이 문서에서 우리는 단일 세포 분석을위한 마이크로 유체 칩을 제시한다. 그것은 수있는 세포 내 단백질, 효소, 조효소, 형광 분석이나 면역에 의해 두 번째 메신저의 정량화.
방법 논문
이 문서에서 우리는 단일 세포 분석을위한 마이크로 유체 칩을 제시한다. 그것은 수있는 세포 내 단백질, 효소, 조효소, 형광 분석이나 면역에 의해 두 번째 메신저의 정량화.
우리는 병렬로 복수의 단일 세포에서 세포 내 생체 분자의 정량적 측정을 가능하게하는 미세 유체 장치를 제시한다. 이를 위해, 세포는 수동적 microchamber의 중간에 갇혀있다. 제어 층의 활성화시에, 셀은 작은 챔버에서 주변 볼륨으로부터 분리된다. 주변 음량은 고립 셀에 영향을주지 않고 교환 될 수있다. 그러나, 챔버의 짧은 개방 및 폐쇄시에, 챔버 내 용액을 몇 백 밀리 초 내에서 대체 될 수있다. 때문에 실의 가역성에, 세포 배양, 세척, 및 최종적으로, 세포 용해 예 : 고도로 제어 가능한 방식으로 다른 솔루션을 순차적으로 노출 할 수있다. 단단히 밀봉 microchambers은 해물의 유지를 가능하게 최소화하고 세포 용해 후 희석을 제어 할 수 있습니다. 용해 및 분석은 동일한 위치에서 발생하기 때문에, 고감도가 유지되어 더 이상의 D보기 때문에분석의 ilution 또는 손실이 운송 중에 발생합니다. microchamber 디자인 따라서 각각의 세포에서 방출 세포 내 분자 (아토 몰, zeptomoles)의 매우 작은 크기의 숫자의 신뢰성과 재현성 분석을 가능하게한다. 또한, 많은 microchambers 적합한 광학 기기가 모니터링을 위해 사용되는 관련 한번에 많은 세포의 분석을 가능하게 배열 형식으로 배열 될 수있다. 우리는 이미 세포 내 단백질, 효소, 보조 인자 및 상대 또는 절대 하나를 정량화 할 수있는 방법으로 두 번째 메신저를 분석하기 위해 개념 증명 연구를위한 플랫폼을 사용하고 있습니다.
과거의 많은 연구는 세포에 세포 대 세포 인구 1-3 이내의 차이, 특히 신호 4를 처리, 또는 단백질 5,6, 대사 및 보조 인자 7,8 세포 내 생체 분자의 양을 제시했습니다. 이러한 이질성은 세포의 적응과 진화 9 근본적으로 중요 할뿐만 아니라, 암과 10-13과 같은 질병의 출현 및 치료에 중요한 역할을하는 것으로 간주됩니다. 따라서, 단일 세포 수준에서의 연구는 이러한 연구는 생리 활성 화학 물질로 처리 한 후 다른 세포 반응을 표시하는 경우 특히, 생물학적, 약리학 적 연구에 높은 관심이다.
최근, 많은 분석 플랫폼은 하나의 살아있는 세포의 분석이나 세포 함량의 화학 성분을 용이하게 개발되었다. 형광 활성 세포 정렬 (FACS)는 금 성 동안andard 단일 살아있는 세포의 매우 높은 처리량 분석을 위해,이 방법은 세포 내 또는 분비 화합물의 정량에 이용 될 수 없다. 미세 유체 플랫폼의 출현 위치, 치료 및 단일 세포의 관찰에 대한 새로운 분석 전략을 약속했다. 미세 유체의 이정표가 지진 및 동료 (14, 15)에 의해 실현 유연한 PDMS 밸브의 통합에 도달 하였다. 그들은 칩 영역을 분리 할 수 있기 때문에이 밸브가 유용합니다, 예를 들어, 두 문화 (16)를 분리합니다. 게다가, 그들은 단일 세포 분석에 특히 적용 가능하며, 따라서 분석 희석의 문제를 줄일. 단일 세포 분석을위한이 방법의 파워는 최근 한센 평행 17 단셀 수백 개 유전자 발현을 분석하는 동료에 의해 입증되었다.
단백질 및 대사 산물을 대상으로하는 경우, 분석 인해 최적의 부족으로 아주 어렵다mplification 방법, 다른 본 발명의 화합물 및 화학 특성에서의 변화의 큰 수입니다. 또한, 대부분의 세포 내 생체 분자가 몇 가지 수만 18의 순서로 낮은 사본 번호에 존재하는 것으로 예상된다, 따라서 사용 된 분석 방법은 높은 감도를 가지고 있어야합니다. 이러한 면역 효소 결합 면역 분석법 (ELISA)와 같은보다 강력한 분석은 여러 세척 및 배양 단계뿐만 아니라 표면의 고정을 필요로하기 때문에 마이크로 유체 장치에 통합하기가 어렵습니다.
때문에 이러한 문제로, 그것은 단백질 또는 대사 산물이 단일 세포 수준에서 정량화 된 곳에서만 몇 가지 예는보고 된 것은 놀라운 일이 아니다. 예를 들어, 형광 화합물의 분비 연구 19,20보고되었다. 최근, ELISA와 구현은 세포 배양에서 분비 (비 형광) 단백질 (THP-1 세포) (21)와 하나의 (난의 분석을 제시했다mmune) 세포 10. 세포 내 단백질을 표적시 등이. 면역 측정법 (11)의 수단에 의해 종양 세포에서의 신호 전달 경로의 분석을위한 세포 내 단백질의 식별을 용이하게 미세 유동 장치를 개발했다. 그러나, 단백질의 단지 상대적인 양을 결정하고, 어떤 효소 증폭 낮은 풍부한 단백질에 대한 신호를 증가하는 데 사용되지 않았다.
최근에는 형광 분석법 (8) 및 면역 분석 (22)와 단일 셀 트래핑 마이크로 디바이스 (도 1)에 결합 할 수 있었다. 세포는 수동적으로 공급하고 세포의 움직임이없는 매체 및 기타 화학 물질의 (빠른) 교환을 할 수 microsized 장애물 구조에 갇혀있다. 각 트랩의 주위에 고리 모양의 밸브는 매우 작은 양 ( "microchamber")에서 세포의 분리를 가능하게한다. 이 밸브는 바로 그가, 세포 용균 (hypoosmolar) 버퍼를 도입 한 후 작동되는NCE 멀리 확산 세포 내 분자 또는 분자의 분비를 방지한다. 가장 중요한 점으로 인해 부피 (625 PL)의 작은 사이즈에 분자의 대규모 희석은 회피된다. 용해 및 분석을 칩의 동일 위치에서 수행되기 때문에 한층, 운송에 의한 분석 물질의 손실이 없다. 여기에 설명 된 칩 설계는 60 microchambers 총 7,8 어느 microchambers 13 교번 행을 포함한다. 라인을 따라 교차 오염이 배제되도록 챔버, 행에 작동된다.
플랫폼은 형광 분석법뿐만 아니라 면역 분석법 (도 1D)와 조합하여 사용할 수있다. 후자의 경우에, 우리는 칩 생산 및 조립 공정과 호환되는 항체의 고정화를위한 프로토콜을 확립. 따라서 플랫폼은 단일 세포 수준에서, 중요한 신뢰성과 정량 분석을위한 길을 엽니 다. 지금까지, 우리는 I의 분석 장치를 사용했다ntracellular 분비 효소 (효소 분석에 의해 상대 정량), 세포 내 보조 인자, 단백질과 작은 분자 (엔드 포인트 분석 또는 ELISA에 의한 절대 정량). 이하에서, 우리는 마이크로 콘택트 프린팅 및 표면 화학에 의해 다층 소프트 리소그래피 및 항체의 패터닝을위한 프로토콜에 의해 칩의 제조 공정을 설명한다. 또한, 칩의 사용과 작업의 몇 가지 예는 제공됩니다.
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1. SU-8 마스터 제작
다음과 같은 프로토콜을 사용하지만 서로 다른 마스크 패턴 (회로도 및 치수는 그림 2 참조, 유체 제어) 채널을 모두 마스터 금형을 준비합니다. 공정은도 3a에 도시된다.
2. 미세 접촉 인쇄를위한 마스터 제작
3. 미세 유체 칩의 제조
이층 장치 설계는 이들 실험을 위해 사용된다. 칩 최종적 유리 슬라이드 (도 3b)에 접착되기 전에 두 층은 별도로 준비되어 함께 접착된다. 이 단계는 PDMS 층의 제조 및 마이크로 콘택트 인쇄 PDMS 스탬프를 설명한다.
4. 유리 슬라이드에 결합
직접 효소 분석을위한 장치를 사용하려면, 접합 후 필요한 유일한 단계는 표면의 차단입니다. 이 프로토콜의 경우, 면역 또는 ELISA를위한 마이크로 유체 칩을 사용하는, 그러나 A.로 진행, 만 (즉, TIRF 현미경 또는 SPR에 대한) 유리 슬라이드에 결합 부위를 제한하는 프로토콜 B를 참조하십시오. 이러한 제한은 중요하지 않은 경우를 참조하지만, 단계 8.6에서 비오틴 콘쥬 게이트를 사용하여 단계 4.8를 계속프로토콜 B에 완전한 기능의 표면을 만들 수 있습니다.
이전 프로토콜 A와 B를 수행하기 : 그것은 이전의 칩에 그들을 소개에 사용 된 단백질의 모든 솔루션을 필터링하는 것이 좋습니다. 파편과 단백질 응집체는 그렇게함으로써, 분석을 위해 사용할 수있는 챔버의 수를 줄이고, 세포 트랩을 차단할 수있다. 이를 위해, 채널에 그들을 도입하기 전에 모든 해법을 필터링하는 비 단백질 흡착 필터 장치를 사용한다.
프로토콜 A (효소 분석)
프로토콜 B (면역)
이후 단계 4.7 표면 개질의 전체 개요는 표 1을 참조하십시오.
5. 세포 실험
프로토콜은있을 수 있기 때문에 분석의 다양성의 일반적인 용어로 작성됩니다. 예로서 G6PDH 독성 분석에 필요한 시약은 주어진다. 장치의 초기 셀 포집 효율 즉, 200 세포 중 5 갇혀되며, 약 2.5 %이다. 세포 트랩의 최종 인원은 강력하게 사용되는 세포주 일시 중단하는 프로토콜에 따라 달라집니다세포주 및 시간은 셀 채널을 통해 플러싱된다. 자연적으로 (예 : U937)를 서스펜션에서 성장 세포를 들어, 하나의 세포는 몇 분 후 챔버의 75 % 정도에서 찾을 수 있습니다. 다른 챔버들 중 하나 가득, 또는 두 개 이상의 셀에 의해 점유되지 않는다. 일반적으로, 단일 셀 점유도는 점착성 세포주 작다. 여기에 제시된 오히려 온화한 현탁 프로토콜을 사용하는 경우, 비율 (HEK MLT 세포)를 대략 30 %로 감소한다. 단일 셀 점유도는 세포를 트립신 처리에 의해 개선 될 수 있지만,이 또한 실험 결과를 변경할 수있다.
표적 분자에 따라, PDMS에 흡착 또는 흡수가 결과에 영향을 미칠 수있다. 흡착 BSA 또는 PLL-g-PEG를 가진 표면을 차단함으로써 감소 될 수있다. 흡수는 대부분 친수성 생체 분자에 대한 확률이지만, (소) 친 유성 세포 성분에 대해 검사되어야한다.
프로토콜 A (효소 분석)
참고 : 분석에 적합합니다 모든 버퍼를 선택 (트리톤, SDS 등) 강한 세제를 Lyse 세포가 즉시 실 개방시 분석의 손실로 이어질 것입니다 염두에 그러나 벌거 벗은.
프로토콜 B (면역)
ELISA 세포 실험 (유량, 챔버 상태 등)에 대한 간단한 설명은 표 1을 참조하십시오.
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우리의 플랫폼에 존재하거나 단일 세포에 의해 생산 세포뿐만 아니라 다양한 분비 분자를 분석 할 수있다. 여기에서, 우리는 가능한 분석의 다양성을 강조하기 위해 다른 예를 들어 연구를 제시하고 싶습니다. 우리는 분비 효소 (그림 5a)뿐만 아니라 세포 내 효소 (그림 5b)와 단백질 (그림 5C와 D)에 대한 예를 제공합니다. 이러한 보조 인자 또는 작은 분자로 더 많은 예제를 위해, Eyer 등. Eyer 등으로 (2012) 참조하여주십시오. (2013).
첫째, 우리는 분비되는 효소 (그림 5a)에 대한 분석을 제시한다. 포르 볼 미리 스테이트 아세테이트 (PMA)를 활성화시에, 사람의 단핵구는 리소자임의 분비, 세균 세포 용해를 유도 효소를 유도한다. 이 분석을 위해, 세포는 완충액 4 - 메틸 움 β-D...
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미세 유체 기술은 단일 세포 분석을위한 새로운 매혹적인 가능성을 열었습니다. 특히, 트랩 가능성 및 미세 도구를 사용하여 개별적으로 세포를 고정화는 단일 셀의 속성과 응답에 대한 체계적인 장단기 연구를 허용했다. 또한, 마이크로 칩에서 생성 고주파 미세 방울, 셀의 캡슐화는, 통상적 계측법 장치로 수행 할 수없는 단일 세포 분비 연구를 사용할 수있다. 의 microdroplet 방법은, 그러나, 배양 및 세척 단계를 분석 프로토콜에 필요한 몇 가지 제한 사항이 있습니다. 우리의 접근 방법은 셀 포착 및 분리의 개념을 모두 겸비하고 따라서, 표면에 고정화 된 항체에 근거 면역 포함한 더 복잡한 분석을 수행하기 용이하게한다. 또한, 상기 방법은 애플리케이션과 타겟 분석 물에 대해 매우 유연하다.
마이크로 칩의 설계는 (I) effi 수cient 셀 트래핑 각종 버퍼 및 시약 (ⅱ) 공급하고, 매우 작은 양의 (III)의 안정적인 절연 필수. 이러한 방식으로 타겟 분자의 희석은 회...
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저자는 더 경쟁 재정적 이익이 없다는 것을 선언합니다.
저자는 기꺼이 원고, 맞춤형 압력 제어 시스템의 건설을위한 C. Bärtschi 및 H. 벤츠의 증거 독서 톰 로빈슨을 인정합니다. 우리는 또한 클린 룸 시설 FIRST 두 ETH 취리히에서 빛을 현미경 센터 (LMC)의 사용을 인정하고 싶습니다. 작품은 7 번째 프레임 워크 프로그램 (ERC 그랜트를 시작, 프로젝트 없음. 203428, nμLIPIDs)에서 머크 세로 노, 유럽 연구위원회 (ERC)에 의해 투자되었다.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| REAGENTS: | |||
| 시약 | 회사 | 카탈로그 번호 | 코멘트 (선택 사항) |
| SU-8 2015 | MicroChem Corp. (Netwon, MA) | ||
| ABCR (Karlsruhe, Germany) | AB103608 | ||
| 4-methylumbelliferyl β-D-N,N′-diacetylchitobioside hydrate | Sigma Aldrich | M9763 | |
| Acetone | Merck VWR (독일 다름슈타트) | 100014 | |
| Avidin | AppliChem (Axon Lab AG) | A-2568 | |
| AZ 1518 | AZ Electronic Materials (독일 비스바덴) | n.a.AZ | |
| 726 개발자 | AZ Electronic Materials (독일 비스바덴) | n.a. | |
| 소 혈청 알부민 | 시그마 알드리치 | A-4503 | |
| 소 혈청 알부민, 비오틴 | 시그마 알드리치 | A-8549 | |
| 세포 해리 완충액 | 인비트로젠 | 13151-014 | |
| 헥사메틸디실라잔(HDMS) | 시그마 알드리치 | 40215 | |
| 염산 | 플루카 | 84422 | |
| 이소프로판올 | Merck VWR (독일 다름슈타트) | 109634 | |
| Magnesium chloride hexahydrate | Fluka | 63068 | |
| MR developer 600 | Microresist technology GmbH (독일 베를린) | n.a.PBS | |
| Invitrogen | 10010-031 | ||
| PLL-g-PEG grafted | SuSoS, (Dü bendorf, Switzerland) | n.a.PLL-g-PEG | |
| 이식 비오틴 | SuSoS, (Dü bendorf, Switzerland) | n.a. | |
| 염화칼륨 | Fluka | 60132 | |
| Protein G, biotin | Sigma Fine Chemicals | 41624 | |
| 실리콘 웨이퍼 | Si-Mat (Kaufering, 독일) | n.a.Sylgard | |
| 184 Silicone Elastomer Kit (PDMS) | Dow Corning | 39100000 | |
| Tris(hydroxymethyl)-aminomethan | Biorad | ||
| 1610716 트윈 20 | Biorad | 1706531 | |
| EQUIPMENT: | |||
| Material Name | Company | Catalogue Number | Comments (optional) |
| 0.22 µ m PES 주사기 필터 | TRP | 99722 | |
| 1/1.5 mm 생검 펀처 | Miltex, York PA | 33-31AA/33-31A | |
| Cell Trics 필터 20 µ m | Partec | 04-004-2325 | |
| 원심분리기 Sigma 3-18K | Kuehner | n.a.Hotplate | |
| HP 160 III BM | Sawatec, Sax, Switzerland | n.a.MA-6 | |
| 마스크 aligner | Karl Suess | n.a.Multizoom | |
| AZ100M 현미경 | Nikon Corporation | n.a.Photomask | |
| Microlitho, Essex, U.K. | n.a | ||
| 플라즈마 클리너 PDC-32G | Harrick | n.a.Spin | |
| coater Modell WS-400 BZ-6NPP/LITE | Laurell | n.a.Spin | |
| 모듈 SM 180 BM | Sawatec, Sax, Switzerland | n.a.Step | |
| 프로파일러 Dektak XT Advanced | Bruker | n.a. | |
| 주사기 펌프 neMESYS | Cetoni | n.a. |
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