참고: 이 프로토콜은 다양한 식물 조직에 적용할 수 있습니다. 이 프로토콜에는 PAMP 유도 시 ROS 검출을 위해 쌀 칼집과 잎 디스크가 사용되었습니다. 차이점은 주로 샘플링 방법으로 인해 발생하므로 아래에는 일반적인 절차만 설명되어 있으며 필요한 경우 특정 단계가 언급됩니다.
1. 조직 준비 및 전처리
- 쌀칼집
- ROS 분석 1일 전에 전처리를 위해 날카로운 면도날 또는 수술용 칼날로 10일된 벼 묘목의 칼집을 3mm 조각으로 자릅니다(그림 1B).
- 100μL의 이중 증류수(ddH2O)가 포함된 96웰 마이크로타이터 플레이트의 개별 웰에 25°C의 어둠 속에서 25°C의 어둠 속에서 상처 부상 관련 이온 누출 및 방어 반응을 완화할 수 있는 5개의 칼집 세그먼트를 배치합니다(그림 2).
메모: 유도 용액에 노출된 일관된 절단 표면 면적을 보장하기 위해 절단을 수직으로 유지하는 것은 재현성이 높은 결과를 얻기 위한 중요한 단계입니다. 세그먼트를 부드럽게 이동합니다. 데이터 변동의 원인이 될 수 있는 세그먼트에 추가 절단이나 상처를 만들지 마십시오. 원칙적으로 ROS 값의 변동이 크기 때문에 각 테스트에는 최소 5번의 반복실험이 포함되어야 합니다. 반복실험 세트가 많을수록 데이터의 신뢰성이 높아집니다.
- 리프 디스크
- 4-6주 된 벼의 잎 디스크(직경 4mm)를 플런저가 있는 생검 펀치를 사용하여 자릅니다. 데이터 변동을 줄이기 위해 항상 메인 틸러의 두 번째 잎(위에서 번호가 매겨짐)의 중간 3분의 1에서 잎 디스크를 자릅니다(그림 1C).
- 전처리를 위해 100μL의 ddH2O가 포함된 96웰 마이크로타이터 플레이트의 개별 웰에 잎 디스크 하나를 놓고 PAMP에 의한 ROS 유도를 방해할 수 있으므로 상처 관련 반응을 완화할 수 있습니다(그림 2).
메모: 리프 디스크를 부드럽게 조작하십시오. 실험에서 디스크에 데이터 변동을 초래할 수 있는 추가 절단이나 상처를 만들지 마십시오. ROS의 유도는 대부분 절단 가장자리의 세포에서 발생하는데, 이는 쌀 조직 (잎 또는 칼집)의 표면이 소수성 층으로 덮여 있기 때문입니다. 절단 가장자리의 셀만 유도 용액과 접촉합니다(논의 섹션 참조).
- 잎 측면과 관련된 변화를 피하기 위해 물 전처리를 위해 마이크로타이터 플레이트의 우물에서 아축 방향 표면이 위를 향하도록 모든 잎 디스크를 떠 있게 유지합니다.
2. 유도 솔루션 준비
- L-012 분말을 ddH2O와 함께 20 mM (6.23 mg/mL) 수용액으로 용해시켜 원액을 만듭니다. 그런 다음 원액을 50mM Tris HCl 완충액(pH 7.5)으로 희석하여 최종 농도 500μM L-012에서 작동 용액을 만듭니다. 사용하기 전에 원액을 냉동 상태로 유지하고 작업 용액으로 희석하십시오.
- PAMP, L-012 및 양고추냉이 과산화효소(HRP; ddH2O에서 10mg/mL)를 함유하는 유도 용액을 준비합니다. 10mL 유도 용액의 경우 9.4mL의 50mM Tris HCl(pH 7.5) 용액, 400μL의 L-012 용액, 100μL의 HRP 및 100μL의 flg22(PAMP, ddH2O의 10mM)를 혼합합니다. 음성 대조군의 경우 PAMP.
대신 100μL의 ddH2O를 추가합니다.
메모: 쌀 조직에 대한 차가운 스트레스를 피하기 위해 준비된 유도 용액을 실온에 보관하십시오. 필요에 따라 키틴(최종 농도 20ng/mL)과 같은 다른 PAMP도 치료에 사용할 수 있습니다. L-012는 빛에 민감하기 때문에 L-012 용액이 포함된 모든 튜브를 알루미늄 호일로 덮습니다.
3. 참조된 마이크로플레이트 리더로 소프트웨어 시작 및 프로토콜 설정(재료 표 참조)
참고: 마이크로플레이트 리더 소프트웨어의 매개변수를 설정하는 데 시간이 걸립니다. 유도 솔루션을 추가하기 전에 기계와 프로토콜을 준비(한 번의 클릭으로 진행)하는 것이 좋습니다.
- 소프트웨어를 시작합니다. 실험 버튼을 클릭하여 새 프로토콜을 생성하거나 기존 프로토콜을 사용합니다.
- 팝업에서 절차를 클릭하여 플레이트를 설정합니다. 플레이트에서 모니터링할 웰을 선택합니다.
- Start Kinetic을 클릭하여 총 실행 시간과 읽기 간격을 설정합니다. 실험 요구 사항에 따라 실행 시간을 35분 이상으로 설정합니다. 가능한 한 자주 판독값을 얻으려면 최소 간격을 선택하십시오. 적분 시간의 경우 신호 강도에 따라 1초 이상을 선택합니다.
참고: 판독 간격은 샘플 수와 신호 통합 지속 시간에 따라 다릅니다.
- Validate (검증) | 확인을 클릭하여 설정을 확인합니다.
- 팝업에서 Detect the new plate(새 플레이트 감지)를 클릭하고 소프트웨어가 load plate(로드 플레이트) 대화 상자를 표시할 때까지 기다립니다. 테스트할 플레이트를 캐리어에 놓습니다.
- 여기에서 중지하여 유도 시스템이 설정될 때까지 기다립니다(다음 섹션에서). 유도 시스템이 준비되는 즉시 실행을 클릭하여 읽기를 시작합니다.
4. elicitation 시스템 구축 및 실시간 ROS 생산 측정
- 전처리된 조직이 들어 있는 웰에서 ddH2O를 조심스럽게 제거하여 조직 손상이나 건조를 방지합니다.
- 멀티채널 피펫을 사용하여 200μL의 유도 용액을 조직이 포함된 웰에 추가합니다.
- 부드럽게 흔들어 섞습니다. 실행을 클릭하여 감지를 시작합니다.
메모: PAMP 처리를 통해 식물 조직은 ROS에 매우 빠르게 반응하고 생성합니다. 따라서 여러 번의 치료가 있을 때 수술 시간을 줄이기 위해 PAMP가 없는 음성 대조군을 먼저 처리하는 것이 좋습니다. 처리 사이의 유도 지연을 줄이기 위해 가능한 한 빨리 작동하십시오. 유도 용액의 추가와 검출 시작 사이의 시간이 짧을수록 중요한 실험 데이터를 더 잘 캡처할 수 있습니다.