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방법 논문

Bluetongue 바이러스에 대한 항 바이러스제 소설의 식별에 대한 분석

13.9K 조회수

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DOI:

10.3791/50820

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2013년 10월 11일

이 논문에서

요약

세포 변성 효과 (CPE) 기반의 분석, 용량 - 반응 분석 및 시간 - 중 - 추가 TOA () 분석 등의 세 가지 분석은 물론, 개발, 최적화, 검증 및 Bluetongue 바이러스에 대한 새로운 항 바이러스제 (BTV)를 식별하기 위해 사용 된 새로 확인 된 항 바이러스제에 사용할 수있는 기계 장치의 액션 (대학교 미술관)을 결정하기로.

초록

BTV에 대한 잠재적 인 항 바이러스제를 확인하기 위해, 우리는 개발, 최적화 및 여기에 제시된 세 가지 분석을 확인했다. CPE 기반의 분석은 화합물은 항 바이러스 효능을 보여 큰 화합물 라이브러리를 화면으로 사용되었는지 여부를 평가하기 위해 개발 된 최초의 분석이었다. 한편, 항 바이러스의 세포 독성은 CPE 기반 분석을 사용하여 평가 될 수있다. 용량 - 반응 분석을 선택된 바이러스에 대한 효능의 범위를 결정하기 위해 디자인 된, 50 % 억제 농도 (IC 50)이나 유효 농도 (EC 50)뿐만 아니라 세포 독성의 범위 (CC 50) 즉. 토아 분석은 BTV 바이러스 라이프 사이클 또는 호스트 세포 기계에 대한 가능한 영향 동안 새로운 항 바이러스제의 기본 메커니즘을 결정하는 최초의 대학교 미술관의 연구에 사용 하였다. 이러한 분석은 세포 배양 시스템의 항 바이러스 효능을 평가하는데 매우 중요합니다, 우리의 최근의 연구지도를 위해 사용되어왔다BTV에 대한 새로운 항 바이러스제의 숫자의 식별을 보내고.

서론

BTV는 속 Orbivirus, 가족 Reoviridae에 프로토 타입 이중 가닥 RNA 바이러스이다. BTV는 세계 1,2 30억달러 / 년 손실, 양, 염소, 소와 다른 가축 등 국내 가축의 가장 중요한 질병 중 하나입니다. 이국적인 BTV의 혈청 형에 나열된 중요한 동물 병원체는 "USDA 높은 위험성 평가 가축 병원체." 최근 다시 부상 BTV의 북부 유럽 3,4에 걸쳐 여러 국가의 주요 가축 질병의 발생과 양을 발생했습니다. 경제적으로 중요한 결과 및 모델 시스템으로서, BTV는 유용한, 분자 유전 학적 및 구조적 연구의 대상이되어 왔으며, 몇몇 백신이 개발되었다. 그러나, 항 바이러스 약물 발견을위한 적합한 분석법의 부족 때문에, BTV 대에는 항 바이러스제는 없다.

모델 시스템으로 BTV를 사용하여 최근의 높은 처리량 검사 (HTS) 캠페인, 우리는 거라고, eveloped 최적화 아르보 바이러스 5에 대한 잠재적 인 광범위한 스펙트럼 항 바이러스를 식별 할 수있는 CPE 기반의 분석을 확인. CPE 기반의 분석은 신속하고 관찰 할 수있는 CPE / 세포 사멸 5-7을 유발 바이러스의 숫자에 대한 항 바이러스 약물 발....

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프로토콜

1. 셀, 바이러스 및 항 바이러스 화합물

  1. BSR 세포, 5 % 소 태아 혈청 (FCS)를 포함하는 아기 햄스터 신장의 파생 둘 베코의 변형 이글 배지 (BHK) 세포를 10 일 (DMEM)을 유지, 100U/ml 페니실린 및 100 ㎍ / ml의 스트렙토 마이신.
  2. 세 가지 분석을 위해, 1 % FCS, 100U/ml 페니실린 및 100 ㎍ / ml의 스트렙토 마이신과 DMEM에 플레이트 세포, 5는 이전 최적화로. 이 매체는 세 가지 분석을위한 분석 매체로 언급된다.
  3. 5 % CO 2와 80~95%의 습도, 37 ° C에서 인큐베이터에있는 모든 세포를 품어.
  4. 패 정화 이전에 8 바와 같이 유형 10 BTV (BTV-10)를 전파. 지정된 각 분석에 대한 분석 매체에 BTV-10을 희석.
  5. 10 mM의 농도에서 주식을 형성하기 위해 DMSO의 모든 테스트 화합물을 용해. -20 ° C에서 주식을 저장
  6. 를 지정 대한 분석 배지를 사용하여 원하는 농도로 화합물을 희석D의 분석 2.

2. CTG 키트를 사용하여 CPE 기반 분석

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결과

1. 화합물의 항 바이러스 효능

세포 기반 분석 CPE는, 개발 및 최적화 이전 2,5 바와 같이 BTV 대해 신규 바이러스제를 식별하는 발광 기반 CTG 키트를 사용하여 시험 관내에서 입증되었다. 열 - 투여 량 반응 분석은 살아있는 세포 5,11 제시 세포 ATP의 정량에 기초 문화 대사 생존 세포의 수를 측정함으로써 확인 된 리드 화합물의 항 바이러스 효능 및 독성을 반영하기 위해 사용 하였다. 우리의 이전 보고서에서 잠재적 인 항 바이러스 화합물의 수는 BTV 5에 대한 HTS를 통해 식별 된 각 클러스터에서 화합물을 포함하여, 평가, 및 그 유도체를 통해 새로이 합성 2했다. 해당 EC (50)에 기초하여, CC (50) 및 SI (50)는 여러 가지 유망한 납 화합물은 강력한 항 바이러스 효능, 낮은 독.......

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토론

바이러스 히트 초기 식별, 항 바이러스 약물 발견과 개발을위한 중요한 단계 중 하나는, 정량 가능한 마커를 선택하는 간단한 프로토콜을 개발, 충분한 신호와 10 % 미만의 CV를 획득 포함하는 견고한 분석법을 개발하는 것이다. 대부분의 생화학 적 또는 세포 - 기반 화면 인해 선별 과정에서 필요한 재현성 및 스크리닝하는 분자의 잠재적으로 많은 수의 가장 강력한, 간단하고 저렴한 분석, 기초 화학 시작점을 제공하도록 설계된다. CPE 기반 분석은 큰 화합물 라이브러리에서 효과적인 히트를 식별하기 위해 이러한 요구 사항을 충족하도록 지정되었다. CPE는 바이러스의 증식과 관련된 배양 된 세포에 악영향을 의미한다. 다양한 분석법기구에게 사균의 수 (세포 독성), 생균 수 (생존)를 나타내는 다른 마커의 다양한 측정을 통해 CPE 표시기를 사용 가능하고,세포 사멸 (아폽토시스). CPE 기반 분석 용 상용 시약은 간단한 분석 프로토콜을 사용할 수 있습니다. 예를 들어, CTG 키트는 하나의 "혼합 및 측정"단계를 포.......

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공개 사항

저자는 더 경쟁 재정적 이익이 없다는 것을 선언합니다.

감사의 글

이 프로젝트는 보조금 1R03M​​H08127-01와 NIH에서 Q. 리튬에 7R03MH08127-02에서 지원하고, UAB에서 의학 교실에서 충격의 펀드 Q. 리 하였다. Molette 기금 오번 대학에서 지원을 받고있다. 우리는 또한 작업 과정에서 양 Pulin 최 씨 블라디미르 Musiienko의 기술 조교 감사합니다.

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재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
DMEM 매체Gibco1134218세포 배양용
FBSGibco16000044세포 배양용
0.05% 트립신-EDTAGibco1000185세포 배양용
DPBSGbico1049769세포 배양용
CellTiter-Glo(CTG) 키트PromegaTB288세포 생존율 측정용
70% 에탄올피셔S25309B95%
항바이러스 화실화합물NIH MLSMR 및 de novo 합성
BTV-10ATCCVR-187
BSR 셀에서
Synergy-II 다중 모드 마이크로플레이트 리더BioTek광 신호 판독용
MicroFlo 선택 디스펜서BioTek세포, 바이러스 및 시약 추가
384웰 평면 바닥 마이크로플레이트CORNING28908031세포 배양용
Gen. 5 소프트웨어BioTekSynergy-II 다중 모드 마이크로플레이트 리더의 판독 출력 분석용
GraphPad Prism 5 GraphPad버전 5생물 정적 분석 및 플롯용
희석 자체 개발 발

참고문헌

  1. Hemati, B., et al. Bluetongue virus targets conventional dendritic cells in skin lymph. J. Virol. 83, 8789-8799 (2009).
  2. Gu, L., et al. Novel Virostatic Agents against Bluetongue Virus. PLoS ONE. 7, e43341(2012).
  3. Meiswinkel, R., et al.

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재인쇄 및 허가

태그

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