1. 리포터 세포를 이용한 잠재적 TLR4 나노 억제제 스크리
닝
참고: TLR4 신호전달은 MyD88 의존 육상 TRIF 의존 경로를 모두 활용하기 때문에 광범위한 TLR 신호 경로를 포괄하는 기본 대상으로 선택됩니다. THP-1-XBlue 리포터 셀은 주로 NF-κB/AP-1 활성화를 검사하는 데 사용되며 THP-1-Dual 셀은 TRIF 의존 신호 전달로 인한 IRF 활성화를 위해 사용됩니다.
- 스크리닝 전에 용량-반응 곡선을 생성하여 최적의 LPS 용량을 식별합니다.
- 작동 중인 LPS 용액을 R10 배지에서 0.01 - 100ng/mL의 최종 농도로 희석합니다(log10 스케일로 희석). 플레이트 디자인을 배치하고 96웰 둥근 바닥 배양 플레이트에서 희석합니다. 희석 후 각 웰에 최소 110μL의 용액이 있는지 확인하십시오.
- 진공 흡입기를 사용하여 세포 파종 플레이트에서 배양 배지를 부드럽게 제거합니다.
- 희석판(1.1.1)에서 제조된 R10 배지가 포함된 LPS를 샘플의 레이아웃에 따라 배양판으로 옮깁니다. 플레이트를 37°C(세포 배양 인큐베이터에서)에서 24시간 동안 배양합니다.
- 24시간에서 상등액(80μL/well)을 새로운 96웰 둥근 바닥 플레이트로 조심스럽게 옮깁니다. 이러한 용액에 대해 즉시 비색 및/또는 루시페라제 발광 분석을 수행하거나 분석 개발 전에 4°C(몇 시간) 또는 -20°C(일)에 보관하십시오.
메모: 플레이트 레이아웃의 디자인은 실험 및 데이터 분석을 위해 간단하고 명확해야 합니다. 각 조건에 대해 2-4번의 반복실험을 고려해야 합니다. 항상 음수 제어 그룹(LPS null)을 포함합니다. Dual cell은 대식세포로 분화된 후 NF-κB/AP-1 활성화의 배경이 상대적으로 높기 때문에 NF-κB/AP-1 활성화를 위해 THP-1-XBlue cell을 사용하는 것이 좋습니다. 그러나 NF-κB/AP-1 및 IRF 활성화를 모두 보고하기 위해 이중 셀을 사용하는 것이 가능합니다.
- NF-κB/AP-1 활성화를 위한 비색 분석 및 IRF 활성화를 위한 루시페라제 발광 분석을 개발합니다.
- NF-κB/AP-1 활성화를 평가하기 위해 각 샘플의 상등액 20μL를 새로운 96웰 평면 바닥 배양 플레이트로 옮기고 180μL의 예열된 SEAP 기질 용액을 각 웰에 추가합니다. 플레이트를 37 ° C에서 1-2 시간 동안 배양하여 색상 개발 (분홍색에서 진한 파란색)을 허용합니다. 플레이트 리더에서 655nm에서 흡수를 수집합니다.
주의: 배양 시간은 발색에 따라 달라질 수 있습니다(30분에서 최대 야간 배양). 발색의 채도(O.D >3)를 피하면서 가장 어두운 색상의 광학 밀도(OD)가 1 이상에 도달할 때까지 기다리는 것이 좋습니다.
- IRF 활성화를 분석하기 위해 각 샘플의 상등액 10μL를 96웰 투명하고 평평한 바닥 흰색 플레이트로 옮깁니다. 루시페라제 용액(50μL)을 추가하고 즉시 well.
로 발광을 잘 수집합니다.
메모: 자동 주입 기능이 있는 발광 플레이트 리더를 사용하여 웰에서 웰로, 플레이트에서 플레이트로 발광 판독의 일관성을 보장하는 것이 좋습니다. 기질 용액을 수동으로 주입하는 경우 각 웰에 대해 일관된 배양 시간과 판독 설정을 보장하십시오.
- 10ng/mL LPS 자극(1.1 기준)을 통해 다양한 펩타이드-GNP 하이브리드에 대한 스크리닝 분석을 수행합니다. 리포터 분석 개발을 위해 1.2에서 동일한 절차를 따릅니다.
- 원심분리 방법을 사용하여 펩타이드-GNP 하이브리드를 R10 배지에서 200nM로 농축합니다. 하이브리드 용액(10nM)을 18,000 x g에서 30분 동안 20부피 원심분리하고 상층액을 조심스럽게 버립니다. 하이브리드(튜브 바닥에 있음)를 튜브에 모으고 PBS로 두 번 세척한 다음 하이브리드를 R10 배지 한 부피에 다시 현탁시킵니다.
- 농축된 하이브리드와 R10 배지를 함유하는 LPS(20ng/mL)를 동일한 부피로 혼합하여 하이브리드와 LPS의 최종 농도가 각각 100nM 및 10ng/mL가 되도록 합니다.
- 배양된 플레이트에서 배양 배지를 제거하고 혼합 용액 100μL를 각 웰에 추가합니다(각 조건에 대해 3회 반복). 음성 대조군(배지만 해당) 및 LPS 대조군(하이브리드가 없는 10ng/mL LPS)을 포함합니다.
- 37°C에서 24시간 배양 후 각 웰의 매체를 튜브로 옮기고 18,000 x g, 4°C에서 30분 동안 튜브를 원심분리합니다.상층액(50-80μL/튜브)을 96웰 원형 바닥 플레이트에 수집하고 3.2.
에 설명된 대로 리포터 분석을 수행합니다.
주의: 원심분리 후 상등액을 버릴 때 튜브 바닥에 있는 하이브리드를 교반하지 마십시오.
메모: 1.3.4 단계의 원심 분리는 배양 배지에서 내부화되지 않은 나노 입자 하이브리드를 제거하는 데 매우 중요하며 하이브리드와 비색 / 발광 판독 값의 간섭을 피할 수 있습니다. 이는 금 나노 입자가 크기와 응집에 따라 넓은 파장의 빛을 흡수할 수 있기 때문입니다.
2. 잠재적 후보의 억제 효과 검증
참고: 스크리닝에서 잠재적 후보의 억제 효과를 확인하기 위해 두 가지 접근 방식이 사용됩니다. 하나는 고정된 하이브리드 농도(또는 그 반대)에서 각성제(LPS)의 용량 반응을 검사하는 것입니다. 다른 하나는 면역 블로팅을 통해 NF-κB/AP-1 및 IRF3 신호의 억제를 직접 살펴보는 것입니다.
- 접근법 1에서는 1.3에 설명된 것과 동일한 절차에 따라 100nM의 선도 하이브리드와 1ng/mL 및 10ng/mL에서 2개의 LPS 농도로 리포터 분석을 수행합니다. 비교를 위해 비활성 하이브리드(스크리닝 결과에 따라)를 하이브리드 대조군으로 포함합니다.
- 면역 블로팅 접근법의 경우 표준 실험 절차를 따르십시오.
- R10 배지에서 THP-1 세포를 배양하고, 세포를 12-well 배양 플레이트(2 x 106 cells/well)에 파종하고, 세포를 50ng/mL PMA로 24시간 동안 처리한 후 2일 동안 휴지하여 대식세포로 분화합니다.
- 세포 분화 후, 시간이 지남에 따라(최대 4시간) 하이브리드(100 nM)의 유무에 관계없이 10 ng/mL LPS로 세포를 자극합니다. 다양한 시점(0, 5, 15, 30, 60, 120, 240분)에서 면역블로팅을 위해 세포 용해물을 준비합니다. 비활성 하이브리드를 컨트롤로 포함합니다.
- IκBα, 인산화된 p65 및 인산화된 IRF3의 신호를 조사하여 NF-κB 및 IRF3의 활성화에 대한 선도 하이브리드의 억제 효과를 조사합니다. β-액틴 및 총 IRF3 신호를 내부 대조군으로 조사합니다.
메모: 신호 전달은 종종 리포터 효소 SEAP 및 루시퍼라아제(24시간)의 발현보다 훨씬 빠르게(몇 시간 내에) 발생합니다. 또 다른 검증 방법으로 24시간에 테스트된 하이브리드의 생존력 분석을 수행하는 것이 좋습니다.
3. TLR 특이성 평가
참고: 선도 펩타이드-GNP 하이브리드의 TLR 특이성을 조사하기 위해 TLR2, TLR3 및 TLR5를 포함한 다른 TLR 신호 경로를 테스트합니다. TLR7, 8 및 9는 THP-1 유래 대식세포가 대식세포에서 TLR7, 8 및 9 발현이 부족하기 때문에 이러한 TLR의 자극에 잘 반응하지 않기 때문에 제외됩니다.
- 1.1 및 1.2에서 동일한 절차에 따라 최적의 농도를 얻기 위해 두 리포터 세포 유래 대식세포에서 TLR2(Pam3CSK4), TLR3(poly I:C) 및 TLR5(편모)에 특이적인 리간드의 다양한 농도(1ng/mL - 25μg/mL)를 테스트합니다.
- 3.1에서 얻은 농도로 납 하이브리드(100nM)와 각 TLR 리간드의 혼합물로 세포를 처리하여 1.3에 설명된 실험 절차에 따라 리드 하이브리드의 억제 특이성을 평가합니다. 비교를 위한 컨트롤로 비활성 하이브리드를 포함합니다.