한 분석용 SEC 컬럼을 설치합니다. 제품 정보를 확인하여 컬럼이 MW, pH 및 샘플과 이동상의 기타 특성 범위에 적합한지 확인하십시오.

2. 버퍼 준비, 밤새 시스템 세척 및 청결도 확인

  1. HPLC 등급 시약을 사용하여 50-100mM NaCl이 함유된 인산염 완충 식염수 1L를 준비합니다. 보틀탑 폴리에테르 설폰 필터 또는 이와 유사한 것을 사용하여 버퍼를 0.1μm로 필터링합니다. 처음 50-100mL의 완충액을 폐기물 병에 여과하고 버려 건조 필터에서 미립자를 제거한 다음 나머지를 여과된 탈이온수로 철저히 세척하고 먼지가 들어가지 않도록 뚜껑을 씌운 깨끗하고 멸균된 병에 여과합니다.
    메모: Tris 완충액과 같은 다른 이동상 용매는 이러한 용매에 우선적으로 용해된 추가 단백질을 분석해야 하는 경우 사용할 수 있습니다.
  2. 0.5mL/분의 유속으로 밤새 플러시하거나 컬럼 제조업체에서 권장하는 대로 세척하여 버퍼의 컬럼을 평형화하고 미립자를 제거합니다. FPLC의 연속 흐름 모드를 사용하여 모든 SEC-MALS 실행이 완료될 때까지 흐름이 중지되지 않도록 합니다.
    1. 밤새 플러시하는 동안 dRI 플로우 셀을 퍼지 모드로 설정합니다. 샘플 실행을 시작하기 전에 퍼지를 끕니다.
    2. 플러시를 시작할 때 컬럼의 갑작스러운 압력 변화로 인한 "컬럼 흘림" 효과(또는 입자 방출)를 방지하기 위해 유속을 점진적으로 증가시킵니다.
    3. 시스템이 매우 안정적이고 입자가 없으며 원하는 이동상과 평형을 이루는 것으로 알려진 경우 야간 플러시를 더 짧은 2-3시간 플러시로 교체하십시오.
  3. 컬럼 다운스트림의 튜빙을 가볍게 두드려 축적된 입자를 방출하고 MALS 기기의 전면 패널 디스플레이에 있는 90° 검출기에서 신호를 관찰하여 시스템 청결도를 확인합니다. 피크 대 피크 잡음이 50 -100μV 이하인지 확인합니다.
  4. '블랭크' 주입을 수행하여 주입기에 입자가 없는지 확인합니다. '블랭크'는 신선하고 멸균된 바이알에서 준비된 작동 중인 버퍼입니다.
    1. 입자 피크의 부피가 1mL 이하이고 기준선보다 5mV 이상 높지 않으면 시스템이 샘플을 사용할 준비가 된 것입니다. 그렇지 않으면 깨끗해질 때까지 추가 블랭크 주입을 수행하거나 주입기를 청소하기 위한 유지 관리를 수행하십시오.

3. 샘플 준비 및 불러오기

  1. SEC 완충액에서 1-2 mg/mL로 최소 200 μL의 BSA를 준비합니다.
    메모: 침전을 방지하기 위해 BSA는 절대 순수한 물에 용해되어서는 안 됩니다.
  2. 주사기 팁 필터를 사용하여 단백질을 0.02μm로 필터링합니다.
  3. 건조 필터에서 입자를 제거하기 위해 처음 몇 방울의 여과액을 버리십시오.
  4. 또는 10,000 x g에서 15분 동안 시료를 원심분리하여 불용성 응집체 및 기타 큰 입자를 침전시킬 수 있습니다.
  5. BSA 용액 100μL를 루프에 주입합니다.
    메모: 이것은 권장되는 물질의 양이며, 안정성 또는 가용성과 같은 샘플의 상황에 따라 더 많거나 적은 물질이 주입될 수 있습니다. 주입 당 필요한 단백질의 양은 분자량에 반비례하여 달라지며, 분자량이 33 kDa 또는 BSA의 절반 인 경우 필요한 단백질 질량의 두 배입니다.

4. MALS 소프트웨어 준비

  1. 새로 열기 | MALS 소프트웨어 메뉴의 방법에서 실험하고 광 산란 시스템 방법 폴더에서 온라인 방법을 선택합니다. DLS 디텍터가 있는 경우 Light Scattering(광 산란)에서 Online method(온라인 방법)를 선택합니다. QELS 폴더 포함.
  2. Configuration 섹션에서 샘플 및 이동상의 매개변수를 설정합니다.
    1. Generic Pump 보기에서 FPLC에서 사용되는 유량으로 설정합니다.
    2. Generic Pump 보기의 Solvent 분기, Name 필드에서 PBS를 선택합니다.
    3. Injector 보기의 Sample branch에서 NameBSA로 입력하고 dn/dc = 0.185(변형되지 않은 단백질의 표준 값), A2 = 0 및 UV 흡광 계수 = 0.667 mL/(mg-cm).
      를 설정합니다. 메모: 다른 단백질의 경우, UV280 nm 흡광 계수는 문헌에서 찾거나 다양한 공개 도메인 소프트웨어 도구를 사용하여 그 순서에서 계산할 수 있습니다.
  3. Procedures(절차) 섹션의 Basic Collection(기본 수집) 보기에서 Trigger on Autoinject(자동 주입 트리거) 확인란을 선택하고 실행 기간을 70분으로 설정하여 SEC 열의 총 투과 부피에 도달할 때까지 전체 용리에 대한 데이터가 수집되도록 합니다.
    메모: 필요한 시간은 컬럼 및 유속에 따라 달라질 수 있으며, 표준 7.8mm x 300mm HPLC-SEC 컬럼의 경우 0.5mL/분에서 35분의 수집이 필요합니다.
  4. 실행 버튼을 클릭하여 MALS 소프트웨어에서 실험을 시작합니다. MALS 검출기를 통해 FPLC 기기에서 펄스 신호를 수신한 후 데이터 읽기를 시작합니다.
  5. 기기의 전면 패널에 있는 Autozero 버튼을 클릭하여 dRI 신호를 제로화합니다.

5. FPLC 소프트웨어 준비

  1. 단백질의 이름과 실행을 FPLC 소프트웨어의 Manual | 수동 명령 실행 | 세트 마크.
  2. 주입 밸브를 Manual load에서 Inject under Flow path로 전환합니다. 주입 밸브.
  3. I/O 상자 아래에 0.5s 펄스를 삽입하여 펄스 신호 포함 | 펄스 디지털 출력. 이렇게 하면 MALS 소프트웨어에서 데이터 수집이 트리거됩니다.

6. 샘플을 루프에 주입합니다. FPLC 소프트웨어에서 실행을 클릭하여 실험 실행을 시작합니다.

액세스가 제한되었습니다. 이 콘텐츠를 보려면 로그인하거나 체험판을 시작하세요.

공개 사항

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
선언된 이해 상충이 없습니다.

재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
AKTA 순수GE 헬스케어Tel.: 29-0182-26고속 단백질 액체 크로마토그래프(FPLC)
AKTA 유니콘GE 헬스케어FPLC 제어 소프트웨어
아스트라와이어트 기술MALS 데이터 수집 및 분석 소프트웨어
소 혈청 알부민 (순도>97%)시그마A1900분석물
DAWN 또는 miniDAWN와이어트 기술WH2 또는 WTREOSWH2 또는 WTREOS
증가 200 10/300GE 헬스케어크기 제외 컬럼, 200Å 기공, 10mm 내경, 300mm 길이
옵티랩와이어트 기술WTREX (영어시차 굴절률(RI) 검출기
염화나트륨 NaCl시그마71382HPLC 등급 NaCl
Stericup 병 상단 필터 폴리 에테르 설폰 0.1 μm 1000 mL밀리포어밀리포어이동상 필터
Whatman Anotop 10 주사기 필터 0.02 μmGE 헬스케어6809-1002샘플 필터
Whatman Anotop 10 주사기 팁 필터, 0.1μm 공극, 10mm 직경 GGE 헬스케어6809-1012샘플 필터
Whatman Anotop 25 주사기 필터 0.1 μmGE 헬스케어6809-2012이동상 필터
와이어트켈스와이어트 기술위크동적 광 산란 검출기
) 년 년 년

재인쇄 및 허가

이 JoVE 논문의 텍스트 또는 그림 재사용 허가 요청

허가 요청

태그

SEC MALS

관련 논문