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방법 논문

마우스의 자동화, 정량인지 / 행동 검사 : 유전학, 약리학, 동물인지 및 학부 교육을위한

13.8K 조회수

DOI:

10.3791/51047

2014년 2월 26일

이 논문에서

요약

에 유전 및 약리 조작의 효과를 평가하기 위해, 공간 지역화 시간적 지역화, 재생 시간, 속도 및 확률 추정, 위험 평가, 충동 성, 및 정확도와 메모리의 정밀도를 중재 메커니즘의 생리 학적 의미있는 특성을 측정하기위한 완전 자동화 시스템 마우스에있는 인식의 기초 메커니즘.

초록

우리는 동거인지의 기본 메커니즘에 대한 유전 및 약리 조작의 효과를 평가하고 생쥐의 학습을위한 24 / 7 행동 테스트 시스템 완전 자동화 된 높은 처리량, 높은 볼륨을, 설명합니다. 표준 폴리 프로필렌 마우스 하우징 욕조는 표준 상용 마우스 시험 상자에 아크릴 튜브를 통해 연결된다. 테스트 상자 지류 펠렛 연결되어 2 할 3 호퍼가 있습니다. 모든 내부 LED와 illuminable 및 적외선 (IR​​)에 의해 머리 항목에 대해 모니터링 빔. 마우스는 심사 처리를하는 동안 제거 환경에서 살고있다. 그들은 프로토콜 제어 소프트웨어와 준 실시간 데이터 분석 및 그래프 소프트웨어 우리가 쓴하는 (고전) 프로토콜 (수단)와 파블로프 조작 적으로 수행하여 두 개 이상의 매일 공급 기간 동안 음식을 구하십시오. 데이터 분석 및 그래프 루틴은 매우 큰 시간의 분석을 단순화하기 위해 만든 MATLAB 기반 언어로 작성행동 및 생리 이벤트 레코드를 다짐하고 원시 데이터에서 하나의 데이터 구조 내에서 게시 된 그래프와 통계에 대한 모든 중간 분석을 통해 전체 데이터의 흔적을 보존 할 수 있습니다. 데이터 분석 코드는 데이터를 여러 번 하루에 자동으로 "구름"에 저장에있는 - 실험실 컴퓨터입니다 통계 및 그래픽 분석에 주제를 수확. 따라서, 개인 마우스의 진보를 시각화하고 매일 정량. 데이터 분석 코드는 프로토콜에서 개별 과목의 프로토콜을 자동 전진을 허용, 프로토콜 제어 코드를 이야기합니다. 구현 된 행동 프로토콜이 일치하는, autoshaping, 초과 호퍼 전환, 시간을 재는 호퍼 스위칭, 충동 성 측정, 식품 가용성의주기를 예상 위험 평가. 오픈 소스 프로토콜 제어 및 데이터 분석 코드는 새로운 프로토콜의 또 심플 만든다. 여덟 테스트 환경은 캐비닛 X 78 X 24에서 48에 맞는 2 개의 같은 택시에게inets (16 환경)은 하나의 컴퓨터에 의해 제어 될 수있다.

서론

인지의 기본 메커니즘을 매개 세포 및 분자 메커니즘을 해명에 부담 유전학, 분자 유전학, 분자 생물학 및 신경 약리학의 강력한 기술을 가지고, 우리는 생리 학적으로 의미있는 양을 높은 볼륨, 높은 관통 넣어 정신 물리학 적 검사 방법을해야합니다 인지 적 메커니즘의 특성. 메커니즘의 psychophysically 측정, 생리 학적 의미있는 정량적 속성은 행동에 의해 측정하고 또한 전기 생리학 또는 생화학 적 방법으로 할 수있는 속성입니다. 예로는 로돕신의 흡수 스펙트럼,주기 클록의 자유 실행 기간과 중간 전뇌 다발 1,2 보상 축삭 내화물 기간이다. 세포 및 분자 측정을 비교할 수있는 정신 물리학 측정은 정량적 인 대응을 통해 심리적 메커니즘을 세포 및 분자 메커니즘을 연결하기위한 토대를 마련. exampl에 대한E, 낚시대의 외측 세그먼트 로돕신의 시츄 흡수 스펙트럼에 인간 암순응 분광 감도 함수에 중첩된다는 사실은 광자 트리거 로돕신의 이성화를 암순응 시각의 첫 단계 강력한 증거이다. 복잡한 행동 패턴의 양적 측면은 또한 행동 유전학 3,4 QTL 방법의 사용에 중심이다.

잘 확립 된 수단 및 파블로프의 조건 반사 학습 프로토콜에 마우스 (쥐)의 성능은 시간과 같은 ....

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프로토콜

TSsystem에있는 세 개의 완전 자동화 된 프로토콜 (일치, 경음악, 클래식 조화를 appetitive)와 스위치 프로토콜로는 러트 거스 뉴 브런 즈윅의 동물 관리 및 시설위원회에 의해 승인되었습니다.

1. 물리적 시스템 설정

  1. 캐비닛의 테스트 환경을 설정 (도 1 참조).
  2. 프로토콜 제어 컴퓨터 테스트 환경에서 제공하는 실험 제어 소프트웨어를 설치합니다.
    참고 : 다른 목적으로이 컴퓨터를 사용하지 마십시오!

2. 소프트웨어 시스템 설정

  1. 데이터 분석 소프트웨어가 설치되어있는 서버 (도 1 참조) 테스트 환경을 제어하는 컴퓨터 (들)의 하드 디스크에 액세스 할 수 있도록 LAN (로컬 영역 네트워크)을 설정한다.
  2. "클라우드"에 데이터 저장을위한 파일 동기화 계정을 설정.
  3. 푸클라우드 동기화 폴더에있는 상업 프로그래밍 언어의 검색 경로에 TSsystem 폴더와 그 하위 폴더를 톤.
    주 : TSsystem은 소프트웨어 도구이다, 즉, 그것이 생성 출....

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결과

이 시스템은 개별 조사 또는 담임 교사의 목적에 맞는 프로토콜을 실행하는 데 사용되어야합니다. 정합 프로토콜, 2 - 호퍼 autoshaping 프로토콜 및 스위치 프로토콜 : 그러나, 우리는 유전자 조작 된 마우스 및 대규모 약리 시험의 대규모 스크리닝하는데 유용한다 3 프로토콜 슈트를 개발했다. 일치하는 프로토콜은 기억, 두 개의 서로 다른 위치에서 소득 (단위 시간당 식품 알약을) 추정하기 위해 마우스의 능력을 측정하는 위치 산출되는 소득, 소득의 비율의 평균 방문 기간의 비율을 일치하고, 신속성과 어떤이 감지하고 소득 비율의 변화에​​ 조정합니다. 악기와 고전적 조건 형성 (연관 학습 속도)의 2 호퍼 autoshaping 프로토콜 측정 속도. 스위치 프로토콜 측정 간격 타이밍 정확도와 정밀도, 확률을 추정 할 수있는 능력 (기준 주파수)와 확률 (위험 평가)의 변화에​​ 조정합니다. 또한 충동의 측정 값을 준다.

매칭. 두 가지 측면 호퍼 (공급 호퍼.......

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토론

우리의 방법은 인간의 노동의 최소 시간의 최소량 한번에 많은 생쥐에 대한 인식, 학습과 기억,,, 여러 가지기구의 기능에 생리 학적 의미 정량적 결과의 넓은 범위를 산출하고, 명 취급 일, 주, 또는 테스트 개월 동안 실험 과목. 이러한 특성은 유전자 및 약물 검사 프로그램을 맞게. 그것은 최소한의 수정 상용 하드웨어 (테스트 상자와 둥지 욕조)를 사용합니다. 그것은 유전자 및 / 또는 약리학 적으로 조작 생쥐의인지 능력을 테스트하기 위해 다른 현재 사용되는 방법보다 적은 시간에 기본 인식의 더 많은 측면에 더 마우스에서 더 많은 데이터를 생성한다.

이는 시판 잘 지원 언어로 작성된 오픈 소스 소프트웨어의 2 종류에 달려있다 : 1) 실험 프로토콜의 구현 (재질 참조) 테스트 장비의 제작자에 의해 제공된 언어데이터의 기록, 2) 온라인을위한 오픈 소스 도구 상자, TSsystem, 준 실시간 데이터 분석, 그래프, 의사 결정. 도구 상자는 가장 널리 사용되는 중 하나를 작성하.......

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공개 사항

저자가 공개하는 게 없다.

감사의 글

이 시스템의 생성은 5RO1MH77027에 의해 지원되었다.

....

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재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
SmartCtrl 연결 패널Med AssociatesSG-716B (115)입력/출력용 제어판
SmartCtrl 인터페이스 모듈Med AssociatesDIG-716B (114)각 챔버용 스마트 카드
범용 케이블Med AssociatesSG-210CB (115)스마트 카드에서 제어판까지 케이블
탁상용 인터페이스 캐비닛Med AssociatesSG-6080C (109)스마트 카드를 담을 수 있는 캐비닛
랙 마운트 전원 공급 장치Med AssociatesSG-500 (112)28볼트 전원
와이드 마우스 테스트 챔버Med AssociatesENV-307W (31)테스트 챔버
필러 패널 패키지Med AssociatesENV-307W-FP (32)테스트 챔버용 다양한 크기의 패널
와이드 마우스 모듈러 그리드 플로어Med AssociatesENV-307W-GF (31)테스트 챔버 바닥 그리드
헤드 엔트리 검출기Med AssociatesENV-303HDW (62)헤드 엔트리 / 펠릿 호퍼 진입
디스펜서Med AssociatesENV-203-20 (73)피더
펠렛 용기Med AssociatesENV-303W (61)호퍼
펠렛 용기 라이트Med AssociatesENV-303RL (62)호퍼 라이트
하우스 라이트Med AssociatesENV-315W (43)하우스 라이트
IR 컨트롤러Med AssociatesENV-253B (77)둥지와 테스트 사이의 튜브용 진입 감지기
Med AssociatesENV-025F28 (42)각 챔버의 배기 팬
폴리프로필렌 Nest TubNest 상자
아크릴 연결연결 및 테스트 영역
테스트 챔버 (78 "H, 48"W, 24 "D)를 보유하는강철 캐비닛
컴퓨터MedPC 실험 제어 소프트웨어
서버
MedPC 소프트웨어Med Associates에 의해 exper-control 컴퓨터에 연결독점 프로세스 제어 프로그래밍 언어
Matlab w Statistics ToolboxMatlab독점 데이터 분석 및 그래프 프로그래밍 시스템
TSsystemin Supplementary Material w updates from senior author오픈 소스 Matlab Toolbox
참고: 이것은 8개의 테스트 환경을 포함하는 하나의 캐비닛에 필요한 장치입니다. 이러한 각 캐비닛에 대해 하드웨어를 복제해야 합니다. 그러나 하나의 컴퓨터로 2개의 캐비닛(16개의 테스트 환경)을 제어할 수 있습니다.
펠렛 둥지 간 튜브 Windows Matlab을 실행, LAN 소프트웨어

참고문헌

  1. Gallistel, C. R., Shizgal, P., Yeomans, J. S. A portrait of the substrate for self-stimulation. Psychol. Rev. 88, 228-273 (1981).
  2. Takahashi, J. S. Molecular neurobiology and genetics of circadian rhythms in mammals. Ann. Rev. Neurosci. 18, 531-553 (1995).
  3. M....

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