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Research Article
Iris Marangon*1, Nicole Boggetto*2, Cécilia Ménard-Moyon3, Nathalie Luciani1, Claire Wilhelm1, Alberto Bianco3, Florence Gazeau1
1Laboratoire Matière et Systèmes Complexes (MSC),CNRS/Université Paris Diderot, 2ImagoSeine BioImaging Core Facility, Institut Jacques Monod,CNRS/Université Paris Diderot, 3Laboratoire d'Immunopathologie et Chimie Thérapeutique,CNRS/Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
이 연구에서 주요 목적은 탄소 나노튜브(CNT)의 세포 흡수와 최종 엑소사이토시스를 모니터링하는 것이었습니다. 이러한 관점에서, 우리는 통계적으로 유의미한 수의 세포에서 CNT의 정량화 및 국소화를 허용하는 다중 스펙트럼 이미징 유세포 분석을 사용하는 고유한 방법을 제안했습니다.
탄소 나노 튜브 (CNT)와 같은 탄소 기반 나노 물질은 탄소가 풍부한 세포 구조와 구별하기가 매우 어렵고 사실상 세포 및 조직 수준에서 분포를 평가할 정량적 방법이 아직 없습니다. 여기서 우리가 제안하는 것은 다중 스펙트럼 이미징 유세포 분석기(ImageStream, Amnis)를 사용하여 세포 내 CNT를 검출하고 정량화할 수 있는 혁신적인 방법입니다. 새로 개발된 이 장치는 고처리량 세포와 고해상도 이미징을 모두 통합하여 각 세포에 대한 이미지를 직접 유동적으로 제공하므로 통계적으로 관련성이 있는 이미지 분석을 제공합니다. 각 세포 이미지는 명시야(BF), 암시야(DF) 및 형광 채널에서 획득되어 각 세포의 광 흡수, 산란 광 및 형광의 수준과 분포에 각각 액세스할 수 있습니다. 그런 다음 분석은 실험의 각 조건에 대해 획득한 7,000-10,000개의 세포에 대한 각 이미지의 픽셀 단위 비교로 구성됩니다. CNTs의 국소화 그리고 정량화는 CNTs의 몇몇 특정한 본질적인 재산 덕분에 가능하게 한다: 강한 가벼운 흡수율 및 산란; 실제로 CNT는 정확한 공동 국소화와 함께 BF에서 강하게 흡수된 어두운 반점과 DF에서 밝은 반점으로 나타납니다.
이 방법론은 빛을 충분히 강하게 흡수(및/또는 산란)할 수 있는 한 이 프로토콜이 광범위한 나노 물질에 적용할 수 있다는 점을 감안할 때 나노 물질과 세포 간의 상호 작용에 대한 연구에 상당한 영향을 미칠 수 있습니다.
지난 수십 년 동안 나노 입자의 위치는 광범위한 응용 분야에서 중요해졌습니다. 특히, 탄소 나노튜브(CNT)는 다양한 진단 및 치료 응용을 위한 나노 도구로 점점 더 탐구되고 있습니다. CNT는 특정 전기적, 열적 및 분광 특성 덕분에 다양한 약물 또는 조영제의 전달 매개체 역할을 하거나 조직 공학1에 관여할 수도 있습니다.
그러나, 그런 nanomaterials의 잠재적인 독성에 관하여 관심사는 유기체에 있는 CNTs의 운명이 아주 논란의 여지가 남아 있기 때문에 주로, 아직도 토론의 밑에 있습니다. 예를 들어, 라만 분광법, 광음향 및 근적외선 광발광 이미징과 같은 기술이 제안되었지만 각 방법은 나노튜브의 유형 및/또는 환경에 따라 한계를 보입니다2-8.
여기서 제안된 방법은 세포 내 나노 입자의 검출 및 정량화에 적용할 수 있습니다. 이는 유세포 분석과 고해상도 이미징을 결합한 장치인 ImageStream을 사용하여 가능했습니다. 많은 세포를 획득할 수 있는 장점(최대 5000 events/sec)과 통계 데이터와 각 세포의 고해상도 이미지를 동시에 얻을 수 있는 이점(0.5μm 공간 해상도)을 결합합니다. 일반적으로 이미지는 CCD 카메라를 사용하여 수집되며 세포의 2차원 그레이 스케일 표현입니다. 빛은 이미지의 각 픽셀에 대해 정량화되고 형광 또는 세포 내 크기(예: BF)를 가진 구성 요소의 강도와 위치를 모두 식별하므로 세포의 모양에 따라 세포를 구별할 수 있는 강력한 기능을 제공합니다9,10.
목표는 세포에서 CNT의 분포 및 거동을 정량적으로 평가할 수 있는 나노 계측 방법을 설계하는 것이었습니다. 특히, 이 방법은 세포에 의한 CNT의 세포 흡수, 처리 및 외세포작용(exocytosis)을 연구하기 위해 개발되었습니다. 우리는 첫째로 CNTs의 복잡한 세포질 수송을 입증하고 둘째로 세포 사이 이 nanomaterials의 이동을 입증했다: 세포 internalized CNTs는 압박을 받을 때 그들의 숙주 세포를 탈출하고, extracellular 공간에서 해외로 퍼지고 naive 세포에 의해, homotypic 또는 heterotypic11
이다는 것을 증명했다입니다.
이전 연구는 CNT 기능화 및 응집 상태12에 따라 능동 또는 수동적 인 세포 흡수의 다른 메커니즘이 발생할 수 있음을 보여주었습니다. 여기에서 다중벽 CNTs는 1,3-dipolar cycloaddition 및 amidation을 통해 기능화되고 그 후에 형광 프로브로 유도체화되었으며, 이소티오시아네이트(FITC)에 형광을 발했습니다. 투과 전자 현미경에서, 이들은 세포질 국소화를 통해 개별적으로 또는 다발로 세포에 의해 내재화되는 것으로 보이며, 대부분 엔도솜 및 리소좀 구획에서 발견됩니다11. ImageStream에서 클러스터링된 CNT는 BF의 어두운 점과 DF의 밝은 점으로 높은 상관관계를 나타내므로 CNT 표지 세포와 대조 세포를 명확하게 구분할 수 있습니다. 다른 한편으로는, CNTs로 기능화된 형광 마커에 의해 방출되는 형광 신호의 분포는 잘 공동 국소화되지 않았다: 실제로, 아마도 담금질 현상으로 인해, 녹색 형광 반점이 BF 및 DF의 반점과 반드시 일치하지는 않는다. 이는 첫째, 형광 프로브가 ImageStream을 사용한 CNT 검출에 필수가 아니며, 둘째, 포르티오리(fortiori)가 CNT의 정량화 및 국소화 모두에 대해 완전히 대표되지 않음을 나타냅니다.
nanoparticles의 통계적인 관계되는 정량화를 주는 저쪽에, 이 방법은 또한 세포에 있는 CNTs의 국소화에 관하여 정보를 제공한다, 예를 들면, 세포의 내부에 CNTs 대 원형질막에 묶인 그들을 구별한ᄂ다는 것을 의미하는. 세포 이미지에서 CNT를 국소화하는 능력은 기존 유세포 분석 분석의 한계를 명확하게 극복합니다13. 이 절차는 세포의 특정 영역에 맞는 마스크를 만들고 로드된 CNT에 해당하는 어두운 반점도 선택함으로써 여기에서 개발되었습니다.
일반적으로 이 방법은 사용된 나노 입자가 빛을 강력하게 흡수(및/또는 산란)할 수 있는 조건의 세포에서 시각화 또는 정량화의 필요성과 관련된 광범위한 실험에 적용할 수 있습니다.
1. 수 분 산성 탄소 나노 튜브 (CNT)의 제조
2. CNT로 셀 라벨링
3. 세포 고정
4. ImageStream 획득
멀티 스펙트럼 이미징 유세포 분석기 ImageStream을 사용하여 세포 이미지를 획득합니다.
몇 가지 사항을 존중해야 합니다.
5. 후처리 - IDEAS 분석 소프트웨어(버전 4.0)
ImageStream 장치의 원리에 대한 개요는 그림 1에 나와 있습니다. 명시야(BF), 암시야(DF 또는 측면 산란광) 및 형광 채널을 포함하여 유동하는 각 세포의 여러 고해상도 이미지를 생성하며, 그림 2에서 예시된 바와 같이 CNT로 표지된 3개의 다른 세포가 있습니다. 이러한 채널의 오버레이도 표시되며, 첫눈에 상관 관계를 보여줍니다.
모든 후처리 분석이 세포 이미징을 기반으로 한다는 점을 감안할 때 초점이 맞춰진 세포의 선택은 연구에 매우 중요합니다(그림 3). 실제로, CNTs의 존재는 표지되지 않은 세포와 비교된 대조 및 기온변화도 둘 다에 변화를 유도합니다: CNTs의 중요한 양을 internalized, 집중된 세포에는, 낮은 rms 기온변화도가 있는 경향이 있습니다 (보통 집중된 세포와 unfocused의 감별을 위해 이용된 유일한 모수인) 또한 중요한 대조에는, 왜 biparametric 줄거리가 근본적인지를 설명하. 그림 3에는 초점이 맞지 않은 셀(노란색 영역)과 초점이 맞춰진 셀(파란색 영역)의 차이가 표시되어 있습니다.
세포 내재화된 CNT는 특히 BF에서 강하게 흡수하는 다크 스팟으로 나타나는 경우 명확하게 구별할 수 있습니다(다양한 라벨링 농도의 효과 참조, 그림 4). 더욱이, BF에 대한 평균 픽셀 신호를 분석하여 흡수의 상대적 정량화를 제공했다: 그림 5의 그래프는 CNT-라벨링 농도에 따른 현저한 증가를 보여준다(실험 조건당 약 7,000개의 세포에 대한 결과).
둘째, CNT의 존재로 인한 반점에 해당하는 BF의 제한된 범위의 어두운 픽셀 또는 DF의 높은 강도의 픽셀에 적용되는 마스크의 사용을 통해 CNT의 정량화도 가능합니다(그림 6의 예 참조). 따라서 이러한 마스크의 영역을 플로팅하면 하이라이팅과 흡수 증가가 가능합니다(그림 7에서 BF의 마스크 영역과 함께 0-533 범위의 픽셀 선택).
또한, BF와 DF의 스폿 간의 상관관계는 BF 강도 대 BF 평균 픽셀 신호(그림 8 참조)(마스크 독립적 분석) 또는 BF의 마스크 면적(마스크 1) 대 DF 면적(마스크 2)을 플로팅하여 평가할 수 있습니다.
세포 내부의 CNTs 국소화를 위해 생성된 절차와 관련하여 그림 9A는 생성된 다양한 마스크를 표시합니다. 국소화 마스크(기본 세포 마스크의 침식에 기반)의 견고성은 라벨링된 세포와 라벨링되지 않은 세포의 집합체에서 시각적으로 확인해야 합니다. 모든 샘플에 동일한 마스크가 사용됩니다.
세포막의 검은 반점의 총 면적과 전체 세포의 전체 면적을 플로팅하면 4 °C에서 2 시간 배양과 비교하여 37 °C에서 20 시간 동안 배양 된 세포에 대한 내재화 점수를 제공합니다 (그림 9B 참조). 이는 CNT가 대부분 4 °C의 막에 위치한다는 것을 나타냅니다. 37 °C에서 CNT는 세포의 90 % 이상에서 내재화됩니다.
마지막으로 형광과 관련하여 이 매개변수는 형광 반점과 BF(및 DF)의 반점 사이의 상관관계가 너무 낮기 때문에 CNT의 정량화를 위한 지표로 사용되지 않았습니다. 실제로, FITC 강도와 명시야 평균 픽셀 간의 상관관계는 -0.2의 Pearson 상관 계수를 나타냅니다. 그림 10에는 형광 신호가 명시야 블랙 스팟과 적절하게 일치하거나 일치하지 않는 두 가지 사례가 나와 있습니다.

그림 1. ImageStream 개요 - 일반 작동.멀티 스펙트럼 이미징 시스템은 명시야, 암시야 및 형광의 세 가지 모드에서 셀당 최대 12개의 이미지를 획득합니다. 설정은 405, 488, 560 및 658nm를 포함한 5개의 여기 레이저로 구성됩니다. 빛은 다른 대물 렌즈(이 연구에서는 40X 대물 렌즈가 사용됨)를 사용하여 큐벳에 흐르는 세포에서 수집되어 angular array의 longpass filter 세트로 구성된 스펙트럼 분해 요소로 전달됩니다. 세포 이미지를 수집하는 CCD 카메라는 이미지 줄무늬를 방지하기 위해 시간 지연 통합(time-delay-integration)이라는 기술을 사용하여 작동됩니다. 확장된 피사계 심도(EDF)는 옵션입니다.

그림 2. 다양한 채널(명시야(BF), 암시야(DF), 형광(FITC) 및 오버레이)를 통해 ImageStream에서 캡처한 탄소 나노튜브(50μg/mL)로 라벨링된 세포의 이미지 갤러리. 세포 내 리소좀(intracellular lysosome) 내에 국한된 CNT는 명시야 이미지에서 큰 검은 점으로 나타납니다. 반대로, 그들은 어두운 영역과 형광 이미지에 밝은 점을 만듭니다.

그림 3. 초점이 맞춰진 셀 선택. BF 이미지에서 rms(Root Mean Square) 구배와 대비를 나타내는 이변량 점도표를 사용하면 초점이 맞지 않는 세포를 제외할 수 있습니다. 여기서 노란색 영역은 초점이 맞지 않은 셀을 나타내고 초점이 맞춰진 셀은 파란색으로 표시됩니다. 초점이 맞지 않는 세포는 명시야 이미지에서 낮은 contrast와 low gradient rms를 모두 특징으로 합니다. rms gradient 외에도 contrast feature는 CNT로 라벨링한 후 focused cell을 구별해야 합니다.

그림 4. ImageStream으로 시각화된 CNT의 용량 의존적 흡수. 명시야 이미지의 검은 반점의 수와 면적은 세포로 배양하는 동안 CNT의 용량에 따라 증가하고 있습니다(0-50μg/ml 범위). 대조군 셀에는 검은 점이 없습니다.

그림 5. 명시야 이미지를 기반으로 한 CNT 흡수의 상대적 정량화. 전체 세포를 특징으로 하는 마스크 "개체"에 적용된 평균 픽셀 특징의 히스토그램은 정량화에 사용할 수 있는 용량 의존적 거동을 명확하게 보여줍니다. R9 범위는 CNT 양성 세포를 둘러쌉니다.

그림 6. BF에서 블랙 스팟을 선택하고 DF 이미지에서 밝은 스팟을 선택하는 마스크 생성. CNT가 BF 이미지에서 강하게 흡수하는 다크 스팟으로 나타나기 때문에 본 연구에서는 0-533(마스크 1, 표기: Intensity(M01, BF, 0-533))으로 구성된 낮은 강도의 제한된 범위의 픽셀을 선택하기 위해 임계값 마스크를 생성합니다. 반대로, DF 이미지(마스크 2, 표기법: 강도(M06, DF, 150-4095))의 고휘도 픽셀(이 경우 150-4095)이 있는 마스크 피팅을 사용하여 높은 산란 영역에 해당하는 DF의 밝은 지점을 선택합니다.

그림 7. CNT의 용량 의존적 흡수는 BF 이미지에서 블랙 스팟 영역의 정량화에 의해 입증됩니다. BF에 적용된 임계값 마스크(마스크 1)를 사용하여 각 세포에 대한 블랙 스팟의 면적을 정량화하여 용량 의존적 분포를 보여줄 수 있습니다.

그림 8. BF(흡수) 및 DF(산란) 이미지를 기반으로 한 CNT 정량화 방법은 상관관계가 있습니다. 왼쪽에서 BF 이미지의 평균 픽셀과 DF 이미지의 강도는 CNT(50μg/ml)로 라벨링된 세포에 대해 양호한 상관관계를 보여줍니다(Pearson 상관 계수 r = -0.68). 오른쪽은 BF에 어두운 반점이 맞는 마스크 영역과 CNT(50μg/ml)로 라벨링된 세포에 대해 DF에 밝은 반점이 맞는 마스크 영역입니다. Pearson 상관 계수는 r = -0.83입니다.7,000개 셀의 값이 표시됩니다.

그림 9. 특정 마스크를 사용한 세포의 CNT 국소화. (A) 마스크는 세포의 특정 위치, 즉 왼쪽에서 오른쪽으로, 세포 전체, 막만, 세포 내부에 맞게 만들어집니다. 또 다른 마스크는 임계값 강도(마스크 1, 표기: Intensity(M01, BF, 0-533)) 덕분에 검은 반점에 맞습니다. (B) CNTs의 국소화의 평가는 A. CNTs (50 μg/ml)를 가진 배양은 내재화 경로를 금하기 위하여 37 °C와 4 °C에 둘 다 기술된 세포의 다른 국소화에 있는 검은 반점의 지역을 측정해서 얻어질 수 있다. 전체 세포의 검은 색 영역과 막의 검은 영역을 나타내는 그래프는 4 ° C에서 막에서 CNT의 용량 의존적 흡수를 보여주는 반면, CNT의 전체 내재화는 37 ° C에서 효과적입니다.

그림 10. FITC 이미지의 형광 밝은 점과 BF의 CNT 유도 흑점의 공동 국소화. 형광 밝은 반점이 항상 BF의 검은 반점과 같은 국소화되는 것은 아닙니다. 표시된 처음 두 셀에 대해서는 제대로 일치하지만 마지막 두 셀에 대해서는 일치하지 않습니다.
저자는 경쟁하는 금전적 이해관계가 없음을 선언합니다.
이 연구에서 주요 목적은 탄소 나노튜브(CNT)의 세포 흡수와 최종 엑소사이토시스를 모니터링하는 것이었습니다. 이러한 관점에서, 우리는 통계적으로 유의미한 수의 세포에서 CNT의 정량화 및 국소화를 허용하는 다중 스펙트럼 이미징 유세포 분석을 사용하는 고유한 방법을 제안했습니다.
이 작업은 ANR P2N (Nanother 프로젝트 2010-NANO-008-04), Region Ile de France (계약 번호 E539) 및 CNRS의 지원을 받았습니다. 오픈 액세스는 EMD Millipore가 비용을 지불했습니다.
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