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1. 오가노이드 배양의 통과
- 1ml의 차가운 기저 배지를 우물의 기저 매트릭스에 추가합니다. 1ml 마이크로피펫을 사용하여 기저 매트릭스가 분해될 때까지 위아래로 격렬하게 피펫을 쏟아냅니다. 15ml 튜브에 옮깁니다. 얼음 위에 놓습니다.
- 피펫에 오가노이드를 집어 넣고 위아래로 10회 격렬하게 피펫팅합니다. 오가노이드의 파괴는 눈으로 관찰할 수 있습니다.
2. 오가노이드 배양의 미세주입.
참고: 이 프로토콜은 오가노이드에 박테리아를 미세 주입하는 데 사용할 수 있습니다. 미세주사에 더 관대한 오가노이드로 주사를 시작하는 것이 도움이 될 수 있습니다. 예를 들어, 마우스 위 오가노이드는 표적화하기 쉬운 매우 큰 낭포성 오가노이드로 성장할 수 있습니다.
- 재료 준비
- 제조업체의 권장 사항에 따라 마이크로피펫 풀러를 사용하여 유리 모세관을 두 개의 주사 바늘로 당깁니다. 마이크로피펫 풀러는 중간에 있는 유리 모세관을 가열하고 모세관을 두 부분으로 당겨 두 개의 유리 바늘을 생성합니다. 여러 개의 바늘을 뽑아 깨끗한 페트리 접시에 보관하는 것이 실용적입니다.
- 세균 감염을 허용하려면 최소 3번의 매체 변경(=1주일) 동안 모든 매체에서 항생제를 제거합니다. 이것은 지하 매트릭스에서 항생제를 희석시킵니다. 특정 항생제에 내성이 있는 박테리아 균주를 사용하는 경우 이 특정 항생제를 추가하여 오염 가능성을 최소화하십시오.
- 미세 주입을 위해 작업대를 준비합니다. 다양한 생물 안전성 수준에서 작업하기 위해 멸균 벤치 내부에 실체 현미경을 배치해야 할 수도 있습니다. 이 프로토콜에서는 멸균 벤치 내부의 실체 현미경 아래에서 생물 안전성 레벨 2 조건으로 H. pylori를 주입합니다.
- 표준 프로토콜에 따라 박테리아를 배양하십시오.
- 감염의 다양성(MOI)을 추정하려면 아래에 설명된 대로 박테리아 수와 오가노이드당 세포 수라는 두 가지 매개변수를 추정합니다. MOI는 예를 들어 숙주의 IL-8 mRNA 발현과 같은 결과와 상관관계가 있을 수 있습니다.
- 감염 용액의 박테리아 밀도를 계산하려면 먼저 표준 프로토콜에 따라 광학 밀도 및 집락 형성 단위(CFU)의 표준 곡선을 설정합니다. 550nm에서 0.1의 광학 밀도는 약 107CFU/ml를 생성해야 합니다.
- 오가노이드당 세포 수를 추정하려면 1웰의 오가노이드 수를 세십시오. 1.1-1.4단계에 설명된 대로 오가노이드를 중단합니다. 200 x g 및 4°C에서 5분 동안 원심분리한 후 효소 해리 용액 1ml를 넣고 재현탁합니다.
- 37°C에서 5-10분 동안 반복적으로 흔들면서 배양합니다.현미경으로 세포가 단일 세포로 해리되었는지 확인합니다(10X 배율의 Leica DMIL과 같은 도립 현미경). 필요한 경우 배양을 연장하십시오.
- 혈구계를 사용하여 오가노이드당 세포 수를 계산하고 오가노이드당 세포 수를 계산합니다. 직경이 약 200μm인 인간 위 오가노이드에는 약 4,000개의 세포가 있습니다. ml당 1 x 109 박테리아가 있는 0.2 μl의 박테리아 용액을 주입하면 대략적인 MOI가 50입니다.
- 오가노이드 주입.
참고: 미세 주입의 경우 유리 바늘은 홀더에 고정되며 미세 조작기로 3차원으로 조작할 수 있습니다. 오가노이드는 우물 내의 지하 매트릭스 내에 남아 있습니다. 웰 안의 크기와 위치로 인해 모든 오가노이드가 동일하게 주입이 가능한 것은 아닙니다. 일반적으로 하나의 웰에서 가장 큰 30개의 오가노이드를 5분 안에 표적화할 수 있습니다.
- 박테리아를 수확하고 표준 프로토콜에 따라 기저 배지에서 세척합니다.
- 광학 밀도에 따라 ml당 박테리아 수를 계산합니다(2.1.5.1단계 참조). 기초 배지에서 박테리아를 ml당 1 x 109 박테리아로 희석합니다.
- 유리 바늘을 가져 가라. 집게를 사용하여 개구부 너비가 약 10μm가 되도록 팁을 끊습니다.
- 바늘을 주입 홀더에 삽입하고 마이크로 매니퓰레이터에 고정합니다.
- 바늘에 약 10μl의 세균 용액을 흡수합니다.
- 오가노이드 배양물을 포함하는 낮은 가장자리가 있는 4-well 플레이트를 실체현미경 아래에 놓습니다.
- 마이크로 매니퓰레이터로 탐색하면서 바늘로 단일 오가노이드를 목표로 합니다. 바늘을 오가노이드 가까이에 놓은 다음 한 번의 빠른 움직임으로 바늘을 오가노이드에 삽입합니다. 마이크로인젝터를 사용하여 각 오가노이드에 약 0.2μl의 박테리아 용액을 주입합니다.
3. 모든 분석을 위해 오가노이드를 수확합니다.
- 예를 들어, 상등액을 제거하고 1ml 2% 포름알데히드를 첨가한 후 4°C에서 RT 또는 O/N에서 20분 동안 배양합니다. 오가노이드는 표준 절차에 따라 면역조직화학을 위해 처리할 수 있습니다.